Atome 2 Filter

@TOME V2.3
(Mar 2018)

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Complexes Modeling

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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]

Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : B0VPK2: (2017-11-21 )
MKKLLLAAAVATLSVNAVQAAPTLYGKLNVSINQVDNKNFDGKSDVTEVNSNSSRIGVKGEEKLTDKLSAVYLAEWAISTDGSGSDTDLSARNRFIGLKTEGVGTLKVGKYDSYFKTSAGSNQDIFNDDTRLDITNIMYGENRLDNVVGFELDPKLLAGLTFNIMAQTGESTSDSKKGETGKDSKNDSFDSVSTSLGYENKDLGLAIAAAGDFGIKGKYAAYGLKDVYTDAYRVTGSYDIAKSGFVVGALWQHAEPTDDLTAYGQTYKSDGSIDKAGKAYRGLEEEAYAVTAAYKIPNTKLKVKAEYASAETQVNGQADRKIDLYGLGLDYQINKQARFYGIVAQQKRDWLNDDDKQTVVGTGIEYNF

Atome Classification :

	(20 SA)										-----.........10........20.....--.--..30......----..40.-------.-----...-...50........60........70........80....---..--..90........100.......110-.......120..---..------...---130-.------.------.------.----.----.--..140..-....-.150...---------------.---.----.----.160.......170.......180.......190.......200--------.-........210..-.....220------.---........230..---.....240....--....250..--.....260.......270---..-----.......--280.----------......290-........300..------.....310....---.---...------320.....--.----.330.......------340.......350..---------------......-----.360......
		(Atome)	(Ident)	(Tito)	(Num)	(QMean)		(Ligand)	(Uniprot)		-----MKKLLLAAAVATLSVNAVQAAPTLYG--K--LNVSINQVDN----KNFDG-------K-----SDV-TEVNSNSSRIGVKGEEKLTDKLSAVYLAEWAISTDGSGS---DT--DLSARNRFIGLKTEGVGTLKVGKYD-SYFKTSAGSNQD---IF------NDD---TR--L------D------I------T----N----I--MYGENRL-DNVV-GFELDPK---------------L---L----A----GLTFNIMAQTGESTSDSKKGETGKDSKNDSFDSVSTSLGYEN----------K-DLGLAIAAAGDFG-IKGKYA--------A---YGLKDVYTDAYRV---TGSYDI-AKSGF--VVGALWQHA--EPTDDLTAYGQTYKSD-----GS-----IDKAGKA--YRGL----------EEEAYAVT--AAYKIPNTKLKVK------AEYASA-ETQVN---G---QAD------RKIDLYGL--G----LDYQINKQARF------YGIVAQQKRDW--LN---------------DDDKQT-----VVGTGIEYNF
2	PsiBlast_PDB	61.40	28%	77	- C5 -	-	3A2S		?	X:[17-323]	---------------------------TLYGTIK--AGVEVSRVKDAGTYKAQGG-------K-----SKTATQIADFGSKIGFKGQEDLGNGMKAIWQLEQKASI--AGT---NS--GWGNRQSFIGLKG-GFGTVRAGNLN-TVLKDS-GDNVN---AWESGS--NTE---DV--L------G------L------G----T----I--GRVESRE-ISV----RYDSP---------------V---F----A----GFSGSVQYVPRDNANDVDKYKHTKSSR----ESYHAGLKYEN--------------------AGFFGQYAGSFA--------K---YA--DLNTDAERVAVNTANAHP-VKD-Y--QVHRVVAGY--DANDLYVSVAGQYEAAKNNEVGS-----IK--GKK--H-------------EQTQVAAT--AAYRFGNVTPRV--------SYAHGFKAKVN---GVK-DAN------YQYDQVIV--G----ADYDFSKR------------------------------------------------------------
56	Fugue	61.29	22%	66	- C5 -	-	4AUI		?	A:[20-327]	-------------------------DVTLYG--T--IKAGVETSRS----VAHHG-------AQADRVKTA-TEIADLGSKIGFKGQEDLGNGLKAIWQLEQKAYV--SGT---DT--GWGNRQSFIGLKG-GFGKVRVGRLN-NILKDTGNFNP----WE------GKS---YY--S------G------L------S----N----I--AQPEERH----V-SVRYDSP---------------E---F----A----GFSGSVQYV--------------PNDNSGKNRSESYHAGFNY----------K-NDGFFVQYAGSYK---------------R---HNYTTEKHQVHRL---VGGYD---HDAL--YASVAVQQQ--DAKLTWR--------------------------DD--NSHN----------SQTEVATT--VAYRFGNVTPRVS------YAHGFK-GSVYD---A---DHD------NTYDQVVV--G----AEYDFSKRTSA------LVSAGWLQKGK--GA---------------EKFVAT-----VGGVGLRHKF
4	PsiBlast_PDB	60.71	28%	75	- C5 -	-	3VZW		?	X:[17-323]	---------------------------TLYGTIK--AGVEVSRVKDAGTYKAQGG-------K-----SKTATQIADFGSKIGFKGQEDLGNGMKAIWQLEQKASI--AGT---NS--GWGNRQSFIGLKG-GFGTVRAGNLN-TVLKDS-GDNVN---AWESGS--NTE---DV--L------G------L------G----T----I--GRVESRE-ISV----RYDSP---------------V---F----A----GFSGSVQYVPRDNANDVDKYKHTKSSR----ESYHAGLKYEN--------------------AGFFGQYAGSFA--------K---YA--DLNTDAERVAVNTANAHP-VKD-Y--QVHRVVAGY--DANDLYVSVAGQYEAAKNNEVGS-----IK--GKK--H-------------EQTQVAAT--AAYRFGNVTPRV--------SYAHGFKAKVN---GVK-DAN------YQYDQVIV--G----ADYDFSKR------------------------------------------------------------
6	PsiBlast_PDB	60.22	28%	81	- C5 -	-	3VY9	-	?	X:[17-323]	---------------------------TLYGTIK--AGVEVSRVKDAGTYKAQGG-------K-----SKTATQIADFGSKIGFKGQEDLGNGMKAIWQLEQKASI--AGT---NS--GWGNRQSFIGLKG-GFGTVRAGNLN-TVLKDS-GDNVN---AWESGS--NTE---DV--L------G------L------G----T----I--GRVESRE-ISV----RYDSP---------------V---F----A----GFSGSVQYVPRDNANDVDKYKHTKSSR----ESYHAGLKYEN--------------------AGFFGQYAGSFA--------K---YA--DLNTDAERVAVNTANAHP-VKD-Y--QVHRVVAGY--DANDLYVSVAGQYEAAKNNEVGS-----IK--GKK--H-------------EQTQVAAT--AAYRFGNVTPRV--------SYAHGFKAKVN---GVK-DAN------YQYDQVIV--G----ADYDFSKR------------------------------------------------------------
7	PsiBlast_PDB	60.17	28%	77	- C5 -	-	3VZU		?	X:[17-323]	---------------------------TLYGTIK--AGVEVSRVKDAGTYKAQGG-------K-----SKTATQIADFGSKIGFKGQEDLGNGMKAIWQLEQKASI--AGT---NS--GWGNRQSFIGLKG-GFGTVRAGNLN-TVLKDS-GDNVN---AWESGS--NTE---DV--L------G------L------G----T----I--GRVESRE-ISV----RYDSP---------------V---F----A----GFSGSVQYVPRDNANDVDKYKHTKSSR----ESYHAGLKYEN--------------------AGFFGQYAGSFA--------K---YA--DLNTDAERVAVNTANAHP-VKD-Y--QVHRVVAGY--DANDLYVSVAGQYEAAKNNEVGS-----IK--GKK--H-------------EQTQVAAT--AAYRFGNVTPRV--------SYAHGFKAKVN---GVK-DAN------YQYDQVIV--G----ADYDFSKR------------------------------------------------------------
3	PsiBlast_PDB	59.57	28%	76	- C5 -	-	3VZT	-	?	X:[17-323]	---------------------------TLYGTIK--AGVEVSRVKDAGTYKAQGG-------K-----SKTATQIADFGSKIGFKGQEDLGNGMKAIWQLEQKASI--AGT---NS--GWGNRQSFIGLKG-GFGTVRAGNLN-TVLKDS-GDNVN---AWESGS--NTE---DV--L------G------L------G----T----I--GRVESRE-ISV----RYDSP---------------V---F----A----GFSGSVQYVPRDNANDVDKYKHTKSSR----ESYHAGLKYEN--------------------AGFFGQYAGSFA--------K---YA--DLNTDAERVAVNTANAHP-VKD-Y--QVHRVVAGY--DANDLYVSVAGQYEAAKNNEVGS-----IK--GKK--H-------------EQTQVAAT--AAYRFGNVTPRV--------SYAHGFKAKVN---GVK-DAN------YQYDQVIV--G----ADYDFSKR------------------------------------------------------------
5	PsiBlast_PDB	58.87	28%	79	- C5 -	-	3VY8	-	?	X:[17-323]	---------------------------TLYGTIK--AGVEVSRVKDAGTYKAQGG-------K-----SKTATQIADFGSKIGFKGQEDLGNGMKAIWQLEQKASI--AGT---NS--GWGNRQSFIGLKG-GFGTVRAGNLN-TVLKDS-GDNVN---AWESGS--NTE---DV--L------G------L------G----T----I--GRVESRE-ISV----RYDSP---------------V---F----A----GFSGSVQYVPRDNANDVDKYKHTKSSR----ESYHAGLKYEN--------------------AGFFGQYAGSFA--------K---YA--DLNTDAERVAVNTANAHP-VKD-Y--QVHRVVAGY--DANDLYVSVAGQYEAAKNNEVGS-----IK--GKK--H-------------EQTQVAAT--AAYRFGNVTPRV--------SYAHGFKAKVN---GVK-DAN------YQYDQVIV--G----ADYDFSKR------------------------------------------------------------
61	Fugue	57.85	13%	-22	- C3 -	-	4QUV		ERG_META2	A:[23-427]	-----FSWLVLMIALPPLVYYLWICVTYYQG--E--LVFTSDAAAW----RRFWS-------H-----VAP-PTWHAAGLYAAWFLGQAALQVWAPGPTVQGMKLPDGSRL---DY--RMNGIFSFLFTLAVVFGLVTMGWLDATVLYDQLGPLLT---VV------NIF---TF--V------F------A------G----F----L--YFWGPFY-DYFM-GTALNPRIGSLDLKLFCEARPGM---I----F----WLLMNLSMAAKQYELHGTVTVPMLLVVGFQSFYLIDYFIHEE----------A-VLTTWDIKHEKFG-WMLCWG--------DLVWLPFTYTLQAQYLV---HHTHDL-PVWGI--IAIVALNLAGYAIFRGANIQKHHFRRD-----PN-----RIVWGKPAKYIKT----------KQGSLLLT--SGWWGIARHMNYF------GDLMIA-LSWCL---P---AAFGSPIPYFHIVYFTI--L----LLHREKRDDAM------C--LAKYGEDW--LQ---------------YRKKVP-----WRIVPKIY--
35	HHSearch	56.49	18%	0	- C- -	-	1HXT		OMPF_ECOLI	A:[8-340]	-----------------------GNKVDLYG--K--A-VGLHYFSK----GNGEN-------------SYG-GNGDMTYAALGFKGETQINSDLTGYGQWEYNFQGNNSEGADAQT--GNKTALAFAGLKYADVGSFDYGRNY-GVVYDAL-GYTNMLPQF------GGD---TA----------------Y-----------S----D--DFFVGAV-GGVA-TYRN-SN-------------------FFGLVD----GLNFAVQYLGKNERDTA---------RRSNGDGVGGSISYEY----------E-GFGIVGAYGAADR-TNLQEA--------Q---PLGNGKKAEQWAT---GLKYDA-N--NI--YLAANYGET--RNATPITNKF-----T----------------NTS--GFAN----------KTQDVLLV--AQYQFDF-GLRPS------IAYTKS-KAKDV---EGI-GDV------DLVNYFEV--G----ATYYFNKNMST------YVDYIINQIDS--DNKL-------------GVGSDD-----TVAVGIVYQF
41	HHSearch	56.38	18%	48	- C5 -	-	2ZFG		OMPF_ECOLI	A:[8-340]	-----------------------GNKVDLYG--K--A-VGLHYFSK----G-GEN-------------SYG-GNGDMTYARLGFKGETQINSDLTGYGQWEYNFQGNNSEGADAQT--GNKTRLAFAGLKYADVGSFDYGRNY-GVVYDAL-GYTD---ML------PEF---GG--D------T------A------Y----S----D--DFFVGRV-GGVA-TYRN-SN-------------------F----FGLVDGLNFAVQYLGKNERDTA---------RRSNGDGVGGSISYEY----------E-GFGIVGAYGAADR-TNLQEA--------Q---PLGNGKKAEQWAT---GLKYDA-N--NI--YLAANYGET--RNATPITNKF-----T----------------NTS--GFAN----------KTQDVLLV--AQYQFDF-GLRPS------IAYTKS-KAKDV---EGI-GDV------DLVNYFEV--G----ATYYFNKNMST------YVDYIINQIDS--DNKL-------------GVGSDD-----TVAVGIVYQF
37	HHSearch	52.97	16%	-11	- C5 -	-	3PRN		PORI_RHOBL	A:[1-289]	-------------------------MISLNG--Y--GRFGLQYVED----RGVG--------------LED--TIISSRLRINIVGTTETDQGVTFGAKLRMQWDDGDAF-----A--GTAGNAAQFWTS-YNGVTVSVGNVD-TAFDSVA-LTY----DS------EMGYEWSS--F------GDAQSS-F------F----AYNSKY--DASGALD-NYNG-IAVT-YS-------------------I----S----GVNLYLSYVDPDQTVDS----------SLVTEEFGIAADWSN----------D-MISLAAAYTTDAG-G---------------------IVDNDIAFV---GAAYKFND--AG--TVGLNWYDN--GLS-------------------------------------T----------AGDQVTLY--GNYAFG--ATTVR------AYVSDI-DRA------------------GADTAYGI--G----ADYQFAEGVKV------SGSVQSGF-A----------------------NE-T-----VADVGVRFDF
57	Fugue	52.80	17%	38	* C4 *	-	4XFK	-	?	A:[9-399]	------AEPLKIALVETLSGPQASTGLLYRA--A--VLYQLGKINE----AGGFN-------G-----EKI-QILEYDNQ----GGPVGAADRVKAAIADGAQIIVQGSSS---AVAGQITEDVRKYNLRNKGKEVLYLN-LG-AEALELTGSKCH---FYHFRFSPNAA---IR--F------KT-----V------A----Q----G--MKDKGILGERAY-SINQNYS---------------W---G----V----DVENTVVANAKEIGYEVVDKTLHEVNKIQDFSPYVAKIQAANVDTVFTGNWSN-DLLLLMKAASGAG-LKAKFA--------T--------SFLDQPGN---IGNAGA-IAEGH--IVSTPFNPE--ANGEASMAFAEDYKKV-----TGHYPSYVEPAAVF--GLQL----------FGEALKNVKPGEGKINTTDIALA------IENASV-KTPMG---D---YSM------RSDDHQAKFPM----VVQEVSKKARIKADGTEYGFLPFKTFTG--DE---------------SIDPVQ-----ESCSMKRPG-
32	HHSearch	51.57	19%	54	- C5 -	-	2FGR	-	OMP32_DELAC	A:[1-332]	-----------------------ESSVTLFG--I--VDTNVAYVNK----DAAGDS------R-----YGL-GTSGASTSRLGLRGTEDLGGGLKAGFWLEGEIFGDDGNA---SG--FNFKRRSTVSLSG-NFGEVRLGRDL-VPTSQKL-TSYD---LF------SAT---GI--G------PFMGFRNW------A----AGQG-A--DDNGIRA-NNLI-SYYT-PN-------------------F----G----GFNAGFGYAFDEKQTIG--------TADSVGRYIGGYVAYDN----------G-PLSASLGLAQQKT-AVG-----------------GLATDRDEITL---GASYNF-G--VA--KLSGLLQQT--KFKRDI-------------------------------GGDI----------KTNSYMLG--ASAPVGG-VGEVK------LQYALY-DQKA---------ID------SKAHQITL--G----YVHNLSKRTAL------YGNLAFLKNKD--ASTLGLQAKGVYAGGVQAGESQT-----GVQVGIRHAF
33	HHSearch	51.49	19%	54	- C5 -	-	2FGQ		OMP32_DELAC	X:[3-332]	-------------------------SVTLFG--I--VDTNVAYVNK----DAAGDS------R-----YGL-GTSGASTSRLGLRGTEDLGGGLKAGFWLEGEIFGDDGNA---SG--FNFKRRSTVSLSG-NFGEVRLGRDL-VPTSQKL-TSYD---LF------SAT---GI--G------P------FMGFRNWA----AGQG-A--DDNGIRA-NNLI-SYYT-PN-------------------F----G----GFNAGFGYAFDEKQTIG--------TADSVGRYIGGYVAYDN----------G-PLSASLGLAQQKT-AVG-----------------GLATDRDEITL---GASYNF-G--VA--KLSGLLQQT--KFKRDI-------------------------------GGDI----------KTNSYMLG--ASAPVGG-VGEVK------LQYALY-DQKA---------ID------SKAHQITL--G----YVHNLSKRTAL------YGNLAFLKNKD--ASTLGLQAKGVYAGGVQAGESQT-----GVQVGIRHAF
36	HHSearch	51.48	16%	-11	- C5 -	-	1BH3		PORI_RHOBL	A:[1-289]	-------------------------MISLNG--Y--GRFGLQYVED----RGVG--------------LED--TIISSRLRINIVGTTETDQGVTFGAKLRMQWDDGDAF-----A--GTAGNAAQFWTSY-NGVTVSVGNVD-TAFDSVAL-TY----DS------EMG---YEASSFGDAQSS------F------FKYNSK----Y--DASGALD-NYNG-IAVT-YS-------------------I----S----GVNLYLSYVDPDQTVDS----------SLVTEEFGIAADWSN----------D-MISLAAAYTTDAG-G---------------------IVDNDIAFV---GAAYKFND--AG--TVGLNWYDN--GLS-------------------------------------T----------AGDQVTLY--GNYAFG--ATTVR------AYVSDI-DRA------------------GADTAYGI--G----ADYQFAEGVKV------SGSVQSGF-A----------------------NE-T-----VADVGVRFDF
30	HHSearch	51.13	22%	85	* C5 *	-	3VY8	-	?	X:[15-355]	-------------------------QVTLYG--T--IKAGVEVSRV----KDAGTYKAQGGKS-----KTA-TQIADFGSKIGFKGQEDLGNGMKAIWQLEQKASIAGT-----NS--GWGNRQSFIGLKG-GFGTVRAGNLN-TVLKDSG-DNVN---AW------ESG---SNT-E------D------V------L----G----LGTIGRVESR-EISV-RYDS-PV-------------------F----A----GFSGSVQYVPRDNANDVDK----YKHTKSSRESYHAGLKYEN----------A-GFFGQYAGSFAKY-ADLNTDAERVAVNTA---NAHPVKDYQVHRV---VAGYDA-N--DLYVSVAGQYEAA--KNNEVGS--------------------------IK--GKKH----------EQTQVAAT--AAYRFGN--VTPR------VSYAHG-FKAKVNGVK---DAN------YQYDQVIV--G----ADYDFSKRTSA------LVSAGWLKQGK--GA---------------GKVEQT-----ASMVGLRHKF
42	HHSearch	51.11	17%	47	- C5 -	-	3NSG	-	OMPF_SALTY	B:[8-341]	-----------------------GNKLDLYG--K--AVGRHVWTTT----GD-----------------S--KNADQTYAQIGFKGETQINTDLTGFGQWEYRTKADRAEGEQ-QN--SNLVRLAFAGLKYAEVGSIDYGRNY-GIVYDVE-SYTD---MA------PYF---SG--E------T------W------GGAY-T----D--NYMTSRA-GGLL-TYRN-SD-------------------FFGLVD----GLSFGIQYQGKNQDNHS--------INSQNGDGVGYTMAYEF----------D-GFGVTAAYSNSKR-TNDQQD------------RDGNGDRAESRAV---GAKYDA-N--NV--YLAAVYAET--RNMSIVENTV---------------------TDTV--EMAN----------KTQNLEVV--AQYQFDF-GLRPA------ISYVQS-KGKQL---NGAGGSA------DLAKYIQA--G----ATYYFNKNMNV------WVDYRFNLLDE--NDYSSS-----------YVGTDD-----QAAVGITYQF
39	HHSearch	50.01	20%	78	- C5 -	-	3WI5	-	OMPB1_NEIMB	A:[1-312]	-------------------------DVTLYG--T--IKAGVETSRS----VFHQNG------QVTEV-TTA-TGIVDLGSKIGFKGQEDLGNGLKAIWQVEQKASIAGT-----DS--GWGNRQSFIGLKG-GFGKLRVGRLN-SVLKDTG-D-IN---PW------DSK---SDY-L------G------V------N----K----I--A-EPEAR-LISV-RYDS-PE-------------------F----A----GLSGSVQYALNDNAG------------RHNSESYHAGFNYKN----------G-GFFVQYGGAYKRH-HQVQE--------------GLNIEKYQIHRL---VSGYDN-D--AL--YASVAVQQQ--DAKLTDA---------------------------S--NSHN----------SQTEVAAT--LAYRFG--NVTPR------VSYAHG-FKGLV---AKA-DIG------NRYDQVVV--G----AEYDFSKRTSA------LVSAGWLQEGK--GE---------------NKFVAT-----AGGVGLRHKF
44	HHSearch	49.21	18%	62	- C5 -	-	4D65	-	?	F:[8-343]	-----------------------GNKLDVYG--Q--IDVRHYFADA----KS------------------G-EDGDDSRVRLGFKGDTQITDQLIGFGRFEWETSTNKAET---SN--DNQNRLAYAGLKFADYGSLDYGRNY-GVIYDTN-AWTD---VL------PL----WG--A------D------T------MD---QE---D--TFMMGRN-RNLL-TYRN-NN---------------GFGYI----D----GLSFALQYQGKNGDQNKST---GSSALDNNGDGYGFSTAYEL----------GWGLSIGGGYSNSSR-TPSQNNI-------K---TGATGKRAEAWNV---GSKLEL-D--EL--YLAAMYGQT--LNTTRFGDD-----------------------DAE--AIAN----------KTENLELV--ALYSFDF-GLTPS------IGYNQS-KGKNL---GNY-GNK------DLVKYIAV--G----ASYDFNKNMAA------VIDYKINLLKD--NQFTDDY----------GINTDN-----VLGLGLIYQF
60	Fugue	48.60	20%	64	- C4 -	-	4OOU		?	A:[20-383]	SEFLKASGSNFYYGGQKVFLSGVNFAWRSYG--SDFGNGQYASNGP----ALKDW-------I-----NKV-KASGGNTARVWVHVE----GQVSPAFDSHGFVTSTDSKK---TL--INDLSDLLDYANGQNV-FLILVLFN-GALQNN-SNVQN---LF------WDE---SK--L------N--------------------------SYINNAL-TPMVNALKSKPS---------------L---A----A----WEVLNEPEGTLQPGSD-------QNSCYDTSTLAAQGAGWGG----------K-KFPMKQILKTINW-ISSAIH--------N---ADSKAL---------------------V--TVGS-WSEL--TQTDSFG-YRNHYK-D-----SC-----LTGAGGK--SNGIINFYQMHTYSHSGKWNQN--APFKVNRWAYNVNDKPLLIGEFASV-CSQNE---G---IQN------LYKYAYNN--GYNGALTWQFNSGGDC------SDTYSNQMYGMQALK---------------GQNDQSGGKGGMVSVNINH--