@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : new_query: (2014-05-06 )
AITCGTVVTRLTPCLTYLRSGGAVAPACCNGVKALNNDAKTTPDRQAACGCLKTASTSISGIQLGNAASLAGKCGVNLPYKISPTIDCSKVK

Atome Classification :

(20 SA) --------------....--.....10--.........-------------20-------..----------------------.-------------------.------------.----.--...30........40........50....--....-------60------.---------.-------.----------......70-.........80--......------------------..90.---------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --------------AITC--GTVVTR---LTPCLTYLR-------------S--------GG----------------------A-------------------V------------A----P--ACCNGVKALNNDAKTTPDRQAACGCLKTA--STSI-------S-------G---------I-------Q----------LGNAASL--AGKCGVNLPYK--ISPTID------------------CSKVK---------
22 HHSearch 91.9464%-122 - C3 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[1-91] --------------AITC--GQVTSN---LAPCLAYLR-------------N--------TG------------------------------------------P------------L----G--RCCGGVKALVNSARTTEDRQIACTCLKSA--AGAI-------S-------G---------I-------N----------LGKAAGL--PSTCGVNIPYK--ISPSTD------------------CSKVQ---------
25 HHSearch 91.7148%-125 - C3 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] ---------------MTC--GQVQGN---LAQCIGFLQ-------------K--------GG----------------------V-------------------V------------P----P--SCCTGVKNILNSSRTTADRRAVCSCLKAA--AGAV-------R-------G---------I-------N----------PNNAEAL--PGKCGVNIPYK--ISTSTN------------------CNSIN---------
21 HHSearch 90.7260%-123 - C3 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[1-92] --------------MITC--GQVSSS---LAPCIPYVR-------------G--------GG----------------------A-------------------V------------P----P--ACCNGIRNVNNLARTTPDRQAACNCLKQL--SASV-------P-------G---------V-------N----------PNNAAAL--PGKCGVSIPYK--ISASTN------------------CATVK---------
26 HHSearch 87.8149%-136 - C3 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] ---------------IDC--GHVDSL---VRPCLSYVQ-------------G--------GP----------------------G-------------------P------------S----G--QCCDGVKNLHNQARSQSDRQSACNCLKGI--ARGI-------H-------N---------L-------N----------EDNARSI--PPKCGVNLPYT--ISLNID------------------CSRV----------
11 SP3 84.0752%-123 - C3 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] --------------AISC--GQVASA---IAPCISYAR-------------G--------QG----------------------SG------------------P------------S----A--GCCSGVRSLNNAARTTADRRAACNCLKNA--AAGV-------S-------G---------L-------N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYT--ISTSTD------------------CSRVN---------
23 HHSearch 83.0352%-124 - C3 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[1-93] --------------AISC--GQVASA---IAPCISYAR-------------G--------QG----------------------SG------------------P------------S----A--GCCSGVRSLNNAARTTADRRAACNCLKNA--AAGV-------S-------G---------L-------N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYT--ISTSTD------------------CSRVN---------
40 HHSearch 65.1527%-142 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[15-105] ------------------------PA---LPACRPLLR-------------LQCN-----GS----------------------QVPEA---------------V------------L----R--DCCQQLAHI--------SEWCRCGALYSM--LDSM-------YKEH-----GAFPRCRREV-------V----------KLTAASI--TAVCRLPIVV-----------------------------------------
15 SP3 61.0221%-120 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] --------MCYPGQAFQ------VPA---LPACRPLLR-------------LQCN-----GS----------------------Q-------------------V------------PEAVLR--DCCQQLAHI--------SEWCRCGALYSM--LDSMYKEHGAFP-------R---------C-------RREVV------KLTAASI--TAVCRLPIV----VDASGD------------------GAYVCKDVAAYPDA
36 HHSearch 58.1627%-131 - C3 -1SM7 - ? A:[13-101] ------------------------QH---LRACQQWIR-------------QQLA-----GS----------------------PFSENQWGPQQGPS------L------------R----E--QCCNELYQE--------DQVCVCPTLKQA--AKSV-------RVQ-----GQ--------HGPFQSTRI----------YQIAKNL--PNVCNMKQI------------------------------------------
34 HHSearch 57.1421%-138 - C3 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[15-109] ------------------------NP---LPSCRWYVTSRTC---------G--------IG----------------------P-------------------RLPWPEL------K----R--RCCRELADI--------PAYCRCTALSIL--MDGA-------IPPGPDAQLEGR------L-------EDLPGCPREVQRGFAATLVTEAECNLATI------------------------------------------
27 HHSearch 55.8821%-114 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-75] ---------------DLC--GMSQDE---LNECKPAVS-------------K--------ENPT--------------------S-------------------P------------S----Q--PCCTALQHA--------DFACLCGYKNSPW-LGSF---------------G---------V-------D----------PELASAL--PKQCGLANAP-----------------------------------------
37 HHSearch 53.6025% -86 - C3 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-121] ------------------------KD---LSSCERYLR-------------QSSS-----RR----------------------STGEEVLRMPGDENQQQESQQ------------L----Q--QCCNQVKQV--------RDECQCEAIKYI--AEDQ-------IQQG----Q---------LHGEESERV----------AQRAGEI--VSSCGV--RCM--RQ------------------------------------
5 Fugue 53.2423% -46 - C3 -1PSY - 2SS_RICCO A:[1-125] AEFMESKGEREGSSSQQC--RQEVQRKD-LSSCERYLR-------------Q--------SSSRRSTGEEVLRMPGDENQQQESQ-------------------Q------------L----Q--QCCNQVKQVRDECQCEAIKYIAEDQIQQGQLHGEE-------S-------E---------R-------V----------AQRAGEI--VSSCGVR-CMR--QTRTN---------------------------------
2 Fugue 52.0221% -93 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -------------AIDLC--GMSQDE---LNECKPAVS-------------K--------EN----------------------P-------------------T------------S----PSQPCCTALQ--------HADFACLCGYKNSP--WLGS-------F-------G---------V-------D----------PELASAL--PKQCGLANA--------PT------------------C-------------
38 HHSearch 51.0920%-101 - C3 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[22-114] -----------------------RVN---LKPCEQHIM-------------QRIM-----GEQE--------------------QY------------------DSYDIRSTRSSDQQ----Q--RCCDELNEME-----N-TQGCMCEALQQI--MENQ-------CDRLQ---D---------R-------QMVQQF-----KRELMSL--PQQCNFRAP------------------------------------------
8 Fugue 50.7719%-109 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] -------PYGRGRTESGC--YQQMEEAEMLNHCGMYLMKNLGERSQVSPRMR--------EE----------------------D-------------------H------------K----Q--LCCMQLKNLD----------EKCMC-PAI--MMML-------N-------E---------P-------M----------WIRMRDQ--VMSMAHNLPIECNLMSQ-P------------------CQM-----------
41 HHSearch 50.3718%-105 - C3 -2LVF - ? A:[16-101] ------------------------QM---LSHCRMYMR-------------QQME-----ES----------------------T-------------------YQTMPRRGMEPH-M----S--ECCEQLEGM--------DESCRCEGLRMM--MRMM-------QQKEM---Q---------PRGEQMRRM----------MRLAENI--PSRCNLS--------------------------------------------
9 Fugue 50.0925%-110 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] ----------------MCYPGQAFQVPA-LPACRPLLR-------------LQCNGSQVP-E----------------------A-------------------V------------L----R--DCCQQLAHI--------SEWCRCGALYSM--LDS-MYKE---H-----------------------------------------GA--FPRCRREVVKL--TAASITAVCRLPIVVDASGDGAYVCKDVAAYPDA----
33 HHSearch 49.4420%-109 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[19-97] ------------------------EM---LNHCGMYLM-------------KNLGE----RS----------------------QVSPRMREED----------H------------K----Q--LCCMQLKNLD--------EKCMCPAIMMM--LNEP-------MW------IRMRD-----Q-------V----------MSMAHNL--PIECNLM--------------------------------------------
32 HHSearch 48.2616%-122 - C3 -1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] ------------------------NP---LDSCRWYVS-------------TRTCG----VG----------------------PRLATQE-------------M------------K----A--RCCRQLEAI--------PAYCRCEAVRIL--MDGV-------VTPS----GQHEGRLLQDL-------PGCPRQVQRA-FAPKLVT--EVECNLATIH-----------------------------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(5 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90.
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) AITCGTVVTRLTPCLTYLRSGGAVAPACCNGVKALNNDAKTTPDRQAACGCLKTASTSISGIQLGNAASLAGKCGVNLPYKISPTIDCSKVK
46 94.92100%-140 - C- -M046 - A:[1-93] AITCGTVVTRLTPCLTYLRSGGAVAPACCNGVKALNNDAKTTPDRQAACGCLKTASTSISGIQLGNAASLAGKCGVNLPYKISPTIDCSKVK
49 94.44100%-126 - C- -M049 - A:[1-93] AITCGTVVTRLTPCLTYLRSGGAVAPACCNGVKALNNDAKTTPDRQAACGCLKTASTSISGIQLGNAASLAGKCGVNLPYKISPTIDCSKVK
42 93.83100%-130 - C- -M042 - A:[1-93] AITCGTVVTRLTPCLTYLRSGGAVAPACCNGVKALNNDAKTTPDRQAACGCLKTASTSISGIQLGNAASLAGKCGVNLPYKISPTIDCSKVK
48 93.60100%-133 - C- -M048 - A:[1-93] AITCGTVVTRLTPCLTYLRSGGAVAPACCNGVKALNNDAKTTPDRQAACGCLKTASTSISGIQLGNAASLAGKCGVNLPYKISPTIDCSKVK
43 91.04100%-120 - C- -M043 - A:[1-93] AITCGTVVTRLTPCLTYLRSGGAVAPACCNGVKALNNDAKTTPDRQAACGCLKTASTSISGIQLGNAASLAGKCGVNLPYKISPTIDCSKVK