Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 3 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: 4RA_A_2(4ZTC) / Model_4(4ZTC/A) = [8.4]	Download	1041.75	10.94	MAIQLKLRKKELILNSRILLSSPHMGGTEEKYVAKAFKDNWIAPLGENVDKFEESITKYTGSKGGASALSSGTAAIHLALRLLNVGKNDIVFAPSFTFIATVNPILYQGAVPVFIDSEPNTWNMSPVALESALEEAERNNQLPKAIIVVNLYGQMADYERILAIANQFNVPVIEDAAESLGSTYKGISSGLFGTIGIYSFNGNKIITTSGGGALVSSDKKYVEHSRFLATQARDQAPYYQHSEIGYNYRLSNISAGIGRGQMEVLNDRVAKRREIFNRYKEAFSGIDRIEMMPEVDGMVPNRWLSTLTINDYNSIDQVVNVINKLNEKNIETRALWKPLHLQPVFQGVKMYYHDNNLSVSEKLFNSGLCLPSGSNMTDSEQEFVIDEFKKIFK
Complex: PLP_I_9(1O61) / Model_23(1O61/B) = [4.1]	Download	665.99	15.86	MAIQLKLRKKELILNSRILLSSPHMGGTEEKYVAKAFKDNWIAPLGENVDKFEESITKYTGSKGGASALSSGTAAIHLALRLLNVGKNDIVFAPSFTFIATVNPILYQGAVPVFIDSEPNTWNMSPVALESALEEAERNNQLPKAIIVVNLYGQMADYERILAIANQFNVPVIEDAAESLGSTYKGISSGLFGTIGIYSFNGNKIITTSGGGALVSSDKKYVEHSRFLATQARDQAPYYQHSEIGYNYRLSNISAGIGRGQMEVLNDRVAKRREIFNRYKEAFSGIDRIEMMPEVDGMVPNRWLSTLTINDYNSIDQVVNVINKLNEKNIETRALWKPLHLQPVFQGVKMYYHDNNLSVSEKLFNSGLCLPSGSNMTDSEQEFVIDEFKKIFK
Complex: X04_C_3(1O69) / Model_21(1O69/B) = [4.0]	Download	754.68	12.27	MAIQLKLRKKELILNSRILLSSPHMGGTEEKYVAKAFKDNWIAPLGENVDKFEESITKYTGSKGGASALSSGTAAIHLALRLLNVGKNDIVFAPSFTFIATVNPILYQGAVPVFIDSEPNTWNMSPVALESALEEAERNNQLPKAIIVVNLYGQMADYERILAIANQFNVPVIEDAAESLGSTYKGISSGLFGTIGIYSFNGNKIITTSGGGALVSSDKKYVEHSRFLATQARDQAPYYQHSEIGYNYRLSNISAGIGRGQMEVLNDRVAKRREIFNRYKEAFSGIDRIEMMPEVDGMVPNRWLSTLTINDYNSIDQVVNVINKLNEKNIETRALWKPLHLQPVFQGVKMYYHDNNLSVSEKLFNSGLCLPSGSNMTDSEQEFVIDEFKKIFK
Consensus [pKd Mean = 5.50]	-	820 (s=160)	13 (s=2)	MAIQLKLRKKELILNSRILLSSPHMGGTEEKYVAKAFKDNWIAPLGENVDKFEESITKYTGSKGGASALSSGTAAIHLALRLLNVGKNDIVFAPSFTFIATVNPILYQGAVPVFIDSEPNTWNMSPVALESALEEAERNNQLPKAIIVVNLYGQMADYERILAIANQFNVPVIEDAAESLGSTYKGISSGLFGTIGIYSFNGNKIITTSGGGALVSSDKKYVEHSRFLATQARDQAPYYQHSEIGYNYRLSNISAGIGRGQMEVLNDRVAKRREIFNRYKEAFSGIDRIEMMPEVDGMVPNRWLSTLTINDYNSIDQVVNVINKLNEKNIETRALWKPLHLQPVFQGVKMYYHDNNLSVSEKLFNSGLCLPSGSNMTDSEQEFVIDEFKKIFK

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
LEU	19	CD1	17	3	2[N], 6[O], 9[C],
LEU	19	CD2	15	3	2[N], 4[O], 9[C],
LEU	19	CG	15	3	2[N], 4[O], 9[C],
LEU	20	CD1	8	3	4[O], 2[C], 2[P],
LEU	20	CG	2	3	2[O],
SER	21	OG	2	3	1[O], 1[C],
SER	22	OG	11	3	2[N], 3[O], 6[C],
PRO	23	CG	16	3	8[C], 6[O], 2[N],
PRO	23	CD	17	3	6[O], 9[C], 2[N],
SER	70	OG	6	3	6[O],
SER	71	OG	21	3	5[C], 12[O], 3[P], 1[N],
THR	73	OG1	46	3	23[C], 15[O], 3[P], 5[N],
THR	73	CG2	27	3	10[C], 12[O], 3[P], 2[N],
ILE	76	CG1	22	3	12[C], 6[O], 4[N],
ILE	76	CD1	35	3	3[P], 4[N], 22[C], 6[O],
ILE	76	CG2	4	3	2[N], 2[C],
PRO	94	CG	3	3	2[C], 1[N],
THR	97	OG1	28	3	3[O], 20[C], 5[N],
THR	97	CG2	15	3	11[C], 1[O], 3[N],
PHE	98	CE1	59	3	19[O], 31[C], 6[N], 3[P],
PHE	98	CD2	64	3	4[P], 6[N], 31[C], 23[O],
PHE	98	CG	59	3	6[N], 4[P], 19[O], 30[C],
PHE	98	CE2	66	3	24[O], 32[C], 6[N], 4[P],
PHE	98	CZ	65	3	22[O], 32[C], 6[N], 5[P],
PHE	98	CD1	54	3	1[P], 6[N], 30[C], 17[O],
ILE	99	CG2	2	3	2[C],
THR	101	OG1	31	3	4[O], 22[C], 5[N],
THR	101	CG2	37	3	4[N], 2[P], 8[O], 23[C],
ASN	103	ND2	4	3	1[O], 3[C],
PRO	104	CD	4	3	2[C], 2[N],
PRO	104	CG	3	3	2[C], 1[N],
ILE	147	CG2	7	3	3[C], 4[N],
VAL	149	CG2	23	3	17[C], 2[O], 4[N],
VAL	149	CG1	14	3	1[O], 10[C], 3[N],
LEU	151	CG	10	3	3[O], 7[C],
LEU	151	CD1	16	3	3[N], 3[O], 10[C],
LEU	151	CD2	3	3	3[C],
TYR	152	CG	1	3	1[C],
TYR	152	CZ	2	3	2[C],
TYR	152	CD2	6	3	3[C], 3[O],
TYR	152	CE2	5	3	2[C], 3[O],
ASP	175	OD1	39	3	8[O], 24[C], 5[N], 2[P],
ASP	175	CG	36	3	5[N], 7[O], 24[C],
ASP	175	OD2	38	3	5[N], 1[P], 8[O], 24[C],
GLU	178	OE1	34	3	4[N], 24[C], 6[O],
GLU	178	CG	45	3	5[N], 30[C], 10[O],
GLU	178	CD	38	3	27[C], 7[O], 4[N],
GLU	178	OE2	41	3	4[N], 9[O], 28[C],
SER	179	OG	3	3	3[C],
ILE	197	CD1	16	3	3[N], 1[P], 3[O], 9[C],
ILE	197	CG1	11	3	1[O], 8[C], 2[N],
ILE	197	CG2	18	3	3[N], 2[P], 6[O], 7[C],
SER	199	OG	59	3	30[C], 20[O], 3[P], 6[N],
PHE	200	CD2	1	3	1[O],
PHE	200	CE1	1	3	1[O],
PHE	200	CG	3	3	3[O],
PHE	200	CD1	3	3	3[O],
ASN	201	OD1	37	3	14[C], 18[O], 3[P], 2[N],
ASN	201	ND2	31	3	2[N], 3[P], 12[O], 14[C],
ASN	201	CG	35	3	3[P], 2[N], 15[C], 15[O],
ASN	203	CG	66	3	30[C], 26[O], 4[P], 6[N],
ASN	203	OD1	64	3	6[N], 4[P], 24[O], 30[C],
ASN	203	ND2	71	3	29[O], 32[C], 5[N], 5[P],
LYS	204	NZ	28	3	9[O], 15[C], 3[N], 1[P],
LYS	204	CG	25	3	1[P], 2[N], 13[C], 9[O],
LYS	204	CE	28	3	15[C], 9[O], 1[P], 3[N],
LYS	204	CD	27	3	3[N], 1[P], 8[O], 15[C],
THR	207	CG2	7	3	7[O],
THR	207	OG1	12	3	8[O], 4[C],
THR	208	OG1	1	3	1[O],
TRP	303	CZ3	15	3	1[N], 11[C], 3[O],
TRP	303	NE1	6	3	1[N], 4[C], 1[O],
TRP	303	CG	1	3	1[C],
TRP	303	CE3	10	3	2[O], 7[C], 1[N],
TRP	303	CZ2	21	3	2[N], 10[C], 9[O],
TRP	303	CE2	11	3	3[O], 7[C], 1[N],
TRP	303	CD2	6	3	3[C], 2[O], 1[N],
LEU	304	CG	2	3	1[O], 1[C],
LEU	304	CD1	5	3	2[C], 3[O],
GLU	331	CG	1	3	1[O],
GLU	331	OE2	15	3	5[O], 8[C], 1[N], 1[P],
GLU	331	OE1	15	3	7[O], 6[C], 2[P],
GLU	331	CD	11	3	1[P], 5[C], 5[O],
ARG	333	NE	13	3	3[C], 8[O], 2[P],
ARG	333	CD	10	3	6[O], 2[C], 2[P],
ARG	333	CG	2	3	2[O],
ARG	333	CZ	21	3	11[O], 8[C], 2[P],
TRP	336	CZ3	27	3	1[P], 2[N], 17[C], 7[O],
TRP	336	CE2	35	3	24[C], 8[O], 3[N],
TRP	336	CD1	21	3	3[N], 4[O], 14[C],
TRP	336	CE3	18	3	1[N], 5[O], 12[C],
TRP	336	CG	16	3	11[C], 4[O], 1[N],
TRP	336	CD2	22	3	3[N], 5[O], 14[C],
TRP	336	NE1	32	3	7[O], 21[C], 4[N],
TRP	336	CZ2	39	3	3[N], 1[P], 8[O], 27[C],
Total = 95


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.