Atome 2 Filter

@TOME V2.3
(Nov 2016)

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3D Common Core:

Structural Clustering:

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Complexes Modeling

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Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]

Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : OR1A2_HUMAN: (2016-01-12 )
MKKENQSFNLDFILLGVTSQQEQNNVFFVIFLCIYPITLTGNLLIILAICADIRLHNPMYFLLANLSLVDIIFSSVTIPKVLANHLLGSKFISFGGCLMQMYFMIALAKADSYTLAAMAYDRAVAISCPLHYTTIMSPRSCILLIAGSWVIGNTSALPHTLLTASLSFCGNQEVANFYCDIMPLLKLSCSDVHFNVKMMYLGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQVPSTKSLFKAFCTCGSHLTVVFLYYGTTMGMYFRPLTSYSPKDAVITVMYVAVTPALNPFIYSLRNWDMKAALQKLFSKRISS

Atome Classification :

	(20 SA)									----------..-.......10........20----........30........40---......-..50...---.-....60....-....70......-..80........--90...-----.....100..-...--..110.......120.......130...----------------....140-----------.-.-......--------------.150.-----------.......160---------------.........170.........180--.-........190------.....-..-..200.......210.......220....---------.-------.-----------.-----------230------------------.---.---..-----.....240--..-...-...250...----...-------.---.-260----------..-.----------.-------...--270......-.-----280-----.......290.........300-.----------------......---------------
		(Atome)	(Ident)	(Tito)	(Num)		(Ligand)	(Uniprot)		----------MK-KENQSFNLDFILLGVTSQQ----EQNNVFFVIFLCIYPITLTG---NLLIIL-AICADIR---L-HNPMYFLLAN-LSLVDIIFSSVT-IPKVLANHLLGS--KFISF-----GGCLMQMYFM-IAL--AKADSYTLAAMAYDRAVAISCPLHYTTI----------------MSPRS-------------C-I-LLIAGS--------------WVI-G-----------NTSALPHT-----------------LLTASLSFCG--NQEVANFYCD----I-MPLLKLSCS--------DVHFN-VK-MMYLGVGVFSLPLLCIIVSYVQVFSTVFQ---------V-------P-----------S-----------T--------------------K---S---LF-----KAFCTCG---SH-LTV-VFLYY-GTT----MGM-------Y---F-RPL----------TS-Y----------S-------PKD--AVITVMYVA-V-----TPA-----LNPFIYSL--RNWDMKAALQKL-F----------------SKRISS---------------
2	PsiBlast_PDB	88.64	22%	-162	- C2 -	3REY		AA2AR_HUMAN	A:[7-305]	---------------------------------------SVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-LAAADILVGVLA-IPFAIT---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--AQSSIFSLLAIAIDRYIAIAIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-A-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQP-------------------------G-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFAAARRQLKQMESQPL-------P-----------G-----------E--------------------R---ARSTLQ-----KEVHAAK---SA-AII-AGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-I-----VLAHTNSVVNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RS-------------------
5	PsiBlast_PDB	88.38	22%	-159	- C2 -	3UZC		AA2AR_HUMAN	A:[7-305]	---------------------------------------SVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-LAAADILVGVLA-IPFAIT---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--AQSSIFSLLAIAIDRYIAIAIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-A-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQP-------------------------G-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFAAARRQLKQMESQPL-------P-----------G-----------E--------------------R---ARSTLQ-----KEVHAAK---SA-AII-AGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-I-----VLAHTNSVVNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RS-------------------
4	PsiBlast_PDB	88.36	22%	-161	- C2 -	3UZA		AA2AR_HUMAN	A:[7-305]	---------------------------------------SVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-LAAADILVGVLA-IPFAIT---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--AQSSIFSLLAIAIDRYIAIAIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-A-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQP-------------------------G-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFAAARRQLKQMESQPL-------P-----------G-----------E--------------------R---ARSTLQ-----KEVHAAK---SA-AII-AGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-I-----VLAHTNSVVNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RS-------------------
9	PsiBlast_PDB	88.31	22%	-151	- C2 -	2YDV		?	A:[6-307]	--------------------------------------SSVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-AAAADILVGVLA-IPFAIA---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--TASSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-K-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQPKE-----------------GKAHSQG-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQ-----------------------------------------------------------ST-LQ-----KEVHAAK---SL-AII-VGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-IVLSHTNSV-----VNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RSHVLR---------------
3	PsiBlast_PDB	88.18	22%	-159	- C2 -	3RFM		AA2AR_HUMAN	A:[7-305]	---------------------------------------SVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-LAAADILVGVLA-IPFAIT---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--AQSSIFSLLAIAIDRYIAIAIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-A-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQP-------------------------G-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFAAARRQLKQMESQPL-------P-----------G-----------E--------------------R---ARSTLQ-----KEVHAAK---SA-AII-AGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-I-----VLAHTNSVVNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RS-------------------
1	PsiBlast_PDB	88.16	22%	-157	- C2 -	3PWH		?	A:[7-305]	---------------------------------------SVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-LAAADILVGVLA-IPFAIT---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--AQSSIFSLLAIAIDRYIAIAIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-A-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQP-------------------------G-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFAAARRQLKQMESQPL-------P-----------G-----------E--------------------R---ARSTLQ-----KEVHAAK---SA-AII-AGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-I-----VLAHTNSVVNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RS-------------------
10	PsiBlast_PDB	88.13	22%	-152	- C2 -	4UG2		?	A:[6-307]	--------------------------------------SSVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-AAAADILVGVLA-IPFAIA---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--TASSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-K-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQPKE-----------------GKAHSQG-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFLAARRQL----------------------------------------------------------------ARSTLQ-----KEVHAAK---SL-AII-VGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-IVLSHTNSV-----VNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RSHVLR---------------
8	PsiBlast_PDB	87.39	22%	-149	- C2 -	2YDO		?	A:[6-307]	--------------------------------------SSVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-AAAADILVGVLA-IPFAIA---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--TASSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-K-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQPKE-----------------GKAHSQG-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMES------------------------------------------------------------T--LQ-----KEVHAAK---SL-AII-VGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-IVLSHTNSV-----VNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RSHVLR---------------
11	PsiBlast_PDB	86.34	22%	-149	- C2 -	4UHR		AA2AR_HUMAN	A:[6-307]	--------------------------------------SSVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-AAAADILVGVLA-IPFAIA---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--TASSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-K-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQPKE-----------------GKA---G-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPL-------P-----------G-----------E--------------------R---ARSTLQ-----KEVHAAK---SL-AII-VGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------C--H----------A-------P------LWLMYLA-IVLSHTNSV-----VNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RSHVLR---------------
7	PsiBlast_PDB	85.51	22%	-155	- C2 -	3VGA		AA2AR_HUMAN	A:[6-307]	--------------------------------------SSVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-LAAADIAVGVLA-IPFAIT---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--TQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-K-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQ------------------------SQG-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPL-------P-----------G-----------E--------------------RARST---LQ-----KEVHAAK---SL-AII-VGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-IVLSHTNSV-----VNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RSHVL----------------
6	PsiBlast_PDB	85.34	22%	-154	- C2 -	3VG9		?	A:[6-307]	--------------------------------------SSVYITVELAIAVLAILG---NVLVCW-AVWLNSN---L-QNVTNYFVVS-LAAADIAVGVLA-IPFAIT---IST--GFCAAC----HGCLFIACFV-LVL--TQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNGL----------------VTGTR-------------A-K-GIIAIC--------------WVL-SFAIGLTPMLGWNNCGQ------------------------SQG-CG--EGQVACLFED----V-VPMNYM------------VYFN-FF-ACVL------VPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPL-------P-----------G-----------E--------------------RARST---LQ-----KEVHAAK---SL-AII-VGLFA-LCW----LPLHIINCFTF---F-CPD----------CS-H----------A-------P------LWLMYLA-IVLSHTNSV-----VNPFIYAY--RIREFRQTFRKI-I----------------RSHVLR---------------
20	PsiBlast_PDB	82.34	24%	-138	- C2 -	4LDE			A:[199-463]	-------------------------------------------------------G---NVLVIT-AIAKFER---L-QTVTNYFITS-LACADLVMGLAV-VP-FGAAHIL-T--KTWTF-----GNFWCEFWTS-IDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSL----------------LTKNK-------------A-R-VIILMV--------------WIVSG-----------LTSFLP--------------------IQMHWYRAT--HQEAINCYAE-----------ETCC--------DFFTNQAY-AIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKR---------Q-------L-----------Q----------------------------------------KFALKEHKALKTLGIIMGT-FTL-CWLPF--FI----VNI-------V---H-VIQ----------DN-L----------I-------RKE--VYILLNWIGYV-----NSG-----FNPLIYC---RSPDFRIAFQEL-L----------------CL-------------------
15	PsiBlast_PDB	82.20	24%	-130	- C2 -	4GBR		ADRB2_HUMAN	A:[22-286]	-------------------------------------------------------G---NVLVIT-AIAKFER---L-QTVTNYFITS-LACADLVMGLAV-VP-FGAAHIL-T--KTWTF-----GNFWCEFWTS-IDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSL----------------LTKNK-------------A-R-VIILMV--------------WIVSG-----------LTSFLP--------------------IQMHWYRAT--HQEAINCYAE-----------ETCC--------DFFTNQAY-AIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQ---E---------A-------K-----------R-----------Q--------------------L---Q---KI-----DKFCL-K---EH-KAL-KTL---GII----MGT-------FTLCW-LPFFIVNIVHVIQDN-L----------I-------RKE--VYILLNWIGYV-----NSG-----FNPLIYC---RSPDFRIAFQEL-L----------------CL-------------------
30	HHSearch	81.51	18%	-130	* C2 *	2KS9		NK1R_HUMAN	A:[34-324]	----------------------------------------LWAAAYTVIVVTSVVG---NVVVMW-IILAHKR---M-RTVTNYFLVN-LAFAEASMAAFN-TVVNFTYAVHNE--WYYGL-----FYCKFHNFFP-IAA--VFASIYSMTAVAFDRYMAIIHPLQPRL------------------SATA-------------T-K-VVICVI--------------WVL-A-----------LLLAFPQG-----------------YYSTT-ET------MPSRVVCM----I-EWPEHPN----------KIYEK-VY-HICVTVLIYFLPLLVIGYAYTVVGITLWA---------S-------E-----------IPGDSSDRYHEQV--------------------S---A---KR-----KVVKMMI---VV-VCT-FAICW-LPF----HIF-------F---L-LPY----------IN-P----------DLYLKKFIQQV--YLAIMWLAM-S-----STM-----YNPIIYCC--LNDRFRLGFKHA-F----------------RCCPFI---------------
33	HHSearch	81.34	18%	-131	- C2 -	2Z73		OPSD_TODPA	A:[33-332]	-------------------------------------VYYSLGIFIGICGIIGCGG---NGIVIY-LFTKTKS---L-QTPANMFIIN-LAFSDFTFSLVNGFPLMTISCFLKK--WIFGF-----AACKVYGFIG-GIF--GFMSIMTMAMISIDRYNVIGRPMAASKK----------------MSHRR-------------A-F-IMIIFV--------------WLW-S-----------VLWAIGPI-----------------FGWGAYTL------EGVLCNCS----F-DYISR------------DSTTR-SN-ILCMFILGFFGPILIIFFCYFNIVMSVSN---------H-------E-----------K-----------EMAAMAKRLNAKELRKAQAGAN---A---EM-----RLAKISI---VI-VSQ-FLLSW-SPY----AVV-------A---L-LAQ----------FG-PLEW-------VT------PYA--AQLPVMFAK-A-----SAI-----HNPMIYSV--SHPKFREAISQT-F----------------PWVLTC---------------
41	Fugue	77.21	18%	-111	- C2 -	1U19		OPSD_BOVIN	A:[4-349]	MNGTEGPNFYVP-FSNKTGVVRSPFEAPQYYL----AEPWQFSMLAAYMFLLIMLGFPINFLTLY-VTVQHKK---L-RTPLNYILLN-LAVADLFMVFGG-FTTTLYTSLHGY--FVFGP-----TGCNLEGFFA-TLG--GEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFR-----------------FGENH-------------A-I-MGVAFT--------------WVM-A-----------LACAAPPLVGWSRY-----------IPEGMQCSCG------IDYYT-------------PHE--------ETNNE-SF-VIYMFVVHFIIPLIVIFFCYGQLVFTVKE---------A-------AAQQQESATTQKA-----------E--------------------K---E---VT-----RMVIIMV---IA-FLI-CWLPY-AGV----AFY-------I---F-THQG---------SD-F----------G-------PIF--MTIPAFFAK-T-----SAV-----YNPVIYIM--MNKQFRNCMVTT-LCCGKNPLGDDEASTTVSKTETSQVAPA----------
31	HHSearch	76.44	18%	-132	- C2 -	1U19		OPSD_BOVIN	A:[41-326]	---------------------------------------SMLAAYMFLLIMLGFPI---NFLTLY-VTVQHKK---L-RTPLNYILLN-LAVADLFMVFGG-FTTTLYTSLHGY--FVFGP-----TGCNLEGFFA-TLG--GEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFR-----------------FGENH-------------A-I-MGVAFT--------------WVM-A-----------LACAAPPL-----------------VGWSRYIPE------GMQCSCG----I-DYYTPH--E--------ETNNE-SF-VIYMFVVHFIIPLIVIFFCYGQLVFTVKE---------A-------A-----------A-----------QQQESATTQ------------K---A---EK-----EVTRMVI---IM-VIA-FLICW-LPY----AGV-------A---F-YIF----------THQG----------SDFG----PIF--MTIPAFFAK-T-----SAV-----YNPVIYIM--MNKQFRNCMVTT-L----------------CCGKNP---------------
39	Fugue	75.68	17%	-116	- C2 -	1F88		OPSD_BOVIN	A:[1-348]	MNGTEGPNFYVP-FSNKTGVVRSPFEAPQYYL----AEPWQFSMLAAYMFLLIMLG---FPINFL-TLYVTVQHKKL-RTPLNYILLN-LAVADLFMVFGG-FTTTLYTSLHGY--FVFGP-----TGCNLEGFFA-TLG--GEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFR-----------------FGENH-------------A-I-MGVAFT--------------WVM-A-----------LACAAPPL-----------------VGWSRYIPEG---------------------MQCSCGIDYYTPHEETNNE-SF-VIYMFVVHFIIPLIVIFFCYGQLVFTVKE---------AAASATTQK-----------A-----------E--------------------K---E---VT-----RMVIIMV---IA-FLI-CWLPY-AGV----AFY-------I---FTHQG----------SD-F----------G-------PIF--MTIPAFFAK-T-----SAV-----YNPVIYIM--MNKQFRNCMVTT-L----------------CCGKNPSTTVSKTETSQVAPA
44	Fugue	71.44	20%	-138	- C1 -	4QT9		?	A:[19-432]	------LSDDALMDTVQRRTFLYFWEGAEPNSGLAPERYHVDGVYPQNDANVVTSG---GSGFGIMAILAGID---RGYVTREEGLARMERIVSFLEKADR-FHGAYPHWWYGDTGKVKPFGQKDNGGDLVETAFLMQGL--LAVHQYYANGNDKEKAIAQRIDRLWREVDWDWYRKGGQNVLYWHWSPTYGWEMDFPIHGYNECMIMYILAAASPTHGVPAAVYHDGWAQ-N-----------GAIVSPHKVEGIELHLRYQGTEAGPLFWAQYSFLGLDPVGLKDEYCPSYFHEMRNLTLVNRA--------YCIRN-PKHYKGFGPDCWGLTASYSVDGYAAHSPNEQDDKG------V-------I-----------S-----------P--------------------T---A---AL-----SSIVYTP---EYSLQVMRHLYNMGDKVFGPFGF-------YDA-F-SET----------DN-W----------Y-------PQRYLAIDQGPIAVMI-----ENY-----RTGLLWKLFMSHPDVQAGLTKLGF----------------NTN------------------
28	HHSearch	70.10	17%	-110	- C2 -	2LNL	-	CXCR1_HUMAN	A:[36-323]	-------------------------------T----LNKYVVIIAYALVFLLSLLG---NSLVML-VILYSRV---G-RSVTDVYLLN-LALADLLFAL-T-LPIWAASK-VNG--WIFGT-----FLCKVVSLLK-EVN--FYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLT-----------------QKRHL-------------V-K-FVCLGC--------------WGL-S-----------MNLSLPFF-----------------LFRQAYHP------NNSSPVCY----E-VLGND---T--------AKWRM-VL-RILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFTLRTLFK---------A-------H-----------------------M--------------------G---Q---KH-----RAMRVIF---AV-VLI-FLLCW-LPY----NLV-------L---L-ADT----------LM-RTQVIQESCERRNNI----GRA--LDATEILGF-L-----HSC-----LNPIIYAF--IGQNFRHGFLKI-L----------------AMHG-----------------