@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Query sequence : gbs1647: (2015-12-09 )
MAIRKLVVMSDSHGDRDIVKDIKNHYLGKVDAIFHNGDSELPSSDPIWEGIHVVTGNCDYDSGYPEVLVTKIDNTVIVQTHGHLHQINFTWDKLDLLAQQEDADICLYGHLHRADAWKNGKTIFINPGSVLQPRGPINEKLYAVVTITDSKVLVEYYTRQHQPYPNLTKEFSR

Atome Classification :

(20 SA) .........10.....---.------------.----------.-20------------......----------.----..-30.......----.40--...----------.-------------.----.---.----.----50.------.......60--------.--------------------------------------.---.------------------------.--------------------.---------------------------------.-------------------------------------.-------.-------------------------------------.----70-.-----........80-------....----....---------90------..---.-......100--.......---.110......---------------------.-----120-......------.130..---------.-------------------.-------...140-.------........150........160.......170.--------------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) MAIRKLVVMSDSHGDR---D------------I----------V-K-------------DIKNHY----------L----GK-VDAIFHNGD----SEL--PSS----------D-------------P----I---W----E----GIH------VVTGNCDY---------D--------------------------------------S---G------------------------Y--------------------P---------------------------------E-------------------------------------V-------L-------------------------------------V----T--K-----IDNTVIVQTH-------GHLH----QINF---------T-------WD---K-LDLLAQQE---DADICLY---GHLHRADAWK---------------------N-----GKT-IFINPG------SVLQPR---------G-------------------P-------INEK---L------YAVVTITDS-KVLVEYYTRQHQPYPNLTKEFSR--------------------------
1 PsiBlast_PDB 96.6458%-108 - C1 -3CK2 ? A:[5-176] -AKQTIIVMSDSHGDS---L------------I----------V-E-------------EVRDRY----------V----GK-VDAVFHNGD----SEL--RPD----------S-------------P----L---W----E----GIR------VVKGNMDF---------Y--------------------------------------A---G------------------------Y--------------------P---------------------------------E-------------------------------------R-------L-------------------------------------V----T--E-----LGSTKIIQTH-------GHLF----DINF---------N-------FQ---K-LDYWAQEE---EAAICLY---GHLHVPSAWL---------------------E-----GKI-LFLNPG------SISQPR---------G-------------------T-------IREC---L------YARVEIDDS-YFKVDFLTRDHEVYPGLSKEFSR--------------------------
27 HHSearch 96.0758%-106 - C1 -3CK2 ? A:[4-176] MAKQTIIVMSDSHGDS---L------------I----------V-E-------------EVRD-R----------YV---GK-VDAVFHNGD----SEL--RPD------------------------S----P---LW---E----GIR------VVKGNMDF---------Y--------------------------------------A---G------------------------Y--------------------P---------------------------------E-------------------------------------R-------L-------------------------------------V----T--E-----LGSTKIIQTH-------GHLF----DINF---------N-------FQ---K-LDYWAQEE---EAAICLY---GHLHVPSAWL---------------------E-----GKI-LFLNPG------SISQPR---------G-------------------T-------IREC---L------YARVEIDDS-YFKVDFLTRDHEVYPGLSKEFSR--------------------------
48 Fugue 70.6025%-102 - C1 -1W24 - VPS29_HUMAN A:[1-182] ---MLVLVLGDLHIPHRCNS------------L----------P-A-------------KFKKLLV---------P----GK-IQHILCTGNLCTKESY--DYL----------K-------------T----L---A----G----DVH------IVRGDFDE---------N--------------------------------------L---N------------------------Y--------------------P---------------------------------E-------------------------------------Q-------K-------------------------------------V----V--T-----VGQFKIGLIH-------GH------QVIP---------D-------MA---S-LALLQRQF---DVDILIS---GHTHKFEAFE---------------------H-----ENK-FYINPG------SATGAY---------N-------------------A-------LETNIIPS------FVLMDIQAS-TVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKKP-------------------------
34 HHSearch 60.9526%-107 - C1 -2KKN - ? A:[1-157] --VKRFLLISDSHVPV---R------------MAS--------LPD-------------EILN-S----------L----KE-YDGVIGLGD----YVD--LDT----------V-------------ILLE-K---FS---K----EFY------GVHGNMDY---------P--------------------------------------DVKEH------------------------L--------------------P---------------------------------F-------------------------------------S-------K-------------------------------------V----L--L-----VEGVTIGMCH-------GWGA----PW-D---------L-------KD---R-LLKVF-NE---KPQVILF---GHTHEPEDTV---------------------K-----AGV-RFLNPG------SLA------------------------------------------EG---S------YAVLELDGG-EVRFELKTL----------------------------------------
30 HHSearch 59.5320% -91 - C1 -1S3L P936_METJA A:[26-189] ---MKIGIMSDTHDHL---P------------N----------I-R-------------KAIE-I----------FND--EN-VETVIHCGD----FVS--LFV----------I-------------K----EFENLN---A----NII------ATYGNNDG---------E--------------------------------------R---CKLKEWLKD----------------I--------------------NEENIID---------------------------D-------------------------------------F-------I-------------------------------------S----V--E-----IDDLKFFITH-------GHHQ----SV--------------------------LEMAIKSG---LYDVVIY---GHTHERVFEE---------------------V-----DDV-LVINPG------ECCGYL---------T-------------------G---------IP---T------IGILDTEKK-EYREIVL------------------------------------------
28 HHSearch 59.3225% -77 - C1 -1Z2W VPS29_MOUSE A:[11-189] ---MLVLVLGDLHIPH---R------------CNS--------L-P-------------AKFKKL----------LVP--GK-IQHILCTGN----LCT--KES----------Y-------------D----YLKTLA---G----DVH------IVRGDFDE---------N--------------------------------------L---N------------------------Y--------------------P---------------------------------E-------------------------------------Q-------K-------------------------------------V----V--T-----VGQFKIGLIH-------GHQV----IPWG---------D-------MA---S-LALLQRQF---DVDILIS---GHTHKFEAFE---------------------H-----ENK-FYINPG------SATGAY---------N-------------------ALET----NIIP---S------FVLMDIQAS-TVVTYVYQLIGDDVKVERIEYKK--------------------------
33 HHSearch 58.1018% -85 - C1 -2A22 - ? A:[5-196] -FGDLVLLIGDLKIPY---G------------AKEL-------P-S-------------NFRE-L----------LAT--DK-INYVLCTGN----VCS--QEY----------V-------------EMLK-N---IT---K----NVY------IVSGDLDS---------A--------------------------------------I---FNPDPESNGV---------------F--------------------P---------------------------------E-------------------------------------Y-------V-------------------------------------V----V--Q-----IGEFKIGLMH-------GNQV----LPWD---------D-------PG---S-LEQWQRRL---DCDILVT---GHTHKLRVFE---------------------K-----NGK-LFLNPG------TATGAF---------S-------------------ALTP----DAPP---S------FMLMALQGN-KVVLYVYDLRDGKTNVAMSEFSK--------------------------
35 HHSearch 57.9225% -86 - C1 -1SU1 YFCE_ECOLI A:[25-198] --MMKLMFASDIHGSL---P------------A----------T-E-------------RVLE-L----------FAQ--SG-AQWLVILGD----VLN--HGP----------RNALPEGYAPAKVVE----R---LNEVAH----KVI------AVRGNCDS---------E--------------------------------------V---D------------------------QMLLHF---------------P---------------------------------ITAP----------------------------------W-------Q-------------------------------------Q----V--L-----LEKQRLFLTH-------GHLF----GPEN---------------------------LPALN---QNDVLVY---GHTHLPVAEQ---------------------R-----GEI-FHFNPG------SVSIPK---------G-------------------G-------N-PA---S------YGMLDNDV-----LSVIALNDQSIIAQVAINP---------------------------
9 PsiBlast_PDB 55.2124% -96 - C1 -2A22 - ? A:[58-196] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------I---T----K----NVY------IVSGDLDSAIFNPDPESN--------------------------------------G---V------------------------F--------------------P---------------------------------E-------------------------------------Y-------V-------------------------------------V----V--Q-----IGEFKIGLMH-------GN------QV-L---------P-------WD---D-PGSLEQWQRRLDCDILVT---GHTHKLRVFE---------------------K-----NGK-LFLNPGTATGAFSALTPD---------A-------------------P-------PS------------FMLMALQGN-KVVLYVYDLRDGKTNVAMSEFSK--------------------------
8 PsiBlast_PDB 54.0223% -84 - C1 -1SU1 YFCE_ECOLI A:[25-203] --MMKLMFASDIHGSL---P------------A----------T-E-------------RVLELFAQSGAQWLVIL----G---DVLNHGPR----NAL--PEGYAPAKVVERLN-------------E----V---A----H----KVI------AVRGNCDS---------EVDQMLLHFPIT---------------------------A---P------------------------W--------------------Q---------------------------------Q-------------------------------------V-------L-------------------------------------L----E--K--------QRLFLTH-------GHL--------F---------G-------PE---N-LPALNQN------DVLVY---GHTHLPVAEQ---------------------R-----GEI-FHFNPG------SVSIPK---------G-------------------GNPASYGMLDND---V------LSVIALNDQ-SIIAQVAINP---------------------------------------
31 HHSearch 53.8719% -64 - C1 -3RQZ ? A:[2-227] -NAMRILIISDVHANL---V------------A----------L-E-------------AVLS-D----------A----GR-VDDIWSLGD----IVG--YGP----------RPRECV--------E----L---VRVL-A----PNI------SVIGNHDW---------A--------------------------------------C---I------------------------GRLSLDNPVARFASYWTTMQLQ---------------------------------A-------------------------------------E-------HLQYLESL------------------------------P----N--R-----MIDGDWTVVH-------GSPR----HPIW---------E-------YIYNARIAALNFPAF---DTPLCFV---GHTHVPLYIREDEALSNVAPHHPNDGEVLDVS-----SGR-YIINPG------AVGQPR---------D-------------------G-------DPRA---S------YAIFEPDAQ-RVTFHRVEYRIADTQAQMREAGL--------------------------
50 Fugue 52.8419% -75 - C1 -3QFM ? A:[11-268] --MTKIALLSDIHGNT---T------------A----------L-E-------------AVLADA----------R----QLGVDEYWLLGD----ILMPGTGR----------R-------------R----I---L----D----LLDQLPITARVLGNWED---------SLWHGVRKELDSTRPSQRYLLRQCQYVLEEISLEEIEVLH---N------------------------Q--------------------P---------------------------------L-------------------------------------Q-------I-------------------------------------H----R--Q-----FGDLTVGISHHLPDKNWGREL----IHTG---------K-------QE---E-FDRLVTHP---PCDIAVY---GHIHQQLLRYG--------------------T-----GGQ-LIVNPG------SIGQPF---------F-------------------L-------DAQL---RKDLRAQYMILEFDDK-GLVDMDFRRVDYDVAAELQLAKDLRLPYFEVYYESLVNGIHHTHHQEFL
29 HHSearch 51.6421% -76 * C1 *3QFM ? A:[11-230] --MTKIALLSDIHGNT---T------------A----------L-E-------------AVLA-D----------ARQ--LG-VDEYWLLGD----ILM--PGT----------GRRRIL--------D----L---LDQL-P----ITA------RVLGNWED---------S--------------------------------------L---W------------------------HGVRKELDSTR----------P---------------------------------SQRYLLRQCQYVLEEISL--------------------EEIEVLHNQ-------------------------------------PLQIHR--Q-----FGDLTVGISH-------HLPD----KNWG---------RELIHTGKQE---E-FDRLVTHP---PCDIAVY---GHIHQQLLRYG--------------------T-----GGQ-LIVNPG------SIGQPF---------F-------------------LDAQLRK-DLRA---Q------YMILEFDDKGLVDMDFRRVDYDVAAELQLAKDL--------------------------
49 Fugue 51.3117% -82 - C1 -1S3L P936_METJA A:[26-190] ---MKIGIMSDTHDHL---P------------N----------I-R-------------KAIEIF----------ND---EN-VETVIHCGD----FVS--LFV----------I-------------K----E---F----ENLNANII------ATYGNNDG---------E--------------------------------------R---C------------------------K--------------------L---------------------------------K-------------------------------------E-------W-------------------------------------L----K--D-----INEENIIDDF-------ISVEIDDLKFFI---------THGHH---QS---V-LEMAIKSG---LYDVVIY---GHTHERVFEE---------------------V-----DDV-LVINPG------ECCGYL---------T----------------------------GIP---T------IGILDTEKK-EYREIVL------------------------------------------
39 HHSearch 50.5120% -98 - C1 -1UF3 ? A:[4-225] -TVRYILATSNPMGDL---E------------A----------L-E-------------KFVK-L----------APD--TG-ADAIALIGN----LMP--KAA----------KSRDYAAFF-----R----I---LSEAHL----PTA------YVPGPQDA---------P--------------------------------------I---WEY----------------------LREAANVELVH----------PEMRNVH---------------------------E-------------------------------------T-------FTFWRGPYLVAGVGGEIADEGEPEEHEALRYPAWVAEYR----L--KALWELKDYPKIFLFH-------TMPY----HKGLNEQ------G-------SH---E-VAHLIKTH---NPLLVLVAGKGQKHE----M---------------------L-----GAS-WVVVPG------DLS------------------------------------------EG---E------YSLLDLRAR-KLETGNVR-----------------------------------------
42 HHSearch 50.3021% -80 - C1 -1UTE PPA5_PIG A:[5-297] -PILRFVAVGDWGGVP---N------------APFHTAREMANA-K-------------AIAT-T----------VKT--LG-ADFILSLGD----NFY--FTGVHDAK-----DKRFQETF------EDVFSDPSLRN---V----PWH------VLAGNHDH---------L--------------------------------------G---NVSAQIAYSKISKRWNFPSPYYRLRFKI------------------P---------------------------------RSNVSVAIFMLDTVTLCGNSDDFVSQQPERPRNLALART-------QLAWIKK-------------------------------Q----LAAA-----KEDYVLVAGH-------YPVW----SIAE---------HGPTHCL-VK---Q-LLPLLTTH---KVTAYLC---GHDHNLQYLQ---------------------DE----NGL-GFVLSG------AGNFMD---------PSKKHLRKVPNGYLRFHFGAE-------NSLG---G------FAYVEITPK-EMSVTYIEASGKSLFKTKLPRRA--------------------------
7 PsiBlast_PDB 49.1336%-104 - C1 -2R17 - VPS29_HUMAN A:[57-135] ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VH------IVRGDFDE---------N--------------------------------------L---N------------------------Y--------------------P---------------------------------E-------------------------------------Q-------K-------------------------------------V----V--T-----VGQFKIGLIH-------GH------QV-I---------P-------WGDMAS-LALLQRQF---DVDILIS---GHTHKFEAFE---------------------H-----ENK-FYINPG------SATGAY---------N-------------------A-------LETN---I------IPSFVLMDI-QASTVVTYVYQLIGDDVKVERIE--------------------------
41 HHSearch 48.4417% -90 - C1 -3D03 ? A:[1-255] ---MLLAHISDTHFRS---RGEKLYGFIDVNAA----------N-A-------------DVVS-Q----------LNALRER-PDAVVVSGD----IVN--CGR----------PEEYQVAR------Q----ILGSLN---Y----PLY------LIPGNHDD---------K--------------------------------------A---L------------------------FLEYLQPLCPQL---------GSDANNMRCAVDDFATRLLFIDSSRAGTSKGWLTD-------------------------------------E-------TISWLEA-------------------------------Q----L--FEG---GDKPATIFMH-------HPPL----PLGNAQMDPIACEN-------GH---R-LLALVERFP--SLTRIFC---GHNHSLTMTQ---------------------Y-----RQALISTLPG------TVHQVPYCHADTDPYY-------------------D-------LSPA---S------CLMHRQVGE-QWVSYQHSLAHYAGPWLYDENIS--------------------------
4 PsiBlast_PDB 48.3536% -95 - C1 -3PSN VPS29_MOUSE A:[66-144] ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VH------IVRGDFDE---------N--------------------------------------L---N------------------------Y--------------------P---------------------------------E-------------------------------------Q-------K-------------------------------------V----V--T-----VGQFKIGLIH-------GH------QV-I---------P-------WGDMAS-LALLQRQF---DVDILIS---GHTHKFEAFE---------------------H-----ENK-FYINPG------SATGAY---------N-------------------A-------LETN---I------IPSFVLMDI-QASTVVTYVYQLIGDDVKVERIE--------------------------
38 HHSearch 48.0621% -97 - C1 -1XM7 - ? A:[-1-172] ---AMMYFISDTHFYH---E------------N----------I-INLNPEVRFKGFEIVILT-N----------LLKVLKP-EDTLYHLGD----FTW--HFN----------DKNEYL--------R----I---WKALPG----RKI------LVMGNHDK---------D--------------------------------------K---E------------------------SL-------------------KEYFD-----------------------------E-------------------------------------IYDFY---K-------------------------------------I----I--E-----HKGKRILLSH-------YPAK----DPITERYPD----R-------QE---M-VREIYFKE---NCDLLIH---GHVHWNREG-----------------------CACKDYRI-ECINAN------VEWNDY---------K-------------------P-------ISER---E------IDKLI------------------------------------------------------