Modeling by threading (Tito software) Unconserved sides chains calculation (Scwrl software) Evaluation (QMean software) Input alignment information: Query sequence MSEIRVISKDSHETLEITTKDTVSLSEASVILIKVNKDDVSEIRQDGRNAIITLKNGEQIVIVDFFNGSNYSTDNSLVFEDNNHKLIWVQFTDANGALLENITYSYIDSIEPLLYHDGVASPWAWLSVPLTAAGILWWAHDSDDKNNNLNSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDTTAPDAPEIDPINGTDPITGTAEPGSTVTVTYPDGTTATVVAGTDGSWTVPNPGLNDGDVVTATA------TDAAGNESVPATEVVD------TVPPVIAIDELDDVDPITGTAEPGSTVTVNFPDGSTITTTTEGDGTWSVANPGTLVTGDV----------VTATATDAAGNTSLPVTS---------IVPVFID------------AIDDIATVLSE--------ITPVVTNPDIPGGALVTFPSLSFIG-------PIIDLKGQTPMEVTVPEGGVM--------TFDV---------------SFFGVLAGGGLGAYDLNILRFNENTGGYEPYDKLDSVGLMVGFIGGVISGG-------------ATITDLPEGQYALVLTPGVGV-NVTAIGIAGINVSNEVLSDYGDVVAKGNVITANNPENP--TDVADVIHAGETATVISIAN-ENGVVIALPQDQNGSTRIQGE-------YGELFIDKNGNYEYIRDFTIPNSLGKVDSFTYTIQDSDGHQDTATLNVRIDTNDLDITWPEDPTQDGVVELTATNNTAAAAITLVPSTNTTVDTGSMAASSTKPLFGAVTSVAGSDTSDVINVAANTAASLNFSVTTQGGILDSSANGDTFSYQVQKLVNGVWTTQPGASASVV------------HSSPILGDAGGTVLISGSYQVSASDTASQWRVVFGSTESNIPLIAGTNTTTVNTTVNATFTHYDQFVGNGATVTATGNLLTDDSGNGVDVTGGAST-KVFVETSPGTYVQANGQTITVED---GTFVVSANGTYTFTANSSATSGDVATLNYKLVAATGDESTPATLTVNIGSETISTASHDIITTGAGADTVVYNLLNAADATGGNGKDEWTDFNLAQGDKVDISSLLNGANASNISNYVSVTSDGAGNTLISIDRDGTGNTYNSTDLIVLKNTDTTLDELLNNNQLLF 5GSM Chain:A ((1-786)) ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------MGKVEFSGKRYVI---DGEPVTIAGGTLQFFRVPADAWKDRLLKMREAGLNTVDTYVAWNWHEPEKGSFDFKGETHPQRNLVGFLELADELGFYVIIRPGPYICGEWRNGGIPDWLIDEHPEILAKGPNGPLPRDIYYPPITYLHPTYLEAVGEWYNAVFPVIRKYLYTNGGPIISVSIDDEPSYWETIFQPFLTDYNEIITKPGGLWEKWLEQNYTLEDLRRRYKGDFKDYSEIKVPTSFSEPLPKLIDWHHFKLWMINEYVRWIYERMAREFDVPISILDPYLLQVAWRHFFTYMREHNLKIHVWTEFWYSFYRSSDFKEDKLGHIYYKTGIYRYHVRKAGTPPLSIETQSSLAHTIDPTEAELLYSILPPLGIPNINYYLFVGGENPEGYESHNGITWDVYSPVGLDGSERPHFGVIKALSETMTSAEGLADAELRPKVAVGLYEPYEALNLWGYEGLEESTDLNEYLLGERGLFTLLAMSNTP--FDAVDLEDVTLDELLSYD-------QLWVYSLD--FMSREVQDKLVEFVARGG-NLVILPMLPRYDENLEPYSSLKDFLGVEVEREKARRNPRLIQFLSVSAEGIDRMLVRNTVRG-----VRGGEPIAFLGEKPV-GAFVRKGGGSAVVLGFRLQYYTSHHDLHRKFVWKLKELQGVREDFEVTNPDM-----IVLPMEGKGYAYLAVTNPRGHPIKGRISY--------RGLEVPVLLDGIELKRRGTLYLPFGVRKGDVEVAYATATLVMWEGDVLTFRNHLSGHSEIALKGVESVKVSGGKIVDGSDGEVLRIVIEHPGEYFEVELL--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

General information: TITO was launched using: RESULT: Template: 5GSM.pdb Alignment : align.pir Tito was launched with SMD and SCWRL Tito text output Monomeric PKB - chain A - contact count / total energy / energy per contact / energy per residue : 4031 55267 13.71 83.11 target 2D structure prediction score : 0.44 Monomeric hydrophicity matching model chain A : 0.69 3D Compatibility (PKB) : 13.71 2D Compatibility (Sec. Struct. Predict.) : 0.44 1D Compatibility (Hydrophobicity) : 0.69 QMean score : 0.102

(partial model without unconserved sides chains): PDB file : Tito_5GSM.pdb: (Unconserved sides chains are recalculated) : Sequence: align-5GSM-query.scw PDB file : Tito_Scwrl_5GSM.pdb: