@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : new_query: (2014-05-07 )
LSCGEVTSGLAPCLPYLQGRGPIGGCCGGVKGLLGAAKTPEDRKTACTCLKSAANSIKGIDTGKAVGLPGVCGVSIPYKISPSTDCSKVQ

Atome Classification :

(20 SA) -------------........----.---10.......--------------.----20.-------------------.----------------.-------...----...30........40........50-...---....----.-------.---------60--------.----------.......--.70......-..---80........90---
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -------------LSCGEVTS----G---LAPCLPYLQ--------------G----R-G-------------------P----------------I-------GGC----CGGVKGLLGAAKTPEDRKTACTCL--KSA---ANSI----K-------G---------I---------D----------TGKAVGL--PGVCGVSIP-YK---ISPSTDCSKVQ----
15 HHSearch 94.6270%-127 - C3 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-91] -------------ITCGQVTS----N---LAPCLAYLR--------------N----T-G-------------------P----------------L-------GRC----CGGVKALVNSARTTEDRQIACTCL--KSA---AGAI----S-------G---------I---------N----------LGKAAGL--PSTCGVNIP-YK---ISPSTDCSKVQ----
17 HHSearch 83.5749%-126 - C3 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-92] -------------ITCGQVSS----S---LAPCIPYVR--------------G----G-GA------------------V----------------P-------PAC----CNGIRNVNNLARTTPDRQAACNCL--KQL---SASV----P-------G---------V---------N----------PNNAAAL--PGKCGVSIP-YK---ISASTNCATVK----
18 HHSearch 83.0547%-114 - C3 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] -------------MTCGQVQG----N---LAQCIGFLQ--------------K----G-GV------------------V----------------P-------PSC----CTGVKNILNSSRTTADRRAVCSCL--KAA---AGAV----R-------G---------I---------N----------PNNAEAL--PGKCGVNIP-YK---ISTSTNCNSIN----
11 SP3 81.4954%-119 - C3 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] ------------AISCGQVAS----A---IAPCISYAR--------------G----Q-GSG-----------------P----------------S-------AGC----CSGVRSLNNAARTTADRRAACNCL--KNA---AAGV----S-------G---------L---------N----------AGNAASI--PSKCGVSIP-YT---ISTSTDCSRVN----
16 HHSearch 78.0554%-102 - C3 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[2-93] -------------ISCGQVAS----A---IAPCISYAR--------------G----Q-GSG-----------------P----------------S-------AGC----CSGVRSLNNAARTTADRRAACNCL--KNA---AAGV----S-------G---------L---------N----------AGNAASI--PSKCGVSIP-YT---ISTSTDCSRVN----
20 HHSearch 76.1747%-117 - C3 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] -------------IDCGHVDS----L---VRPCLSYVQ--------------G----GPG-------------------P----------------S-------GQC----CDGVKNLHNQARSQSDRQSACNCL--KGI---ARGI----H-------N---------L---------N----------EDNARSI--PPKCGVNLP-YT---ISLNIDCSRV-----
34 HHSearch 65.4825%-158 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[15-105] --------------------P----A---LPACRPLLR--------------LQC--N-G-------------------SQVPEAV----------L-------RDC----CQQLAHI--------SEWCRCGAL--YSM---LDSM----YKEH-----GAFPRCRREV---------V----------KLTAASI--TAVCRLPIV-V-------------------
10 Fugue 59.1427% -91 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] -----PYGRGRTESGCYQQME----EAEMLNHCGMYLMKNLGERSQVSPRMRE----E-D-------------------H----------------K-------QLC----CMQLKNL--------DEKCMCPAI--MMM---LNEP----M-------W---------I---------RMRDQV-----MSMAHNL--PIECNLM-----------SQPCQM------
28 HHSearch 55.2524%-157 - C3 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[15-109] --------------------N----P---LPSCRWYVTSRTC----------G----I-G-------------------P----------------RLPWPELKRRC----CRELADI--------PAYCRCTAL--SIL---MDGA----IPPGPDAQLEGR------L---------EDLPGCPREVQRGFAATLVTEAECNLATI---------------------
27 HHSearch 55.1029%-120 - C3 -1SM7 - ? A:[13-101] --------------------Q----H---LRACQQWIRQQL-----------A----G-S-------------------PFSENQWGPQQGPSL--R-------EQC----CNELYQE--------DQVCVCPTL--KQA---AKSV----RVQ-----GQ--------HGPFQSTR--I----------YQIAKNL--PNVCNMKQI---------------------
5 Fugue 49.3018% -77 - C3 -2A10 - CCMK4_SYNY3 A:[4-107] ------------QSAVGSIETIGFPG---ILAAADAMV--------------K----A-G-------------------R----------------I-------TIVGYIRAGSARFTLNIRGDVQEVKTAMAAG--IDA---INRT----E-------G---------A---------D----------VKTWVII--PRPHENVVAVLP---IDFSPEVEPFREAAE
31 HHSearch 48.3827%-113 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[19-97] --------------------E----M---LNHCGMYLM--------------KNLGER-S-------------------QVSPRMREEDH------K-------QLC----CMQLKNLDE--------KCMCPAI--MMM---LNEP----MW------IRMRD-----Q---------V----------MSMAHNL--PIECNLM-----------------------
30 HHSearch 47.9728% -98 - C3 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-118] --------------------K----D---LSSCERYLR--------------QSSSRR-STGE----------------EVLRMPGDENQQQESQQL-------QQC----CNQVKQV--------RDECQCEAI--KYI---AEDQ----IQQGQLH-GEESE-----R---------V----------AQRAGEI--VSSCGVRC----------------------
25 HHSearch 47.0517%-147 - C3 -1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] --------------------N----P---LDSCRWYVSTRTC----------G----V-G-------------------P----------------RLATQEMKARC----CRQLEAI--------PAYCRCEAV--RIL---MDGV----VTPS----GQHEGRLLQDLPGCPRQVQRA----------FAPKLVT--EVECNLATI-H-------------------
21 HHSearch 42.8926% -72 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[4-75] --------------LCGMSQD----E---LNECKPAVS--------------K----E-NPTS----------------P----------------S-------QPC----CTALQHA--------DFACLCGYK--NSP---WLGS----F-------G---------V---------D----------PELASAL--PKQCGLANA-P-------------------
2 Fugue 41.7326% -68 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -----------AIDLCGMSQD----E---LNECKPAVS--------------K----E-NPTS----------------P----------------S-------QPC----CTALQHA--------DFACLCGYK--NSP---WLGS----F-------G---------V---------D----------PELASAL--PKQCGLANA----------PTC--------
29 HHSearch 41.4621% -87 - C3 -3OB4 - ? A:[429-485] --------------------------------------------------------------------------------------------------------ERC----CNELNEFE------NNQRCMCEAL--QQI---MENQSDRLQ-------G---------R---------QQEQQF-----KRELRNL--PQQCGLRAP---------------------
3 Fugue 40.1320%-101 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] -------------AGC--NAG----Q---LTVCTGAIAG-------------G----A-R-------------------P----------------T-------AAC----CSSLR-----------AQQGCFCQ--FAK---DPRY----G-------RY--------V---------N----------SPNARKA--VSSCGIALP-T----------CH-------
8 Fugue 34.8516% -55 - C3 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[1-127] GPMRRERGRQGDSSSCERQVDRV--N---LKPCEQHIM--------------Q----R-IMGEQEQYDSYDIRSTRSSDQ----------------Q-------QRC----CDELNEMENTQGCMCEALQQIMEN--QCDRLQDRQM----V-------Q---------Q---------F----------KRELMSL--PQQCNFRAP-QRCDLDVSGGRCS-------
22 HHSearch 33.5523% -82 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[6-66] --------------------G----Q---LTVCTGAIA--------------G----G-AR------------------P----------------T-------AAC----CSSLRA-----------QQGCFCQFAKDPR--YGR-------------Y---------V---------N----------SPNARKA--VSSCGIALP---------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) LSCGEVTSGLAPCLPYLQGRGPIGGCCGGVKGLLGAAKTPEDRKTACTCLKSAANSIKGIDTGKAVGLPGVCGVSIPYKISPSTDCSKVQ
36 96.09100%-138 - C- -M036 - A:[1-93] LSCGEVTSGLAPCLPYLQGRGPIGGCCGGVKGLLGAAKTPEDRKTACTCLKSAANSIKGIDTGKAVGLPGVCGVSIPYKISPSTDCSKVQ
42 93.74100%-128 - C- -M042 - A:[1-124] LSCGEVTSGLAPCLPYLQGRGPIGGCCGGVKGLLGAAKTPEDRKTACTCLKSAANSIKGIDTGKAVGLPGVCGVSIPYKISPSTDCSKVQ
37 93.03100%-121 - C- -M037 - A:[1-146] LSCGEVTSGLAPCLPYLQGRGPIGGCCGGVKGLLGAAKTPEDRKTACTCLKSAANSIKGIDTGKAVGLPGVCGVSIPYKISPSTDCSKVQ
38 90.25100%-130 - C- -M038 - A:[1-146] LSCGEVTSGLAPCLPYLQGRGPIGGCCGGVKGLLGAAKTPEDRKTACTCLKSAANSIKGIDTGKAVGLPGVCGVSIPYKISPSTDCSKVQ