Atome 2 Filter

@TOME V2.3
(Mar 2018)

Ref. - - Doc.

Global output mode :

Sort entries by :

Sequence Color type :

Show alignment :

Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling

Templates Information:

Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]

Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : M_TH16_EuGene_00079081: (2018-03-21 )
GRGWCKVKVLYRHNRKEAQATYAEIDKETHWNLDGFPIVIKPDGDCIIKLVSGWVDHETYYFKGETHKVTTYSK

Atome Classification :

	(20 SA)										--------------...---------.....--.10---...-.------..-----...20.-..----------.....-30----....---...---..--------------40...---.---...-..50--.--..-----.---...---.60......--------.-----.70-...
		(Atome)	(Ident)	(Tito)	(Num)	(QMean)		(Ligand)	(Uniprot)		--------------GRG---------WCKVK--VL----YRH-N------RK-----EAQATY-AE----------IDKET-H-----WNLD---GFP---IV--------------I-KPD---G---DCI-IKLV--S--GW-----V---DHE---TYYFKGETH--------K-----VTT-YSK
48	SP3	70.78	22%	0	- C- -	-	1JB0	-	PSAE_THEEB	E:[1-69]	-------------VQRG----------SKVK--ILRPESYWY-N------EV--------GTV-AS----------VDQTP-G-----VK------YP---VI--------------V-RFD---K---VNY-TGYS--G--SA-----S---GVN---TNNF--ALH--------E-----VQE-VA-
36	Fugue	58.27	32%	25	- C10 -	-	1PRE	-	AERA_AERHY	A:[2-104]	-EPVYPDQLRLFSLGQG---------VCGDK--------YRPVN------RE-----EAQSVK-SN----------IVGMMGQ-----WQIS---GLANGWVI--------------M-GPG---Y---NGE-IKPG--T--A-----------SN---TWCYP--TN--------P-----VTG-E--
7	PsiBlast_PDB	51.91	26%	-22	- C13 -	-	1ODT	-	CAH_BACSU	C:[93-152]	------------------------------------------------------------ASYDGE----------IHEMV-N-----WALH---GYA---TFGMLVRGQQSSEDTSI-SPH---G---HAL-GWMT--K--GI-----L---DKD---TYYYRG------------------------
5	PsiBlast_PDB	50.44	26%	-19	* C13 *	-	1L7A	-	CAH_BACSU	A:[93-152]	------------------------------------------------------------ASYDGE----------IHEMV-N-----WALH---GYA---TFGMLVRGQQRSEDTSI-SPH---G---HAL-GWMT--K--GI-----L---DKD---TYYYRG------------------------
6	PsiBlast_PDB	50.27	26%	-23	- C13 -	-	1ODS	-	CAH_BACSU	A:[93-152]	------------------------------------------------------------ASYDGE----------IHEMV-N-----WALH---GYA---TFGMLVRGQQSSEDTSI-SPH---G---HAL-GWMT--K--GI-----L---DKD---TYYYRG------------------------
32	Fugue	49.33	13%	-116	- C11 -	-	1Q5Y		NIKR_ECOLI	A:[2-85]	--------------TQG---------FAVLS--YV----YEH-E------KR-----DLASRI-VS----------TQHHH-H-----DLSV---ATL---HV--------------H-INH---D---DCL-EIAV--L--KG-----D---MGD---VQHFADDVIAQRGVRHGH-----LQC-LPK
3	PsiBlast_PDB	48.72	29%	-127	- C15 -	-	2C54		GME_ARATH	A:[15-55]	-------------------------------------------------------------TY-KE----------LEREQ-Y-----WPSE---NLK---IS--------------I-TGA---G---GFI-ASHI--A--RR-----L---KHE---GHY---------------------------
2	PsiBlast_PDB	47.00	29%	-133	- C15 -	-	2C5E		GME_ARATH	A:[15-55]	-------------------------------------------------------------TY-KE----------LEREQ-Y-----WPSE---NLK---IS--------------I-TGA---G---GFI-ASHI--A--RR-----L---KHE---GHY---------------------------
43	SP3	46.85	17%	65	- C11 -	-	1F1S	-	HYSA_STRA3	A:[920-984]	---------------------------SKQQ--VI----YDK-N------SQTWAVIKHDNQE-SL----------INNQF-K-----MNKA---GLY---LV--------------Q-KVG---N---------------------------DYQ---NVYYQPQTM--------T-----KTD-QLA
1	PsiBlast_PDB	46.64	29%	-132	- C15 -	-	2C5A		GME_ARATH	A:[15-55]	-------------------------------------------------------------TY-KE----------LEREQ-Y-----WPSE---NLK---IS--------------I-TGA---G---GFI-ASHI--A--RR-----L---KHE---GHY---------------------------
50	SP3	46.42	29%	8	- C- -	-	1EDQ	-	?	A:[444-516]	-------------YGRG---------WTGVN--GY------Q-N------NI-----PFTGTA-TG----------PVKGT-------WE-N---G-----IV------------------D---Y---RQI-AGQFMSG--EW-----QYTYDATAEAPYVFKPSTG--------D-----LIT-FD-
4	PsiBlast_PDB	45.66	29%	-109	- C15 -	-	2C59		GME_ARATH	A:[15-55]	-------------------------------------------------------------TY-KE----------LEREQ-Y-----WPSE---NLK---IS--------------I-TGA---G---GFI-ASHI--A--RR-----L---KHE---GHY---------------------------
49	SP3	43.17	14%	68	- C11 -	-	1FXL	-	ELAV4_HUMAN	A:[83-167]	----------SASIRDA---------NLYVS--GLP---KTM-T------QK-----ELEQLF-SQYGRIITSRILVDQVT-G------VSR---GVG---FI--------------R-FDK---R---IEA-EEAI--K--GL-----N---GQK------PSGATE--------P-----ITVKFA-
8	HHSearch	41.88	35%	-281	- C13 -	-	5GKF	-	NUCS_THEKO	B:[55-71]	-------------------------------------------------------------------------------------------------V---II--------------V-KPD---G---SFL-IHQS--K--K----------------------------------------------
9	HHSearch	41.22	35%	-253	- C13 -	-	5GKE	-	NUCS_THEKO	A:[55-71]	-------------------------------------------------------------------------------------------------V---II--------------V-KPD---G---SFL-IHQS--K--K----------------------------------------------
37	Fugue	39.54	13%	-2	- C11 -	-	2RAQ	-	?	A:[3-95]	--------------AKG---------LIRIV--LD----ILK-P------HE-----PIIPEY-AK----------YLSEL-R------GVE---GVN---IT--------------LMEID---KETENIK-VTIQ--G--ND-----L---DFD---EITRAIESY--------G-----GSI-HSV
45	SP3	39.34	14%	46	- C14 -	-	1BTN		?	?:[1-106]	MEGFLNRKHEWEAHNKKASSRSWHNVYCVINNQEM----GFY-K------DA-----KSAASG-IP----------YHSEV-P-----VSLK---EAI---CE--------------V-ALDYKKK---KHV-FKLR--L---------S---DGN---EYLFQAKDD--------EEMNTWIQA-ISS
46	SP3	37.27	10%	-20	* C11 *	-	1SJQ	-	PTBP1_HUMAN	A:[12-99]	-------------SGVP------------SR--VI----HIR-KLPIDVTEG-----EVISLG-LP----------FGKVT-N-----LLMLKGKNQA---FI--------------E-MNT---E---EAA-NTMV--N--YY-----T---SVT----PVLRGQPI--------Y-----I-Q-FSN
44	SP3	35.36	16%	53	* C14 *	-	1OQK	-	RNP1_METTH	A:[9-86]	---------RHELIGL------------SVR--IA----RSV-H------RD-----I-QGIS-GR----------VVDET-RNTLRIEMDD---GRE---IT--------------V-PKG---I---AVFHFRTP--Q--G------------E---LVEIDGRAL--------V-----ARP-EER
42	SP3	34.98	20%	23	- C11 -	-	1O6W	-	PRP40_YEAST	A:[1-75]	--------------MSI---------WKEAK--D------AS-G------RI--------YYY-NT----------LTKKS-T-----WE------------K--------------P-KEL---I---SQE-ELLL--RENGWKAAKTA---DGK---VYYYNPTT---------R-----ETS-WTI