Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C7_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 2 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C7_S1
Complex: GLN_A_5(2F2A) / Model_6(2F2A/A) = [4.2]	Download	5169.08	22.18	MTELHNRSLEELHHMLVSKEITVQDLTKTTFERIKETEPEVEAFITLNEEKALEQAKALDEKGIDESNVLAGIPIGIKDNIVTKDILTTAASKILYNFEPIYDATVMDKIYQADMIPVGKLNMDEFAMGGSTETSYFKKTKNAWDPTKVPGGSSGGSAAAVAAGQIPVSLGSDTGGSIRQPAAFNGIVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPMTRTVKDNALALTAISGYDEKDGTSSGVSVPDFAEGLTGDIKGMKIALPKEYLGEGVAPGVKEAVLKAAETFRSLGAVVEEVSLPHSKYGVAVYYIIASSEASSNLQRFDGIRYGYRSENVKSLDDVYVNSRSEGFGEEVKRRIMLGTFSLSAGYYDAYFKKAGQVRTLIKRDFEKVFADYDLIIGPSSPTVAFGIGENINDPITMYMSDILTIPVNLAGLPGMSVPAGLSEGLPVGLQIIGNYFDEKTMYQAAYAFEQATEFHKQQPAILGGKDE
Complex: ASN_A_5(2DQN) / Model_2(2DQN/A) = [3.8]	Download	5512.23	25.91	MTELHNRSLEELHHMLVSKEITVQDLTKTTFERIKETEPEVEAFITLNEEKALEQAKALDEKGIDESNVLAGIPIGIKDNIVTKDILTTAASKILYNFEPIYDATVMDKIYQADMIPVGKLNMDEFAMGGSTETSYFKKTKNAWDPTKVPGGSSGGSAAAVAAGQIPVSLGSDTGGSIRQPAAFNGIVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPMTRTVKDNALALTAISGYDEKDGTSSGVSVPDFAEGLTGDIKGMKIALPKEYLGEGVAPGVKEAVLKAAETFRSLGAVVEEVSLPHSKYGVAVYYIIASSEASSNLQRFDGIRYGYRSENVKSLDDVYVNSRSEGFGEEVKRRIMLGTFSLSAGYYDAYFKKAGQVRTLIKRDFEKVFADYDLIIGPSSPTVAFGIGENINDPITMYMSDILTIPVNLAGLPGMSVPAGLSEGLPVGLQIIGNYFDEKTMYQAAYAFEQATEFHKQQPAILGGKDE
Consensus [pKd Mean = 4.00]	-	5340 (s=171)	24 (s=1)	MTELHNRSLEELHHMLVSKEITVQDLTKTTFERIKETEPEVEAFITLNEEKALEQAKALDEKGIDESNVLAGIPIGIKDNIVTKDILTTAASKILYNFEPIYDATVMDKIYQADMIPVGKLNMDEFAMGGSTETSYFKKTKNAWDPTKVPGGSSGGSAAAVAAGQIPVSLGSDTGGSIRQPAAFNGIVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPMTRTVKDNALALTAISGYDEKDGTSSGVSVPDFAEGLTGDIKGMKIALPKEYLGEGVAPGVKEAVLKAAETFRSLGAVVEEVSLPHSKYGVAVYYIIASSEASSNLQRFDGIRYGYRSENVKSLDDVYVNSRSEGFGEEVKRRIMLGTFSLSAGYYDAYFKKAGQVRTLIKRDFEKVFADYDLIIGPSSPTVAFGIGENINDPITMYMSDILTIPVNLAGLPGMSVPAGLSEGLPVGLQIIGNYFDEKTMYQAAYAFEQATEFHKQQPAILGGKDE

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
LYS	78	CD	2	2	1[N], 1[C],
LYS	78	NZ	8	2	2[N], 2[O], 4[C],
LYS	78	CE	5	2	2[C], 2[N], 1[O],
ASN	80	CG	1	2	1[N],
ASN	80	ND2	3	2	1[N], 1[O], 1[C],
MET	123	CE	1	2	1[N],
ASP	124	OD2	14	2	2[O], 4[N], 8[C],
ASP	124	CG	10	2	4[N], 2[O], 4[C],
ASP	124	OD1	3	2	2[O], 1[N],
MET	128	CG	17	2	3[N], 5[O], 9[C],
MET	128	CE	6	2	4[O], 2[C],
MET	128	SD	6	2	2[C], 4[O],
THR	134	CG2	2	2	2[O],
THR	134	OG1	2	2	2[O],
SER	153	OG	19	2	9[C], 6[O], 4[N],
SER	154	OG	7	2	2[O], 2[N], 3[C],
SER	172	OG	7	2	2[N], 2[O], 3[C],
ASP	173	OD1	11	2	2[O], 2[N], 7[C],
ASP	173	OD2	9	2	5[C], 2[O], 2[N],
ASP	173	CG	9	2	5[C], 2[N], 2[O],
THR	174	CG2	19	2	9[C], 4[N], 6[O],
THR	174	OG1	16	2	2[N], 5[O], 9[C],
SER	177	OG	19	2	4[N], 6[O], 9[C],
ILE	178	CD1	1	2	1[O],
ILE	178	CG1	4	2	1[C], 1[N], 2[O],
ARG	179	CZ	2	2	2[O],
ARG	179	NE	1	2	1[O],
GLN	180	CG	2	2	2[N],
GLN	180	CD	7	2	4[C], 3[N],
GLN	180	OE1	6	2	3[N], 3[C],
GLN	180	NE2	7	2	3[N], 4[C],
PRO	181	CG	7	2	2[N], 2[O], 3[C],
PRO	181	CD	8	2	3[N], 2[O], 3[C],
LYS	191	CD	1	2	1[O],
LYS	191	CG	1	2	1[O],
PHE	205	CG	17	2	9[C], 6[O], 2[N],
PHE	205	CD1	14	2	1[N], 6[O], 7[C],
PHE	205	CD2	19	2	6[O], 4[N], 9[C],
PHE	205	CE2	19	2	6[O], 4[N], 9[C],
PHE	205	CZ	19	2	9[C], 4[N], 6[O],
PHE	205	CE1	17	2	9[C], 2[N], 6[O],
ASP	210	OD1	6	2	3[C], 1[N], 2[O],
ASP	210	OD2	1	2	1[N],
ASP	210	CG	3	2	1[N], 2[O],
TYR	308	CD1	16	2	3[N], 4[O], 9[C],
TYR	308	CG	15	2	5[O], 2[N], 8[C],
TYR	308	CE1	19	2	9[C], 6[O], 4[N],
TYR	308	CE2	19	2	4[N], 6[O], 9[C],
TYR	308	CD2	18	2	6[O], 3[N], 9[C],
TYR	308	CZ	19	2	9[C], 4[N], 6[O],
TYR	309	CD2	13	2	7[C], 4[O], 2[N],
TYR	309	CZ	16	2	5[O], 3[N], 8[C],
TYR	309	CE2	16	2	8[C], 5[O], 3[N],
TYR	309	CG	12	2	6[C], 4[O], 2[N],
TYR	309	CD1	12	2	6[C], 4[O], 2[N],
TYR	309	CE1	16	2	3[N], 5[O], 8[C],
SER	313	OG	3	2	1[C], 2[O],
GLU	353	CG	6	2	2[C], 4[O],
GLU	353	CD	6	2	2[C], 4[O],
GLU	353	OE1	2	2	2[O],
GLU	353	OE2	7	2	3[C], 4[O],
ARG	357	CZ	18	2	4[N], 5[O], 9[C],
ARG	357	CG	6	2	2[C], 4[O],
ARG	357	NE	13	2	4[O], 3[N], 6[C],
ARG	357	CD	8	2	4[C], 4[O],
MET	420	SD	7	2	2[N], 2[O], 3[C],
MET	420	CG	8	2	2[O], 2[N], 4[C],
TYR	421	CG	10	2	2[N], 4[O], 4[C],
TYR	421	CD1	11	2	4[O], 2[N], 5[C],
TYR	421	CE1	10	2	4[C], 2[N], 4[O],
TYR	421	CZ	9	2	1[N], 4[O], 4[C],
TYR	421	CD2	4	2	2[O], 2[C],
TYR	421	CE2	5	2	2[C], 3[O],
SER	423	OG	10	2	2[O], 2[N], 6[C],
ASP	424	OD2	19	2	9[C], 4[N], 6[O],
ASP	424	CG	18	2	9[C], 6[O], 3[N],
ASP	424	OD1	18	2	3[N], 6[O], 9[C],
THR	427	OG1	12	2	7[C], 3[N], 2[O],
THR	427	CG2	2	2	2[O],
ILE	428	CD1	14	2	8[C], 2[N], 4[O],
ILE	428	CG1	15	2	8[C], 4[O], 3[N],
ILE	428	CG2	3	2	3[C],
ASN	431	CG	8	2	5[C], 2[O], 1[N],
ASN	431	ND2	8	2	2[O], 1[N], 5[C],
ASN	431	OD1	7	2	5[C], 2[O],
Total = 85


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.