@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : new_query: (2014-05-06 )
VNCGQVNKALSSCVPFLTGFDTTPSLTCCAGVMELKRLAPTVKDKRIACECVKTAAARYPNIREDAASSLPYKCGVVINVPISKTTNCHEIN

Atome Classification :

(20 SA) -------------------.........10.......----.---20---.--.------------.-----.-----------.....30........40........50.--...-...-------.---------------60------.----.----.----------......70-.........80........90.--------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -------------------VNCGQVNKALSSCVPFLT----G---F----D--T------------T-----P-----------SLTCCAGVMELKRLAPTVKDKRIACECV--KTA-AAR-------Y---------------P-------N----I----R----------EDAASSL--PYKCGVVINVPISKTTNCHEIN--------------------
17 HHSearch 93.5941%-113 - C4 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[2-93] -------------------ISCGQVASAIAPCISYAR----G---Q----G--S------------G-----P-----------SAGCCSGVRSLNNAARTTADRRAACNCL--KNA-AAG-------V---------------S-------G----L----N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYTISTSTDCSRVN--------------------
11 SP3 93.5241%-118 - C4 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] ------------------AISCGQVASAIAPCISYAR----G---Q----G--S------------G-----P-----------SAGCCSGVRSLNNAARTTADRRAACNCL--KNA-AAG-------V---------------S-------G----L----N----------AGNAASI--PSKCGVSIPYTISTSTDCSRVN--------------------
22 HHSearch 90.8836%-128 - C4 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] -------------------IDCGHVDSLVRPCLSYVQ----G---G-------P------------G-----P-----------SGQCCDGVKNLHNQARSQSDRQSACNCL--KGI-ARG-------I---------------H-------N----L----N----------EDNARSI--PPKCGVNLPYTISLNIDCSRV---------------------
20 HHSearch 90.8737%-132 - C4 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-92] -------------------ITCGQVSSSLAPCIPYVR----G---G-------G------------A-----V-----------PPACCNGIRNVNNLARTTPDRQAACNCL--KQL-SAS-------V---------------P-------G----V----N----------PNNAAAL--PGKCGVSIPYKISASTNCATVK--------------------
21 HHSearch 89.2740%-115 - C4 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] -------------------MTCGQVQGNLAQCIGFLQ----K---G-------G------------V-----V-----------PPSCCTGVKNILNSSRTTADRRAVCSCL--KAA-AGA-------V---------------R-------G----I----N----------PNNAEAL--PGKCGVNIPYKISTSTNCNSIN--------------------
18 HHSearch 88.5039%-128 - C4 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-91] -------------------ITCGQVTSNLAPCLAYLR----N---T----G---------------------P-----------LGRCCGGVKALVNSARTTEDRQIACTCL--KSA-AGA-------I---------------S-------G----I----N----------LGKAAGL--PSTCGVNIPYKISPSTDCSKVQ--------------------
28 HHSearch 66.8229%-134 - C4 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-117] --------------------------KDLSSCERYLR----Q---SSS--R--RSTGEEVLR----M-----PGDENQQQESQQLQQCCNQVKQV--------RDECQCEAI--KYI-AED-------QIQQGQL---------H-------G----EESERV----------AQRAGEI--VSSCGVR-----------------------------------
34 HHSearch 59.6522%-151 * C4 *1HSS - IAA1_WHEAT A:[15-103] --------------------------PALPACRPLLR----L---QCN--GS-Q------------V-----PEAV--------LRDCCQQLAHI--------SEWCRCGAL--YSM-LDS-------MYKEHGAF--------P-------RCRREV----V----------KLTAASI--TAVCRLPI----------------------------------
32 HHSearch 56.0820%-144 - C4 -1SM7 - ? A:[13-101] --------------------------QHLRACQQWIR----Q---QLAG-S--PFSENQWGPQQGPS-----L-----------REQCCNELYQE--------DQVCVCPTL--KQA-AKS-------V---------------RVQ-----GQ---H----GPFQSTRI---YQIAKNL--PNVCNMKQI---------------------------------
31 HHSearch 54.3317%-144 - C4 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[16-110] ---------------------------PLPSCRWYVTSRTCG---I----G--P------------R-----LPWPEL------KRRCCRELAD---I-----PAYCRCTAL--SIL-MDG-------A---------------IPPGPDAQLEGR-L----EDLPGCPREVQRGFAATLVTEAECNLATIS--------------------------------
5 Fugue 51.5213% -90 - C4 -2OCC - COX5A_BOVIN E:[5-109] HETDEEFDARWVTYFNKPDIDAWELRKGMNTLV--------G---Y----D--L------------V-----P-----------EPKIIDAALRACRR---LNDFASAVRIL--EVV-KDKAGPHKEIY---------------P-------Y----V----I----------QELRPTL--NEL-----GISTPEELGLDKV---------------------
23 HHSearch 49.9624% -90 - C4 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-75] -------------------DLCGMSQDELNECKPAVS----K---E----N--PT-----------S-----P-----------SQPCCTALQHA--------DFACLCGYK--NSPWLGS-------F-----------------------G----V----D----------PELASAL--PKQCGLANAP--------------------------------
35 HHSearch 49.6217%-100 - C4 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[23-114] --------------------------VNLKPCEQHIM----Q---RIMG-EQEQY-----------D-----SYDIRSTRSSDQQQRCCDELNEME----N--TQGCMCEAL--QQI-MEN-------Q---------------CDRLQ---D----R----QMVQQF-----KRELMSL--PQQCNFRAP---------------------------------
37 HHSearch 49.5319%-106 - C4 -2LVF - ? A:[16-101] --------------------------QMLSHCRMYMR----QQMEE----S--T------------Y-----QTMPRRGMEPH-MSECCEQLEGM--------DESCRCEGL--RMM-MRMM------QQKEMQP---------R-------GEQMRR----M----------MRLAENI--PSRCNLS-----------------------------------
2 Fugue 49.3025% -70 - C4 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -----------------AIDLCGMSQDELNECKPAVS----K---E----N--P------------TS----P-----------SQPCCTALQHA--------DFACLCGYK--NSP-WLG-------S---------------F-------G----V----D----------PELASAL--PKQCGL------ANAPTC------------------------
36 HHSearch 47.2918%-131 - C4 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[19-97] --------------------------EMLNHCGMYLM----K---NLGERS--QVSPRMREE----D-----H-----------KQLCCMQLKNLD--------EKCMCPAI--MMM-LNE-------P---------------MW------IRMRDQ----V----------MSMAHNL--PIECNLM-----------------------------------
4 Fugue 46.8620% -86 - C4 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] -------------------AGC--NAGQLTVCTGAIA----G--------G--A------------R-----P-----------TAACCSSLRAQQGCFCQFAKDP----------R-YGR-------Y----------------------------V----N----------SPNARKA--VSSCGI-------ALPTCH-----------------------
24 HHSearch 45.0022%-125 - C4 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[6-66] --------------------------GQLTVCTGAIA----G---G-------A------------R-----P-----------TAACCSSLRA-----------QQGCFCQFAKDPRYGR-------------------------------Y----V----N----------SPNARKA--VSSCGIALP---------------------------------
30 HHSearch 43.6315%-107 - C4 -1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] --------------------------NPLDSCRWYVS----T---RTCGVG--P------------RLATQEM-----------KARCCRQLEAI--------PAYCRCEAV--RIL-MDG-------VVTPSGQHEGRLLQDLP-------G----C----PRQVQRA----FAPKLVT--EVECNLATIH--------------------------------
10 Fugue 43.0814% -67 - C4 -4HR1 - ? A:[3-120] ---------------FNGAQTVIQKISWLRTAIAFLK----G---YM---E--T------------T-----G-----------AT--KKELEQVEKLKERVDEIATAVNWD--VYA-QYARGD----F---------------N-------L----L----S----------DDEYKEI--QKALLVLEDIKEQIIVEMLRVGLAQGQMGTLKISDYLDSLDS


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(2 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90.
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) VNCGQVNKALSSCVPFLTGFDTTPSLTCCAGVMELKRLAPTVKDKRIACECVKTAAARYPNIREDAASSLPYKCGVVINVPISKTTNCHEIN
42 95.79100%-138 - C- -M042 - A:[1-93] VNCGQVNKALSSCVPFLTGFDTTPSLTCCAGVMELKRLAPTVKDKRIACECVKTAAARYPNIREDAASSLPYKCGVVINVPISKTTNCHEIN
38 90.69100%-135 - C- -M038 - A:[1-93] VNCGQVNKALSSCVPFLTGFDTTPSLTCCAGVMELKRLAPTVKDKRIACECVKTAAARYPNIREDAASSLPYKCGVVINVPISKTTNCHEIN