@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : new_query: (2014-05-03 )
ITCGLVASKLAPCIGYLQGAPGPSAACCGGIKSLNSAAASPADRKTACTCLKSAATSIKGINYGKAASLPRQCGVSVPYAISPNTNCNAIH

Atome Classification :

(20 SA) ------------------------------------------------------........--.---10.......------------------.----20--.------------.-------------------.-----.----...---..30........-----------40........50--...---....-------.-------60--------.---------.----------.......--70........80--.........90---------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ------------------------------------------------------ITCGLVAS--K---LAPCIGYLQ------------------G----A---P------------G-------------------P-----S----AAC---CGGIKSLNSAAA-----------SPADRKTACTCL--KSA---ATSI-------K-------G---------I---------N----------YGKAASL--PRQCGVSVPYA---ISPNTNCNAIH---------
13 HHSearch 96.0057%-129 - C1 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-91] ------------------------------------------------------ITCGQVTS--N---LAPCLAYLR------------------N----T---G--------------------------------P-----L----GRC---CGGVKALVNSAR-----------TTEDRQIACTCL--KSA---AGAI-------S-------G---------I---------N----------LGKAAGL--PSTCGVNIPYK---ISPSTDCSKVQ---------
29 SP3 93.6854%-128 - C1 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -----------------------------------------------------AISCGQVAS--A---IAPCISYAR------------------G----Q---G------------SG------------------P-----S----AGC---CSGVRSLNNAAR-----------TTADRRAACNCL--KNA---AAGV-------S-------G---------L---------N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYT---ISTSTDCSRVN---------
16 HHSearch 93.2848%-123 - C1 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] ------------------------------------------------------IDCGHVDS--L---VRPCLSYVQ------------------G----G---P------------G-------------------P-----S----GQC---CDGVKNLHNQAR-----------SQSDRQSACNCL--KGI---ARGI-------H-------N---------L---------N----------EDNARSI--PPKCGVNLPYT---ISLNIDCSRV----------
11 HHSearch 91.5249%-129 - C1 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-92] ------------------------------------------------------ITCGQVSS--S---LAPCIPYVR------------------G----G---G------------A-------------------V-----P----PAC---CNGIRNVNNLAR-----------TTPDRQAACNCL--KQL---SASV-------P-------G---------V---------N----------PNNAAAL--PGKCGVSIPYK---ISASTNCATVK---------
12 HHSearch 89.5855%-123 - C1 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[2-93] ------------------------------------------------------ISCGQVAS--A---IAPCISYAR------------------G----Q---G------------SG------------------P-----S----AGC---CSGVRSLNNAAR-----------TTADRRAACNCL--KNA---AAGV-------S-------G---------L---------N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYT---ISTSTDCSRVN---------
14 HHSearch 86.4446%-125 - C1 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] ------------------------------------------------------MTCGQVQG--N---LAQCIGFLQ------------------K----G---G------------V-------------------V-----P----PSC---CTGVKNILNSSR-----------TTADRRAVCSCL--KAA---AGAV-------R-------G---------I---------N----------PNNAEAL--PGKCGVNIPYK---ISTSTNCNSIN---------
24 HHSearch 69.7229%-108 - C1 -1SM7 - ? A:[13-101] -------------------------------------------------------------Q--H---LRACQQWIR------------------QQLA-GS--PFSENQWGPQQGPS-------------------L-----R----EQC---CNELYQE-------------------DQVCVCPTL--KQA---AKSV-------RVQ-----GQ--------HGPFQSTR--I----------YQIAKNL--PNVCNMKQI-------------------------
28 HHSearch 60.8222%-126 - C1 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[15-106] -------------------------------------------------------------P--A---LPACRPLLR------------------LQCN-G---S------------QVPEA---------------V-----L----RDC---CQQLAHIS-------------------EWCRCGAL--YSM---LDSM-------YKEH-----GAFPRCRREV---------V----------KLTAASI--TAVCRLPIVVD-----------------------
23 HHSearch 58.5322%-131 - C1 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[15-109] -------------------------------------------------------------N--P---LPSCRWYVTSRTC--------------G----I---G------------PR------------------LPWPELK----RRC---CRELADI-------------------PAYCRCTAL--SIL---MDGA-------IPPGPDAQLEGR------L---------EDLPGCPREVQRGFAATLVTEAECNLATI-------------------------
5 Fugue 57.7420%-101 - C1 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] ----------------------------------------------PYGRGRTESGCYQQME--EAEMLNHCGMYLMKNLGERSQVSPRM-----R----E---E------------D-------------------H-----K----QLC---CMQLKNLDEKCM-------------------CPAI--MMM---LNEPMWIRM--R-------D---------Q---------V----------MSMAHNL--PIECNLM----------SQPCQM-----------
37 SP3 57.1214%-131 * C1 *1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] -----------------------------------------------MCYPGQAFQ----VP--A---LPACRPLLR------------------LQCN-G---S------------Q-------------------V-----PEAVLRDC---CQQLAHI-------------------SEWCRCGAL--YSM---LDSMYKEHGAFP-------R---------C---------RREVV------KLTAASI--TAVCRLPIV-----VDASGDGAYVCKDVAAYPDA
17 HHSearch 56.5625% -95 - C1 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-75] ------------------------------------------------------DLCGMSQD--E---LNECKPAVS------------------K----E---NPT----------S-------------------P-----S----QPC---CTALQHA-------------------DFACLCGYK--NSP---WLGS-------F-------G---------V---------D----------PELASAL--PKQCGLANAP------------------------
32 SP3 56.2217%-111 - C1 -1QPO - NADC_MYCTU A:[116-284] IATATAAWVDAVRGTKAKIRDTRKTLPGLRALQKYAVRTGGGVNHRLGLGDAALIKDNHVAAAGS---VVDALRAVR------------------N----A----------------A-------------------P-----D----LPCEVEVDSLEQLDAVLPEKPELILLDNFAVWQTQTAVQRR--DSR---APTV-------MLESSG--G---------L---------S----------LQTAATY---AETGVDY------LAVGALTHSVRVLDIGLDM-
26 HHSearch 55.3824% -82 - C1 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-119] -------------------------------------------------------------K--D---LSSCERYLR------------------Q----SSSRR------------STGEEVLRMPGDENQQQESQQ-----L----QQC---CNQVKQV-------------------RDECQCEAI--KYI---AEDQ-------IQQ-----GQ--------LHGEESER--V----------AQRAGEI--VSSCGVRCM-------------------------
2 Fugue 55.3727% -85 - C1 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] ----------------------------------------------------AIDLCGMSQD--E---LNECKPAVS------------------KEN--P---T------------S-------------------P-----S----QPC---CTALQH-------------------ADFACLCGYK--NSP---WLGS-------F-------G---------V---------D----------PELASAL--PKQCGLANA---------PTC-------------
22 HHSearch 48.3914%-115 - C1 -1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] -------------------------------------------------------------N--P---LDSCRWYVS------------------TRTCGV---G------------PRLATQE-------------M-----K----ARC---CRQLEAI-------------------PAYCRCEAV--RIL---MDGV-------VTPS----GQHEGRLLQDLPGCPRQVQRA----------FAPKLVT--EVECNLATIH------------------------
18 HHSearch 47.4729% -75 - C1 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[6-66] -------------------------------------------------------------G--Q---LTVCTGAIA------------------G----G---A------------R-------------------P-----T----AAC---CSSLRA----------------------QQGCFCQFAKDPR--YGR----------------Y---------V---------N----------SPNARKA--VSSCGIALP-------------------------
3 Fugue 45.3327% -80 - C1 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] ------------------------------------------------------AGC--NAG--Q---LTVCTGAIA------------------G----G---A------------R-------------------P-----T----AAC---CSSLR----------------------AQQGCFCQ--FAK---DPRY-------G-------RY--------V---------N----------SPNARKA--VSSCGIALP----------TCH------------
25 HHSearch 44.8922% -63 - C1 -3OB4 - ? A:[427-485] -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------H-----Q----ERC---CNELNEFEN-----------------NQRCMCEAL--QQI---MENQSDRL---Q-------G---------R---------QQEQQF-----KRELRNL--PQQCGLRAP-------------------------
7 Fugue 44.7314% -64 - C1 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[1-127] -----------------------------------------GPMRRERGRQGDSSSCERQVD--RVN-LKPCEQHIMQRIMGEQEQYDSYDIRSTR----S---S------------D-------------------Q-----Q----QRC---CDELNEMENTQG-----------CMCEALQQIMEN--QCDRLQDRQM-------V-------Q---------Q---------F----------KRELMSL--PQQCNFRAPQRCDLDVSGGRCS------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(5 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ITCGLVASKLAPCIGYLQGAPGPSAACCGGIKSLNSAAASPADRKTACTCLKSAATSIKGINYGKAASLPRQCGVSVPYAISPNTNCNAIH
39 99.77100%-133 - C- -M039 - A:[1-93] ITCGLVASKLAPCIGYLQGAPGPSAACCGGIKSLNSAAASPADRKTACTCLKSAATSIKGINYGKAASLPRQCGVSVPYAISPNTNCNAIH
45 99.57100%-138 - C- -M045 - A:[1-93] ITCGLVASKLAPCIGYLQGAPGPSAACCGGIKSLNSAAASPADRKTACTCLKSAATSIKGINYGKAASLPRQCGVSVPYAISPNTNCNAIH
43 99.26100%-137 - C- -M043 - A:[1-93] ITCGLVASKLAPCIGYLQGAPGPSAACCGGIKSLNSAAASPADRKTACTCLKSAATSIKGINYGKAASLPRQCGVSVPYAISPNTNCNAIH
42 45.49100% - - C- -M042 - A:[1-144] ITCGLVASKLAPCIGYLQGAPGPSAACCGGIKSLNSAAASPADRKTACTCLKSAATSIKGINYGKAASLPRQCGVSVPYAISPNTNCNAIH
46 45.32100% - - C- -M046 - A:[1-93] ITCGLVASKLAPCIGYLQGAPGPSAACCGGIKSLNSAAASPADRKTACTCLKSAATSIKGINYGKAASLPRQCGVSVPYAISPNTNCNAIH