@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : new_query: (2014-05-06 )
ITCGQVSSSLAPCIGYVRGGGAVPPACCNGIRNVNNLARTTPDRRTACNCLKQLSGSISGVNPNNAAALPGKCGVNIPYKISASTNCATVK

Atome Classification :

(20 SA) --------.........---10.......-------------.----20---.-------------.------------------.-----------..----....30........40........50...-----...-.-------.-------60--------.---------.----------.......--70........80........90---------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --------ITCGQVSSS---LAPCIGYVR-------------G----G----G-------------A------------------V-----------PP----ACCNGIRNVNNLARTTPDRRTACNCLKQL-----SGS-I-------S-------G---------V---------N----------PNNAAAL--PGKCGVNIPYKISASTNCATVK---------
21 HHSearch 94.0192%-121 - C3 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-92] --------ITCGQVSSS---LAPCIPYVR-------------G----G----G-------------A------------------V-----------PP----ACCNGIRNVNNLARTTPDRQAACNCLKQL-----SAS-V-------P-------G---------V---------N----------PNNAAAL--PGKCGVSIPYKISASTNCATVK---------
23 HHSearch 83.3558%-114 - C3 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-91] --------ITCGQVTSN---LAPCLAYLR-------------N----T----G--------------------------------P-----------LG----RCCGGVKALVNSARTTEDRQIACTCLKSA-----AGA-I-------S-------G---------I---------N----------LGKAAGL--PSTCGVNIPYKISPSTDCSKVQ---------
24 HHSearch 82.7862%-110 - C3 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] --------MTCGQVQGN---LAQCIGFLQ-------------K----G----G-------------V------------------V-----------PP----SCCTGVKNILNSSRTTADRRAVCSCLKAA-----AGA-V-------R-------G---------I---------N----------PNNAEAL--PGKCGVNIPYKISTSTNCNSIN---------
11 SP3 81.8658%-107 - C3 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -------AISCGQVASA---IAPCISYAR-------------G----Q----G-------------SG-----------------P-----------SA----GCCSGVRSLNNAARTTADRRAACNCLKNA-----AAG-V-------S-------G---------L---------N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYTISTSTDCSRVN---------
26 HHSearch 79.5947%-120 - C3 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] --------IDCGHVDSL---VRPCLSYVQ-------------G----G----P-------------G------------------P-----------SG----QCCDGVKNLHNQARSQSDRQSACNCLKGI-----ARG-I-------H-------N---------L---------N----------EDNARSI--PPKCGVNLPYTISLNIDCSRV----------
22 HHSearch 78.0458%-109 - C3 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[2-93] --------ISCGQVASA---IAPCISYAR-------------G----Q----G-------------SG-----------------P-----------SA----GCCSGVRSLNNAARTTADRRAACNCLKNA-----AAG-V-------S-------G---------L---------N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYTISTSTDCSRVN---------
18 SP3 60.9920%-139 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] -MCYPGQAFQ----VPA---LPACRPLLR-------------LQCN-G----S-------------Q------------------V-----------PEAVLRDCCQQLAHI--------SEWCRCGALYSM-----LDS-MYKEHGAFP-------R---------C---------RREVV------KLTAASI--TAVCRLPIV--VDASGDGAYVCKDVAAYPDA
34 HHSearch 60.2429%-121 - C3 -1SM7 - ? A:[13-101] ---------------QH---LRACQQWIR-------------QQLA-G----SPFSENQWGPQQGPS------------------L-----------RE----QCCNELYQE--------DQVCVCPTLKQA-----AKS-V-------RVQ-----GQ--------H---------GPFQSTRI---YQIAKNL--PNVCNMKQI----------------------
39 HHSearch 57.4525%-146 * C3 *1HSS - IAA1_WHEAT A:[15-104] ---------------PA---LPACRPLLR-------------LQCN-G----S-------------QVPEA--------------V-----------LR----DCCQQLAHI--------SEWCRCGALYSM-----LDS-M-------YKEH-----GAFPRCRREV---------V----------KLTAASI--TAVCRLPIV----------------------
36 HHSearch 56.4324%-134 - C3 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[15-109] ---------------NP---LPSCRWYVTSRTC---------G----I----G-------------PR-----------------LPWPEL------KR----RCCRELADI--------PAYCRCTALSIL-----MDG-A-------IPPGPDAQLEGR------L---------EDLPGCPREVQRGFAATLVTEAECNLATI----------------------
40 HHSearch 49.8220% -95 - C3 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[22-114] --------------RVN---LKPCEQHIM-------------QRIM-G----EQEQ----------YDSYDIRSTRSSD------Q-----------QQ----RCCDELNEME-----N-TQGCMCEALQQI-----MEN-Q-------CDRLQ---D---------R---------QMVQQF-----KRELMSL--PQQCNFRAP----------------------
38 HHSearch 48.4521% -86 - C3 -2LVF - ? A:[16-101] ---------------QM---LSHCRMYMR-------------QQME-E----S-------------T------------------YQTMPRRGMEPHMS----ECCEQLEGM--------DESCRCEGLRMM-----MRMMQQKEMQP-R-------GEQMR-----R---------M----------MRLAENI--PSRCNLS------------------------
32 HHSearch 48.4417%-119 - C3 -1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] ---------------NP---LDSCRWYVS-------------TRTCGV----G-------------PRLATQE------------M-----------KA----RCCRQLEAI--------PAYCRCEAVRIL-----MDG-V-------VTPS----GQHEGRLLQDLPGCPRQVQRA----------FAPKLVT--EVECNLATIH---------------------
13 SP3 47.5421% -76 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] --------AGC--NAGQ---LTVCTGAIA-------------G----G----A-------------R------------------P-----------TA----ACCSSLRA-----------QQGCFCQFAK-----DPR-Y-------G-------RY--------V---------N----------SPNARKA--VSSCGIALP-------TCH------------
33 HHSearch 46.7323% -75 - C3 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-121] ---------------KD---LSSCERYLR-------------Q----SSSRRS-------------TGEEVLRMPGDENQQQESQQ-----------LQ----QCCNQVKQV--------RDECQCEAIKYI-----AED-Q-------IQQ-----GQ--------LHGEESER--V----------AQRAGEI--VSSCGV--RCMRQ------------------
3 Fugue 46.0626% -81 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] --------AGC--NAGQ---LTVCTGAIA-------------G----G----A-------------R------------------P-----------TA----ACCSSLRAQQGCFCQFAKDPR----YGRY-----------------------------------V---------N----------SPNARKA--VSSCGIALP-------TCH------------
27 HHSearch 45.5626% -87 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[4-75] ---------LCGMSQDE---LNECKPAVS-------------K----E----NPT-----------S------------------P-----------SQ----PCCTALQHA--------DFACLCGYKNSP-----WLG-S-------F-------G---------V---------D----------PELASAL--PKQCGLANAP---------------------
28 HHSearch 44.0230% -69 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[6-66] ---------------GQ---LTVCTGAIA-------------G----G----A-------------R------------------P-----------TA----ACCSSLRA-----------QQGCFCQFAK-----DPR-YG------R-------Y---------V---------N----------SPNARKA--VSSCGIALP----------------------
2 Fugue 43.8727% -76 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] ------AIDLCGMSQDE---LNECKPAVS-------------K----E----N-------------P------------------T-----------SPSQ--PCCTALQHA--------DFACLCGYKNSP-----WLG-S-------F-------G---------V---------D----------PELASAL--PKQCGLANA------PTC-------------
7 Fugue 43.2020% -89 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] PYGRGRTESGCYQQMEEAEMLNHCGMYLMKNLGERSQVSPRMR----E----E-------------D------------------H-----------KQ----LCCMQLKNLDEKCM--------CPAIMMMLNEPMWIR-M-------R-------D---------Q---------V----------MSMAHNL--PIECNL-------MSQPCQM-----------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ITCGQVSSSLAPCIGYVRGGGAVPPACCNGIRNVNNLARTTPDRRTACNCLKQLSGSISGVNPNNAAALPGKCGVNIPYKISASTNCATVK
46 95.59100%-130 - C- -M046 - A:[1-93] ITCGQVSSSLAPCIGYVRGGGAVPPACCNGIRNVNNLARTTPDRRTACNCLKQLSGSISGVNPNNAAALPGKCGVNIPYKISASTNCATVK
48 94.04100%-120 - C- -M048 - A:[1-93] ITCGQVSSSLAPCIGYVRGGGAVPPACCNGIRNVNNLARTTPDRRTACNCLKQLSGSISGVNPNNAAALPGKCGVNIPYKISASTNCATVK
45 91.05100%-116 - C- -M045 - A:[1-93] ITCGQVSSSLAPCIGYVRGGGAVPPACCNGIRNVNNLARTTPDRRTACNCLKQLSGSISGVNPNNAAALPGKCGVNIPYKISASTNCATVK
41 90.16100%-116 - C- -M041 - A:[1-93] ITCGQVSSSLAPCIGYVRGGGAVPPACCNGIRNVNNLARTTPDRRTACNCLKQLSGSISGVNPNNAAALPGKCGVNIPYKISASTNCATVK