Modeling by threading (Tito software) Unconserved sides chains calculation (Scwrl software) Evaluation (QMean software) Input alignment information: Query sequence MSEIRVISKDSHETLEITTKDTVSLSEASVILIKVNKDDVSEIRQDGRNAIITLKNGEQIVIVDFFNGSNYSTDNSLVFEDNNHKLIWVQFTDANGALLENITYSYIDSIEPLLYHDGVASPWAWLSVPLTAAGILWWAHDSDDKNNNLNSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDTTAPDAPEIDPINGTDPITGTAEPGSTVTVTYPDGTTATVVAGTDGSWTVPNPGLNDGDVVTATATDAAGNESVPATEVVDTVPPVIAIDELDDVDPITGTAEPGSTVTVNFPDGSTITTTTEGDGTWSVANPGTLVTGDVVTATATDAAGNTSLPVTSIVPVFIDAIDDIATVLSEITPVVTNPDIPGGALVTFPSLSFIGPIIDLKGQTPMEVTVPEGGVMTFDVSFFGVLAGGGLGAYDLNILRFNENTGGYEPYDKLDSVGLMVGFIGGVISGGATITDLPEGQYAL-----------VLTPGVGVNVTAIGIAGINVSNEVLSDYGDVVAKGNVITANNPENPTDVADVIHAGETATVISIANENGVVI-----ALPQDQNGSTRIQGEYGELFIDKNGNYE----YIRDFTIPNSLGKVDSFTYTIQDSDGHQDTATLNVRIDTNDLD-ITWPEDPTQDGVVELTAT-NNTAAAAITLVPSTNTTVDTGSMAASSTKPLFGAVTSVA------GSDTSDVINVAANTAASLNF------------SVTTQGGILDSSANGDTFSYQVQKLVNGVWTTQPGASASVVHSSPILGDAGGTVLISGSYQVSASDTASQWRVVFGSTESNIPLIAGTNTTTVN-TTVNATFTHYDQFVGNGATVTATGNLLTDDSGNGVDVTGGASTKVFVETSPGTYVQANGQTITVEDGTFVVSANGTYTFTANSSATSGDVATLNYKLVAATGDESTPATLTVNIGSETISTASHDIITTG--------AGADTVVYNLLNAADATGGNGKDEWTDFNLAQ-GDKVDISSLLNGANASNISNYVSVTSDGAGNTLISIDRDGTGNTYNSTDLIVLKNTDTTLDELLNNNQLLF 3VSM Chain:A ((27-659)) --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------NIQELQNFERWFKNNLSYSFSQKAEKVVNPNRNWNDNTV-FDNLSPWT-----------SVPDFGTVCHTLIGY----CVRYNNTSD-----TLYQNPELAYNLINGLRIICSKLPDPPPHQQAPWGPVADWYHFTITMPEVFMNITIV----LNETQ----HYDEAASLTRYWLGLYLPTAVNSMGWHRTAGNSMRMGVPYTYSQMLRGYSLAQIRQEQGIQEILNTIAFPYVTQGNGLHVDSIYIDHIDVR-AYGYLINSYFTFAYYTYYFGDEVINTVGLTRAIENVGSPEGVVVPGVMSRNGTLYSNVIGNFITYPLAVHSADYSKVLTKLSKTYYGSVVGVTNRLAYYESDPTNNIQAPLWTMARRIWNRRGRIINYNANTVSFESGIILQSLNG------IMRIPSGT-TSTQSFRPTIGQTAIAKTDTAGAILVYAKFAEMNNLQFKSCTLFYDHGMFQLYYNIGVEPNSLNNTNGRVIVLSRDTSVNTNDLSFEAQRINNNNSSEGTTFNGVVCHRVPITNINVPSLTVRSPNSSVELVEQIISFQTMYTATA-SACYKLNVEGHSDSLRAFRVNSDENIYVNVGNGVKALFNYPWVMVKENNKVSFMSANEDTTIPFSVIMNSFTSIGEPALQYSPSNCFVYGNGFKLNN-----STFDLQFIFEIV----------------------------------------------

General information: TITO was launched using: RESULT: Template: 3VSM.pdb Alignment : align.pir Tito was launched with SMD and SCWRL Tito text output Monomeric PKB - chain A - contact count / total energy / energy per contact / energy per residue : 3510 8833 2.52 15.15 target 2D structure prediction score : 0.43 Monomeric hydrophicity matching model chain A : 0.69 3D Compatibility (PKB) : 2.52 2D Compatibility (Sec. Struct. Predict.) : 0.43 1D Compatibility (Hydrophobicity) : 0.69 QMean score : 0.111

(partial model without unconserved sides chains): PDB file : Tito_3VSM.pdb: (Unconserved sides chains are recalculated) : Sequence: align-3VSM-query.scw PDB file : Tito_Scwrl_3VSM.pdb: