Modeling by threading (Tito software) Unconserved sides chains calculation (Scwrl software) Evaluation (QMean software) Input alignment information: Query sequence MSEIRVISKDSHETLEITTKDTVSLSEASVILIKVNKDDVSEIRQDGRNAIITLKNGEQIVIVDFFNGSNYSTDNSLVFEDNNHKLIWVQFTDANGALLENITYSYIDSIEPLLYHDGVASPWAWLSVPLTAAGILWWAHDSDDKNNNLNSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDTTAPDAPEIDPINGTDPITGT----AEPGSTVTVTYPDGTTATVVAGTDGSWTVPNPG---LNDGD-VVTATATDAAGNESVPA---TEVVDTVPPVIAIDE-------------LDDVDPITGTA-----EPGSTVTVNFPDGSTITTTTEGDGTWSVANPGT--LVTGD-VVTATATDAAGNTSLPVTSIVPVFIDAIDDIATVLSEITPVVTNPDIPGGALVTFPSLSFIGPIIDLKGQTPMEVTVPEGGVMTFDVSFFGVLAGGGLGAYDLNILRFNENTGGYEPYDKLDSVGLMVGFIGGVISGGATITDLPEGQYALVLTPGVGVNVTAIGIAGINVSNEVLSDYGDVVAKGNVITANNPENPTDVADVIHAGETATVISIANENGVVIALPQDQNGSTRIQGEYGELFIDKNGNYEYIRDFTIPNSLGKVDSFTYTIQDSDGHQDTATLNVRIDTNDLDITWPEDPTQDGVVELTATNNTAAAAITLVPSTNTTVDTGSMAASSTKPLFGAVTSVAGSDTSDVINVAANTAASLNFSVTTQGGILDSSANGDTFSYQVQKLVNGVWTTQPGASASVVHSSPILGDAGGTVLISGSYQVSASDTASQWRVVFGSTESNIPLIAGTNTTTVNTTVNATFTHYDQFVGNGATVTATGNLLTDDSGNGVDVTGGASTKVFVETSPGTYVQANGQTITVEDGTFVVSANGTYTFTANSSATSGDVATLNYKLVAATGDESTPATLTVNIGSETISTASHDIITTGAGADTVVYNLLNAADATGGNGKDEWTDFNLAQGDKVDISSLLNGANASNISNYVSVTSDGAGNTLISIDRDGTGNTYNSTDLIVLKNTDTTLDELLNNNQLLF 5IRB Chain:B ((134-308)) -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ITVSGRVGLDASAGDTVSMTI-NGTLYTTVVLANKTWSVGVSGSDLAQDNSFQVSVTGQDSAGNPYAGTTTSTHTVDTSADAGTVTVNAITSDDVINASEAAGTVAVSGTATGGDIAEGDTVTLEI-NGETYTTTVDANGEWSVDVAGSDLAADTAFDAVVTSSDAAGNTVDTTGSS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

General information: TITO was launched using: RESULT: Template: 5IRB.pdb Alignment : align.pir Tito was launched with SMD and SCWRL Tito text output Monomeric PKB - chain B - contact count / total energy / energy per contact / energy per residue : 501 28972 57.83 202.60 target 2D structure prediction score : 0.59 Monomeric hydrophicity matching model chain B : 0.66 3D Compatibility (PKB) : 57.83 2D Compatibility (Sec. Struct. Predict.) : 0.59 1D Compatibility (Hydrophobicity) : 0.66 QMean score : 0.623

(partial model without unconserved sides chains): PDB file : Tito_5IRB.pdb: (Unconserved sides chains are recalculated) : Sequence: align-5IRB-query.scw PDB file : Tito_Scwrl_5IRB.pdb: