@TOME V2.3
(Nov 2016)
Ref.
-
-
Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Atome Result
Tools Result
PDB occurence
Core Structure Cluster
Sequence Color type :
Secondary Structure
Hydrophobicity
Disulfide Bonds
TCoffee Identity Score
Uniprot annotation
Core Structure Cluster
Contacts with Ligands
Show alignment :
Atome selection
All alignments
Only Template with Ligand
Column output:
Score:
Atome Rank Value
Tools Score
Hide column
Alignment:
Sequence Identity (%)
Tcoffee Alignment Score
Hide column
3D Common Core:
Tito PKB Score
Verify3D Score
QMean Score
Hide column
Structural Clustering:
Cluster Num
3D-Jury Struct. Score
Hide column
Modeller Result :
Model Rank
QMean Score
Dfire Score
Dope Score
Errat Score
Verify3D Score
Modeller Score
Hide column
Complexes Modeling
Show Ligands of Templates
Complexes Affinity Score
Main Binding Site Identity
Hide column
Templates Information:
Uniprot entry
Cath class
Scop class
Smart class
Prosite class
Pfam class
EC Number
Taxonomy
Experiment Method
Hide column
Sequence & Result Tab:
PDB Template Sequence
Complexes Tab
Values color: [
Good
|
Correct
|
Middling
|
Bad
]
Sequence color :
Mutated
Helix
Strand
Conserved
Query sequence : PF00704_CHIT1_: (2014-09-15 )
MVRSVAWAGFMVLLMIPWGSAAKLVCYFTNWAQYRQGEARFLPKDLDPSLCTHLIYAFAGMTNHQLSTTEWNDETLYQEFNGLKKMNPKLKTLLAIGGWNFGTQKFTDMVATANNRQTFVNSAIRFLRKYSFDGLDLDWEYPGSQGSPAVDKERFTTLVQDLANAFQQEAQTSGKERLLLSAAVPAGQTYVDAGYEVDKIAQNLDFVNLMAYDFHGSWEKVTGHNSPLYKRQEESGAAASLNVDAAVQQWLQKGTPASKLILGMPTYGRSFTLASSSDTRVGAPATGSGTPGPFTKEGGMLAYYEVCSWKGATKQRIQDQKVPYIFRDNQWVGFDDVESFKTKVSYLKQKGLGGAMVWALDLDDFAGFSCNQGRYPLIQTLRQELSLPYLPSGTPELEVPKPGQPSEPEHGPSPGQDTFCQGKADGLYPNPRERSSFYSCAAGRLFQQSCPTGLVFSNSCKCCTWN
Atome Classification :
(17 SA)
.........10........20........----30........---40........----50--.........60.-------------------------------.-.--...-.----------------.-------------70...----------------------.-------------....80-........90........100.------......110.......120.......130---------------........140...-..------.---.150.......160.......170.-....--..180.......190..-.-....200.........210.....-..-220........------230....----------------------.-.----.240.......250........260.......270....-...280.......290.....---------------...300......-.----310.........320.....--..330.......340.......350.......360.......370.-......380.......390.......400.......410.......420.......430.......440.......450.......460....
(Atome)
(Ident)
(Tito)
(Num)
(Ligand)
(Uniprot)
MVR
S
V
A
W
A
G
F
M
V
L
L
M
IPWGSA
A
K
L
V
C
Y
FT----
N
W
A
Q
YRQGEA---RFLPKDL
D
P
S
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
FAGMT-------------------------------N-H--QLS-T----------------T-------------EWN
D
E
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
E
FN-
G
L
K
KMNPK
L
K
T
L
L
A
IGGWNF
G
T
------
Q
K
F
T
D
M
VATANN
R
Q
T
F
V
N
S
A
I
R
F
L
R
K
YS----------------FDGL
D
L
D
W
EYPGSQ-GS------P---AV
D
K
E
R
F
T
T
L
V
Q
D
L
A
N
A
F
Q
Q
E
A
QTS-GK
E
R
--
L
L
L
S
AAVPAGQ
T
Y
V
DAG-Y-
E
V
D
K
I
--
A
QNLD
F
V
N
L
M
A
Y
DFHGS-WE-KV-TGHNSPLY------
K
R
QEESG----------------------A-A----ASL
N
V
D
A
A
V
Q
Q
W
L
-
Q
KGTPAS
K
L
I
L
GMPTYG
R
S
F
T
LASS-SDTRVGAPATGSGT-PGPFTK---------------EG
G
M
L
A
Y
Y
E
VCS-W----K--G
A
T
K
Q
RIQDQKV
P
Y
I
F
R--DN
Q
W
VG
F
D
D
V
E
S
F
K
T
K
V
S
Y
L
K
QKGLG
G
A
M
V
W
A
L
D
L
D
DFAGFSCNQG-R
Y
P
L
I
Q
T
L
R
Q
ELSLPYLPSGTPELEVPKPGQPSEPEHGPSPGQDTFCQGKADGLYPN
P
R
E
R
S
S
F
Y
S
C
A
A
G
R
L
F
Q
QSCPT
G
L
V
FSNSCKCCTWN
5
PsiBlast_PDB
98.69
100%
-92
- C1 -
1LG2
5
CHIT1_HUMAN
A:
[1-365]
---------------------
A
K
L
V
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
Q
G
E
A
---
R
F
L
P
K
D
L
D
P
S
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
T
-------------------------------
N
-
H
--
Q
L
S
-
T
----------------
T
-------------
E
W
N
D
E
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
E
F
N
-
G
L
K
K
M
N
P
K
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
Q
K
F
T
D
M
V
A
T
A
N
N
R
Q
T
F
V
N
S
A
I
R
F
L
R
K
Y
S
----------------
F
D
G
L
D
L
D
W
E
Y
P
G
S
Q
-
G
S
------
P
---
A
V
D
K
E
R
F
T
T
L
V
Q
D
L
A
N
A
F
Q
Q
E
A
Q
T
S
-
G
K
E
R
--
L
L
L
S
A
A
V
P
A
G
Q
T
Y
V
D
A
G
-
Y
-
E
V
D
K
I
--
A
Q
N
L
D
F
V
N
L
M
A
Y
D
F
H
G
S
-
W
E
-
K
V
-
T
G
H
N
S
P
L
Y
------
K
R
-----------------------------
A
----
A
S
L
N
V
D
A
A
V
Q
Q
W
L
-
Q
K
G
T
P
A
S
K
L
I
L
G
M
P
T
Y
G
R
S
F
T
L
A
S
S
-
S
D
T
R
V
G
A
P
A
T
G
S
G
T
-
P
G
P
F
T
K
---------------
E
G
G
M
L
A
Y
Y
E
V
C
S
-
W
----
K
--
G
A
T
K
Q
R
I
Q
D
Q
K
V
P
Y
I
F
R
--
D
N
Q
W
V
G
F
D
D
V
E
S
F
K
T
K
V
S
Y
L
K
Q
K
G
L
G
G
A
M
V
W
A
L
D
L
D
D
F
A
G
F
S
C
N
Q
G
-
R
Y
P
L
I
Q
T
L
R
Q
E
L
S
--------------------------------------------------------------------------------
10
PsiBlast_PDB
97.55
99%
-90
- C1 -
1HKK
4
CHIT1_HUMAN
A:
[1-364]
---------------------
A
K
L
V
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
Q
G
E
A
---
R
F
L
P
K
D
L
D
P
S
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
T
-------------------------------
N
-
H
--
Q
L
S
-
T
----------------
T
-------------
E
W
N
D
E
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
E
F
N
-
G
L
K
K
M
N
P
K
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
Q
K
F
T
D
M
V
A
T
A
N
N
R
Q
T
F
V
N
S
A
I
R
F
L
R
K
Y
S
----------------
F
D
G
L
D
L
D
W
E
Y
P
G
S
Q
-
G
S
------
P
---
A
V
D
K
E
R
F
T
T
L
V
Q
D
L
A
N
A
F
Q
Q
E
A
Q
T
S
-
G
K
E
R
--
L
L
L
S
A
A
V
P
A
G
Q
T
Y
V
D
A
G
-
Y
-
E
V
D
K
I
--
A
Q
N
L
D
F
V
N
L
M
A
Y
D
F
H
G
S
-
W
E
-
K
V
-
T
G
H
N
S
P
L
Y
------
K
R
Q
E
Q
S
G
----------------------
A
-
A
----
A
S
L
N
V
D
A
A
V
Q
Q
W
L
-
Q
K
G
T
P
A
S
K
L
I
L
G
M
P
T
Y
G
R
S
F
T
L
A
S
S
-
S
D
T
R
V
G
A
P
A
T
G
S
G
T
-
P
G
P
F
T
K
---------------
E
G
G
M
L
A
Y
Y
E
V
C
S
-
W
----
K
--
G
A
T
K
Q
R
I
Q
D
Q
K
V
P
Y
I
F
R
--
D
N
Q
W
V
G
F
D
D
V
E
S
F
K
T
K
V
S
Y
L
K
Q
K
G
L
G
G
A
M
V
W
A
L
D
L
D
D
F
A
G
F
S
C
N
Q
G
-
R
Y
P
L
I
Q
T
L
R
Q
E
L
---------------------------------------------------------------------------------
4
PsiBlast_PDB
97.00
100%
-89
- C1 -
1LG1
1
CHIT1_HUMAN
A:
[1-365]
---------------------
A
K
L
V
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
Q
G
E
A
---
R
F
L
P
K
D
L
D
P
S
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
T
-------------------------------
N
-
H
--
Q
L
S
-
T
----------------
T
-------------
E
W
N
D
E
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
E
F
N
-
G
L
K
K
M
N
P
K
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
Q
K
F
T
D
M
V
A
T
A
N
N
R
Q
T
F
V
N
S
A
I
R
F
L
R
K
Y
S
----------------
F
D
G
L
D
L
D
W
E
Y
P
G
S
Q
-
G
S
------
P
---
A
V
D
K
E
R
F
T
T
L
V
Q
D
L
A
N
A
F
Q
Q
E
A
Q
T
S
-
G
K
E
R
--
L
L
L
S
A
A
V
P
A
G
Q
T
Y
V
D
A
G
-
Y
-
E
V
D
K
I
--
A
Q
N
L
D
F
V
N
L
M
A
Y
D
F
H
G
S
-
W
E
-
K
V
-
T
G
H
N
S
P
L
Y
------
K
R
Q
E
E
S
G
----------------------
A
-
A
----
A
S
L
N
V
D
A
A
V
Q
Q
W
L
-
Q
K
G
T
P
A
S
K
L
I
L
G
M
P
T
Y
G
R
S
F
T
L
A
S
S
-
S
D
T
R
V
G
A
P
A
T
G
S
G
T
-
P
G
P
F
T
K
---------------
E
G
G
M
L
A
Y
Y
E
V
C
S
-
W
----
K
--
G
A
T
K
Q
R
I
Q
D
Q
K
V
P
Y
I
F
R
--
D
N
Q
W
V
G
F
D
D
V
E
S
F
K
T
K
V
S
Y
L
K
Q
K
G
L
G
G
A
M
V
W
A
L
D
L
D
D
F
A
G
F
S
C
N
Q
G
-
R
Y
P
L
I
Q
T
L
R
Q
E
L
S
--------------------------------------------------------------------------------
7
PsiBlast_PDB
96.97
99%
-89
- C1 -
1HKI
3
CHIT1_HUMAN
A:
[1-365]
---------------------
A
K
L
V
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
Q
G
E
A
---
R
F
L
P
K
D
L
D
P
S
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
T
-------------------------------
N
-
H
--
Q
L
S
-
T
----------------
T
-------------
E
W
N
D
E
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
E
F
N
-
G
L
K
K
M
N
P
K
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
Q
K
F
T
D
M
V
A
T
A
N
N
R
Q
T
F
V
N
S
A
I
R
F
L
R
K
Y
S
----------------
F
D
G
L
D
L
D
W
E
Y
P
G
S
Q
-
G
S
------
P
---
A
V
D
K
E
R
F
T
T
L
V
Q
D
L
A
N
A
F
Q
Q
E
A
Q
T
S
-
G
K
E
R
--
L
L
L
S
A
A
V
P
A
G
Q
T
Y
V
D
A
G
-
Y
-
E
V
D
K
I
--
A
Q
N
L
D
F
V
N
L
M
A
Y
D
F
H
G
S
-
W
E
-
K
V
-
T
G
H
N
S
P
L
Y
------
K
R
Q
E
Q
S
G
----------------------
A
-
A
----
A
S
L
N
V
D
A
A
V
Q
Q
W
L
-
Q
K
G
T
P
A
S
K
L
I
L
G
M
P
T
Y
G
R
S
F
T
L
A
S
S
-
S
D
T
R
V
G
A
P
A
T
G
S
G
T
-
P
G
P
F
T
K
---------------
E
G
G
M
L
A
Y
Y
E
V
C
S
-
W
----
K
--
G
A
T
K
Q
R
I
Q
D
Q
K
V
P
Y
I
F
R
--
D
N
Q
W
V
G
F
D
D
V
E
S
F
K
T
K
V
S
Y
L
K
Q
K
G
L
G
G
A
M
V
W
A
L
D
L
D
D
F
A
G
F
S
C
N
Q
G
-
R
Y
P
L
I
Q
T
L
R
Q
E
L
S
--------------------------------------------------------------------------------
8
PsiBlast_PDB
96.62
99%
-88
- C1 -
1HKJ
3
CHIT1_HUMAN
A:
[1-365]
---------------------
A
K
L
V
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
Q
G
E
A
---
R
F
L
P
K
D
L
D
P
S
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
T
-------------------------------
N
-
H
--
Q
L
S
-
T
----------------
T
-------------
E
W
N
D
E
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
E
F
N
-
G
L
K
K
M
N
P
K
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
Q
K
F
T
D
M
V
A
T
A
N
N
R
Q
T
F
V
N
S
A
I
R
F
L
R
K
Y
S
----------------
F
D
G
L
D
L
D
W
E
Y
P
G
S
Q
-
G
S
------
P
---
A
V
D
K
E
R
F
T
T
L
V
Q
D
L
A
N
A
F
Q
Q
E
A
Q
T
S
-
G
K
E
R
--
L
L
L
S
A
A
V
P
A
G
Q
T
Y
V
D
A
G
-
Y
-
E
V
D
K
I
--
A
Q
N
L
D
F
V
N
L
M
A
Y
D
F
H
G
S
-
W
E
-
K
V
-
T
G
H
N
S
P
L
Y
------
K
R
Q
E
Q
S
G
----------------------
A
-
A
----
A
S
L
N
V
D
A
A
V
Q
Q
W
L
-
Q
K
G
T
P
A
S
K
L
I
L
G
M
P
T
Y
G
R
S
F
T
L
A
S
S
-
S
D
T
R
V
G
A
P
A
T
G
S
G
T
-
P
G
P
F
T
K
---------------
E
G
G
M
L
A
Y
Y
E
V
C
S
-
W
----
K
--
G
A
T
K
Q
R
I
Q
D
Q
K
V
P
Y
I
F
R
--
D
N
Q
W
V
G
F
D
D
V
E
S
F
K
T
K
V
S
Y
L
K
Q
K
G
L
G
G
A
M
V
W
A
L
D
L
D
D
F
A
G
F
S
C
N
Q
G
-
R
Y
P
L
I
Q
T
L
R
Q
E
L
S
--------------------------------------------------------------------------------
16
PsiBlast_PDB
85.24
55%
-85
- C1 -
3RME
2
CHIA_HUMAN
A:
[2-377]
----------------------
Q
L
T
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
P
G
L
G
---
R
F
M
P
D
D
I
N
P
C
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
Q
-------------------------------
N
-
N
--
E
I
T
-
T
----------------
I
-------------
E
W
N
D
V
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
A
F
N
-
G
L
K
N
K
N
S
Q
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
A
P
F
T
A
M
V
S
T
P
E
N
R
Q
T
F
I
T
S
V
I
K
F
L
R
Q
Y
E
----------------
F
D
G
L
D
F
D
W
E
Y
P
G
S
R
-
G
S
------
P
---
P
Q
D
K
H
L
F
T
V
L
V
Q
E
M
R
E
A
F
E
Q
E
A
K
Q
I
-
N
K
P
R
--
L
M
V
T
A
A
V
A
A
G
I
S
N
I
Q
S
G
-
Y
-
E
I
P
Q
L
--
S
Q
Y
L
D
Y
I
H
V
M
T
Y
D
L
H
G
S
-
W
E
-
G
Y
-
T
G
E
N
S
P
L
Y
------
K
Y
P
T
D
T
G
----------------------
S
-
N
----
A
Y
L
N
V
D
Y
V
M
N
Y
W
K
-
D
N
G
A
P
A
E
K
L
I
V
G
F
P
T
Y
G
H
N
F
I
L
S
N
P
-
S
N
T
G
I
G
A
P
T
S
G
A
G
P
-
A
G
P
Y
A
K
---------------
E
S
G
I
W
A
Y
Y
E
I
C
T
-
F
L
K
--
N
--
G
A
T
Q
G
W
D
A
P
Q
E
V
P
Y
A
Y
Q
--
G
N
V
W
V
G
Y
D
N
V
K
S
F
D
I
K
A
Q
W
L
K
H
N
K
F
G
G
A
M
V
W
A
I
D
L
D
D
F
T
G
T
F
C
N
Q
G
-
K
F
P
L
I
S
T
L
K
K
A
L
-------
G
L
Q
S
A
S
C
T
A
P
A
---------------------------------------------------------------
32
HHSearch
85.13
56%
-84
- C1 -
3FY1
3
CHIA_HUMAN
A:
[1-377]
---------------------
Y
Q
L
T
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
P
G
L
G
---
R
F
M
P
D
D
I
N
P
C
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
Q
-------------------------------
N
-
N
--
E
I
T
-
T
----------------
I
-------------
E
W
N
D
V
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
A
F
N
-
G
L
K
N
K
N
S
Q
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
A
P
F
T
A
M
V
S
T
P
E
N
R
Q
T
F
I
T
S
V
I
K
F
L
R
Q
Y
E
----------------
F
D
G
L
D
F
D
W
E
Y
P
G
S
R
-
G
S
------
P
---
P
Q
D
K
H
L
F
T
V
L
V
Q
E
M
R
E
A
F
E
Q
E
A
K
Q
I
-
N
K
P
R
--
L
M
V
T
A
A
V
A
A
G
I
S
N
I
Q
S
G
-
Y
-
E
I
P
Q
L
--
S
Q
Y
L
D
Y
I
H
V
M
T
Y
D
L
H
G
S
-
W
E
-
G
Y
-
T
G
E
N
S
P
L
Y
------
K
Y
P
T
D
T
G
----------------------
S
-
N
----
A
Y
L
N
V
D
Y
V
M
N
Y
W
K
-
D
N
G
A
P
A
E
K
L
I
V
G
F
P
T
Y
G
H
N
F
I
L
S
N
P
-
S
N
T
G
I
G
A
P
T
S
G
A
G
P
-
A
G
P
Y
A
K
---------------
E
S
G
I
W
A
Y
Y
E
I
C
T
-
F
L
K
--
N
--
G
A
T
Q
G
W
D
A
P
Q
E
V
P
Y
A
Y
Q
--
G
N
V
W
V
G
Y
D
N
V
K
S
F
D
I
K
A
Q
W
L
K
H
N
K
F
G
G
A
M
V
W
A
I
D
L
D
D
F
T
G
T
F
C
N
Q
G
-
K
F
P
L
I
S
T
L
K
K
A
L
G
L
Q
S
A
S
C
T
A
P
A
----------------------------------------------------------------------
14
PsiBlast_PDB
84.99
55%
-84
- C1 -
3RM8
1
CHIA_HUMAN
A:
[2-377]
----------------------
Q
L
T
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
P
G
L
G
---
R
F
M
P
D
D
I
N
P
C
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
Q
-------------------------------
N
-
N
--
E
I
T
-
T
----------------
I
-------------
E
W
N
D
V
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
A
F
N
-
G
L
K
N
K
N
S
Q
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
A
P
F
T
A
M
V
S
T
P
E
N
R
Q
T
F
I
T
S
V
I
K
F
L
R
Q
Y
E
----------------
F
D
G
L
D
F
D
W
E
Y
P
G
S
R
-
G
S
------
P
---
P
Q
D
K
H
L
F
T
V
L
V
Q
E
M
R
E
A
F
E
Q
E
A
K
Q
I
-
N
K
P
R
--
L
M
V
T
A
A
V
A
A
G
I
S
N
I
Q
S
G
-
Y
-
E
I
P
Q
L
--
S
Q
Y
L
D
Y
I
H
V
M
T
Y
D
L
H
G
S
-
W
E
-
G
Y
-
T
G
E
N
S
P
L
Y
------
K
Y
P
T
D
T
G
----------------------
S
-
N
----
A
Y
L
N
V
D
Y
V
M
N
Y
W
K
-
D
N
G
A
P
A
E
K
L
I
V
G
F
P
T
Y
G
H
N
F
I
L
S
N
P
-
S
N
T
G
I
G
A
P
T
S
G
A
G
P
-
A
G
P
Y
A
K
---------------
E
S
G
I
W
A
Y
Y
E
I
C
T
-
F
L
K
--
N
--
G
A
T
Q
G
W
D
A
P
Q
E
V
P
Y
A
Y
Q
--
G
N
V
W
V
G
Y
D
N
V
K
S
F
D
I
K
A
Q
W
L
K
H
N
K
F
G
G
A
M
V
W
A
I
D
L
D
D
F
T
G
T
F
C
N
Q
G
-
K
F
P
L
I
S
T
L
K
K
A
L
-------
G
L
Q
S
A
S
C
T
A
P
A
---------------------------------------------------------------
13
PsiBlast_PDB
84.92
55%
-87
- C1 -
3RM4
1
CHIA_HUMAN
A:
[2-373]
----------------------
Q
L
T
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
P
G
L
G
---
R
F
M
P
D
D
I
N
P
C
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
Q
-------------------------------
N
-
N
--
E
I
T
-
T
----------------
I
-------------
E
W
N
D
V
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
A
F
N
-
G
L
K
N
K
N
S
Q
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
A
P
F
T
A
M
V
S
T
P
E
N
R
Q
T
F
I
T
S
V
I
K
F
L
R
Q
Y
E
----------------
F
D
G
L
D
F
D
W
E
Y
P
G
S
R
-
G
S
------
P
---
P
Q
D
K
H
L
F
T
V
L
V
Q
E
M
R
E
A
F
E
Q
E
A
K
Q
I
-
N
K
P
R
--
L
M
V
T
A
A
V
A
A
G
I
S
N
I
Q
S
G
-
Y
-
E
I
P
Q
L
--
S
Q
Y
L
D
Y
I
H
V
M
T
Y
D
L
H
G
S
-
W
E
-
G
Y
-
T
G
E
N
S
P
L
Y
------
K
Y
P
T
D
T
G
----------------------
S
-
N
----
A
Y
L
N
V
D
Y
V
M
N
Y
W
K
-
D
N
G
A
P
A
E
K
L
I
V
G
F
P
T
Y
G
H
N
F
I
L
S
N
P
-
S
N
T
G
I
G
A
P
T
S
G
A
G
P
-
A
G
P
Y
A
K
---------------
E
S
G
I
W
A
Y
Y
E
I
C
T
-
F
L
K
--
N
--
G
A
T
Q
G
W
D
A
P
Q
E
V
P
Y
A
Y
Q
--
G
N
V
W
V
G
Y
D
N
V
K
S
F
D
I
K
A
Q
W
L
K
H
N
K
F
G
G
A
M
V
W
A
I
D
L
D
D
F
T
G
T
F
C
N
Q
G
-
K
F
P
L
I
S
T
L
K
K
A
L
-------
G
L
Q
S
A
S
C
-------------------------------------------------------------------
15
PsiBlast_PDB
84.27
55%
-83
- C1 -
3RM9
1
CHIA_HUMAN
A:
[2-377]
----------------------
Q
L
T
C
Y
F
T
----
N
W
A
Q
Y
R
P
G
L
G
---
R
F
M
P
D
D
I
N
P
C
----
L
---
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
Q
-------------------------------
N
-
N
--
E
I
T
-
T
----------------
I
-------------
E
W
N
D
V
----------------------
T
-------------
L
Y
Q
A
F
N
-
G
L
K
N
K
N
S
Q
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
N
F
G
T
------
A
P
F
T
A
M
V
S
T
P
E
N
R
Q
T
F
I
T
S
V
I
K
F
L
R
Q
Y
E
----------------
F
D
G
L
D
F
D
W
E
Y
P
G
S
R
-
G
S
------
P
---
P
Q
D
K
H
L
F
T
V
L
V
Q
E
M
R
E
A
F
E
Q
E
A
K
Q
I
-
N
K
P
R
--
L
M
V
T
A
A
V
A
A
G
I
S
N
I
Q
S
G
-
Y
-
E
I
P
Q
L
--
S
Q
Y
L
D
Y
I
H
V
M
T
Y
D
L
H
G
S
-
W
E
-
G
Y
-
T
G
E
N
S
P
L
Y
------
K
Y
P
T
D
T
G
----------------------
S
-
N
----
A
Y
L
N
V
D
Y
V
M
N
Y
W
K
-
D
N
G
A
P
A
E
K
L
I
V
G
F
P
T
Y
G
H
N
F
I
L
S
N
P
-
S
N
T
G
I
G
A
P
T
S
G
A
G
P
-
A
G
P
Y
A
K
---------------
E
S
G
I
W
A
Y
Y
E
I
C
T
-
F
L
K
--
N
--
G
A
T
Q
G
W
D
A
P
Q
E
V
P
Y
A
Y
Q
--
G
N
V
W
V
G
Y
D
N
V
K
S
F
D
I
K
A
Q
W
L
K
H
N
K
F
G
G
A
M
V
W
A
I
D
L
D
D
F
T
G
T
F
C
N
Q
G
-
K
F
P
L
I
S
T
L
K
K
A
L
-------
G
L
Q
S
A
S
C
T
A
P
A
---------------------------------------------------------------
34
HHSearch
80.43
53%
-89
- C1 -
2PI6
6
CH3L1_SHEEP
A:
[1-359]
---------------------
Y
K
L
I
C
Y
Y
T
----
S
W
S
Q
Y
R
E
G
D
G
---
S
C
F
P
D
A
I
D
P
F
----
L
---
C
T
H
V
I
Y
T
F
A
N
I
S
-------------------------------
N
-
N
--
E
I
D
-
T
----------------
W
-------------
E
W
N
D
V
----------------------
T
-------------
L
Y
D
T
L
N
-
T
L
K
N
R
N
P
K
L
K
T
L
L
S
V
G
G
W
N
F
G
P
------
E
R
F
S
K
I
A
S
K
T
Q
S
R
R
T
F
I
K
S
V
P
P
F
L
R
T
H
G
----------------
F
D
G
L
D
L
A
W
L
Y
P
G
R
R
---------------
D
K
R
H
L
T
T
L
V
K
E
M
K
A
E
F
I
R
E
A
Q
A
--
G
T
E
Q
--
L
L
L
S
A
A
V
S
A
G
K
I
A
I
D
R
G
-
Y
-
D
I
A
Q
I
--
S
R
H
L
D
F
I
S
L
L
T
Y
D
F
H
G
A
-
W
R
-
Q
T
-
V
G
H
H
S
P
L
F
------
R
G
N
E
D
A
S
------------------------
S
----
R
F
S
N
A
D
Y
A
V
S
Y
M
L
-
R
L
G
A
P
A
N
K
L
V
M
G
I
P
T
F
G
R
S
F
T
L
A
S
S
--
K
T
D
V
G
A
P
V
S
G
P
G
I
-
P
G
R
F
T
K
---------------
E
K
G
I
L
A
Y
Y
E
I
C
D
-
F
L
---
H
--
G
A
T
T
H
R
F
R
D
Q
Q
V
P
Y
A
T
K
--
G
N
Q
W
V
A
Y
D
D
Q
E
S
V
K
N
K
A
R
Y
L
K
N
R
Q
L
A
G
A
M
V
W
A
L
D
L
D
D
F
R
G
T
F
C
G
Q
N
L
T
F
P
L
T
S
A
V
K
D
V
L
A
--------------------------------------------------------------------------------
21
Fugue
77.31
48%
-89
- C1 -
1E9L
1
CH3L3_MOUSE
A:
[1-372]
---------------------
Y
Q
L
M
C
Y
Y
T
----
S
W
A
K
D
R
P
I
E
G
---
S
F
K
P
G
N
I
D
-------PCL
C
T
H
L
I
Y
A
F
A
G
M
Q
---------------------------------------------------------------------------------------------------NN
E
I
T
Y
TH
E
Q
D
L
R
D
Y
E
A
L
N
-
G
L
K
D
K
N
T
E
L
K
T
L
L
A
I
G
G
W
K
F
G
P
------
A
P
F
S
A
M
V
S
T
P
Q
N
R
Q
I
F
I
Q
S
V
I
R
F
L
R
Q
Y
-N---------------
F
D
G
L
N
L
D
W
Q
Y
P
G
S
R
----------GSP
P
K
D
K
H
L
F
S
V
L
V
K
E
M
R
K
A
F
E
E
E
S
V
E
K
-
D
--
I
P
R
L
L
L
T
S
T
G
A
G
I
I
D
V
I
K
S
G
Y--
K
I
P
E
L
--
S
Q
S
L
D
Y
I
Q
V
M
T
Y
D
L
H
D
P
-
K
D
-
G
Y
-
T
G
E
N
S
P
L
Y
KSPYDI------
G
----------------------
K
-
S
----
A
D
L
N
V
D
S
I
I
S
Y
W
K
-
D
H
G
A
A
S
E
K
L
I
V
G
F
P
A
Y
G
H
T
F
I
L
S
D
-P
S
K
T
G
I
G
A
P
T
I
S
T
G
-
P
P
G
K
Y
T
D
---------------
E
S
G
L
L
A
Y
Y
E
V
C
T
-
F
----
L
N
E
G
A
T
E
V
W
D
A
P
Q
E
V
P
Y
A
Y
Q
--
G
N
E
W
V
G
Y
D
N
V
R
S
F
K
L
K
A
Q
W
L
K
D
N
N
L
G
G
A
V
V
W
P
L
D
M
D
D
F
S
G
S
F
C
H
Q
R
-
H
F
P
L
T
S
T
L
K
G
D
L
N
----
I
H
S
A
S
-----------------------------------------------------------------------
38
HHSearch
72.97
39%
-79
* C1 *
1ITX
11
CHIA1_BACCI
A:
[9-419]
------------------
A
D
S
Y
K
I
V
G
Y
Y
P
----
S
W
A
A
Y
G
---
R
---
N
Y
N
V
A
D
I
D
P
T
----
K
---
V
T
H
I
N
Y
A
F
A
D
I
C
W
NG
I
H
G
N
PDPSGPNP
V
T
W
T
CQNEKS
Q
T
I
N
V
P
N
-
G
--
T
I
V
-
L
----------------
G
D------------
P
W
I
D
T
GKTFAGDTWDQPIA--------
G
-------------
N
I
N
Q
L
N
-
K
L
K
Q
T
N
P
N
L
K
T
I
I
S
V
G
G
W
T
W
-
S
------
N
R
F
S
D
V
A
A
T
A
A
T
R
E
V
F
A
N
S
A
V
D
F
L
R
K
Y
N
----------------
F
D
G
V
D
L
D
W
E
Y
P
V
S
G
-
G
L
DGNSK-
R
---
P
E
D
K
Q
N
Y
T
L
L
L
S
K
I
R
E
K
L
D
A
A
G
A
V
D
-
G
K
-
K
--
Y
L
L
T
I
A
S
G
A
S
A
T
Y
A
A
-
N
-
T
-
E
L
A
K
I
--
A
A
I
V
D
W
I
N
I
M
T
Y
D
F
N
G
A
-
W
Q
-
K
I
-
S
A
H
N
A
P
L
N
------
Y
D
P
A
A
S
A
----------------------
A
-
G
VPDA
N
T
F
N
V
A
A
G
A
Q
G
H
L
-
D
A
G
V
P
A
A
K
L
V
L
G
V
P
F
Y
G
R
G
W
D
G
C
A
Q
-
A
G
N
G
Q
Y
Q
T
C
T
G
G
S
S
-
V
G
T
W
-----------------
E
A
G
S
F
D
F
Y
D
L
E
A
N
Y
INK-
N
--
G
Y
T
R
Y
W
N
D
T
A
K
V
P
Y
L
Y
N
AS
N
K
R
F
I
S
Y
D
D
A
E
S
V
G
Y
K
T
A
Y
I
K
S
K
G
L
G
G
A
M
F
W
E
L
S
G
D
R
----------
N
K
T
L
Q
N
K
L
K
A
D
L
---------------------------------------------------------------------------------
41
HHSearch
70.42
30%
-84
- C1 -
1GOI
6
CHIB_SERMA
A:
[4-425]
--------------------
R
K
A
V
I
G
Y
Y
F
I
P
T
N
Q
I
N
N
Y
T
E
T
D
T
SVV
P
F
P
V
S
N
I
T
P
A
K
A
K
-
Q
---
L
T
H
I
N
F
S
F
L
D
I
N
-------------------------------
S
-
N
L-
E
C
A
W
D
----------------
P
-------------
A
T
N
D
A
K
A
R
-------------------
D
-------------
V
V
N
R
L
T
-
A
L
K
A
H
N
P
S
L
R
I
M
F
S
I
G
G
W
Y
Y
S
N
DLGVS
H
A
N
Y
V
N
A
V
K
T
P
A
S
R
A
K
F
A
Q
S
C
V
R
I
M
K
D
Y
G
----------------
F
D
G
V
N
I
D
W
E
Y
P
Q
---------------
A
A
E
V
D
G
F
I
A
A
L
Q
E
I
R
T
L
L
N
Q
Q
T
I
T
D
-
G
R
Q
A
L
P
Y
Q
L
T
I
A
G
A
G
G
A
F
F
L
S
R
Y
-
Y
S
K
L
A
Q
I
--
V
A
P
L
D
Y
I
N
L
M
T
Y
D
L
A
G
P
-
W
E
-
K
V
-
T
N
H
Q
A
A
L
F
------
G
D
A
A
G
P
T
F
Y
NALREANLGWS
W
E
E
L
T
R
A
F
P
S
-
P
----
F
S
L
T
V
D
A
A
V
Q
Q
H
L
M
M
E
G
V
P
S
A
K
I
V
M
G
V
P
F
Y
G
R
A
F
K
G
V
S
G
-
G
N
G
G
Q
Y
S
S
H
S
T
P
G
E
--
D
P
Y
P
S
TDYWLVGC
E
E
C
V
R
D
K
D
P
R
I
A
S
Y
R
Q
L
E
Q
-
M
L
Q
GN
Y
--
G
Y
Q
R
L
W
N
D
K
T
K
T
P
Y
L
Y
H
AQ
N
G
L
F
V
T
Y
D
D
A
E
S
F
K
Y
K
A
K
Y
I
K
Q
Q
Q
L
G
G
V
M
F
W
H
L
G
Q
D
N
R
N
---------
G
D
L
L
A
A
L
D
R
Y
F
N
A
A
------------------------------------------------------------------------------
40
HHSearch
64.19
32%
-69
- C1 -
1KFW
5
?
A:
[7-424]
-------------------
N
G
Y
R
N
V
G
Y
F
A
----
Q
W
G
V
Y
G
---
R
---
A
F
Q
A
K
Q
L
D
V
S
GTAK
N
---
L
T
H
I
N
Y
S
F
G
N
I
N
-------------------------------
N
-
Q
TL
T
C
F
-
M
A
N
K
A
Q
G
T
G
PNGSDGAG
D
-------------
A
W
A
D
F
G
M
G
Y
A
ADKSVSGKADTWDQPLA
G
-------------
S
F
N
Q
L
K
-
Q
L
K
A
K
N
P
K
L
K
V
M
I
S
L
G
G
W
T
W
-
S
------
K
N
F
S
K
A
A
A
T
E
A
S
R
Q
K
L
V
S
S
C
I
D
L
Y
I
K
G
N
LPNFEG
R
G
G
AGAAAGI
F
D
G
I
D
I
D
W
E
W
P
G
T
N
S
G
L
AGNGVD
T
---
V
N
D
R
A
N
F
K
A
L
L
A
E
F
R
K
Q
L
D
A
Y
G
S
T
N
-
N
K
-
K
--
Y
V
L
S
A
F
L
P
A
N
P
A
D
I
D
A
--
G
-
G
W
D
D
P
A
N
F
K
S
L
D
F
G
S
I
Q
G
Y
D
L
H
G
A
-
W
N
-
P
T
L
T
G
H
Q
A
N
L
Y
------
D
D
P
A
D
P
R
----------------------
A
P
S
----
K
K
F
S
A
D
K
A
V
K
K
Y
L
-
A
A
G
I
D
P
K
Q
L
G
L
G
L
A
A
Y
G
R
G
W
T
G
A
K
N
-
V
S
P
--
W
G
P
A
T
D
G
A
P
-
G
---
T
Y
---------------
E
T
A
N
E
D
Y
D
K
L
K
T
-
L
--------
G
T
D
H
Y
D
A
A
T
G
S
A
W
R
Y
D
--
G
T
Q
W
W
S
Y
D
N
I
A
T
T
K
Q
K
T
D
Y
I
V
S
K
G
L
G
G
G
M
W
W
E
L
S
G
-
D
R
N
G
---------
E
L
V
G
A
M
S
D
K
F
R
A
A
------------------------------------------------------------------------------
49
HHSearch
63.78
34%
-79
- C1 -
3G6M
2
?
A:
[19-383]
-------------------
T
G
S
I
N
A
V
Y
F
T
----
N
W
G
I
Y
G
---
R
---
N
F
Q
P
A
D
L
Q
A
S
----
K
---
I
L
H
V
L
Y
S
F
M
N
L
R
-------------------------------
V
D
G
--
T
V
Y
-
S
----------------
G
DTYADLEKHYSDD
S
W
N
D
I
G
T
N
A
Y
-----------------
G
-------------
C
V
K
Q
L
Y
-
K
L
K
K
A
N
R
S
L
K
I
M
L
S
I
G
G
W
T
W
-
S
------
T
N
F
P
A
A
A
S
T
E
A
T
R
A
T
F
A
K
T
A
V
E
F
M
K
D
W
G
----------------
F
D
G
I
D
V
D
W
E
Y
P
A
S
--------------
E
T
D
A
N
N
M
V
L
L
L
Q
R
V
R
Q
E
L
D
S
Y
S
A
T
Y
A
N
G
Y
H
--
F
Q
L
S
I
A
A
P
A
G
P
S
H
Y
N
-
V
-
L
-
K
L
A
Q
L
--
G
S
V
L
D
N
I
N
L
M
A
Y
D
Y
A
G
S
-
W
D
-
S
V
-
S
G
H
Q
T
N
L
Y
------
P
S
T
S
N
P
S
------------------------
S
----
T
P
F
S
T
K
A
A
V
D
A
Y
I
-
A
A
G
V
P
A
S
K
I
I
L
G
M
P
I
Y
G
R
A
F
V
G
T
-----
D
G
P
G
K
P
Y
S
T
I
G
E
--
G
S
--
W
---------------
E
S
G
I
W
D
Y
K
V
L
P
K
------
A
--
G
A
T
V
I
T
D
S
A
A
G
A
T
Y
S
Y
D
SS
S
R
T
M
I
S
Y
D
T
P
D
M
V
R
T
K
V
S
Y
A
K
G
L
G
L
G
G
S
M
F
W
E
A
S
A
D
K
T
-------
G
-
S
D
S
L
I
G
T
A
L
S
S
M
G
S
-------------------------------------------------------------------------------
45
HHSearch
63.55
31%
-77
- C1 -
3ALF
5
?
A:
[4-348]
----------------------
V
K
G
G
Y
W
F
----
K
D
S
----------
G
L
A
L
N
N
I
D
S
T
----
L
---
F
T
H
L
F
C
A
F
A
D
L
N
-------------------------------
P
-
Q
LN
Q
L
I
-
I
----------------
S
-------------
P
E
-
N
Q
----------------------
D
-------------
S
F
R
Q
F
T
S
T
V
Q
R
K
N
P
S
V
K
T
F
L
S
I
A
G
G
R
A
N
S
------
T
A
Y
G
I
M
A
R
Q
P
N
S
R
K
S
F
I
D
S
S
I
R
L
A
R
Q
L
G
----------------
F
H
G
L
D
L
D
W
E
Y
P
L
-----------
S
---
A
A
D
M
T
N
L
G
T
L
L
N
E
W
R
T
A
I
N
T
E
A
R
N
S
-
G
R
A
A
--
L
L
L
T
A
A
V
S
N
S
P
R
V
N
G
L
N
-
Y
-
P
V
E
S
L
--
A
R
N
L
D
W
I
N
L
M
A
Y
D
F
Y
G
P
N
W
S
P
S
Q
-
T
N
S
H
A
Q
L
F
------
D
P
V
N
---------------------------------
H
V
S
G
S
D
G
I
N
A
W
I
-
Q
A
G
V
P
T
K
K
L
V
L
G
I
P
F
Y
G
Y
A
W
R
L
V
N
A
-
N
I
H
G
L
R
A
P
A
A
G
K
S
N
-
V
G
A
--
V
---------------
D
D
G
S
M
T
Y
N
R
I
R
D
-
Y
I
V
E
-
S
--
R
A
T
T
V
Y
N
A
T
I
V
G
D
Y
C
Y
S
--
G
S
N
W
I
S
Y
D
D
T
Q
T
V
R
N
K
V
N
Y
V
K
G
R
G
L
L
G
Y
F
A
W
H
V
A
G
D
Q
N
----------
W
G
L
S
R
T
A
S
Q
T
W
G
V
S
------------------------------------------------------------------------------