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Binding Site Prediction
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Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 2 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: SLB_A_16(3E81) / Model_132(3E81/A) = [3.9]	Download	1420.87	0.12	MASYALLEQARHLQALVLDVDGILSDGFVTLTNTGDEIKSFDIRDGLGMKLAQQAGMKVIIITGRKSNIVEKRMSDLGVDLVFQGREDKGSALREACAQFNILPSDCLYMGDDWPDLSAFAIAGMSVTVPNGHEEVRRRADLVTQAMGGRGAVREVCDMLLIAKGIYQELLEKYLAVPH
Complex: KDO_A_2(4UME) / Model_4(4UME/A) = [3.4]	Download	656.36	-5.31	MASYALLEQARHLQALVLDVDGILSDGFVTLTNTGDEIKSFDIRDGLGMKLAQQAGMKVIIITGRKSNIVEKRMSDLGVDLVFQGREDKGSALREACAQFNILPSDCLYMGDDWPDLSAFAIAGMSVTVPNGHEEVRRRADLVTQAMGGRGAVREVCDMLLIAKGIYQELLEKYLAVPH
Consensus [pKd Mean = 3.65]	-	1038 (s=382)	-2 (s=2)	MASYALLEQARHLQALVLDVDGILSDGFVTLTNTGDEIKSFDIRDGLGMKLAQQAGMKVIIITGRKSNIVEKRMSDLGVDLVFQGREDKGSALREACAQFNILPSDCLYMGDDWPDLSAFAIAGMSVTVPNGHEEVRRRADLVTQAMGGRGAVREVCDMLLIAKGIYQELLEKYLAVPH

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
ASP	19	C	3	2	2[O], 1[C],
ASP	19	CB	5	2	2[C], 3[O],
ASP	19	CA	3	2	2[O], 1[C],
ASP	19	O	1	2	1[O],
ASP	19	CG	8	2	4[O], 4[C],
ASP	19	OD1	11	2	6[C], 5[O],
ASP	19	OD2	11	2	6[C], 5[O],
VAL	20	CG2	2	2	2[O],
VAL	20	CB	4	2	2[O], 2[C],
VAL	20	N	4	2	2[C], 2[O],
VAL	20	C	4	2	2[O], 2[C],
VAL	20	CA	4	2	2[O], 2[C],
VAL	20	O	4	2	2[O], 2[C],
VAL	20	CG1	2	2	2[O],
ASP	21	CG	24	2	11[C], 13[O],
ASP	21	CB	23	2	11[C], 12[O],
ASP	21	O	12	2	6[C], 6[O],
ASP	21	OD1	22	2	12[O], 10[C],
ASP	21	C	8	2	4[C], 4[O],
ASP	21	N	9	2	5[O], 4[C],
ASP	21	CA	12	2	6[C], 6[O],
ASP	21	OD2	23	2	13[O], 10[C],
GLY	22	CA	4	2	2[C], 2[O],
GLY	22	N	4	2	2[O], 2[C],
SER	25	OG	1	2	1[O],
GLY	27	O	7	2	3[C], 4[O],
GLY	27	C	2	2	2[O],
PHE	28	C	1	2	1[O],
VAL	29	C	2	2	2[O],
VAL	29	CG2	21	2	10[C], 11[O],
VAL	29	CB	12	2	4[C], 8[O],
VAL	29	CG1	10	2	4[C], 6[O],
VAL	29	CA	6	2	2[C], 4[O],
VAL	29	O	2	2	2[O],
VAL	29	N	4	2	3[O], 1[C],
LEU	31	CD2	1	2	1[O],
LEU	31	CG	1	2	1[O],
LEU	31	CD1	1	2	1[O],
GLU	37	CD	2	2	1[O], 1[C],
GLU	37	OE1	1	2	1[O],
GLU	37	OE2	6	2	4[O], 2[C],
LYS	39	NZ	9	2	4[C], 5[O],
LYS	39	CD	1	2	1[O],
LYS	39	CE	2	2	2[O],
ILE	62	C	3	2	3[O],
ILE	62	O	5	2	3[O], 2[C],
THR	63	OG1	13	2	6[O], 7[C],
THR	63	CG2	7	2	4[O], 3[C],
THR	63	N	7	2	4[O], 3[C],
THR	63	CA	8	2	4[O], 4[C],
THR	63	O	9	2	4[C], 5[O],
THR	63	C	13	2	7[C], 6[O],
THR	63	CB	8	2	4[O], 4[C],
GLY	64	CA	25	2	14[C], 10[O], 1[N],
GLY	64	N	17	2	9[C], 1[N], 7[O],
GLY	64	C	29	2	1[N], 11[O], 17[C],
GLY	64	O	28	2	11[O], 1[N], 16[C],
ARG	65	CB	27	2	14[C], 13[O],
ARG	65	CD	32	2	15[O], 17[C],
ARG	65	CG	33	2	17[C], 1[N], 15[O],
ARG	65	CA	27	2	15[C], 11[O], 1[N],
ARG	65	N	26	2	1[N], 11[O], 14[C],
ARG	65	O	9	2	4[C], 5[O],
ARG	65	CZ	32	2	14[O], 1[N], 17[C],
ARG	65	C	13	2	6[C], 7[O],
ARG	65	NE	32	2	17[C], 1[N], 14[O],
LYS	66	N	8	2	3[C], 5[O],
GLY	85	CA	2	2	2[O],
GLY	85	C	2	2	2[O],
GLY	85	N	2	2	2[O],
ARG	86	C	6	2	4[O], 2[C],
ARG	86	O	12	2	1[N], 5[O], 6[C],
ARG	86	CA	1	2	1[O],
ARG	86	N	5	2	4[O], 1[C],
GLU	87	CG	14	2	6[O], 8[C],
GLU	87	CD	14	2	6[O], 8[C],
GLU	87	OE1	13	2	6[O], 7[C],
GLU	87	OE2	15	2	8[C], 7[O],
GLU	87	N	6	2	3[O], 3[C],
GLU	87	C	3	2	2[C], 1[O],
GLU	87	O	4	2	3[C], 1[O],
GLU	87	CB	11	2	5[O], 6[C],
GLU	87	CA	8	2	5[C], 3[O],
ASP	88	N	1	2	1[O],
LYS	89	CE	10	2	6[C], 4[O],
LYS	89	CG	1	2	1[O],
LYS	89	CD	5	2	3[O], 2[C],
LYS	89	NZ	10	2	6[C], 4[O],
ASP	112	OD2	6	2	2[C], 4[O],
ASP	112	CG	6	2	2[C], 4[O],
ASP	112	OD1	9	2	4[O], 5[C],
ASP	113	CB	15	2	6[O], 9[C],
ASP	113	OD1	6	2	2[C], 4[O],
ASP	113	CA	4	2	2[O], 2[C],
ASP	113	CG	16	2	12[C], 4[O],
ASP	113	OD2	22	2	13[C], 9[O],
ASP	113	N	3	2	2[O], 1[C],
ASP	113	C	3	2	3[O],
TRP	114	CD2	1	2	1[O],
TRP	114	CD1	4	2	2[C], 1[O], 1[N],
TRP	114	CE3	1	2	1[O],
TRP	114	CB	5	2	2[O], 1[N], 2[C],
TRP	114	C	5	2	3[O], 2[C],
TRP	114	N	6	2	3[O], 3[C],
TRP	114	NE1	3	2	2[C], 1[O],
TRP	114	CG	3	2	1[O], 2[C],
TRP	114	CA	4	2	2[O], 2[C],
TRP	114	O	2	2	1[O], 1[C],
PRO	115	C	5	2	2[O], 3[C],
PRO	115	CA	12	2	4[O], 1[N], 7[C],
PRO	115	CD	24	2	12[C], 1[N], 11[O],
PRO	115	N	12	2	8[C], 3[O], 1[N],
PRO	115	CB	21	2	12[C], 8[O], 1[N],
PRO	115	O	2	2	1[C], 1[O],
PRO	115	CG	26	2	14[C], 1[N], 11[O],
ASP	116	CG	5	2	2[C], 3[O],
ASP	116	OD2	8	2	4[C], 4[O],
ASP	116	N	1	2	1[O],
ASP	116	OD1	6	2	3[O], 3[C],
Total = 119


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.