Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C5_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C5_S1
Complex: SIA_A_3(2YA5) / Model_7(2YA5/A) = [6.2]	Download	549.08	19.86	MSYFRNRDIDIERNSMNRSVQERKCRYSIRKLSVGAVSMIVGAVVFGTSPVLAQEGASEQPLANETQLSGESSTLTDTEKSQPSSETELSGNKQEQERKDKQEEKIPRDYYARDLENVETVIEKEDVETNASNGQRVDLSSELDKLKKLENATVHMEFKPDAKAPAFYNLFSVSSATKKDEYFTMAVYNNTATLEGRGSDGKQFYNNYNDAPLKVKPGQWNSVTFTVEKPTAELPKGRVRLYVNGVLSRTSLRSGNFIKDMPDVTHVQIGATKRANNTVWGSNLQIRNLTVYNRALTPEEVQKRSQLFKRSDLEKKLPEGAALTEKTDIFESGRNGKPNKDGIKSYRIPALLKTDKGTLIAGADERRLHSSDWGDIGMVIRRSEDNGKTWGDRVTITNLRDNPKASDPSIGSPVNIDMVLVQDPETKRIFSIYDMFPEGKGIFGMSSQKEEAYKKIDGKTYQILYREGEKGAYTIRENGTVYTPDGKATDYRVVVDPVKPAYSDKGDLYKGNQLLGNIYFTTNKTSPFRIAKDSYLWMSYSDDDGKTWSAPQDITPMVKADWMKFLGVGPGTGIVLRNGPHKGRILIPVYTTNNVSHLNGSQSSRIIYSDDHGKTWHAGEAVNDNRQVDGQKIHSSTMNNRRAQNTESTVVQLNNGDVKLFMRGLTGDLQVATSKDGGVTWEKDIKRYPQVKDVYVQMSAIHTMHEGKEYIILSNAGGPKRENGMVHLARVEENGELTWLKHNPIQKGEFAYNSLQELGNGEYGILYEHTEKGQNAYTLSFRKFNWDFLSKDLISPTEAKVKRTREMGKGVIGLEFDSEVLVNKAPTLQLANGKTARFMTQYDTKTLLFTVDSEDMGQKVTGLAEGAIESMHNLPVSVAGTKLSNGMNGSEAAVHEVPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTAGEEAAPTVEKPEFTGGVNGTEPAVHEIAEYKGSDSLVTLTTKEDYTYKAPLAQQALPETGNKESDLLASLGLTAFFLGLFTLGKKREQ
Complex: 6UD_A_3(5KKY) / Model_4(5KKY/A) = [6.1]	Download	686.31	18.57	MSYFRNRDIDIERNSMNRSVQERKCRYSIRKLSVGAVSMIVGAVVFGTSPVLAQEGASEQPLANETQLSGESSTLTDTEKSQPSSETELSGNKQEQERKDKQEEKIPRDYYARDLENVETVIEKEDVETNASNGQRVDLSSELDKLKKLENATVHMEFKPDAKAPAFYNLFSVSSATKKDEYFTMAVYNNTATLEGRGSDGKQFYNNYNDAPLKVKPGQWNSVTFTVEKPTAELPKGRVRLYVNGVLSRTSLRSGNFIKDMPDVTHVQIGATKRANNTVWGSNLQIRNLTVYNRALTPEEVQKRSQLFKRSDLEKKLPEGAALTEKTDIFESGRNGKPNKDGIKSYRIPALLKTDKGTLIAGADERRLHSSDWGDIGMVIRRSEDNGKTWGDRVTITNLRDNPKASDPSIGSPVNIDMVLVQDPETKRIFSIYDMFPEGKGIFGMSSQKEEAYKKIDGKTYQILYREGEKGAYTIRENGTVYTPDGKATDYRVVVDPVKPAYSDKGDLYKGNQLLGNIYFTTNKTSPFRIAKDSYLWMSYSDDDGKTWSAPQDITPMVKADWMKFLGVGPGTGIVLRNGPHKGRILIPVYTTNNVSHLNGSQSSRIIYSDDHGKTWHAGEAVNDNRQVDGQKIHSSTMNNRRAQNTESTVVQLNNGDVKLFMRGLTGDLQVATSKDGGVTWEKDIKRYPQVKDVYVQMSAIHTMHEGKEYIILSNAGGPKRENGMVHLARVEENGELTWLKHNPIQKGEFAYNSLQELGNGEYGILYEHTEKGQNAYTLSFRKFNWDFLSKDLISPTEAKVKRTREMGKGVIGLEFDSEVLVNKAPTLQLANGKTARFMTQYDTKTLLFTVDSEDMGQKVTGLAEGAIESMHNLPVSVAGTKLSNGMNGSEAAVHEVPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTAGEEAAPTVEKPEFTGGVNGTEPAVHEIAEYKGSDSLVTLTTKEDYTYKAPLAQQALPETGNKESDLLASLGLTAFFLGLFTLGKKREQ
Complex: DAN_A_3(2YA6) / Model_8(2YA6/A) = [5.8]	Download	570.35	18.57	MSYFRNRDIDIERNSMNRSVQERKCRYSIRKLSVGAVSMIVGAVVFGTSPVLAQEGASEQPLANETQLSGESSTLTDTEKSQPSSETELSGNKQEQERKDKQEEKIPRDYYARDLENVETVIEKEDVETNASNGQRVDLSSELDKLKKLENATVHMEFKPDAKAPAFYNLFSVSSATKKDEYFTMAVYNNTATLEGRGSDGKQFYNNYNDAPLKVKPGQWNSVTFTVEKPTAELPKGRVRLYVNGVLSRTSLRSGNFIKDMPDVTHVQIGATKRANNTVWGSNLQIRNLTVYNRALTPEEVQKRSQLFKRSDLEKKLPEGAALTEKTDIFESGRNGKPNKDGIKSYRIPALLKTDKGTLIAGADERRLHSSDWGDIGMVIRRSEDNGKTWGDRVTITNLRDNPKASDPSIGSPVNIDMVLVQDPETKRIFSIYDMFPEGKGIFGMSSQKEEAYKKIDGKTYQILYREGEKGAYTIRENGTVYTPDGKATDYRVVVDPVKPAYSDKGDLYKGNQLLGNIYFTTNKTSPFRIAKDSYLWMSYSDDDGKTWSAPQDITPMVKADWMKFLGVGPGTGIVLRNGPHKGRILIPVYTTNNVSHLNGSQSSRIIYSDDHGKTWHAGEAVNDNRQVDGQKIHSSTMNNRRAQNTESTVVQLNNGDVKLFMRGLTGDLQVATSKDGGVTWEKDIKRYPQVKDVYVQMSAIHTMHEGKEYIILSNAGGPKRENGMVHLARVEENGELTWLKHNPIQKGEFAYNSLQELGNGEYGILYEHTEKGQNAYTLSFRKFNWDFLSKDLISPTEAKVKRTREMGKGVIGLEFDSEVLVNKAPTLQLANGKTARFMTQYDTKTLLFTVDSEDMGQKVTGLAEGAIESMHNLPVSVAGTKLSNGMNGSEAAVHEVPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTAGEEAAPTVEKPEFTGGVNGTEPAVHEIAEYKGSDSLVTLTTKEDYTYKAPLAQQALPETGNKESDLLASLGLTAFFLGLFTLGKKREQ
Complex: G39_A_3(2YA8) / Model_10(2YA8/A) = [4.7]	Download	784.40	23.62	MSYFRNRDIDIERNSMNRSVQERKCRYSIRKLSVGAVSMIVGAVVFGTSPVLAQEGASEQPLANETQLSGESSTLTDTEKSQPSSETELSGNKQEQERKDKQEEKIPRDYYARDLENVETVIEKEDVETNASNGQRVDLSSELDKLKKLENATVHMEFKPDAKAPAFYNLFSVSSATKKDEYFTMAVYNNTATLEGRGSDGKQFYNNYNDAPLKVKPGQWNSVTFTVEKPTAELPKGRVRLYVNGVLSRTSLRSGNFIKDMPDVTHVQIGATKRANNTVWGSNLQIRNLTVYNRALTPEEVQKRSQLFKRSDLEKKLPEGAALTEKTDIFESGRNGKPNKDGIKSYRIPALLKTDKGTLIAGADERRLHSSDWGDIGMVIRRSEDNGKTWGDRVTITNLRDNPKASDPSIGSPVNIDMVLVQDPETKRIFSIYDMFPEGKGIFGMSSQKEEAYKKIDGKTYQILYREGEKGAYTIRENGTVYTPDGKATDYRVVVDPVKPAYSDKGDLYKGNQLLGNIYFTTNKTSPFRIAKDSYLWMSYSDDDGKTWSAPQDITPMVKADWMKFLGVGPGTGIVLRNGPHKGRILIPVYTTNNVSHLNGSQSSRIIYSDDHGKTWHAGEAVNDNRQVDGQKIHSSTMNNRRAQNTESTVVQLNNGDVKLFMRGLTGDLQVATSKDGGVTWEKDIKRYPQVKDVYVQMSAIHTMHEGKEYIILSNAGGPKRENGMVHLARVEENGELTWLKHNPIQKGEFAYNSLQELGNGEYGILYEHTEKGQNAYTLSFRKFNWDFLSKDLISPTEAKVKRTREMGKGVIGLEFDSEVLVNKAPTLQLANGKTARFMTQYDTKTLLFTVDSEDMGQKVTGLAEGAIESMHNLPVSVAGTKLSNGMNGSEAAVHEVPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTAGEEAAPTVEKPEFTGGVNGTEPAVHEIAEYKGSDSLVTLTTKEDYTYKAPLAQQALPETGNKESDLLASLGLTAFFLGLFTLGKKREQ
Complex: FSI_A_4(2VK7) / Model_18(2VK7/A) = [4.3]	Download	680.67	14.26	MSYFRNRDIDIERNSMNRSVQERKCRYSIRKLSVGAVSMIVGAVVFGTSPVLAQEGASEQPLANETQLSGESSTLTDTEKSQPSSETELSGNKQEQERKDKQEEKIPRDYYARDLENVETVIEKEDVETNASNGQRVDLSSELDKLKKLENATVHMEFKPDAKAPAFYNLFSVSSATKKDEYFTMAVYNNTATLEGRGSDGKQFYNNYNDAPLKVKPGQWNSVTFTVEKPTAELPKGRVRLYVNGVLSRTSLRSGNFIKDMPDVTHVQIGATKRANNTVWGSNLQIRNLTVYNRALTPEEVQKRSQLFKRSDLEKKLPEGAALTEKTDIFESGRNGKPNKDGIKSYRIPALLKTDKGTLIAGADERRLHSSDWGDIGMVIRRSEDNGKTWGDRVTITNLRDNPKASDPSIGSPVNIDMVLVQDPETKRIFSIYDMFPEGKGIFGMSSQKEEAYKKIDGKTYQILYREGEKGAYTIRENGTVYTPDGKATDYRVVVDPVKPAYSDKGDLYKGNQLLGNIYFTTNKTSPFRIAKDSYLWMSYSDDDGKTWSAPQDITPMVKADWMKFLGVGPGTGIVLRNGPHKGRILIPVYTTNNVSHLNGSQSSRIIYSDDHGKTWHAGEAVNDNRQVDGQKIHSSTMNNRRAQNTESTVVQLNNGDVKLFMRGLTGDLQVATSKDGGVTWEKDIKRYPQVKDVYVQMSAIHTMHEGKEYIILSNAGGPKRENGMVHLARVEENGELTWLKHNPIQKGEFAYNSLQELGNGEYGILYEHTEKGQNAYTLSFRKFNWDFLSKDLISPTEAKVKRTREMGKGVIGLEFDSEVLVNKAPTLQLANGKTARFMTQYDTKTLLFTVDSEDMGQKVTGLAEGAIESMHNLPVSVAGTKLSNGMNGSEAAVHEVPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTAGEEAAPTVEKPEFTGGVNGTEPAVHEIAEYKGSDSLVTLTTKEDYTYKAPLAQQALPETGNKESDLLASLGLTAFFLGLFTLGKKREQ
Consensus [pKd Mean = 5.42]	-	654 (s=85)	18 (s=3)	MSYFRNRDIDIERNSMNRSVQERKCRYSIRKLSVGAVSMIVGAVVFGTSPVLAQEGASEQPLANETQLSGESSTLTDTEKSQPSSETELSGNKQEQERKDKQEEKIPRDYYARDLENVETVIEKEDVETNASNGQRVDLSSELDKLKKLENATVHMEFKPDAKAPAFYNLFSVSSATKKDEYFTMAVYNNTATLEGRGSDGKQFYNNYNDAPLKVKPGQWNSVTFTVEKPTAELPKGRVRLYVNGVLSRTSLRSGNFIKDMPDVTHVQIGATKRANNTVWGSNLQIRNLTVYNRALTPEEVQKRSQLFKRSDLEKKLPEGAALTEKTDIFESGRNGKPNKDGIKSYRIPALLKTDKGTLIAGADERRLHSSDWGDIGMVIRRSEDNGKTWGDRVTITNLRDNPKASDPSIGSPVNIDMVLVQDPETKRIFSIYDMFPEGKGIFGMSSQKEEAYKKIDGKTYQILYREGEKGAYTIRENGTVYTPDGKATDYRVVVDPVKPAYSDKGDLYKGNQLLGNIYFTTNKTSPFRIAKDSYLWMSYSDDDGKTWSAPQDITPMVKADWMKFLGVGPGTGIVLRNGPHKGRILIPVYTTNNVSHLNGSQSSRIIYSDDHGKTWHAGEAVNDNRQVDGQKIHSSTMNNRRAQNTESTVVQLNNGDVKLFMRGLTGDLQVATSKDGGVTWEKDIKRYPQVKDVYVQMSAIHTMHEGKEYIILSNAGGPKRENGMVHLARVEENGELTWLKHNPIQKGEFAYNSLQELGNGEYGILYEHTEKGQNAYTLSFRKFNWDFLSKDLISPTEAKVKRTREMGKGVIGLEFDSEVLVNKAPTLQLANGKTARFMTQYDTKTLLFTVDSEDMGQKVTGLAEGAIESMHNLPVSVAGTKLSNGMNGSEAAVHEVPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTSGEEPAPTVEKPEYTGPLGTAGEEAAPTVEKPEFTGGVNGTEPAVHEIAEYKGSDSLVTLTTKEDYTYKAPLAQQALPETGNKESDLLASLGLTAFFLGLFTLGKKREQ

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
ARG	347	NE	51	5	19[O], 30[C], 1[N], 1[F],
ARG	347	CG	26	5	9[O], 15[C], 1[N], 1[F],
ARG	347	CD	44	5	1[N], 1[F], 18[O], 24[C],
ARG	347	CZ	58	5	20[O], 31[C], 6[N], 1[F],
ILE	348	CG2	38	5	6[N], 1[F], 7[O], 24[C],
ILE	348	CG1	59	5	38[C], 14[O], 1[F], 6[N],
ILE	348	CD1	75	5	44[C], 24[O], 1[F], 6[N],
ASP	364	CG	18	5	5[N], 1[F], 4[O], 8[C],
ASP	364	OD2	40	5	9[O], 24[C], 6[N], 1[F],
ASP	364	OD1	10	5	2[N], 4[C], 4[O],
ARG	366	NE	31	5	20[C], 5[O], 1[F], 5[N],
ARG	366	CG	4	5	4[O],
ARG	366	CZ	64	5	38[C], 19[O], 1[F], 6[N],
ARG	366	CD	14	5	1[N], 1[F], 4[O], 8[C],
ASP	372	OD2	104	5	9[N], 1[F], 36[O], 58[C],
ASP	372	OD1	96	5	58[C], 31[O], 1[F], 6[N],
ASP	372	CG	98	5	6[N], 1[F], 33[O], 58[C],
TRP	373	CG	4	5	2[C], 2[O],
TRP	373	CD2	4	5	4[O],
TRP	373	CZ3	13	5	9[O], 4[C],
TRP	373	CE3	12	5	5[C], 7[O],
TRP	373	CD1	3	5	1[O], 2[C],
ILE	376	CD1	7	5	5[O], 2[C],
LYS	404	NZ	3	5	1[C], 2[O],
VAL	414	CG1	12	5	8[C], 4[O],
ILE	416	CG2	43	5	6[N], 26[C], 11[O],
ILE	416	CG1	63	5	6[N], 1[F], 18[O], 38[C],
ILE	416	CD1	71	5	1[F], 6[N], 45[C], 19[O],
ASP	417	CG	81	5	24[O], 50[C], 6[N], 1[F],
ASP	417	OD2	92	5	1[F], 6[N], 56[C], 29[O],
ASP	417	OD1	84	5	28[O], 49[C], 6[N], 1[F],
ASP	434	CG	28	5	14[C], 8[O], 6[N],
ASP	434	OD2	44	5	6[N], 27[C], 11[O],
ASP	434	OD1	19	5	5[N], 4[O], 10[C],
PHE	436	CG	15	5	5[O], 10[C],
PHE	436	CE2	20	5	13[C], 5[O], 2[N],
PHE	436	CD1	18	5	5[O], 10[C], 3[N],
PHE	436	CZ	21	5	5[N], 11[C], 5[O],
PHE	436	CD2	14	5	7[C], 5[O], 2[N],
PHE	436	CE1	21	5	4[N], 12[C], 5[O],
ILE	442	CD1	66	5	37[C], 21[O], 8[N],
ILE	442	CG1	62	5	18[O], 37[C], 7[N],
ILE	442	CG2	79	5	25[O], 46[C], 8[N],
PHE	443	CE1	47	5	5[N], 17[O], 25[C],
PHE	443	CD2	50	5	14[O], 30[C], 6[N],
PHE	443	CG	30	5	2[N], 17[C], 11[O],
PHE	443	CE2	73	5	7[N], 23[O], 43[C],
PHE	443	CD1	33	5	3[N], 12[O], 18[C],
PHE	443	CZ	70	5	20[O], 43[C], 7[N],
SER	534	OG	4	5	4[C],
PHE	565	CD1	38	5	11[O], 22[C], 5[N],
PHE	565	CG	39	5	23[C], 11[O], 5[N],
PHE	565	CZ	64	5	17[O], 40[C], 7[N],
PHE	565	CE2	59	5	6[N], 17[O], 36[C],
PHE	565	CD2	48	5	6[N], 17[O], 25[C],
PHE	565	CE1	55	5	5[N], 15[O], 35[C],
VAL	568	CG2	7	5	3[N], 4[C],
PRO	570	CD	54	5	12[O], 36[C], 6[N],
PRO	570	CG	53	5	13[O], 33[C], 6[N], 1[F],
TYR	590	CD2	42	5	6[N], 10[O], 26[C],
TYR	590	CZ	86	5	9[N], 52[C], 25[O],
TYR	590	CG	25	5	16[C], 7[O], 2[N],
TYR	590	CE2	74	5	8[N], 22[O], 44[C],
TYR	590	CE1	71	5	43[C], 21[O], 7[N],
TYR	590	CD1	44	5	6[N], 30[C], 8[O],
THR	592	CG2	11	5	6[C], 3[O], 2[N],
THR	592	OG1	1	5	1[C],
HIS	597	CE1	4	5	4[C],
HIS	597	ND1	1	5	1[C],
HIS	597	NE2	3	5	3[C],
LEU	598	CD2	41	5	14[O], 23[C], 4[N],
LEU	598	CG	28	5	11[O], 14[C], 3[N],
LEU	598	CD1	36	5	13[O], 20[C], 3[N],
GLN	602	OE1	49	5	16[O], 28[C], 5[N],
GLN	602	CG	28	5	3[N], 17[C], 8[O],
GLN	602	CD	38	5	23[C], 12[O], 3[N],
GLN	602	NE2	33	5	3[N], 12[O], 18[C],
GLN	644	OE1	9	5	3[N], 3[O], 3[C],
GLN	644	NE2	6	5	3[N], 3[O],
GLN	644	CD	6	5	3[N], 3[O],
THR	646	OG1	44	5	3[N], 24[C], 17[O],
THR	646	CG2	25	5	7[O], 15[C], 3[N],
GLU	647	OE2	104	5	58[C], 36[O], 1[F], 9[N],
GLU	647	CD	101	5	1[F], 9[N], 56[C], 35[O],
GLU	647	OE1	87	5	46[C], 31[O], 1[F], 9[N],
GLU	647	CG	92	5	56[C], 29[O], 7[N],
ARG	663	CD	59	5	22[O], 34[C], 3[N],
ARG	663	CG	22	5	2[N], 14[O], 6[C],
ARG	663	CZ	83	5	7[N], 1[F], 27[O], 48[C],
ARG	663	NE	71	5	3[N], 27[O], 41[C],
LEU	665	CD2	1	5	1[N],
LEU	665	CD1	1	5	1[N],
LEU	665	CG	1	5	1[N],
TYR	695	CD1	22	5	12[O], 7[C], 3[N],
TYR	695	CE2	49	5	3[N], 28[C], 18[O],
TYR	695	CZ	46	5	3[N], 25[C], 18[O],
TYR	695	CE1	29	5	3[N], 13[C], 13[O],
TYR	695	CD2	36	5	3[N], 17[C], 16[O],
TYR	695	CG	21	5	12[O], 6[C], 3[N],
VAL	696	CG2	28	5	14[C], 14[O],
VAL	696	CG1	7	5	7[O],
GLN	697	CG	12	5	8[C], 4[O],
ARG	721	CZ	49	5	30[C], 17[O], 1[F], 1[N],
ARG	721	NE	32	5	1[F], 15[O], 16[C],
ARG	721	CG	15	5	10[O], 5[C],
ARG	721	CD	20	5	10[C], 10[O],
TYR	752	CZ	82	5	6[N], 1[F], 29[O], 46[C],
TYR	752	CD2	59	5	32[C], 20[O], 1[F], 6[N],
TYR	752	CE1	71	5	39[C], 25[O], 1[F], 6[N],
TYR	752	CE2	80	5	44[C], 29[O], 1[F], 6[N],
TYR	752	CG	49	5	18[O], 29[C], 1[N], 1[F],
TYR	752	CD1	53	5	20[O], 31[C], 1[N], 1[F],
GLU	768	OE1	33	5	1[F], 19[C], 13[O],
GLU	768	OE2	29	5	9[O], 18[C], 1[N], 1[F],
GLU	768	CG	3	5	3[O],
GLU	768	CD	22	5	1[F], 13[C], 8[O],
TYR	777	CZ	4	5	4[O],
TYR	777	CE2	10	5	4[O], 6[C],
TYR	777	CD2	4	5	4[O],
Total = 119


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.