Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C3_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 4 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C3_S1
Complex: DLY_A_7(2ATS) / Model_43(2ATS/B) = [4.0]	Download	1540.98	15.86	MTQQAQTIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
Complex: 3OH_B_4(3S8H) / Model_151(3S8H/B) = [3.6]	Download	285.76	20.33	MTQQAQTIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
Complex: 3VN_B_13(5F1V) / Model_97(5F1V/B) = [3.6]	Download	924.49	24.80	MTQQAQTIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
Complex: LYS_B_7(1YXD) / Model_46(1YXD/A) = [3.5]	Download	9272.10	24.99	MTQQAQTIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
Consensus [pKd Mean = 3.67]	-	3005 (s=3644)	21 (s=3)	MTQQAQTIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
ILE	12	O	1	4	1[O],
VAL	13	C	1	4	1[O],
ALA	14	N	2	4	1[O], 1[C],
ALA	14	C	2	4	1[O], 1[C],
ALA	14	CB	6	4	3[C], 3[O],
ALA	14	CA	3	4	2[C], 1[O],
ALA	14	O	3	4	1[O], 2[C],
VAL	48	CB	6	4	3[N], 3[C],
VAL	48	O	6	4	3[C], 3[N],
VAL	48	C	3	4	3[N],
VAL	48	CA	3	4	3[N],
VAL	48	CG1	10	4	7[C], 3[N],
VAL	48	CG2	4	4	1[C], 3[N],
GLY	49	O	1	4	1[N],
THR	50	CG2	6	4	3[O], 3[C],
THR	50	CA	6	4	3[O], 3[C],
THR	50	CB	6	4	3[O], 3[C],
THR	50	O	4	4	2[O], 2[C],
THR	50	C	6	4	3[O], 3[C],
THR	50	OG1	6	4	3[C], 3[O],
THR	50	N	6	4	3[C], 3[O],
THR	51	CB	6	4	3[C], 3[O],
THR	51	OG1	6	4	3[O], 3[C],
THR	51	N	6	4	3[C], 3[O],
THR	51	CA	6	4	3[O], 3[C],
THR	51	CG2	5	4	2[O], 3[C],
GLY	52	O	1	4	1[N],
GLU	53	O	18	4	6[N], 3[O], 9[C],
GLU	53	CA	3	4	3[N],
GLU	53	C	12	4	3[N], 6[C], 3[O],
ALA	54	N	17	4	10[C], 4[O], 3[N],
ALA	54	C	31	4	6[O], 19[C], 6[N],
ALA	54	CA	30	4	18[C], 6[O], 6[N],
ALA	54	CB	30	4	18[C], 6[O], 6[N],
ALA	54	O	32	4	6[N], 20[C], 6[O],
SER	55	C	33	4	6[N], 20[C], 7[O],
SER	55	OG	32	4	6[N], 19[C], 7[O],
SER	55	O	41	4	26[C], 9[O], 6[N],
SER	55	CA	34	4	6[N], 20[C], 8[O],
SER	55	CB	34	4	6[N], 20[C], 8[O],
SER	55	N	31	4	6[N], 6[O], 19[C],
THR	56	CA	29	4	4[O], 19[C], 6[N],
THR	56	CG2	10	4	3[O], 4[C], 3[N],
THR	56	N	31	4	6[N], 6[O], 19[C],
THR	56	O	19	4	6[N], 13[C],
THR	56	CB	14	4	5[N], 6[C], 3[O],
THR	56	OG1	5	4	5[N],
THR	56	C	27	4	6[N], 18[C], 3[O],
LEU	57	CG	11	4	8[C], 3[N],
LEU	57	CD2	6	4	3[N], 3[C],
LEU	57	N	27	4	6[N], 18[C], 3[O],
LEU	57	CA	21	4	6[N], 15[C],
LEU	57	CD1	5	4	3[N], 2[C],
LEU	57	C	27	4	6[N], 3[O], 18[C],
LEU	57	O	31	4	6[N], 19[C], 6[O],
LEU	57	CB	17	4	5[N], 12[C],
SER	58	CA	21	4	15[C], 6[N],
SER	58	O	15	4	3[N], 12[C],
SER	58	C	20	4	14[C], 6[N],
SER	58	CB	17	4	12[C], 5[N],
SER	58	N	20	4	14[C], 6[N],
SER	58	OG	11	4	8[C], 3[N],
MET	59	N	20	4	5[N], 15[C],
MET	59	CE	12	4	8[C], 1[O], 3[N],
MET	59	CA	15	4	12[C], 3[N],
MET	59	CB	15	4	3[N], 12[C],
MET	59	SD	22	4	4[N], 17[C], 1[O],
MET	59	O	10	4	7[C], 3[N],
MET	59	CG	21	4	3[N], 17[C], 1[O],
MET	59	C	12	4	9[C], 3[N],
GLU	60	C	3	4	2[C], 1[N],
GLU	60	OE2	2	4	2[C],
GLU	60	N	9	4	6[C], 3[N],
GLU	60	CA	3	4	3[C],
GLU	61	CB	6	4	3[N], 3[C],
GLU	61	CA	4	4	2[C], 2[N],
GLU	61	OE1	4	4	2[N], 2[C],
GLU	61	C	6	4	3[N], 3[C],
GLU	61	N	6	4	3[N], 3[C],
GLU	61	O	2	4	2[N],
HIS	62	CD2	10	4	7[C], 3[N],
HIS	62	C	6	4	3[N], 3[C],
HIS	62	CB	12	4	3[N], 9[C],
HIS	62	NE2	11	4	8[C], 3[N],
HIS	62	CA	9	4	6[C], 3[N],
HIS	62	ND1	17	4	13[C], 1[O], 3[N],
HIS	62	CG	12	4	9[C], 3[N],
HIS	62	CE1	14	4	3[N], 1[O], 10[C],
HIS	62	O	6	4	3[C], 3[N],
HIS	62	N	9	4	3[N], 6[C],
THR	63	N	6	4	3[N], 3[C],
THR	63	OG1	1	4	1[C],
GLY	82	O	5	4	3[N], 2[C],
GLY	82	C	3	4	3[N],
THR	83	N	1	4	1[N],
THR	83	O	3	4	1[N], 2[C],
THR	83	CA	5	4	3[N], 2[C],
THR	83	C	5	4	2[C], 3[N],
GLY	84	O	28	4	19[C], 6[O], 3[N],
GLY	84	C	21	4	12[C], 6[O], 3[N],
GLY	84	N	5	4	3[N], 2[C],
GLY	84	CA	3	4	2[O], 1[N],
ALA	85	C	25	4	3[N], 13[C], 9[O],
ALA	85	CA	40	4	9[O], 25[C], 6[N],
ALA	85	O	7	4	3[N], 1[C], 3[O],
ALA	85	N	18	4	6[O], 8[C], 4[N],
ALA	85	CB	44	4	29[C], 9[O], 6[N],
ASN	86	CG	41	4	12[O], 25[C], 4[N],
ASN	86	ND2	43	4	12[O], 26[C], 5[N],
ASN	86	C	24	4	12[C], 9[O], 3[N],
ASN	86	CA	29	4	3[N], 12[O], 14[C],
ASN	86	O	16	4	7[C], 6[O], 3[N],
ASN	86	N	37	4	3[N], 12[O], 22[C],
ASN	86	OD1	48	4	12[O], 30[C], 6[N],
ASN	86	CB	34	4	3[N], 19[C], 12[O],
SER	87	O	11	4	4[N], 1[O], 6[C],
SER	87	CA	22	4	6[O], 12[C], 4[N],
SER	87	N	29	4	3[N], 17[C], 9[O],
SER	87	OG	23	4	16[C], 3[O], 4[N],
SER	87	CB	29	4	4[N], 17[C], 8[O],
SER	87	C	10	4	6[C], 4[N],
THR	88	CA	9	4	1[N], 2[O], 6[C],
THR	88	C	10	4	2[O], 6[C], 2[N],
THR	88	CG2	9	4	2[O], 6[C], 1[N],
THR	88	OG1	6	4	3[C], 2[O], 1[N],
THR	88	N	8	4	3[C], 1[O], 4[N],
THR	88	CB	9	4	1[N], 6[C], 2[O],
THR	88	O	10	4	2[N], 6[C], 2[O],
ARG	89	CZ	7	4	2[N], 5[C],
ARG	89	CA	10	4	2[O], 6[C], 2[N],
ARG	89	NE	8	4	6[C], 2[N],
ARG	89	N	10	4	6[C], 2[O], 2[N],
ARG	89	CB	10	4	2[N], 2[O], 6[C],
ARG	89	O	7	4	2[N], 5[C],
ARG	89	CG	10	4	6[C], 2[O], 2[N],
ARG	89	CD	10	4	2[N], 2[O], 6[C],
ARG	89	C	8	4	2[N], 6[C],
GLU	90	CA	11	4	6[C], 5[N],
GLU	90	O	6	4	5[C], 1[N],
GLU	90	CD	60	4	10[N], 12[O], 38[C],
GLU	90	C	4	4	2[N], 2[C],
GLU	90	OE2	59	4	12[O], 38[C], 9[N],
GLU	90	N	10	4	5[C], 5[N],
GLU	90	OE1	59	4	9[N], 12[O], 38[C],
GLU	90	CB	36	4	3[O], 29[C], 4[N],
GLU	90	CG	44	4	6[O], 35[C], 3[N],
ALA	91	N	2	4	1[C], 1[N],
ALA	91	C	3	4	1[N], 2[C],
ALA	91	O	1	4	1[N],
ILE	92	CD1	10	4	6[C], 2[O], 2[N],
ILE	92	CB	7	4	2[N], 5[C],
ILE	92	O	3	4	1[N], 2[C],
ILE	92	CG2	7	4	2[N], 5[C],
ILE	92	CA	5	4	4[C], 1[N],
ILE	92	N	6	4	4[C], 2[N],
ILE	92	C	5	4	4[C], 1[N],
ILE	92	CG1	9	4	2[N], 6[C], 1[O],
GLU	93	OE2	5	4	4[C], 1[N],
GLU	93	CG	5	4	4[C], 1[N],
GLU	93	CB	3	4	1[N], 2[C],
GLU	93	N	5	4	4[C], 1[N],
GLU	93	O	1	4	1[N],
GLU	93	CA	3	4	2[C], 1[N],
GLU	93	OE1	3	4	2[C], 1[N],
GLU	93	C	2	4	1[N], 1[C],
GLU	93	CD	5	4	1[N], 4[C],
LEU	94	CD2	15	4	3[N], 2[O], 10[C],
LEU	94	CA	2	4	2[C],
LEU	94	N	1	4	1[N],
LEU	94	CD1	14	4	10[C], 1[O], 3[N],
LEU	94	CB	8	4	5[C], 3[N],
LEU	94	CG	11	4	3[N], 8[C],
LYS	96	CE	4	4	3[C], 1[N],
LYS	96	CB	1	4	1[N],
LYS	96	NZ	5	4	1[N], 4[C],
LYS	96	CG	3	4	2[C], 1[N],
LYS	96	CD	3	4	2[C], 1[N],
LEU	107	CD2	2	4	1[O], 1[C],
VAL	109	CG1	1	4	1[O],
TYR	112	CE1	41	4	24[C], 11[O], 6[N],
TYR	112	CD2	29	4	13[C], 12[O], 4[N],
TYR	112	CA	5	4	5[O],
TYR	112	N	6	4	6[O],
TYR	112	CD1	30	4	15[C], 11[O], 4[N],
TYR	112	O	20	4	3[N], 10[O], 7[C],
TYR	112	CB	12	4	3[C], 9[O],
TYR	112	CG	28	4	3[N], 14[C], 11[O],
TYR	112	C	8	4	5[O], 3[C],
TYR	112	CE2	40	4	12[O], 22[C], 6[N],
TYR	112	CZ	50	4	29[C], 12[O], 9[N],
TYR	113	CG	9	4	3[C], 6[O],
TYR	113	N	3	4	3[O],
TYR	113	C	3	4	3[O],
TYR	113	CD1	4	4	4[O],
TYR	113	CB	11	4	6[O], 4[C], 1[N],
TYR	113	CE1	3	4	3[O],
TYR	113	CA	3	4	3[O],
TYR	113	CZ	5	4	1[C], 4[O],
TYR	113	CE2	11	4	1[N], 4[C], 6[O],
TYR	113	CD2	13	4	5[C], 6[O], 2[N],
ASN	114	ND2	9	4	3[O], 3[C], 3[N],
ASN	114	N	3	4	3[O],
ASN	114	CB	3	4	3[O],
ASN	114	OD1	4	4	3[O], 1[N],
ASN	114	CA	2	4	2[O],
ASN	114	CG	6	4	3[O], 3[N],
HIS	124	ND1	1	4	1[N],
ALA	127	C	1	4	1[C],
ALA	127	CA	1	4	1[C],
ALA	127	CB	8	4	1[N], 2[O], 5[C],
ALA	127	O	2	4	2[C],
ALA	131	CB	1	4	1[C],
TYR	139	CD1	6	4	3[C], 3[O],
TYR	139	CG	5	4	2[O], 3[C],
TYR	139	CE1	6	4	3[C], 3[O],
TYR	139	CE2	6	4	3[C], 3[O],
TYR	139	CD2	5	4	3[C], 2[O],
TYR	139	CZ	6	4	3[C], 3[O],
ASN	140	C	1	4	1[O],
ASN	140	O	1	4	1[O],
VAL	141	O	2	4	1[O], 1[C],
VAL	141	CB	6	4	3[O], 3[C],
VAL	141	CG2	6	4	3[C], 3[O],
VAL	141	CA	4	4	2[O], 2[C],
VAL	141	CG1	5	4	3[C], 2[O],
VAL	141	N	1	4	1[O],
VAL	141	C	2	4	1[C], 1[O],
GLY	143	C	1	4	1[O],
ARG	144	CZ	5	4	3[C], 2[O],
ARG	144	NE	6	4	3[C], 3[O],
ARG	144	CB	3	4	2[O], 1[C],
ARG	144	CG	4	4	2[C], 2[O],
ARG	144	CA	2	4	2[O],
ARG	144	N	2	4	2[O],
ARG	144	CD	5	4	3[C], 2[O],
LYS	167	CG	5	4	3[C], 2[O],
LYS	167	CB	2	4	1[C], 1[O],
LYS	167	NZ	6	4	3[O], 3[C],
LYS	167	O	1	4	1[C],
LYS	167	CE	6	4	3[C], 3[O],
LYS	167	CD	5	4	3[C], 2[O],
ASP	168	C	1	4	1[C],
ASP	168	O	2	4	1[C], 1[O],
ALA	169	CB	6	4	3[O], 3[C],
ALA	169	N	3	4	2[O], 1[C],
ALA	169	C	4	4	1[O], 3[C],
ALA	169	CA	6	4	3[O], 3[C],
ALA	169	O	6	4	3[C], 3[O],
THR	170	N	1	4	1[O],
SER	191	C	3	4	2[C], 1[O],
SER	191	CA	2	4	1[C], 1[O],
SER	191	CB	1	4	1[O],
SER	191	O	3	4	1[O], 2[C],
SER	191	OG	2	4	1[C], 1[O],
GLY	192	O	6	4	3[O], 3[C],
GLY	192	C	6	4	3[O], 3[C],
GLY	192	CA	6	4	3[C], 3[O],
GLY	192	N	5	4	3[C], 2[O],
ASP	193	O	2	4	1[C], 1[O],
ASP	193	CA	6	4	3[C], 3[O],
ASP	193	OD1	5	4	3[C], 2[O],
ASP	193	CB	5	4	3[C], 2[O],
ASP	193	C	4	4	3[C], 1[O],
ASP	193	N	6	4	3[C], 3[O],
ASP	194	N	4	4	1[O], 3[C],
ASP	194	OD1	3	4	2[C], 1[O],
ASP	194	OD2	5	4	2[O], 3[C],
ASP	194	CG	3	4	2[C], 1[O],
ASP	194	CB	3	4	1[O], 2[C],
ASP	194	CA	3	4	1[O], 2[C],
ASN	208	C	2	4	1[C], 1[O],
ASN	208	CA	1	4	1[O],
ASN	208	CG	2	4	1[O], 1[C],
ASN	208	OD1	3	4	2[C], 1[O],
ASN	208	O	1	4	1[O],
ASN	208	ND2	1	4	1[O],
ASN	208	CB	1	4	1[O],
ILE	209	CG1	2	4	1[O], 1[C],
ILE	209	CD1	1	4	1[O],
ILE	209	CG2	3	4	1[O], 2[C],
ILE	209	CB	3	4	1[O], 2[C],
ILE	209	N	2	4	1[O], 1[C],
ILE	209	O	6	4	3[O], 3[C],
ILE	209	C	4	4	1[O], 3[C],
ILE	209	CA	3	4	1[O], 2[C],
SER	210	N	3	4	2[C], 1[O],
SER	210	CA	3	4	2[C], 1[O],
SER	210	C	3	4	2[C], 1[O],
SER	210	OG	1	4	1[O],
SER	210	CB	2	4	1[O], 1[C],
SER	210	O	3	4	1[O], 2[C],
VAL	211	C	3	4	2[C], 1[O],
VAL	211	N	5	4	3[C], 2[O],
VAL	211	CB	6	4	3[C], 3[O],
VAL	211	CG1	5	4	3[C], 2[O],
VAL	211	CA	5	4	2[O], 3[C],
VAL	211	O	1	4	1[O],
VAL	211	CG2	6	4	3[O], 3[C],
THR	212	N	2	4	1[O], 1[C],
ASN	214	ND2	1	4	1[O],
LEU	249	O	1	4	1[O],
PHE	250	CE2	6	4	3[C], 3[O],
PHE	250	CG	3	4	1[O], 2[C],
PHE	250	CZ	6	4	3[O], 3[C],
PHE	250	CE1	6	4	3[C], 3[O],
PHE	250	CD1	6	4	3[C], 3[O],
PHE	250	CD2	5	4	3[C], 2[O],
PHE	250	CB	1	4	1[O],
SER	253	O	1	4	1[O],
SER	253	CB	1	4	1[O],
SER	253	CA	1	4	1[O],
SER	253	C	1	4	1[O],
ASN	254	ND2	6	4	3[O], 3[C],
ASN	254	CB	6	4	3[O], 3[C],
ASN	254	OD1	6	4	3[C], 3[O],
ASN	254	N	4	4	2[O], 2[C],
ASN	254	O	4	4	2[O], 2[C],
ASN	254	CG	6	4	3[O], 3[C],
ASN	254	C	4	4	2[C], 2[O],
ASN	254	CA	4	4	2[O], 2[C],
PRO	255	N	3	4	1[O], 2[C],
PRO	255	CD	2	4	1[O], 1[C],
PRO	255	CB	1	4	1[O],
PRO	255	CA	1	4	1[O],
Total = 324


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.