Modeling by threading (Tito software)
Unconserved sides chains calculation (Scwrl software)
Evaluation (QMean software)



Input alignment information:
Query sequenceMSEIRVISKDSHETLEITTKDTVSLSEASVILIKVNKDDVSEIRQDGRNAIITLKNGEQIVIVDFFNGSNYSTDNSLVFEDNNHKLIWVQFTDANGALLENITYSYIDSIEPLLYHDGVASPWAWLSVPLTAAGILWWAHDSDDKNNNLNSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDTTAPDAPEIDPINGTDPITGTA-----EPGSTVTVTYPDGTTATVVAGTDGSWTVPNPG---LNDGD-VVTATATDAAGNESVP---ATEVVDTVPPVIAIDE--L-----------DDVDPITGTA-----EPGSTVTVNFPDGSTITTTTEGDGTWSVANPGT--LVTGD-VVTATATDAAGNTSLPVTSIVPVFIDAIDDIATVLSEITPVVTNPDIPGGALVTFPSLSFIGPIIDLKGQTPMEVTVPEGGVMTFDVSFFGVLAGGGLGAYDLNILRFNENTGGYEPYDKLDSVGLMVGFIGGVISGGATITDLPEGQYALVLTPGVGVNVTAIGIAGINVSNEVLSDYGDVVAKGNVITANNPENPTDVADVIHAGETATVISIANENGVVIALPQDQNGSTRIQGEYGELFIDKNGNYEYIRDFTIPNSLGKVDSFTYTIQDSDGHQDTATLNVRIDTNDLDITWPEDPTQDGVVELTATNNTAAAAITLVPSTNTTVDTGSMAASSTKPLFGAVTSVAGSDTSDVINVAANTAASLNFSVTTQGGILDSSANGDTFSYQVQKLVNGVWTTQPGASASVVHSSPILGDAGGTVLISGSYQVSASDTASQWRVVFGSTESNIPLIAGTNTTTVNTTVNATFTHYDQFVGNGATVTATGNLLTDDSGNGVDVTGGASTKVFVETSPGTYVQANGQTITVEDGTFVVSANGTYTFTANSSATSGDVATLNYKLVAATGDESTPATLTVNIGSETISTASHDIITTGAGADTVVYNLLNAADATGGNGKDEWTDFNLAQGDKVDISSLLNGANASNISNYVSVTSDGAGNTLISIDRDGTGNTYNSTDLIVLKNTDTTLDELLNNNQLLF
4P99 Chain:B ((47-219))-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTVAVSGTATGGDIAEGDTVTLEI-NGETYTTTVDANGEWSVDVAGSDLAADTAFDAVVTSSDAAGNTVDTTGSSTHTVDTEATAGTVTVNAITSDDVINASEAAGTVAVSGTATGGDIAEGDTVTLEI-NGETYTTTVDANGEWSVDVAGSDLAADTAFDAVVTSSDAAGNTVD-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------


General information:
TITO was launched using:
RESULT:

Template: 4P99.pdb
Alignment : align.pir
Tito was launched with SMD and SCWRL
Tito text output
Monomeric PKB - chain B - contact count / total energy / energy per contact / energy per residue : 456 36804 80.71 262.89
target 2D structure prediction score : 0.63
Monomeric hydrophicity matching model chain B : 0.65

3D Compatibility (PKB) : 80.71
2D Compatibility (Sec. Struct. Predict.) : 0.63
1D Compatibility (Hydrophobicity) : 0.65
QMean score : 0.659

(partial model without unconserved sides chains):
PDB file : Tito_4P99.pdb:





(Unconserved sides chains are recalculated) :
Sequence: align-4P99-query.scw
PDB file : Tito_Scwrl_4P99.pdb: