Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C4_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 4 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C4_S1
Complex: AN2_B_4(4U7O) / Model_22(4U7O/B) = [9.5]	Download	698.60	16.74	MKRKVRFFRSVNFKIAITFILILLISIEIIGAYFIRGLERSTINTFIKDMNQTVESLATTISPELNRKDNADDEEVNANIKRFIENSATSDIIEIRVVDEKGIIRGTTDVNEQSAVGKKNDYVDINDFTTKRYVALDNDDKRVNINVQPILSPTGDAVIGALYVKSNIEQKYSEINNTAVIFFTASLIAAFISMIVSVLVARSITQPIGEMREQAIRIARGDYSRKVKVHGQDELGQLADTFNQLAERIEEAQDTMEAERNRLDSVLSHMTDGVIATDRRGKVITINDMAVSLLDIKNEEAIGQSILTLLDIEEEYTLRKLLEDPNEMVLDRSTSTLESDQMILRVDFSMIRRESGFISGLVAVLHDVTEQEKTERERREFVSNVSHELRTPLTSMRSYIEALSEGAWKDEEVAPNFLKVTLDETDRMIRMINDLLNLSRMDTGNTQLQLEYVNFNELVNFVLDRFDMMVGNQEKNYKIRREFTQRDLWVEVDTDKIIQVVDNIMNNAIKYSPDGGTITCRLLETHNNVVLSITDQGLGIPKKDLNRVFERFYRVDKARARAQGGTGLGLAISREVIKAHRGAIWAESKEGKGSTFYISLPYEPYEEEWWE
Complex: ATP_A_4(3SL2) / Model_6(3SL2/A) = [7.7]	Download	1275.80	18.71	MKRKVRFFRSVNFKIAITFILILLISIEIIGAYFIRGLERSTINTFIKDMNQTVESLATTISPELNRKDNADDEEVNANIKRFIENSATSDIIEIRVVDEKGIIRGTTDVNEQSAVGKKNDYVDINDFTTKRYVALDNDDKRVNINVQPILSPTGDAVIGALYVKSNIEQKYSEINNTAVIFFTASLIAAFISMIVSVLVARSITQPIGEMREQAIRIARGDYSRKVKVHGQDELGQLADTFNQLAERIEEAQDTMEAERNRLDSVLSHMTDGVIATDRRGKVITINDMAVSLLDIKNEEAIGQSILTLLDIEEEYTLRKLLEDPNEMVLDRSTSTLESDQMILRVDFSMIRRESGFISGLVAVLHDVTEQEKTERERREFVSNVSHELRTPLTSMRSYIEALSEGAWKDEEVAPNFLKVTLDETDRMIRMINDLLNLSRMDTGNTQLQLEYVNFNELVNFVLDRFDMMVGNQEKNYKIRREFTQRDLWVEVDTDKIIQVVDNIMNNAIKYSPDGGTITCRLLETHNNVVLSITDQGLGIPKKDLNRVFERFYRVDKARARAQGGTGLGLAISREVIKAHRGAIWAESKEGKGSTFYISLPYEPYEEEWWE
Complex: ACP_A_3(5C93) / Model_5(5C93/A) = [7.3]	Download	1169.86	12.38	MKRKVRFFRSVNFKIAITFILILLISIEIIGAYFIRGLERSTINTFIKDMNQTVESLATTISPELNRKDNADDEEVNANIKRFIENSATSDIIEIRVVDEKGIIRGTTDVNEQSAVGKKNDYVDINDFTTKRYVALDNDDKRVNINVQPILSPTGDAVIGALYVKSNIEQKYSEINNTAVIFFTASLIAAFISMIVSVLVARSITQPIGEMREQAIRIARGDYSRKVKVHGQDELGQLADTFNQLAERIEEAQDTMEAERNRLDSVLSHMTDGVIATDRRGKVITINDMAVSLLDIKNEEAIGQSILTLLDIEEEYTLRKLLEDPNEMVLDRSTSTLESDQMILRVDFSMIRRESGFISGLVAVLHDVTEQEKTERERREFVSNVSHELRTPLTSMRSYIEALSEGAWKDEEVAPNFLKVTLDETDRMIRMINDLLNLSRMDTGNTQLQLEYVNFNELVNFVLDRFDMMVGNQEKNYKIRREFTQRDLWVEVDTDKIIQVVDNIMNNAIKYSPDGGTITCRLLETHNNVVLSITDQGLGIPKKDLNRVFERFYRVDKARARAQGGTGLGLAISREVIKAHRGAIWAESKEGKGSTFYISLPYEPYEEEWWE
Complex: ADP_B_3(4ZKI) / Model_21(4ZKI/B) = [6.9]	Download	718.35	20.76	MKRKVRFFRSVNFKIAITFILILLISIEIIGAYFIRGLERSTINTFIKDMNQTVESLATTISPELNRKDNADDEEVNANIKRFIENSATSDIIEIRVVDEKGIIRGTTDVNEQSAVGKKNDYVDINDFTTKRYVALDNDDKRVNINVQPILSPTGDAVIGALYVKSNIEQKYSEINNTAVIFFTASLIAAFISMIVSVLVARSITQPIGEMREQAIRIARGDYSRKVKVHGQDELGQLADTFNQLAERIEEAQDTMEAERNRLDSVLSHMTDGVIATDRRGKVITINDMAVSLLDIKNEEAIGQSILTLLDIEEEYTLRKLLEDPNEMVLDRSTSTLESDQMILRVDFSMIRRESGFISGLVAVLHDVTEQEKTERERREFVSNVSHELRTPLTSMRSYIEALSEGAWKDEEVAPNFLKVTLDETDRMIRMINDLLNLSRMDTGNTQLQLEYVNFNELVNFVLDRFDMMVGNQEKNYKIRREFTQRDLWVEVDTDKIIQVVDNIMNNAIKYSPDGGTITCRLLETHNNVVLSITDQGLGIPKKDLNRVFERFYRVDKARARAQGGTGLGLAISREVIKAHRGAIWAESKEGKGSTFYISLPYEPYEEEWWE
Consensus [pKd Mean = 7.85]	-	965 (s=259)	17 (s=3)	MKRKVRFFRSVNFKIAITFILILLISIEIIGAYFIRGLERSTINTFIKDMNQTVESLATTISPELNRKDNADDEEVNANIKRFIENSATSDIIEIRVVDEKGIIRGTTDVNEQSAVGKKNDYVDINDFTTKRYVALDNDDKRVNINVQPILSPTGDAVIGALYVKSNIEQKYSEINNTAVIFFTASLIAAFISMIVSVLVARSITQPIGEMREQAIRIARGDYSRKVKVHGQDELGQLADTFNQLAERIEEAQDTMEAERNRLDSVLSHMTDGVIATDRRGKVITINDMAVSLLDIKNEEAIGQSILTLLDIEEEYTLRKLLEDPNEMVLDRSTSTLESDQMILRVDFSMIRRESGFISGLVAVLHDVTEQEKTERERREFVSNVSHELRTPLTSMRSYIEALSEGAWKDEEVAPNFLKVTLDETDRMIRMINDLLNLSRMDTGNTQLQLEYVNFNELVNFVLDRFDMMVGNQEKNYKIRREFTQRDLWVEVDTDKIIQVVDNIMNNAIKYSPDGGTITCRLLETHNNVVLSITDQGLGIPKKDLNRVFERFYRVDKARARAQGGTGLGLAISREVIKAHRGAIWAESKEGKGSTFYISLPYEPYEEEWWE

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
HIS	387	NE2	18	4	4[P], 13[O], 1[N],
HIS	387	CD2	16	4	4[P], 11[O], 1[N],
HIS	387	ND1	16	4	11[O], 1[N], 4[P],
HIS	387	CG	16	4	4[P], 11[O], 1[N],
HIS	387	CE1	18	4	4[P], 1[N], 13[O],
GLU	388	OE2	3	4	3[O],
ARG	390	NE	3	4	3[O],
ARG	390	CZ	4	4	1[P], 1[N], 2[O],
ARG	390	CG	1	4	1[O],
ARG	390	CD	4	4	1[P], 3[O],
ARG	427	NE	1	4	1[O],
ARG	430	NE	1	4	1[O],
ASP	434	CG	1	4	1[O],
ASP	434	OD2	4	4	2[O], 1[P], 1[C],
ASP	434	OD1	1	4	1[O],
ASN	503	OD1	33	4	3[C], 20[O], 2[N], 8[P],
ASN	503	ND2	29	4	19[O], 1[N], 6[P], 3[C],
ASN	503	CG	35	4	3[C], 21[O], 2[N], 9[P],
ILE	504	CG1	13	4	3[C], 4[O], 6[N],
ILE	504	CG2	18	4	8[N], 10[C],
ASN	506	CG	13	4	1[N], 9[O], 2[P], 1[C],
ASN	506	ND2	20	4	1[C], 4[P], 1[N], 14[O],
ASN	506	OD1	4	4	2[O], 1[N], 1[P],
ASN	507	OD1	116	4	41[C], 10[P], 21[N], 44[O],
ASN	507	ND2	116	4	41[C], 10[P], 44[O], 21[N],
ASN	507	CG	116	4	44[O], 21[N], 10[P], 41[C],
LYS	510	NZ	84	4	38[O], 8[N], 10[P], 28[C],
LYS	510	CE	68	4	18[C], 10[P], 6[N], 34[O],
LYS	510	CD	59	4	6[N], 28[O], 9[P], 16[C],
LYS	510	CG	48	4	5[P], 7[N], 15[O], 21[C],
TYR	511	CE1	101	4	40[C], 7[P], 21[N], 33[O],
TYR	511	CE2	114	4	10[P], 21[N], 42[O], 41[C],
TYR	511	CG	88	4	38[C], 21[N], 24[O], 5[P],
TYR	511	CZ	113	4	41[C], 21[N], 41[O], 10[P],
TYR	511	CD2	105	4	41[C], 8[P], 21[N], 35[O],
TYR	511	CD1	88	4	38[C], 5[P], 24[O], 21[N],
SER	512	OG	15	4	7[C], 8[N],
PRO	513	CD	2	4	1[C], 1[N],
ILE	518	CG1	1	4	1[N],
ILE	533	CG2	4	4	4[N],
ASP	535	CG	34	4	17[C], 17[N],
ASP	535	OD2	40	4	20[C], 20[N],
ASP	535	OD1	34	4	17[N], 17[C],
LEU	538	CG	17	4	9[C], 7[N], 1[O],
LEU	538	CD2	7	4	3[C], 4[N],
LEU	538	CD1	18	4	2[O], 6[N], 10[C],
ILE	540	CG1	67	4	38[C], 9[O], 20[N],
ILE	540	CD1	73	4	40[C], 13[O], 20[N],
ILE	540	CG2	60	4	35[C], 16[N], 9[O],
PRO	541	CG	3	4	3[O],
PRO	541	CD	22	4	5[N], 4[O], 13[C],
ASP	544	CG	3	4	3[O],
ASP	544	OD2	4	4	4[O],
LEU	545	CD2	1	4	1[N],
VAL	548	CG2	65	4	14[O], 12[N], 3[P], 36[C],
VAL	548	CG1	80	4	40[C], 4[P], 21[O], 15[N],
PHE	549	CD2	1	4	1[C],
PHE	549	CZ	2	4	1[C], 1[N],
PHE	549	CG	6	4	4[O], 2[C],
PHE	549	CE1	8	4	4[O], 1[N], 3[C],
PHE	549	CD1	11	4	1[P], 6[O], 4[C],
PHE	552	CD1	2	4	2[O],
PHE	552	CE1	1	4	1[O],
TYR	553	CG	40	4	19[C], 1[N], 19[O], 1[P],
TYR	553	CZ	32	4	13[O], 1[N], 18[C],
TYR	553	CD2	42	4	3[N], 18[O], 2[P], 19[C],
TYR	553	CE1	24	4	13[C], 1[N], 10[O],
TYR	553	CD1	30	4	14[C], 1[P], 14[O], 1[N],
TYR	553	CE2	38	4	19[C], 1[P], 3[N], 15[O],
ARG	554	CG	72	4	19[C], 9[P], 41[O], 3[N],
ARG	554	CD	69	4	19[C], 10[P], 39[O], 1[N],
ARG	554	NE	50	4	1[N], 29[O], 7[P], 13[C],
ARG	554	CZ	27	4	8[C], 15[O], 1[N], 3[P],
VAL	555	CG1	57	4	17[O], 9[N], 1[P], 30[C],
VAL	555	CG2	55	4	12[N], 14[O], 29[C],
ASP	556	OD2	1	4	1[O],
ASP	556	OD1	4	4	4[O],
ASP	556	CG	2	4	2[O],
LYS	557	CD	5	4	1[N], 2[O], 2[C],
LYS	557	CE	13	4	7[C], 3[O], 3[N],
LYS	557	CG	2	4	2[O],
LYS	557	NZ	14	4	8[C], 3[N], 3[O],
GLN	563	NE2	1	4	1[N],
THR	566	CG2	27	4	6[P], 19[O], 1[N], 1[C],
THR	566	OG1	37	4	1[N], 25[O], 9[P], 2[C],
LEU	568	CD1	17	4	4[P], 13[O],
LEU	568	CG	26	4	8[P], 18[O],
LEU	568	CD2	12	4	11[O], 1[P],
LEU	570	CD2	80	4	35[C], 12[N], 26[O], 7[P],
LEU	570	CD1	107	4	9[P], 21[N], 36[O], 41[C],
LEU	570	CG	97	4	37[C], 10[P], 37[O], 13[N],
ILE	572	CG1	6	4	6[O],
ILE	572	CD1	9	4	8[O], 1[P],
SER	573	OG	13	4	9[O], 4[P],
SER	588	OG	34	4	17[C], 16[N], 1[O],
SER	594	OG	47	4	20[N], 2[O], 25[C],
PHE	596	CZ	80	4	4[P], 16[O], 20[N], 40[C],
PHE	596	CD2	42	4	19[N], 5[O], 18[C],
PHE	596	CG	33	4	17[C], 16[N],
PHE	596	CD1	46	4	23[C], 20[N], 3[O],
PHE	596	CE1	63	4	32[C], 11[O], 20[N],
PHE	596	CE2	72	4	34[C], 3[P], 15[O], 20[N],
Total = 102


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.