@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : new_query: (2014-05-07 )
ITCGQVASSLTSCIPFITKGGIVPPSCCAGVKSLNAAAKTTPDRQAVCNCLKSEAGRIGGFNANNAAILPGKCGVSIPYKISTSTNCASIKF

Atome Classification :

(20 SA) ------------------------------------------------------...--..-.--..--.10.......----.----20--.--.-------------------.-----..----....30......-..-----------40........50...-..----..-------.-------60--------.----------.----------.-------......--70........80........90.---------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ------------------------------------------------------ITC--GQ-V--AS--SLTSCIPFIT----K----G---G--I-------------------V-----PP----SCCAGVKSLNAA-AK-----------TTPDRQAVCNCLKSE-AG----RI-------G-------G---------F----------N----------A-------NNAAIL--PGKCGVSIPYKISTSTNCASIKF---------------------
22 HHSearch 94.7166%-122 - C3 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-92] ------------------------------------------------------ITC--GQ-V--SS--SLAPCIPYVR----G----G---G--A-------------------V-----PP----ACCNGIRNVNNL-AR-----------TTPDRQAACNCLKQL-SA----SV-------P-------G---------V----------N----------P-------NNAAAL--PGKCGVSIPYKISASTNCATVK----------------------
25 HHSearch 93.4564%-128 - C3 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] ------------------------------------------------------MTC--GQ-V--QG--NLAQCIGFLQ----K----G---G--V-------------------V-----PP----SCCTGVKNILNS-SR-----------TTADRRAVCSCLKAA-AG----AV-------R-------G---------I----------N----------P-------NNAEAL--PGKCGVNIPYKISTSTNCNSIN----------------------
23 HHSearch 90.1653%-115 - C3 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-91] ------------------------------------------------------ITC--GQ-V--TS--NLAPCLAYLR----N----T---G----------------------P-----LG----RCCGGVKALVNS-AR-----------TTEDRQIACTCLKSA-AG----AI-------S-------G---------I----------N----------L-------GKAAGL--PSTCGVNIPYKISPSTDCSKVQ----------------------
26 HHSearch 89.2141%-134 - C3 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] ------------------------------------------------------IDC--GH-V--DS--LVRPCLSYVQ----G----G---P--G-------------------P-----SG----QCCDGVKNLHNQ-AR-----------SQSDRQSACNCLKGI-AR----GI-------H-------N---------L----------N----------E-------DNARSI--PPKCGVNLPYTISLNIDCSRV-----------------------
11 SP3 88.0355%-115 - C3 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -----------------------------------------------------AISC--GQ-V--AS--AIAPCISYAR----G----Q---G--SG------------------P-----SA----GCCSGVRSLNNA-AR-----------TTADRRAACNCLKNA-AA----GV-------S-------G---------L----------N----------A-------GNAASI--PSKCGVSIPYTISTSTDCSRVN----------------------
24 HHSearch 84.1556%-116 - C3 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[2-93] ------------------------------------------------------ISC--GQ-V--AS--AIAPCISYAR----G----Q---G--SG------------------P-----SA----GCCSGVRSLNNA-AR-----------TTADRRAACNCLKNA-AA----GV-------S-------G---------L----------N----------A-------GNAASI--PSKCGVSIPYTISTSTDCSRVN----------------------
20 SP3 56.9921%-128 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] -------------------------------------------------------MCYPGQ-AFQVP--ALPACRPLLR----LQCN-G---S--Q-------------------V-----PEAVLRDCCQQLAHI--------------------SEWCRCGALYSM-LD----SMYKEHGAFP-------R---------C----------RREVV------K-------LTAASI--TAVCRLPIV--VDASGDGAYVCKDVAAYPDA-------------
36 HHSearch 53.9427%-120 - C3 -1SM7 - ? A:[13-101] ------------------------------------------------------------------Q--HLRACQQWIR----QQLA-G---S--PFSENQWGPQQGPS------L-----RE----QCCNELYQE--------------------DQVCVCPTLKQA-AK----SV-------RVQ-----GQ--------H----------G----------PFQSTRIYQIAKNL--PNVCNMKQI-----------------------------------
27 HHSearch 53.8426%-108 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[4-75] -------------------------------------------------------LC--GM-S--QD--ELNECKPAVS----K----E---NPTS-------------------P-----SQ----PCCTALQHA--------------------DFACLCGYKNSPWLG----S--------F-------G---------V----------D----------P-------ELASAL--PKQCGLANAP----------------------------------
13 SP3 50.7318%-115 - C3 -1QPO - NADC_MYCTU A:[116-284] IATATAAWVDAVRGTKAKIRDTRKTLPGLRALQKYAVRTGGGVNHRLGLGDAALIKD--NH-V--AAAGSVVDALRAVR----N----A---A--P-------------------D-----LPCEV-EVDS-LEQLDAV-LPEKPELILLDNFAVWQTQTAVQRRDSR-AP----TVMLESS--G-------G---------L----------S----------L-------QTAATY---AETGVDY---LAVGALTHSVRVLDIGLDM--------------
38 HHSearch 49.8023%-128 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[15-106] ------------------------------------------------------------------P--ALPACRPLLR----LQCN-G---S--QVPEA---------------V-----LR----DCCQQLAHI--------------------SEWCRCGALYSM-LD----SM-------YKEH---------------GAFPRCRREVV----------K-------LTAASI--TAVCRLPIVVD---------------------------------
33 HHSearch 49.7421%-123 - C3 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[15-109] ------------------------------------------------------------------N--PLPSCRWYVTSRTCG----I---G--PR------------------LPWPELKR----RCCRELADI--------------------PAYCRCTALSIL-MD----GA-------IPPGPDAQLEGR------L----------EDLPGCPREVQR-------GFAATLVTEAECNLATI-----------------------------------
2 Fugue 49.2726% -91 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] ----------------------------------------------------AIDLC--GM-S--QD--ELNECKPAVS----K----E---N--P-------------------T-----SPSQ--PCCTALQHA--------------------DFACLCGYKNSP-WL----GS-------F-------G---------V----------D----------P-------ELASAL--PKQCGLANA------PTC--------------------------
31 HHSearch 47.1114%-130 - C3 -1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] ------------------------------------------------------------------N--PLDSCRWYVS----TRTCGV---G--PRLATQE-------------M-----KA----RCCRQLEAI--------------------PAYCRCEAVRIL-MD----GV-------VTPS----GQHEGRLLQDL----------PGCPRQVQRA-F-------APKLVT--EVECNLATIH----------------------------------
10 Fugue 45.9223%-100 - C2 -2OVS ? A:[1-118] ----------------------------------------------------GLVPR--GSMIM-KD--GIYS-IIFIS----N----E---D----------------------------------SCGEGILIKNGNMI------------TGGDIASVYQGVLSE-DEDIILHV-------H-------R---------Y----------N----------Y-------EIPSVLNIEQDYQLVIPKKVLSNDNNLTLHCHVRGNEKLFVDVYAKFIEPLV
3 Fugue 44.7323% -90 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] ------------------------------------------------------AGC-----N--AG--QLTVCTGAIA----G----G---A--R-------------------P-----TA----ACCSSLRAQQGC-FC-----------QFAKDPRYGRYVNS-----------------------------------------------------------------PNARKA--VSSCGIALP-------TCH-------------------------
14 SP3 43.8522% -82 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] ------------------------------------------------------AGC-----N--AG--QLTVCTGAIA----G----G---A--R-------------------P-----TA----ACCSSLRA-----------------------QQGCFCQFAK-DP----RY-------G-------RY--------V----------N----------S-------PNARKA--VSSCGIALP-------TCH-------------------------
29 HHSearch 42.4525% -83 - C3 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[4-65] -----------------------------------------------------------------AS--QLAVCASAIL----S----G---A--K-------------------P-----SG----ECCGNLRA-----------------------QQGCFCQYAK-DP----TYG------Q-------Y---------I----------R----------S-------PHARDT--LTSCGLAVP-----------------------------------
32 HHSearch 41.6924% -75 - C3 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-122] ------------------------------------------------------------------K--DLSSCERYLR----Q----SSSRR--STGEEVLRMPGDENQQQESQQ-----LQ----QCCNQVKQV--------------------RDECQCEAIKYI-AE----DQ-------IQQG----Q---------LHGEESER---V----------A-------QRAGEI--VSSCGV--RCMRQT------------------------------
35 HHSearch 41.4320% -70 - C3 -3OB4 - ? A:[427-485] -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------H-----QE----RCCNELNEFEN------------------NQRCMCEALQQI-ME----NQSDRL---Q-------G---------R----------QQEQQF-----K-------RELRNL--PQQCGLRAP-----------------------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90.
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ITCGQVASSLTSCIPFITKGGIVPPSCCAGVKSLNAAAKTTPDRQAVCNCLKSEAGRIGGFNANNAAILPGKCGVSIPYKISTSTNCASIKF
45 98.25100%-128 - C- -M045 - A:[1-94] ITCGQVASSLTSCIPFITKGGIVPPSCCAGVKSLNAAAKTTPDRQAVCNCLKSEAGRIGGFNANNAAILPGKCGVSIPYKISTSTNCASIKF
40 96.38100%-130 - C- -M040 - A:[1-92] ITCGQVASSLTSCIPFITKGGIVPPSCCAGVKSLNAAAKTTPDRQAVCNCLKSEAGRIGGFNANNAAILPGKCGVSIPYKISTSTNCASIKF
39 94.72100%-126 - C- -M039 - A:[1-92] ITCGQVASSLTSCIPFITKGGIVPPSCCAGVKSLNAAAKTTPDRQAVCNCLKSEAGRIGGFNANNAAILPGKCGVSIPYKISTSTNCASIKF
43 92.75100%-120 - C- -M043 - A:[1-94] ITCGQVASSLTSCIPFITKGGIVPPSCCAGVKSLNAAAKTTPDRQAVCNCLKSEAGRIGGFNANNAAILPGKCGVSIPYKISTSTNCASIKF