@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : new_query: (2014-05-05 )
AITCGQVVSSLSQCASYLRNGGAVPPACCSGVKSLNSAARTTPDRQTVCGCLKRASGGVNASNAASLPGKCGVNIPYKISPSTDCSKVQ

Atome Classification :

(20 SA) --------------....--.....10--.........-------------20-------.----.----------------------.---------------.------------..--...30.....-----...40........50-----.--..--.-.------.---.-----------.------------------------60---------.......--..70........80-.........-----
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --------------AITC--GQVVSS---LSQCASYLR-------------N--------G----G----------------------A---------------V------------PP--ACCSGVKSLN-----SAARTTPDRQTVCGC-----L--KR--A-S------G---G-----------V------------------------N----------ASNAASL--PGKCGVNIPYKIS--PSTDCSKVQ-----
14 HHSearch 98.7166%-116 - C4 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[1-91] --------------AITC--GQVTSN---LAPCLAYLR-------------N--------T----G--------------------------------------P------------LG--RCCGGVKALV-----NSARTTEDRQIACTC-----L--KS--A-AGAI---S---G-----------I------------------------N----------LGKAAGL--PSTCGVNIPYKIS--PSTDCSKVQ-----
11 HHSearch 94.7366%-111 - C4 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[1-92] --------------MITC--GQVSSS---LAPCIPYVR-------------G--------G----G----------------------A---------------V------------PP--ACCNGIRNVN-----NLARTTPDRQAACNC-----L--KQ--L-SASV---P---G-----------V------------------------N----------PNNAAAL--PGKCGVSIPYKIS--ASTNCATVK-----
32 SP3 92.5261%-104 - C4 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] --------------AISC--GQVASA---IAPCISYAR-------------G--------Q----G----------------------SG--------------P------------SA--GCCSGVRSLN-----NAARTTADRRAACNC-----L--KN--A-A------AGVSG-----------L------------------------N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYTIS--TSTDCSRVN-----
15 HHSearch 90.3759%-114 - C4 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] ---------------MTC--GQVQGN---LAQCIGFLQ-------------K--------G----G----------------------V---------------V------------PP--SCCTGVKNIL-----NSSRTTADRRAVCSC-----L--KA--A-A------GAVRG-----------I------------------------N----------PNNAEAL--PGKCGVNIPYKIS--TSTNCNSIN-----
12 HHSearch 89.6562%-104 - C4 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[1-93] --------------AISC--GQVASA---IAPCISYAR-------------G--------Q----G----------------------SG--------------P------------SA--GCCSGVRSLN-----NAARTTADRRAACNC-----L--KN--A-A------AGVSG-----------L------------------------N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYTIS--TSTDCSRVN-----
16 HHSearch 86.6948%-114 - C4 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] ---------------IDC--GHVDSL---VRPCLSYVQ-------------G--------G----P----------------------G---------------P------------SG--QCCDGVKNLH-----NQARSQSDRQSACNC-----L--KG--I-A------RGIHN-----------L------------------------N----------EDNARSI--PPKCGVNLPYTIS--LNIDCSRV------
27 HHSearch 65.8528%-116 - C4 -1SM7 - ? A:[13-101] ------------------------QH---LRACQQWIR-------------QQLA-----G----SPFSENQWGPQQGP---------S---------------L------------RE--QCCNELYQE-------------DQVCVCPT-----L--KQ--A-A------K---S-----------VRVQGQHGPFQSTR-----------I----------YQIAKNL--PNVCNMKQI--------------------
24 HHSearch 60.5622%-119 - C4 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[15-109] ------------------------NP---LPSCRWYVT-------------SRTCG----I----G----------------------PR--------------LPWPEL-------KR--RCCRELADI-------------PAYCRCTA-----L--SI--L-M------D---G-----------AIPPGPDAQLEGRL-----------EDLPGCPREVQRGFAATLVTEAECNLATI--------------------
22 HHSearch 55.5124%-111 - C4 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[19-97] ------------------------EM---LNHCGMYLM-------------K--------NLGERS----------------------QVSPRMREED------H------------KQ--LCCMQLKNLD-------------EKCMCPA-----I--MM--M-L------N---E-----------P------------------------MWIRMRDQV--MSMAHNL--PIECNLM----------------------
17 HHSearch 53.4124% -87 - C4 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-75] ---------------DLC--GMSQDE---LNECKPAVS-------------K--------E----NPT--------------------S---------------P------------SQ--PCCTALQHA-------------DFACLCGY-----K--NS--PWLGS----F---G-----------V------------------------D----------PELASAL--PKQCGLANAP-------------------
31 HHSearch 51.4322% -84 - C4 -2LVF - ? A:[16-101] ------------------------QM---LSHCRMYMR-------------QQME-----E----S----------------------T---------------YQTMPRRGMEPH-MS--ECCEQLEGM-------------DESCRCEG-----L--RM--M-M------R---MMQQKEMQ----PRGEQMRR-----------------M----------MRLAENI--PSRCNLS----------------------
2 Fugue 50.7826% -66 - C4 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -------------AIDLC--GMSQDE---LNECKPAVS-------------K--------E----N----------------------P---------------T------------SPSQPCCTALQHAD---------------FACLCGYKNSP--WL--G-S------F---G-----------V------------------------D----------PELASAL--PKQCGLANA--------PTC---------
23 HHSearch 50.1216%-111 - C4 -1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] ------------------------NP---LDSCRWYVS-------------TRTCG----V----G----------------------PRLATQE---------M------------KA--RCCRQLEAI-------------PAYCRCEA-----V--RI--L-M------D---G-----------VVTPSGQHEGRLLQDLPGCPRQVQRA----------FAPKLVT--EVECNLATIH-------------------
28 HHSearch 49.5119% -88 * C4 *1W2Q - CONG_ARAHY A:[22-114] -----------------------RVN---LKPCEQHIM-------------QRIM-----G----EQEQ-------------------Y---------------DSYDIRSTRSSDQQQ--RCCDELNEME----------N-TQGCMCEA-----L--QQ--I-M------E---N-----------QCDRLQDR-----------------QMVQQF-----KRELMSL--PQQCNFRAP--------------------
3 Fugue 48.4024% -74 - C4 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] ---------------AGC----NAGQ---LTVCTGAIA-------------G--------G----A----------------------R---------------P------------TA--ACCSSLRAQQ-----GCFCQFAKD--------------PR--Y-G------R---Y-----------V------------------------N----------SPNARKA--VSSCGIALPT---------CH--------
26 HHSearch 46.0529% -58 - C4 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-121] ------------------------KD---LSSCERYLR-------------Q--------SSSRRSTGE-------------------EVLRMPGDENQQQESQQ------------LQ--QCCNQVKQV-------------RDECQCEA-----I--KY--I-AEDQIQQG---Q-----------LHGEESER-----------------V----------AQRAGEI--VSSCGV--RCMRQ----------------
6 Fugue 44.8623% -87 - C4 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] ----------------MCYPGQAFQVPA-LPACRPLLR-------------LQCNGSQVP-----E----------------------A---------------V------------LR--DCCQQLAHISEWCRCGALYSMLDS--MYKE-----H--------------------GAFPRCRREVVK------------------------L----------TAASITA----VCRLPIVVDASGDGAYVCKDVAAYPDA
7 Fugue 44.1521% -44 - C4 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] -------PYGRGRTESGC--YQQMEEAEMLNHCGMYLMKNLGERSQVSPRMR--------E----E----------------------D---------------H------------KQ--LCCMQLKNLD-----EKCMCPAIMMMLNEP-----M--WI--R-M------R---D-----------Q------------------------V----------MSMAHNL--PIECNLM---------SQPCQM-------
18 HHSearch 42.8432% -66 - C4 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[6-66] ------------------------GQ---LTVCTGAIA-------------G--------G----A----------------------R---------------P------------TA--ACCSSLRA----------------QQGCFC-----QFAKDPRY-G------R---Y-----------V------------------------N----------SPNARKA--VSSCGIALP--------------------
5 Fugue 40.1825% -27 - C4 -1PSY - 2SS_RICCO A:[1-125] AEFMESKGEREGSSSQQC--RQEVQRKD-LSSCERYLR-------------Q--------S----SSRRSTGEEVLRMPGDENQQQESQ---------------Q------------LQ--QCCNQVKQVRDECQCEAIKYIAEDQIQQGQ-----L--HG--E-E------S---E-----------R------------------------V----------AQRAGEI--VSSC--GVRCMRQ--TRTN----------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) AITCGQVVSSLSQCASYLRNGGAVPPACCSGVKSLNSAARTTPDRQTVCGCLKRASGGVNASNAASLPGKCGVNIPYKISPSTDCSKVQ
46 98.97100%-125 - C- -M046 - A:[1-96] AITCGQVVSSLSQCASYLRNGGAVPPACCSGVKSLNSAARTTPDRQTVCGCLKRASGGVNASNAASLPGKCGVNIPYKISPSTDCSKVQ
41 98.18100%-116 - C- -M041 - A:[1-96] AITCGQVVSSLSQCASYLRNGGAVPPACCSGVKSLNSAARTTPDRQTVCGCLKRASGGVNASNAASLPGKCGVNIPYKISPSTDCSKVQ
48 96.03100%-118 - C- -M048 - A:[1-96] AITCGQVVSSLSQCASYLRNGGAVPPACCSGVKSLNSAARTTPDRQTVCGCLKRASGGVNASNAASLPGKCGVNIPYKISPSTDCSKVQ
47 94.38100%-118 - C- -M047 - A:[1-96] AITCGQVVSSLSQCASYLRNGGAVPPACCSGVKSLNSAARTTPDRQTVCGCLKRASGGVNASNAASLPGKCGVNIPYKISPSTDCSKVQ