@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 127_tII_ARATH: (2014-05-01 )
LRVLSEDKKVACIVTDLQVCLSALETPIPPSAECCKNLKIQKSCLCDYMENPSIEKYLEPARKVFAACGMPYPRC

Atome Classification :

(20 SA) --------.........10.--.--..--.---------...20...--.--.--..-------------.-30-----------........-40----------.-----.-.-------------......50-------.--------..------------.-...------------..60--.........70-------...-------..----------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --------LRVLSEDKKVAC--I--VT--D---------LQVCLSAL--E--T--PI-------------P-PS-----------AECCKNLK-I-----------Q-----K-S-------------CLCDYME--------N--------PS------------I-EKY------------LEP---ARKVFAACGM--------PYP-------RC----------
11 HHSearch 94.0640%-128 - C5 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[1-67] ------------------AC--Q--AS--Q---------LAVCASAI--L--S--GA-------------K-PS-----------GECCGNLR-A-----------Q-----Q-G-------------CFCQYAK--------D--------PT------------Y-GQY------------IRSPH-ARDTLTSCGL--------AVP-------HC----------
1 Fugue 88.9633%-133 - C5 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] -----------------AGC--N--AG--Q---------LTVCTGAI--A--G--GA-------------R-PT-----------AACCSSLR-A-----------Q-----Q-G-------------CFCQFAK--------D--------PR------------Y-GRY------------VNSPN-ARKAVSSCGI--------ALP-------TCH---------
12 HHSearch 88.7633%-133 - C5 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-68] -----------------AGC--N--AG--Q---------LTVCTGAI--A--G--GA-------------R-PT-----------AACCSSLR-A-----------Q-----Q-G-------------CFCQFAK--------D--------PR------------Y-GRY------------VNSPN-ARKAVSSCGI--------ALP-------TC----------
30 SP3 86.8229%-133 - C5 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] -----------------AGC--N--AG--Q---------LTVCTGAI--A--G--GA-------------R-PT-----------AACCSSLR-A-----------Q-----Q-G-------------CFCQFAK--------D--------PR------------Y-GRY------------VNSPN-ARKAVSSCGI--------ALP-------TCH---------
2 Fugue 82.8027%-106 - C5 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -------------AIDLCGM--S--QD--E---------LNECKPAV--S--KENPT-------------S-PS-----------QPCCTALQHA-----------D-----F-A-------------CLCGYKN--------S--------PW------------L-GSFGVD---------PEL---ASALPKQCGL--------ANAP------TC----------
18 HHSearch 79.9527%-110 - C5 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-78] -----------------ITC--G--QVTSN---------LAPCLAYL--R--N--TG---------------PL-----------GRCCGGVK-ALVNSARTTEDRQ-----I-A-------------CTC--LK--------S--------AA--------------GAISG----------INLGK-AAGLPSTCGV--------NIP-------------------
13 HHSearch 77.9429%-108 - C5 -2RKN DIRL1_ARATH A:[9-77] -------------------------QD--E---------LNECKPAV--S--K--ENPT-----------S-PS-----------QPCCTALQ-H-----------A-----DFA-------------CLCGYKN--------S--------PW------------L-GSFG-----------VDPEL-ASALPKQCGL--------ANAP------TC----------
17 HHSearch 75.6626%-109 - C5 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[2-80] -----------------ISC--G--QVASA---------IAPCISYA--R--G--QG-------------SGPS-----------AGCCSGVR-SLNNAARTTADRR-----A-A-------------CNC--LK--------N--------AA--------------AGVSG----------LNAGN-AASIPSKCGV--------SIP-------------------
20 HHSearch 72.9928%-144 - C5 -1HYP - HPSE_SOYBN A:[6-73] -----------------PSC--P------D---------LSICLNILGGS--L--GT----------------V-----------DDCCALIG-G-----------LGDIEAI-V-------------CLCIQLR--------A----------------------L-GI-------------LNLNRNLQLILNSCGR--------SYP-------S-----------
15 HHSearch 70.4623% -95 - C5 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-79] -----------------ITC--G--QVSSS---------LAPCIPYV--R--G--GG-------------A-VP-----------PACCNGIR-NVNNLARTTPDRQ-----A-A-------------CNC--LK--------Q--------LS--------------ASVPG----------VNPNN-AAALPGKCGV--------SIP-------------------
14 HHSearch 67.9431% -70 - C5 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[7-78] -------------------------DS--L---------VRPCLSYV--Q--G--GP-------------G-PS-----------GQCCDGVK-NLHNQARSQSDRQ-----S-A-------------CNCLKGI--------A--------RG------------I-H-N------------LNEDN-ARSIPPKCGV--------NLP-------------------
8 Fugue 66.9826% -79 - C5 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] -----------------IDCGHV--DS--L---------VRPCLSYV--QG-G--P--------------G-PS-----------GQCCDGVK-N-----------L-----H-NQARSQSDRQSACNCLKGIAR--------G--------IH------------N-LN-------------EDN---ARSIPPKCG-VNLPYTISLNI-------DCSRV-------
4 Fugue 66.5618%-107 - C5 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] ----PYGRGRTESGCYQQME--E--AE--M---------LNHCGMYL--M--K--NLGERSQVSPRMREED-HK-----------QLCCMQLKNL-----------D-----E-K-------------CMCPAIM--------MMLNEPMWIRM------------R-DQV------------MSM---AHNLPIECNL--------MSQ-------PCQM--------
33 SP3 65.9816%-110 - C5 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] PYGRGRTESGCYQQMEEAE----------M---------LNHCGMYL--MKNL--GE-------------R-SQVSPRMREEDHKQLCCMQLK-NL----------D-----E-K-------------CMCPAIMMMLNEPMWI--------RM------------R-DQV------------MSM---AHNLPIECNL--------MSQ-------PCQM--------
31 SP3 64.7117% -92 * C5 *1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] ----------------AISC--GQVAS--A---------IAPCISYA--R--G--QG-------------SGPS-----------AGCCSGVR-S-----------L-----N-N-------------A----AR--------T--------TADRRAACNCLKNAA-AGVSGLN--------AGN---AASIPSKCGV--------SIPYTISTSTDCSRVN------
25 HHSearch 62.2920% -79 - C5 -3OB4 - ? A:[427-485] ------------------------------------------------------------------------HQ-----------ERCCNELN-E-----------FEN---NQR-------------CMCEALQ--------Q--------IM------------E-NQSDRLQGRQQEQQFKRE---LRNLPQQCGL--------RAP-------------------
7 Fugue 61.1220% -95 - C5 -2LSE - ? A:[1-101] ---MQEERKKLLEKLEKILD--E--VT--DGAPDEARERIEKLAKDV--K--D--EL-------------E-EG-----------DAKNMIEK-F-----------R-----D-E-------------MEQMYKD--------A--------PNAV----------M-EQL------------LEE---IEKLLKKAGS--------LVP-------RGSYLEHHHHHH
19 HHSearch 59.3822% -70 - C5 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[7-78] -------------------------QG--N---------LAQCIGFL--Q--K--GG-------------V-VP-----------PSCCTGVK-NILNSSRTTADRR-----A-V-------------CSCLKAA--------A--------GA------------V-R-G------------INPNN-AEALPGKCGV--------NIP-------------------
9 Fugue 51.0420% -77 - C5 -1X2I - ? A:[2-69] ----------ALTLAERQRL--I--VE--G---------LPHVSATL--A--R--RL-------------L-KH-----------FG--SVER-V-----------F-----T-A-------------SVAELMK--------V--------EG------------IGEKI------------AKE---IRRVITA-----------PYI-------E-----------
6 Fugue 50.4113% -78 - C5 -3DNV - HIPB_ECOLI B:[4-74] --------FQKIYSPTQLAN--A--MK--L---------VRQQNG-------------------------W-TQ-----------SELAKKIG-I-----------K-----Q-A--------------TISNFE--------N--------NP------------D-NTT------------LTT---FFKILQSLEL--------SMT-------LCDAK-------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(1 SA) .........10........20........30........40........50........60........70....
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) LRVLSEDKKVACIVTDLQVCLSALETPIPPSAECCKNLKIQKSCLCDYMENPSIEKYLEPARKVFAACGMPYPRC
41 34.97100% 25 - C- -M041 - A:[6-84] LRVLSEDKKVACIVTDLQVCLSALETPIPPSAECCKNLKIQKSCLCDYMENPSIEKYLEPARKVFAACGMPYPRC