Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 4 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: BMG_B_13(2ZC5) / Model_3(2ZC5/B) = [4.1]	Download	904.56	10.33	MANEQTRSSRRQKQPTPKKSVKKNSGKGSGKSSGTHKKGLFIKILLGILSFFCILFLAGVGLFWYYAKDAPELTDKKLDATVSSKLYTQDGELFEDLGAEKREKISANELPKTLEDAIVSVEDRRFYKHIGVDPIRIIGSALSNFTSGGLQGGSTLTQQLIKLSFFSTSAEDQTLKRKAQEAWMAVRLEQKKSKQEILTYYVNKVYMSNGLYGMETASEMYFGKKLSELSLPQTALLAGMPQAPSAYDPYVYPDQAKKRRDTVLYTMLQNEKISQTEYDQAVNVPVTDGLQELTQSDDNTKIVDNYVKEVINEVQEKTDKNVYTDGLEIYTNLDLDAQKKLYDIVNTDQYVSYPDDEMQVASTLIDTNTGKVKAQIGGRHIAEDVTLGNNLAVNTSRDFGSTMKPVTDYGPAFEYLKYSTGKTITDAPYNYEGTSTPVGNWDNQYMGTITLRQALYLSRNVPAVKLFNEVGSDKVASFLKNLGIEYSTIHQSNAISSNTEEQDGTKYGASSLKMAAAYAAFANGGTYYKPQYVNKIVFQDGTEETYEPDGKTAMSPETAYMITDILKDTITEGTGTNAQIAGLYQAGKTGTSNYTDDEYAKLGISSGVYPDILFAGYTPNYSISVWTGYNKKMTPVTSESSHVASDVYRELMQYVSANVTNTDWEMPSGLIRVGGELYYKDQYTARSNAITPSTTIPSSSYVQTPGSSTTETTTQSSSSTSQSESTAESSKESTTAETSEPASSTTVPSSSSEESSTPSSSAPPASSSEPATSGADAANDHTPSSSTSASGNR
Complex: PCZ_B_12(2C5W) / Model_1(2C5W/B) = [3.8]	Download	1350.94	10.81	MANEQTRSSRRQKQPTPKKSVKKNSGKGSGKSSGTHKKGLFIKILLGILSFFCILFLAGVGLFWYYAKDAPELTDKKLDATVSSKLYTQDGELFEDLGAEKREKISANELPKTLEDAIVSVEDRRFYKHIGVDPIRIIGSALSNFTSGGLQGGSTLTQQLIKLSFFSTSAEDQTLKRKAQEAWMAVRLEQKKSKQEILTYYVNKVYMSNGLYGMETASEMYFGKKLSELSLPQTALLAGMPQAPSAYDPYVYPDQAKKRRDTVLYTMLQNEKISQTEYDQAVNVPVTDGLQELTQSDDNTKIVDNYVKEVINEVQEKTDKNVYTDGLEIYTNLDLDAQKKLYDIVNTDQYVSYPDDEMQVASTLIDTNTGKVKAQIGGRHIAEDVTLGNNLAVNTSRDFGSTMKPVTDYGPAFEYLKYSTGKTITDAPYNYEGTSTPVGNWDNQYMGTITLRQALYLSRNVPAVKLFNEVGSDKVASFLKNLGIEYSTIHQSNAISSNTEEQDGTKYGASSLKMAAAYAAFANGGTYYKPQYVNKIVFQDGTEETYEPDGKTAMSPETAYMITDILKDTITEGTGTNAQIAGLYQAGKTGTSNYTDDEYAKLGISSGVYPDILFAGYTPNYSISVWTGYNKKMTPVTSESSHVASDVYRELMQYVSANVTNTDWEMPSGLIRVGGELYYKDQYTARSNAITPSTTIPSSSYVQTPGSSTTETTTQSSSSTSQSESTAESSKESTTAETSEPASSTTVPSSSSEESSTPSSSAPPASSSEPATSGADAANDHTPSSSTSASGNR
Complex: TEB_B_13(2ZC6) / Model_4(2ZC6/B) = [3.2]	Download	1340.52	9.43	MANEQTRSSRRQKQPTPKKSVKKNSGKGSGKSSGTHKKGLFIKILLGILSFFCILFLAGVGLFWYYAKDAPELTDKKLDATVSSKLYTQDGELFEDLGAEKREKISANELPKTLEDAIVSVEDRRFYKHIGVDPIRIIGSALSNFTSGGLQGGSTLTQQLIKLSFFSTSAEDQTLKRKAQEAWMAVRLEQKKSKQEILTYYVNKVYMSNGLYGMETASEMYFGKKLSELSLPQTALLAGMPQAPSAYDPYVYPDQAKKRRDTVLYTMLQNEKISQTEYDQAVNVPVTDGLQELTQSDDNTKIVDNYVKEVINEVQEKTDKNVYTDGLEIYTNLDLDAQKKLYDIVNTDQYVSYPDDEMQVASTLIDTNTGKVKAQIGGRHIAEDVTLGNNLAVNTSRDFGSTMKPVTDYGPAFEYLKYSTGKTITDAPYNYEGTSTPVGNWDNQYMGTITLRQALYLSRNVPAVKLFNEVGSDKVASFLKNLGIEYSTIHQSNAISSNTEEQDGTKYGASSLKMAAAYAAFANGGTYYKPQYVNKIVFQDGTEETYEPDGKTAMSPETAYMITDILKDTITEGTGTNAQIAGLYQAGKTGTSNYTDDEYAKLGISSGVYPDILFAGYTPNYSISVWTGYNKKMTPVTSESSHVASDVYRELMQYVSANVTNTDWEMPSGLIRVGGELYYKDQYTARSNAITPSTTIPSSSYVQTPGSSTTETTTQSSSSTSQSESTAESSKESTTAETSEPASSTTVPSSSSEESSTPSSSAPPASSSEPATSGADAANDHTPSSSTSASGNR
Complex: EDO_B_11(2C5W) / Model_1(2C5W/B) = [3.1]	Download	563.11	20.09	MANEQTRSSRRQKQPTPKKSVKKNSGKGSGKSSGTHKKGLFIKILLGILSFFCILFLAGVGLFWYYAKDAPELTDKKLDATVSSKLYTQDGELFEDLGAEKREKISANELPKTLEDAIVSVEDRRFYKHIGVDPIRIIGSALSNFTSGGLQGGSTLTQQLIKLSFFSTSAEDQTLKRKAQEAWMAVRLEQKKSKQEILTYYVNKVYMSNGLYGMETASEMYFGKKLSELSLPQTALLAGMPQAPSAYDPYVYPDQAKKRRDTVLYTMLQNEKISQTEYDQAVNVPVTDGLQELTQSDDNTKIVDNYVKEVINEVQEKTDKNVYTDGLEIYTNLDLDAQKKLYDIVNTDQYVSYPDDEMQVASTLIDTNTGKVKAQIGGRHIAEDVTLGNNLAVNTSRDFGSTMKPVTDYGPAFEYLKYSTGKTITDAPYNYEGTSTPVGNWDNQYMGTITLRQALYLSRNVPAVKLFNEVGSDKVASFLKNLGIEYSTIHQSNAISSNTEEQDGTKYGASSLKMAAAYAAFANGGTYYKPQYVNKIVFQDGTEETYEPDGKTAMSPETAYMITDILKDTITEGTGTNAQIAGLYQAGKTGTSNYTDDEYAKLGISSGVYPDILFAGYTPNYSISVWTGYNKKMTPVTSESSHVASDVYRELMQYVSANVTNTDWEMPSGLIRVGGELYYKDQYTARSNAITPSTTIPSSSYVQTPGSSTTETTTQSSSSTSQSESTAESSKESTTAETSEPASSTTVPSSSSEESSTPSSSAPPASSSEPATSGADAANDHTPSSSTSASGNR
Consensus [pKd Mean = 3.55]	-	1039 (s=328)	12 (s=4)	MANEQTRSSRRQKQPTPKKSVKKNSGKGSGKSSGTHKKGLFIKILLGILSFFCILFLAGVGLFWYYAKDAPELTDKKLDATVSSKLYTQDGELFEDLGAEKREKISANELPKTLEDAIVSVEDRRFYKHIGVDPIRIIGSALSNFTSGGLQGGSTLTQQLIKLSFFSTSAEDQTLKRKAQEAWMAVRLEQKKSKQEILTYYVNKVYMSNGLYGMETASEMYFGKKLSELSLPQTALLAGMPQAPSAYDPYVYPDQAKKRRDTVLYTMLQNEKISQTEYDQAVNVPVTDGLQELTQSDDNTKIVDNYVKEVINEVQEKTDKNVYTDGLEIYTNLDLDAQKKLYDIVNTDQYVSYPDDEMQVASTLIDTNTGKVKAQIGGRHIAEDVTLGNNLAVNTSRDFGSTMKPVTDYGPAFEYLKYSTGKTITDAPYNYEGTSTPVGNWDNQYMGTITLRQALYLSRNVPAVKLFNEVGSDKVASFLKNLGIEYSTIHQSNAISSNTEEQDGTKYGASSLKMAAAYAAFANGGTYYKPQYVNKIVFQDGTEETYEPDGKTAMSPETAYMITDILKDTITEGTGTNAQIAGLYQAGKTGTSNYTDDEYAKLGISSGVYPDILFAGYTPNYSISVWTGYNKKMTPVTSESSHVASDVYRELMQYVSANVTNTDWEMPSGLIRVGGELYYKDQYTARSNAITPSTTIPSSSYVQTPGSSTTETTTQSSSSTSQSESTAESSKESTTAETSEPASSTTVPSSSSEESSTPSSSAPPASSSEPATSGADAANDHTPSSSTSASGNR

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
ASP	398	OD2	12	4	2[O], 2[N], 7[C], 1[S],
ASP	398	OD1	16	4	3[O], 3[N], 9[C], 1[S],
ASP	398	CG	11	4	1[S], 6[C], 2[N], 2[O],
SER	401	OG	60	4	13[O], 37[C], 6[N], 4[S],
THR	402	CG2	14	4	8[O], 1[N], 5[C],
THR	402	OG1	6	4	3[O], 3[C],
MET	403	CG	2	4	1[O], 1[S],
LYS	404	CG	21	4	4[O], 13[C], 4[N],
LYS	404	CE	45	4	1[S], 31[C], 4[N], 9[O],
LYS	404	NZ	47	4	1[S], 4[N], 31[C], 11[O],
LYS	404	CD	33	4	9[O], 19[C], 4[N], 1[S],
TYR	431	CD1	1	4	1[O],
TYR	431	CE2	1	4	1[O],
TYR	431	CE1	2	4	1[C], 1[O],
TYR	431	CZ	3	4	1[O], 2[C],
VAL	438	CG2	1	4	1[O],
VAL	438	CG1	5	4	2[C], 3[O],
ASN	440	CG	9	4	1[S], 4[O], 4[C],
ASN	440	ND2	1	4	1[O],
ASN	440	OD1	17	4	1[S], 5[O], 11[C],
TRP	441	CZ2	32	4	23[C], 5[N], 4[S],
TRP	441	CE2	44	4	4[S], 2[O], 30[C], 8[N],
TRP	441	CZ3	29	4	4[S], 5[N], 20[C],
TRP	441	NE1	53	4	4[S], 8[N], 32[C], 9[O],
TRP	441	CE3	38	4	2[O], 27[C], 5[N], 4[S],
TRP	441	CG	65	4	10[O], 10[N], 41[C], 4[S],
TRP	441	CD1	65	4	4[S], 11[O], 40[C], 10[N],
TRP	441	CD2	49	4	5[O], 32[C], 8[N], 4[S],
ASP	442	OD1	4	4	1[O], 2[C], 1[S],
ASP	442	CG	7	4	5[C], 1[N], 1[S],
ASP	442	OD2	6	4	1[S], 2[N], 3[C],
ASN	443	ND2	2	4	1[C], 1[O],
ASN	443	OD1	4	4	2[C], 2[O],
ASN	443	CG	3	4	1[O], 2[C],
LEU	457	CD1	4	4	1[S], 2[C], 1[N],
LEU	457	CD2	11	4	1[S], 4[N], 6[C],
LEU	457	CG	7	4	1[S], 3[N], 3[C],
SER	458	OG	58	4	36[C], 7[N], 12[O], 3[S],
ARG	459	CZ	2	4	1[S], 1[C],
ARG	459	CD	2	4	2[C],
ARG	459	CG	1	4	1[C],
ARG	459	NE	2	4	1[C], 1[S],
ASN	460	OD1	56	4	36[C], 6[N], 12[O], 2[S],
ASN	460	CG	48	4	6[N], 31[C], 9[O], 2[S],
ASN	460	ND2	50	4	2[S], 9[O], 33[C], 6[N],
VAL	464	CG2	1	4	1[O],
ILE	495	CG2	32	4	2[S], 18[C], 5[N], 7[O],
ILE	495	CG1	31	4	4[N], 19[C], 7[O], 1[S],
ILE	495	CD1	35	4	2[S], 20[C], 4[N], 9[O],
SER	496	OG	9	4	2[N], 6[C], 1[S],
SER	497	OG	1	4	1[S],
ASN	498	ND2	3	4	1[S], 1[N], 1[C],
ASN	498	OD1	1	4	1[N],
ASN	498	CG	3	4	1[S], 1[N], 1[C],
THR	569	OG1	2	4	2[O],
THR	569	CG2	8	4	3[C], 5[O],
THR	574	CG2	48	4	4[S], 7[O], 8[N], 29[C],
THR	574	OG1	43	4	8[N], 25[C], 7[O], 3[S],
THR	576	CG2	1	4	1[C],
LYS	588	NZ	46	4	3[S], 29[C], 5[N], 9[O],
LYS	588	CG	19	4	3[N], 8[C], 8[O],
LYS	588	CE	32	4	9[O], 3[N], 20[C],
LYS	588	CD	22	4	9[O], 10[C], 3[N],
THR	589	OG1	48	4	29[C], 7[N], 9[O], 3[S],
THR	589	CG2	26	4	2[S], 14[C], 4[N], 6[O],
THR	591	CG2	64	4	7[N], 40[C], 13[O], 4[S],
THR	591	OG1	66	4	3[S], 13[O], 41[C], 9[N],
SER	592	OG	19	4	3[O], 4[N], 11[C], 1[S],
ASN	593	CG	34	4	1[S], 21[C], 4[N], 8[O],
ASN	593	OD1	27	4	6[O], 4[N], 16[C], 1[S],
ASN	593	ND2	37	4	1[S], 5[N], 23[C], 8[O],
THR	595	CG2	1	4	1[N],
TYR	609	CZ	20	4	1[S], 4[O], 12[C], 3[N],
TYR	609	CD1	8	4	1[O], 6[C], 1[S],
TYR	609	CE2	19	4	4[O], 13[C], 1[N], 1[S],
TYR	609	CD2	19	4	4[O], 12[C], 1[N], 2[S],
TYR	609	CG	13	4	4[O], 6[C], 1[N], 2[S],
TYR	609	CE1	12	4	10[C], 1[O], 1[S],
PRO	610	CG	3	4	2[N], 1[C],
PRO	610	CD	6	4	3[C], 3[N],
ASP	611	OD2	4	4	2[N], 1[C], 1[S],
ASP	611	CG	1	4	1[N],
ILE	612	CG2	3	4	1[S], 1[O], 1[C],
ILE	612	CG1	6	4	4[O], 2[C],
ILE	612	CD1	10	4	1[S], 5[C], 4[O],
LEU	613	CD2	2	4	2[O],
LEU	613	CG	5	4	2[C], 3[O],
LEU	613	CD1	17	4	1[S], 6[O], 10[C],
PHE	614	CD1	2	4	2[O],
SER	641	OG	1	4	1[C],
HIS	642	CE1	1	4	1[N],
SER	645	OG	2	4	2[O],
Total = 92


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.