Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: PEP_B_8(1ONE) / Model_112(1ONE/B) = [6.9]	Download	162.55	-8.72	MFMSQIVDIRAREILDSRGNPTIEADVILESGVVGRACAPSGASTGSREALELRDGDKSRYLGKGVRTAVQNVNSSIHELLVGQSVFEQKALDEKMIAFDGTENKSKLGANATLAVSLAAAHAAAAEQKLPLFQYIANLRGQTTLTMPVPMMNILNGGAHADNTVDIQEFMIEPVGFTSFAEALRAGAEVFHSLKSVLKKQGLNTAVGDEGGFAPNLRSNEEAITVILQAIEQTGYKAGSDIMLALDCASSEFYKNGQYILEGEGNKSFTSNQFADYLAGLVKQYPIISIEDGLDESDWEGWSYLTSILGDKIQLVGDDLFVTNPKILQRGIDEKVGNSILIKYNQIGTLTETLDAIYLAKANGYTTVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVSKYNQLLRIEELTKAVYRGKAEFKGLK
Complex: 0V5_B_9(3UJS) / Model_66(3UJS/B) = [5.0]	Download	208.15	-8.72	MFMSQIVDIRAREILDSRGNPTIEADVILESGVVGRACAPSGASTGSREALELRDGDKSRYLGKGVRTAVQNVNSSIHELLVGQSVFEQKALDEKMIAFDGTENKSKLGANATLAVSLAAAHAAAAEQKLPLFQYIANLRGQTTLTMPVPMMNILNGGAHADNTVDIQEFMIEPVGFTSFAEALRAGAEVFHSLKSVLKKQGLNTAVGDEGGFAPNLRSNEEAITVILQAIEQTGYKAGSDIMLALDCASSEFYKNGQYILEGEGNKSFTSNQFADYLAGLVKQYPIISIEDGLDESDWEGWSYLTSILGDKIQLVGDDLFVTNPKILQRGIDEKVGNSILIKYNQIGTLTETLDAIYLAKANGYTTVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVSKYNQLLRIEELTKAVYRGKAEFKGLK
Complex: 6BM_A_4(5IDZ) / Model_53(5IDZ/A) = [4.8]	Download	381.08	-7.95	MFMSQIVDIRAREILDSRGNPTIEADVILESGVVGRACAPSGASTGSREALELRDGDKSRYLGKGVRTAVQNVNSSIHELLVGQSVFEQKALDEKMIAFDGTENKSKLGANATLAVSLAAAHAAAAEQKLPLFQYIANLRGQTTLTMPVPMMNILNGGAHADNTVDIQEFMIEPVGFTSFAEALRAGAEVFHSLKSVLKKQGLNTAVGDEGGFAPNLRSNEEAITVILQAIEQTGYKAGSDIMLALDCASSEFYKNGQYILEGEGNKSFTSNQFADYLAGLVKQYPIISIEDGLDESDWEGWSYLTSILGDKIQLVGDDLFVTNPKILQRGIDEKVGNSILIKYNQIGTLTETLDAIYLAKANGYTTVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVSKYNQLLRIEELTKAVYRGKAEFKGLK
Complex: 2PG_A_4(2XH7) / Model_130(2XH7/A) = [4.8]	Download	165.16	-8.72	MFMSQIVDIRAREILDSRGNPTIEADVILESGVVGRACAPSGASTGSREALELRDGDKSRYLGKGVRTAVQNVNSSIHELLVGQSVFEQKALDEKMIAFDGTENKSKLGANATLAVSLAAAHAAAAEQKLPLFQYIANLRGQTTLTMPVPMMNILNGGAHADNTVDIQEFMIEPVGFTSFAEALRAGAEVFHSLKSVLKKQGLNTAVGDEGGFAPNLRSNEEAITVILQAIEQTGYKAGSDIMLALDCASSEFYKNGQYILEGEGNKSFTSNQFADYLAGLVKQYPIISIEDGLDESDWEGWSYLTSILGDKIQLVGDDLFVTNPKILQRGIDEKVGNSILIKYNQIGTLTETLDAIYLAKANGYTTVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVSKYNQLLRIEELTKAVYRGKAEFKGLK
Complex: XSP_A_5(3UJS) / Model_67(3UJS/A) = [4.5]	Download	154.54	-8.72	MFMSQIVDIRAREILDSRGNPTIEADVILESGVVGRACAPSGASTGSREALELRDGDKSRYLGKGVRTAVQNVNSSIHELLVGQSVFEQKALDEKMIAFDGTENKSKLGANATLAVSLAAAHAAAAEQKLPLFQYIANLRGQTTLTMPVPMMNILNGGAHADNTVDIQEFMIEPVGFTSFAEALRAGAEVFHSLKSVLKKQGLNTAVGDEGGFAPNLRSNEEAITVILQAIEQTGYKAGSDIMLALDCASSEFYKNGQYILEGEGNKSFTSNQFADYLAGLVKQYPIISIEDGLDESDWEGWSYLTSILGDKIQLVGDDLFVTNPKILQRGIDEKVGNSILIKYNQIGTLTETLDAIYLAKANGYTTVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVSKYNQLLRIEELTKAVYRGKAEFKGLK
Consensus [pKd Mean = 5.20]	-	214 (s=85)	-8 (s=0)	MFMSQIVDIRAREILDSRGNPTIEADVILESGVVGRACAPSGASTGSREALELRDGDKSRYLGKGVRTAVQNVNSSIHELLVGQSVFEQKALDEKMIAFDGTENKSKLGANATLAVSLAAAHAAAAEQKLPLFQYIANLRGQTTLTMPVPMMNILNGGAHADNTVDIQEFMIEPVGFTSFAEALRAGAEVFHSLKSVLKKQGLNTAVGDEGGFAPNLRSNEEAITVILQAIEQTGYKAGSDIMLALDCASSEFYKNGQYILEGEGNKSFTSNQFADYLAGLVKQYPIISIEDGLDESDWEGWSYLTSILGDKIQLVGDDLFVTNPKILQRGIDEKVGNSILIKYNQIGTLTETLDAIYLAKANGYTTVISHRSGETEDSTIADLAVGTAAGQIKTGSLCRSDRVSKYNQLLRIEELTKAVYRGKAEFKGLK

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
ARG	18	CD	6	8	6[O],
ARG	18	NE	17	8	13[O], 4[P],
ARG	18	CZ	36	8	1[C], 27[O], 8[P],
PRO	40	CB	9	8	9[O],
PRO	40	CG	5	8	5[O],
PRO	40	O	2	8	2[O],
PRO	40	CA	2	8	2[O],
PRO	40	C	8	8	8[O],
SER	41	OG	15	8	1[P], 14[O],
SER	41	O	59	8	17[C], 33[O], 9[P],
SER	41	N	22	8	15[O], 7[P],
SER	41	CA	33	8	8[P], 25[O],
SER	41	CB	12	8	12[O],
SER	41	C	53	8	9[P], 32[O], 12[C],
GLY	42	CA	80	8	3[N], 26[C], 42[O], 9[P],
GLY	42	N	58	8	17[C], 32[O], 9[P],
GLY	42	C	75	8	9[P], 25[C], 39[O], 2[N],
GLY	42	O	45	8	32[O], 4[C], 9[P],
ALA	43	N	78	8	3[N], 26[C], 41[O], 8[P],
ALA	43	C	63	8	36[O], 18[C], 1[N], 8[P],
ALA	43	CB	65	8	37[O], 19[C], 1[N], 8[P],
ALA	43	CA	66	8	1[N], 20[C], 37[O], 8[P],
ALA	43	O	48	8	8[P], 4[C], 36[O],
SER	44	CA	75	8	8[P], 2[N], 43[O], 22[C],
SER	44	O	78	8	8[P], 22[C], 46[O], 2[N],
SER	44	N	80	8	2[N], 46[O], 24[C], 8[P],
SER	44	OG	79	8	8[P], 22[C], 47[O], 2[N],
SER	44	C	74	8	8[P], 43[O], 21[C], 2[N],
SER	44	CB	78	8	46[O], 22[C], 2[N], 8[P],
THR	45	C	39	8	7[P], 1[C], 31[O],
THR	45	O	22	8	7[P], 15[O],
THR	45	OG1	27	8	20[O], 7[P],
THR	45	CG2	44	8	7[P], 31[O], 6[C],
THR	45	CA	54	8	14[C], 33[O], 7[P],
THR	45	CB	36	8	29[O], 7[P],
THR	45	N	59	8	15[C], 35[O], 2[N], 7[P],
GLY	46	N	33	8	7[P], 25[O], 1[C],
GLY	46	CA	7	8	7[O],
GLU	49	CG	8	8	8[O],
GLU	49	CD	34	8	8[P], 26[O],
GLU	49	OE1	31	8	23[O], 8[P],
GLU	49	OE2	69	8	8[P], 2[N], 14[C], 45[O],
ASN	153	CG	13	8	3[O], 10[C],
ASN	153	CA	2	8	2[O],
ASN	153	ND2	19	8	6[O], 12[C], 1[N],
ASN	153	OD1	25	8	1[N], 15[C], 9[O],
ASN	153	CB	10	8	3[O], 7[C],
ALA	159	N	4	8	4[O],
ALA	159	C	10	8	1[P], 9[O],
ALA	159	O	8	8	2[P], 6[O],
ALA	159	CB	21	8	5[P], 1[C], 15[O],
ALA	159	CA	5	8	5[O],
HIS	160	CB	29	8	5[P], 16[O], 8[C],
HIS	160	CD2	56	8	15[C], 35[O], 1[N], 5[P],
HIS	160	CE1	71	8	1[N], 19[C], 42[O], 9[P],
HIS	160	CA	11	8	1[P], 1[C], 9[O],
HIS	160	CG	54	8	15[C], 33[O], 1[N], 5[P],
HIS	160	NE2	63	8	1[N], 39[O], 16[C], 7[P],
HIS	160	ND1	70	8	8[P], 1[N], 42[O], 19[C],
HIS	160	N	11	8	1[C], 9[O], 1[P],
GLN	168	C	17	8	6[C], 11[O],
GLN	168	OE1	92	8	52[O], 28[C], 3[N], 9[P],
GLN	168	CA	15	8	10[O], 5[C],
GLN	168	CG	85	8	3[N], 28[C], 46[O], 8[P],
GLN	168	CD	92	8	52[O], 28[C], 3[N], 9[P],
GLN	168	NE2	94	8	3[N], 28[C], 54[O], 9[P],
GLN	168	O	6	8	2[C], 4[O],
GLN	168	CB	62	8	2[P], 3[N], 31[O], 26[C],
GLU	169	CD	91	8	9[P], 3[N], 51[O], 28[C],
GLU	169	CG	66	8	7[P], 28[C], 28[O], 3[N],
GLU	169	N	16	8	6[C], 10[O],
GLU	169	OE1	68	8	7[P], 28[C], 30[O], 3[N],
GLU	169	CB	57	8	26[O], 28[C], 3[N],
GLU	169	CA	6	8	2[C], 4[O],
GLU	169	OE2	94	8	9[P], 3[N], 54[O], 28[C],
MET	171	CG	3	8	3[O],
MET	171	SD	17	8	12[O], 4[C], 1[N],
MET	171	CE	17	8	1[N], 3[C], 13[O],
ASP	209	CB	11	8	2[C], 9[O],
ASP	209	CG	7	8	7[O],
ASP	209	OD2	9	8	9[O],
GLU	210	CD	92	8	9[P], 28[C], 52[O], 3[N],
GLU	210	OE2	93	8	9[P], 3[N], 53[O], 28[C],
GLU	210	CA	8	8	5[C], 3[O],
GLU	210	CG	73	8	33[O], 28[C], 3[N], 9[P],
GLU	210	CB	25	8	17[C], 8[O],
GLU	210	N	5	8	3[O], 2[C],
GLU	210	OE1	86	8	9[P], 28[C], 46[O], 3[N],
ASP	247	CG	74	8	7[P], 3[N], 36[O], 28[C],
ASP	247	N	9	8	9[O],
ASP	247	OD2	91	8	51[O], 28[C], 3[N], 9[P],
ASP	247	OD1	62	8	3[N], 28[C], 31[O],
ASP	247	O	30	8	18[O], 9[C], 3[N],
ASP	247	CB	57	8	3[N], 28[C], 26[O],
ASP	247	CA	35	8	3[N], 11[C], 21[O],
ASP	247	C	28	8	3[N], 8[C], 17[O],
CYS	248	N	13	8	13[O],
CYS	248	O	5	8	5[O],
CYS	248	C	9	8	9[O],
ALA	249	CA	33	8	13[C], 18[O], 2[N],
ALA	249	C	9	8	9[O],
ALA	249	N	27	8	17[O], 8[C], 2[N],
ALA	249	O	8	8	8[O],
ALA	249	CB	69	8	7[P], 3[N], 38[O], 21[C],
SER	250	N	1	8	1[O],
GLU	252	OE1	15	8	2[P], 13[O],
GLU	252	CD	26	8	4[P], 22[O],
GLU	252	OE2	32	8	7[P], 4[C], 21[O],
GLU	252	CG	24	8	21[O], 2[C], 1[P],
GLU	291	CG	37	8	3[N], 16[C], 18[O],
GLU	291	CA	7	8	7[O],
GLU	291	OE2	77	8	3[N], 28[C], 38[O], 8[P],
GLU	291	CD	59	8	28[O], 28[C], 3[N],
GLU	291	CB	28	8	3[N], 18[O], 7[C],
GLU	291	O	9	8	9[O],
GLU	291	OE1	57	8	26[O], 28[C], 3[N],
GLU	291	C	8	8	8[O],
ASP	292	OD2	47	8	3[N], 18[C], 26[O],
ASP	292	N	3	8	3[O],
ASP	292	CG	28	8	3[N], 8[C], 17[O],
ASP	292	CB	22	8	17[O], 5[C],
ASP	292	OD1	17	8	17[O],
VAL	316	CG1	8	8	8[O],
GLY	317	C	3	8	3[O],
GLY	317	O	5	8	5[O],
ASP	318	O	14	8	14[O],
ASP	318	OD2	94	8	9[P], 3[N], 54[O], 28[C],
ASP	318	C	30	8	18[O], 9[C], 3[N],
ASP	318	N	16	8	16[O],
ASP	318	CA	31	8	3[N], 9[C], 19[O],
ASP	318	CB	60	8	1[P], 25[C], 31[O], 3[N],
ASP	318	OD1	87	8	47[O], 28[C], 3[N], 9[P],
ASP	318	CG	87	8	9[P], 28[C], 47[O], 3[N],
ASP	319	OD1	80	8	3[N], 19[C], 49[O], 9[P],
ASP	319	N	37	8	3[N], 9[C], 25[O],
ASP	319	CA	22	8	3[C], 19[O],
ASP	319	CG	61	8	8[P], 18[C], 32[O], 3[N],
ASP	319	CB	29	8	23[O], 6[C],
ASP	319	OD2	64	8	8[P], 17[C], 36[O], 3[N],
LEU	341	C	7	8	7[O],
LEU	341	CA	8	8	8[O],
LEU	341	CG	49	8	23[O], 23[C], 3[N],
LEU	341	CB	33	8	3[N], 13[C], 17[O],
LEU	341	CD2	85	8	3[N], 28[C], 45[O], 9[P],
LEU	341	O	6	8	6[O],
LEU	341	CD1	44	8	20[O], 21[C], 3[N],
LYS	343	CB	48	8	3[P], 3[N], 27[O], 15[C],
LYS	343	CA	1	8	1[O],
LYS	343	NZ	94	8	9[P], 28[C], 54[O], 3[N],
LYS	343	CE	94	8	3[N], 28[C], 54[O], 9[P],
LYS	343	CD	94	8	9[P], 28[C], 54[O], 3[N],
LYS	343	CG	86	8	9[P], 3[N], 46[O], 28[C],
ASN	345	CG	10	8	10[O],
ASN	345	OD1	28	8	9[P], 19[O],
ASN	345	ND2	10	8	10[O],
GLN	346	CG	20	8	18[O], 2[P],
GLN	346	CD	49	8	3[P], 2[N], 35[O], 9[C],
GLN	346	NE2	61	8	3[N], 16[C], 35[O], 7[P],
GLN	346	CB	1	8	1[O],
GLN	346	OE1	29	8	23[O], 4[C], 2[P],
VAL	368	O	1	8	1[O],
SER	370	CB	65	8	35[O], 27[C], 3[N],
SER	370	N	11	8	1[N], 4[C], 6[O],
SER	370	C	44	8	22[O], 19[C], 3[N],
SER	370	O	37	8	3[N], 13[C], 21[O],
SER	370	CA	34	8	3[N], 18[C], 13[O],
SER	370	OG	86	8	3[N], 28[C], 46[O], 9[P],
HIS	371	CG	68	8	28[O], 28[C], 3[N], 9[P],
HIS	371	CB	46	8	3[N], 17[C], 25[O], 1[P],
HIS	371	CE1	70	8	9[P], 28[C], 30[O], 3[N],
HIS	371	CD2	85	8	3[N], 28[C], 45[O], 9[P],
HIS	371	ND1	64	8	3[N], 27[C], 27[O], 7[P],
HIS	371	N	57	8	1[P], 3[N], 27[O], 26[C],
HIS	371	CA	65	8	3[N], 26[C], 28[O], 8[P],
HIS	371	C	94	8	9[P], 28[C], 54[O], 3[N],
HIS	371	O	94	8	3[N], 28[C], 54[O], 9[P],
HIS	371	NE2	84	8	9[P], 28[C], 44[O], 3[N],
ARG	372	CZ	93	8	9[P], 3[N], 53[O], 28[C],
ARG	372	CG	88	8	48[O], 28[C], 3[N], 9[P],
ARG	372	N	91	8	51[O], 28[C], 3[N], 9[P],
ARG	372	NE	94	8	54[O], 28[C], 3[N], 9[P],
ARG	372	CB	92	8	9[P], 28[C], 52[O], 3[N],
ARG	372	CA	94	8	9[P], 3[N], 54[O], 28[C],
ARG	372	C	93	8	9[P], 3[N], 53[O], 28[C],
ARG	372	CD	94	8	9[P], 3[N], 54[O], 28[C],
ARG	372	O	84	8	44[O], 28[C], 3[N], 9[P],
SER	373	O	55	8	9[P], 19[C], 27[O],
SER	373	CB	93	8	9[P], 28[C], 53[O], 3[N],
SER	373	CA	93	8	3[N], 28[C], 53[O], 9[P],
SER	373	OG	91	8	51[O], 28[C], 3[N], 9[P],
SER	373	N	94	8	3[N], 28[C], 54[O], 9[P],
SER	373	C	68	8	9[P], 1[N], 36[O], 22[C],
GLY	374	O	23	8	16[O], 7[P],
GLY	374	CA	34	8	9[P], 23[O], 2[C],
GLY	374	N	64	8	36[O], 19[C], 9[P],
GLY	374	C	23	8	6[P], 17[O],
GLU	375	CD	4	8	4[O],
GLU	375	CG	13	8	8[O], 5[C],
GLU	375	OE2	14	8	5[C], 9[O],
GLU	375	N	8	8	8[O],
LYS	394	O	27	8	12[O], 12[C], 3[N],
LYS	394	CE	82	8	9[P], 3[N], 42[O], 28[C],
LYS	394	CA	10	8	4[O], 6[C],
LYS	394	NZ	83	8	3[N], 28[C], 43[O], 9[P],
LYS	394	CD	59	8	3[N], 28[C], 28[O],
LYS	394	CB	24	8	3[N], 9[C], 12[O],
LYS	394	CG	47	8	3[N], 26[C], 18[O],
LYS	394	C	13	8	5[O], 8[C],
THR	395	C	7	8	4[C], 3[O],
THR	395	CA	10	8	7[C], 3[O],
THR	395	N	9	8	6[C], 3[O],
THR	395	O	1	8	1[O],
GLY	396	CA	6	8	3[O], 3[C],
GLY	396	N	11	8	3[O], 8[C],
ARG	403	NE	1	8	1[O],
ARG	403	CZ	11	8	3[O], 8[C],
Total = 216


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.