Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 3 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: HMG_A_2(5HWO) / Model_5(5HWO/A) = [9.2]	Download	1748.34	26.29	MNDKTEVNMTIGIDKIGFATSQYVLKLQDLAEARGIDPEKLSKGLLLKELSIAPLTEDIVTLAASASDSILTEQERQEVDMVIVATESGIDQSKAAAVFVHGLLGIQPFARSFEIKEACYGATAALHYAKLHVENSPESKVLVIASDIAKYGIETPGEPTQGAGSVAMLITQNPRMMAFNNDNVAQTRDIMDFWRPNYSTTPYVNGVYSTQQYLDSLKTTWLEYQKRYQLTLDDFAAVCFHLPYPKLALKGLKKIMDKSLPQEKKDLLQKHFDQSILYSQKVGNIYTGSLFLGLLSLLENTDSLKAGDKIVLYSYGSGAVAEFFSGELVEGYEAYLDKDRLNKLNQRTALSVADYEKVFFEEVNLDETNSAQFAGYENQDFALVEILDHQRRYSKVEK
Complex: CAA_A_2(5HWQ) / Model_6(5HWQ/A) = [8.9]	Download	1819.03	30.82	MNDKTEVNMTIGIDKIGFATSQYVLKLQDLAEARGIDPEKLSKGLLLKELSIAPLTEDIVTLAASASDSILTEQERQEVDMVIVATESGIDQSKAAAVFVHGLLGIQPFARSFEIKEACYGATAALHYAKLHVENSPESKVLVIASDIAKYGIETPGEPTQGAGSVAMLITQNPRMMAFNNDNVAQTRDIMDFWRPNYSTTPYVNGVYSTQQYLDSLKTTWLEYQKRYQLTLDDFAAVCFHLPYPKLALKGLKKIMDKSLPQEKKDLLQKHFDQSILYSQKVGNIYTGSLFLGLLSLLENTDSLKAGDKIVLYSYGSGAVAEFFSGELVEGYEAYLDKDRLNKLNQRTALSVADYEKVFFEEVNLDETNSAQFAGYENQDFALVEILDHQRRYSKVEK
Complex: COA_A_4(5HWP) / Model_8(5HWP/A) = [6.6]	Download	2250.96	31.86	MNDKTEVNMTIGIDKIGFATSQYVLKLQDLAEARGIDPEKLSKGLLLKELSIAPLTEDIVTLAASASDSILTEQERQEVDMVIVATESGIDQSKAAAVFVHGLLGIQPFARSFEIKEACYGATAALHYAKLHVENSPESKVLVIASDIAKYGIETPGEPTQGAGSVAMLITQNPRMMAFNNDNVAQTRDIMDFWRPNYSTTPYVNGVYSTQQYLDSLKTTWLEYQKRYQLTLDDFAAVCFHLPYPKLALKGLKKIMDKSLPQEKKDLLQKHFDQSILYSQKVGNIYTGSLFLGLLSLLENTDSLKAGDKIVLYSYGSGAVAEFFSGELVEGYEAYLDKDRLNKLNQRTALSVADYEKVFFEEVNLDETNSAQFAGYENQDFALVEILDHQRRYSKVEK
Consensus [pKd Mean = 8.23]	-	1939 (s=222)	29 (s=2)	MNDKTEVNMTIGIDKIGFATSQYVLKLQDLAEARGIDPEKLSKGLLLKELSIAPLTEDIVTLAASASDSILTEQERQEVDMVIVATESGIDQSKAAAVFVHGLLGIQPFARSFEIKEACYGATAALHYAKLHVENSPESKVLVIASDIAKYGIETPGEPTQGAGSVAMLITQNPRMMAFNNDNVAQTRDIMDFWRPNYSTTPYVNGVYSTQQYLDSLKTTWLEYQKRYQLTLDDFAAVCFHLPYPKLALKGLKKIMDKSLPQEKKDLLQKHFDQSILYSQKVGNIYTGSLFLGLLSLLENTDSLKAGDKIVLYSYGSGAVAEFFSGELVEGYEAYLDKDRLNKLNQRTALSVADYEKVFFEEVNLDETNSAQFAGYENQDFALVEILDHQRRYSKVEK

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
ILE	36	CD1	3	3	3[O],
ILE	36	CG1	3	3	3[O],
ILE	36	CG2	19	3	3[O], 9[C], 7[N],
ASP	37	CG	30	3	15[N], 15[C],
ASP	37	OD2	30	3	15[C], 15[N],
ASP	37	OD1	27	3	12[N], 15[C],
PRO	38	CD	5	3	3[N], 2[C],
GLU	39	CD	24	3	12[C], 12[N],
GLU	39	OE2	18	3	9[N], 9[C],
GLU	39	CG	24	3	12[N], 12[C],
GLU	39	OE1	28	3	13[C], 15[N],
LYS	40	CE	93	3	12[N], 42[C], 6[P], 33[O],
LYS	40	CG	84	3	15[N], 33[C], 6[P], 30[O],
LYS	40	NZ	81	3	30[O], 6[P], 39[C], 6[N],
LYS	40	CD	85	3	15[N], 33[C], 6[P], 31[O],
LEU	41	CD2	13	3	11[O], 2[C],
LYS	43	CD	35	3	3[O], 15[N], 17[C],
LYS	43	CG	46	3	23[C], 15[N], 8[O],
LYS	43	NZ	20	3	12[C], 8[N],
LYS	43	CE	27	3	15[C], 12[N],
LEU	45	CD1	59	3	6[P], 22[O], 28[C], 3[N],
LEU	45	CG	79	3	6[N], 39[C], 28[O], 6[P],
LEU	45	CD2	96	3	6[N], 39[C], 9[P], 42[O],
LEU	46	CD1	1	3	1[O],
LEU	47	CD1	3	3	3[O],
GLU	87	OE2	12	3	8[C], 4[O],
GLU	87	OE1	13	3	4[O], 9[C],
GLU	87	CD	12	3	4[O], 8[C],
GLU	87	CG	7	3	4[O], 3[C],
GLU	117	CG	1	3	1[O],
CYS	119	SG	19	3	2[S], 6[O], 11[C],
ASP	147	OD1	1	3	1[O],
ASP	147	CG	1	3	1[O],
ASP	147	OD2	2	3	1[O], 1[C],
TYR	151	CE2	37	3	20[C], 6[N], 11[O],
TYR	151	CD2	29	3	17[C], 3[N], 9[O],
TYR	151	CZ	52	3	12[O], 3[S], 31[C], 6[N],
TYR	151	CD1	32	3	5[N], 18[C], 9[O],
TYR	151	CE1	42	3	12[O], 24[C], 6[N],
TYR	151	CG	29	3	9[O], 3[N], 17[C],
THR	155	OG1	15	3	6[C], 3[N], 6[O],
PRO	156	CG	44	3	18[O], 3[P], 20[C], 3[N],
PRO	156	CD	37	3	16[C], 3[N], 3[P], 15[O],
PRO	159	CD	36	3	18[C], 3[N], 3[P], 12[O],
PRO	159	CG	39	3	15[O], 3[P], 3[N], 18[C],
THR	160	OG1	54	3	6[N], 34[C], 14[O],
THR	160	CG2	52	3	12[O], 2[P], 6[N], 32[C],
ILE	190	CD1	2	3	2[S],
ASP	192	OD2	34	3	3[S], 6[O], 22[C], 3[N],
ASP	192	OD1	16	3	11[C], 3[S], 2[O],
ASP	192	CG	23	3	13[C], 3[N], 3[S], 4[O],
PHE	193	CG	40	3	9[O], 3[S], 25[C], 3[N],
PHE	193	CE2	39	3	3[S], 11[O], 19[C], 6[N],
PHE	193	CD2	49	3	3[S], 12[O], 28[C], 6[N],
PHE	193	CE1	20	3	3[S], 4[O], 13[C],
PHE	193	CZ	29	3	19[C], 7[O], 3[S],
PHE	193	CD1	29	3	1[N], 19[C], 3[S], 6[O],
PRO	202	CG	7	3	6[C], 1[O],
VAL	204	CG2	59	3	3[S], 11[O], 6[N], 39[C],
VAL	204	CG1	39	3	24[C], 6[N], 9[O],
ASN	205	OD1	6	3	3[O], 3[C],
VAL	207	CG2	37	3	19[O], 4[P], 14[C],
VAL	207	CG1	23	3	9[C], 12[O], 2[P],
SER	209	OG	63	3	3[S], 13[O], 6[N], 41[C],
THR	210	OG1	62	3	6[N], 35[C], 18[O], 3[S],
THR	210	CG2	25	3	3[S], 5[O], 14[C], 3[N],
GLN	212	CG	2	3	2[S],
TYR	213	CD2	32	3	3[N], 18[C], 3[S], 8[O],
TYR	213	CG	23	3	3[S], 4[O], 13[C], 3[N],
TYR	213	CE1	15	3	2[O], 3[S], 10[C],
TYR	213	CZ	16	3	3[O], 3[S], 10[C],
TYR	213	CD1	15	3	3[S], 2[O], 10[C],
TYR	213	CE2	28	3	3[N], 15[C], 3[S], 7[O],
LEU	214	CG	2	3	2[C],
HIS	241	CD2	34	3	19[C], 3[N], 3[S], 9[O],
HIS	241	CE1	28	3	3[S], 9[O], 16[C],
HIS	241	ND1	19	3	10[C], 3[S], 6[O],
HIS	241	NE2	34	3	9[O], 3[S], 19[C], 3[N],
HIS	241	CG	25	3	16[C], 6[O], 3[S],
PRO	243	CG	45	3	8[O], 3[S], 28[C], 6[N],
PRO	243	CD	34	3	7[O], 3[S], 3[N], 21[C],
TYR	244	CZ	82	3	6[N], 41[C], 3[P], 3[S], 29[O],
TYR	244	CD1	51	3	6[N], 30[C], 3[P], 12[O],
TYR	244	CG	58	3	6[N], 37[C], 14[O], 1[S],
TYR	244	CE2	73	3	6[N], 43[C], 3[S], 21[O],
TYR	244	CD2	69	3	6[N], 41[C], 19[O], 3[S],
TYR	244	CE1	67	3	33[C], 5[N], 3[P], 26[O],
LYS	246	CD	29	3	11[C], 15[O], 3[P],
LYS	246	CG	32	3	14[C], 3[P], 15[O],
LYS	246	CE	38	3	17[O], 3[P], 15[C], 3[N],
LYS	246	NZ	42	3	18[O], 3[P], 17[C], 4[N],
LEU	247	CG	29	3	3[N], 16[C], 7[O], 3[S],
LEU	247	CD2	36	3	3[S], 7[O], 3[N], 23[C],
LEU	247	CD1	26	3	5[O], 3[S], 15[C], 3[N],
LEU	249	CD2	4	3	4[O],
LEU	249	CG	1	3	1[O],
LYS	250	CE	40	3	21[O], 3[P], 16[C],
LYS	250	CG	15	3	3[P], 12[O],
LYS	250	NZ	43	3	14[C], 24[O], 5[P],
LYS	250	CD	24	3	9[C], 3[P], 12[O],
LYS	253	NZ	3	3	3[O],
ASN	284	CG	38	3	23[C], 4[N], 9[O], 2[S],
ASN	284	ND2	43	3	9[O], 3[S], 6[N], 25[C],
ASN	284	OD1	27	3	1[N], 16[C], 9[O], 1[S],
TYR	286	CD2	11	3	4[O], 7[C],
TYR	286	CE1	29	3	19[C], 9[O], 1[S],
TYR	286	CG	12	3	8[C], 4[O],
TYR	286	CZ	17	3	12[C], 5[O],
TYR	286	CE2	10	3	6[C], 4[O],
TYR	286	CD1	22	3	12[C], 1[S], 9[O],
THR	287	CG2	3	3	1[C], 2[O],
SER	289	OG	6	3	2[C], 4[O],
TYR	313	CE2	2	3	2[O],
TYR	315	CE1	16	3	3[O], 3[S], 10[C],
TYR	315	CD2	28	3	3[S], 6[O], 3[N], 16[C],
TYR	315	CZ	27	3	2[N], 16[C], 3[S], 6[O],
TYR	315	CD1	16	3	10[C], 3[O], 3[S],
TYR	315	CG	25	3	6[O], 3[S], 16[C],
TYR	315	CE2	30	3	6[O], 3[S], 3[N], 18[C],
SER	317	OG	37	3	3[N], 22[C], 3[S], 9[O],
Total = 120


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.