Modeling by threading (Tito software) Unconserved sides chains calculation (Scwrl software) Evaluation (QMean software) Input alignment information: Query sequence MSEIRVISKDSHETLEITTKDTVSLSEASVILIKVNKDDVSEIRQDGRNAIITLKNGEQIVIVDFFNGSNYSTDNSLVFEDNNHKLIWVQFTDANGALLENITYSYIDSIEPLLYHDGVASPWAWLSVPLTAAGILWWAHDSDDKNNNLNSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDTTAPDAPEIDPINGTDPITGTA-----EPGSTVTVTYPDGTTATVVAGTDGSWTVPNPG---LNDGD-VVTATATDAAGNESVPA---TEVVDTVPPVIAIDE--L-----------DDVDPITGTA-----EPGSTVTVNFPDGSTITTTTEGDGTWSVANPGT--LVTGD-VVTATATDAAGNTSLPVTSIVPVFIDAIDDIATVLSEITPVVTNPDIPGGALVTFPSLSFIGPIIDLKGQTPMEVTVPEGGVMTFDVSFFGVLAGGGLGAYDLNILRFNENTGGYEPYDKLDSVGLMVGFIGGVISGGATITDLPEGQYALVLTPGVGVNVTAIGIAGINVSNEVLSDYGDVVAKGNVITANNPENPTDVADVIHAGETATVISIANENGVVIALPQDQNGSTRIQGEYGELFIDKNGNYEYIRDFTIPNSLGKVDSFTYTIQDSDGHQDTATLNVRIDTNDLDITWPEDPTQDGVVELTATNNTAAAAITLVPSTNTTVDTGSMAASSTKPLFGAVTSVAGSDTSDVINVAANTAASLNFSVTTQGGILDSSANGDTFSYQVQKLVNGVWTTQPGASASVVHSSPILGDAGGTVLISGSYQVSASDTASQWRVVFGSTESNIPLIAGTNTTTVNTTVNATFTHYDQFVGNGATVTATGNLLTDDSGNGVDVTGGASTKVFVETSPGTYVQANGQTITVEDGTFVVSANGTYTFTANSSATSGDVATLNYKLVAATGDESTPATLTVNIGSETISTASHDIITTGAGADTVVYNLLNAADATGGNGKDEWTDFNLAQGDKVDISSLLNGANASNISNYVSVTSDGAGNTLISIDRDGTGNTYNSTDLIVLKNTDTTLDELLNNNQLLF 4P99 Chain:B ((48-227)) ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TVAVSGTATGGDIAEGDTVTLEI-NGETYTTTVDANGEWSVDVAGSDLAADTAFDAVVTSSDAAGNTVDTTGSSTHTVDTEATAGTVTVNAITSDDVINASEAAGTVAVSGTATGGDIAEGDTVTLEI-NGETYTTTVDANGEWSVDVAGSDLAADTAFDAVVTSSDAAGNTVDT-TGSSTHT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

General information: TITO was launched using: RESULT: Template: 4P99.pdb Alignment : align.pir Tito was launched with SMD and SCWRL Tito text output Monomeric PKB - chain B - contact count / total energy / energy per contact / energy per residue : 528 38541 72.99 262.18 target 2D structure prediction score : 0.58 Monomeric hydrophicity matching model chain B : 0.66 3D Compatibility (PKB) : 72.99 2D Compatibility (Sec. Struct. Predict.) : 0.58 1D Compatibility (Hydrophobicity) : 0.66 QMean score : 0.623

(partial model without unconserved sides chains): PDB file : Tito_4P99.pdb: (Unconserved sides chains are recalculated) : Sequence: align-4P99-query.scw PDB file : Tito_Scwrl_4P99.pdb: