Atome 2 Filter

Binding Site Prediction
[Download fasta file] - [Download text file]
Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 4 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]	File	Volume (A3) (FPocket)	Hydrophobicity Score(FPocket)	Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: BGC_A_4(4YS6) / Model_42(4YS6/A) = [5.5]	Download	264.39	2.53	MKNKFRKIVGTIAILTASILLSACGNSGSADDSTGYVGIAMPTKSAERWIADGNNMVSELEKLGYKTDLQYGEDKVENQVAQIENMITKGVDTLVIASIDGSALTDVLAKAKEADIKVIAYDRLLMNSENVDYYATFDNFGVGVSQAAYIEEHLGLKEGKGPFTIELFGGSPDDNNALINYNGVMSVLQPYMDNGQLVVPSGQTSFSQIATLRWDGSTAQARMDNLLSANYTDQTLDAVLSPYDPISLGIISSLKGVGYGSESKPLPVITGQDATVAGVKSIIAGEQTQTIFKDTRILAKNTIEMIKAISDGEEVPVNDTETYDNGVKTVPTYLANTVSVDKDNYQAELIDTDYYKESDLKN
Complex: GAL_A_3(3URM) / Model_1(3URM/A) = [5.0]	Download	321.22	2.65	MKNKFRKIVGTIAILTASILLSACGNSGSADDSTGYVGIAMPTKSAERWIADGNNMVSELEKLGYKTDLQYGEDKVENQVAQIENMITKGVDTLVIASIDGSALTDVLAKAKEADIKVIAYDRLLMNSENVDYYATFDNFGVGVSQAAYIEEHLGLKEGKGPFTIELFGGSPDDNNALINYNGVMSVLQPYMDNGQLVVPSGQTSFSQIATLRWDGSTAQARMDNLLSANYTDQTLDAVLSPYDPISLGIISSLKGVGYGSESKPLPVITGQDATVAGVKSIIAGEQTQTIFKDTRILAKNTIEMIKAISDGEEVPVNDTETYDNGVKTVPTYLANTVSVDKDNYQAELIDTDYYKESDLKN
Complex: BDP_A_3(3UUG) / Model_2(3UUG/A) = [4.8]	Download	335.88	9.40	MKNKFRKIVGTIAILTASILLSACGNSGSADDSTGYVGIAMPTKSAERWIADGNNMVSELEKLGYKTDLQYGEDKVENQVAQIENMITKGVDTLVIASIDGSALTDVLAKAKEADIKVIAYDRLLMNSENVDYYATFDNFGVGVSQAAYIEEHLGLKEGKGPFTIELFGGSPDDNNALINYNGVMSVLQPYMDNGQLVVPSGQTSFSQIATLRWDGSTAQARMDNLLSANYTDQTLDAVLSPYDPISLGIISSLKGVGYGSESKPLPVITGQDATVAGVKSIIAGEQTQTIFKDTRILAKNTIEMIKAISDGEEVPVNDTETYDNGVKTVPTYLANTVSVDKDNYQAELIDTDYYKESDLKN
Complex: XYP_A_4(3MA0) / Model_48(3MA0/A) = [4.6]	Download	220.56	12.00	MKNKFRKIVGTIAILTASILLSACGNSGSADDSTGYVGIAMPTKSAERWIADGNNMVSELEKLGYKTDLQYGEDKVENQVAQIENMITKGVDTLVIASIDGSALTDVLAKAKEADIKVIAYDRLLMNSENVDYYATFDNFGVGVSQAAYIEEHLGLKEGKGPFTIELFGGSPDDNNALINYNGVMSVLQPYMDNGQLVVPSGQTSFSQIATLRWDGSTAQARMDNLLSANYTDQTLDAVLSPYDPISLGIISSLKGVGYGSESKPLPVITGQDATVAGVKSIIAGEQTQTIFKDTRILAKNTIEMIKAISDGEEVPVNDTETYDNGVKTVPTYLANTVSVDKDNYQAELIDTDYYKESDLKN
Consensus [pKd Mean = 4.97]	-	285 (s=46)	6 (s=4)	MKNKFRKIVGTIAILTASILLSACGNSGSADDSTGYVGIAMPTKSAERWIADGNNMVSELEKLGYKTDLQYGEDKVENQVAQIENMITKGVDTLVIASIDGSALTDVLAKAKEADIKVIAYDRLLMNSENVDYYATFDNFGVGVSQAAYIEEHLGLKEGKGPFTIELFGGSPDDNNALINYNGVMSVLQPYMDNGQLVVPSGQTSFSQIATLRWDGSTAQARMDNLLSANYTDQTLDAVLSPYDPISLGIISSLKGVGYGSESKPLPVITGQDATVAGVKSIIAGEQTQTIFKDTRILAKNTIEMIKAISDGEEVPVNDTETYDNGVKTVPTYLANTVSVDKDNYQAELIDTDYYKESDLKN

Res_Name	Res_Num	Res_At	Nb_Contacts	Nb_Complexes	Nb[At_Ligand]
PRO	42	CD	3	4	3[O],
PRO	42	CG	19	4	8[C], 11[O],
THR	43	OG1	1	4	1[O],
THR	43	CG2	10	4	4[C], 6[O],
SER	45	OG	4	4	3[O], 1[C],
ARG	48	CZ	47	4	24[O], 23[C],
ARG	48	CG	46	4	23[O], 23[C],
ARG	48	NE	47	4	23[C], 24[O],
ARG	48	CD	47	4	23[C], 24[O],
TRP	49	CE2	47	4	23[C], 24[O],
TRP	49	CG	41	4	19[O], 22[C],
TRP	49	CZ2	47	4	24[O], 23[C],
TRP	49	CZ3	47	4	24[O], 23[C],
TRP	49	NE1	47	4	23[C], 24[O],
TRP	49	CE3	46	4	23[O], 23[C],
TRP	49	CD1	41	4	22[C], 19[O],
TRP	49	CD2	47	4	23[C], 24[O],
ASP	52	OD1	4	4	4[O],
ASP	52	CG	5	4	5[O],
ASP	52	OD2	22	4	12[C], 10[O],
ASP	74	OD1	2	4	2[O],
ASP	74	CG	2	4	2[O],
ASP	74	OD2	5	4	3[O], 2[C],
ASP	122	OD2	46	4	23[O], 23[C],
ASP	122	OD1	40	4	20[C], 20[O],
ASP	122	CG	42	4	22[O], 20[C],
ARG	123	CD	43	4	20[O], 23[C],
ARG	123	CZ	47	4	23[C], 24[O],
ARG	123	NE	47	4	23[C], 24[O],
ARG	123	CG	43	4	20[O], 23[C],
THR	136	OG1	17	4	7[C], 10[O],
THR	136	CG2	1	4	1[O],
PHE	137	CE2	6	4	6[O],
PHE	137	CG	8	4	8[O],
PHE	137	CE1	2	4	2[O],
PHE	137	CD1	4	4	2[O], 2[C],
PHE	137	CD2	10	4	6[O], 4[C],
ASN	139	ND2	22	4	11[C], 11[O],
ASN	139	OD1	22	4	10[C], 12[O],
ASN	139	CG	23	4	11[O], 12[C],
VAL	142	CG2	11	4	3[C], 8[O],
VAL	142	CG1	12	4	4[C], 8[O],
GLN	146	NE2	5	4	3[O], 2[C],
SER	171	OG	2	4	2[O],
ASP	174	OD2	47	4	24[O], 23[C],
ASP	174	CG	44	4	23[C], 21[O],
ASP	174	OD1	37	4	23[C], 14[O],
ASN	176	OD1	24	4	12[O], 12[C],
ASN	176	ND2	45	4	23[C], 22[O],
ASN	176	CG	36	4	20[C], 16[O],
ASN	180	ND2	38	4	18[O], 20[C],
ASN	180	CG	28	4	15[C], 13[O],
ASN	180	OD1	20	4	10[C], 10[O],
ARG	213	CG	1	4	1[O],
ARG	213	CD	1	4	1[O],
TRP	214	CE2	47	4	24[O], 23[C],
TRP	214	CZ2	47	4	24[O], 23[C],
TRP	214	CD1	46	4	23[C], 23[O],
TRP	214	CD2	47	4	23[C], 24[O],
TRP	214	CZ3	47	4	24[O], 23[C],
TRP	214	NE1	47	4	24[O], 23[C],
TRP	214	CE3	47	4	23[C], 24[O],
TRP	214	CG	45	4	23[C], 22[O],
PRO	242	CG	6	4	3[C], 3[O],
TYR	243	CE1	43	4	20[O], 23[C],
TYR	243	CZ	41	4	21[C], 20[O],
TYR	243	CG	43	4	20[O], 23[C],
TYR	243	CE2	40	4	20[O], 20[C],
TYR	243	CD2	43	4	20[O], 23[C],
TYR	243	CD1	46	4	23[C], 23[O],
ASP	244	CG	3	4	3[O],
ASP	244	OD2	3	4	3[O],
ASP	244	OD1	3	4	3[O],
PRO	245	CG	28	4	12[O], 16[C],
PRO	245	CD	31	4	17[C], 14[O],
ILE	246	CD1	13	4	8[C], 5[O],
ILE	246	CG1	8	4	5[C], 3[O],
GLN	272	OE1	43	4	21[O], 22[C],
GLN	272	NE2	46	4	23[O], 23[C],
GLN	272	CG	40	4	22[C], 18[O],
GLN	272	CD	45	4	22[O], 23[C],
ASP	273	CG	47	4	23[C], 24[O],
ASP	273	OD1	47	4	24[O], 23[C],
ASP	273	OD2	47	4	24[O], 23[C],
THR	275	OG1	2	4	1[O], 1[C],
THR	275	CG2	6	4	1[C], 5[O],
ILE	291	CG2	1	4	1[O],
LYS	293	CD	28	4	16[C], 12[O],
LYS	293	NZ	45	4	23[C], 22[O],
LYS	293	CG	21	4	10[O], 11[C],
LYS	293	CE	40	4	20[O], 20[C],
THR	295	OG1	1	4	1[O],
THR	295	CG2	3	4	3[O],
LEU	298	CD2	5	4	5[O],
Total = 94


Binding Site Information :		Doc...
Information extracted from the bests complexes created by comparative docking.