@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 494_tIV_RICCO: (2014-05-09 )
LTLCDMNDDGLLACKPSVTKPDPVEPPSPACCQALTGANLTCLCSYRNSLMLPSLGIDPDLALGLPSKCNLTPPADC

Atome Classification :

(20 SA) --------------------....----.....10........----20----.----.---.--------..---------.---.----.-------.30......-.--------.------------40---------.---...---------------.---------....50--------.------.----.--------------.------.-.---------.--.-----.60...----.------....70...------..---.-----------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --------------------LTLC----DMNDDGLLACKPSVT----K-----P----D---P--------VE---------P---P----S-------PACCQALTG-A--------N------------L----------T---CLC---------------S---------YRNSL---------M------L----P--------------S------L-G---------I--D-----PDLALG----L------PSKCNLTPP------AD---C-----------------
1 Fugue 92.3947%-122 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -------------------AIDLC----GMSQDELNECKPAVS----K-----E----N---P---------T---------S---P----S-------QPCCTALQH-A--------D------------F----------A---CLC---------------G---------YKNSP---------W------L----G--------------S------F-G---------V--D-----PELASA----L------PKQCGLANA------PT---C-----------------
11 HHSearch 90.6148%-122 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-77] ---------------------DLC----GMSQDELNECKPAVS----K-----E----N---P---------T---------S---P----S-------QPCCTALQH-A--------D------------F----------A---CLC---------------G---------YKNSP---------W------L----G--------------S------F-G---------V--D-----PELASA----L------PKQCGLANA------PT---C-----------------
30 HHSearch 71.1228%-103 - C3 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[12-109] -----------------------------IPHNPLPSCRWYVT----S-----RTCGIG---P--------R----------L---PWPELK-------RRCCRELAD-I--------P------------A----------Y---CRC---------------T---------ALSILMDGAIP---P------G----P--------------DAQLEGRL-EDLPGCPRE-V--Q-----RGFAAT----LVT----EAECNLATI-----------------------------
32 SP3 67.6823% -78 - C3 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -------------------AIS-C----GQVASAIAPCISYAR----G-----Q----G---S--------G--------------P----S-------AGCCSGVRS-L--------NNAARTTADRRAAC----------N---CLK---------------N---------AAAG-------------------------------------V------S-G---------L--N-----AGNAAS----I------PSKCGVSIPYTISTSTD---CSRVN-------------
27 HHSearch 66.0624% -87 - C3 -1B1U - IAAT_ELECO A:[12-109] -----------------------------IPHNPLDSCRWYVS----T-----RTCGVG---P--------RL---------ATQEM----K-------ARCCRQLEA-I--------P------------A----------Y---CRC---------------E---------AVRIL---------M------D----GVVTPSGQHEGRLLQD------LPGCP-------R--QVQRA-FAPKLV----T------EVECNLATI------H----------------------
23 HHSearch 64.5325%-114 - C3 -1SM7 - ? A:[14-104] ---------------------------------HLRACQQWIR----Q-----Q----LAGSPF-------SENQWGPQQGPS---L----R-------EQCCNELYQ-E--------D------------Q----------V---CVC---------------P---------TLKQA---------A------K----SVRVQG---------Q------H-GPFQST----R--I-----YQIAKN----L------PNVCNMKQI------GT---C-----------------
19 HHSearch 63.9832% -92 - C3 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[3-79] ----------------------TC----GQVSSSLAPCIPYVR----G-----G----G-----------------------A---V----P-------PACCNGIRN-V--------NNLARTTPDRQ--A----------A---CNC-------------------------LKQL-----------------S----A--------------S------VPG---------V--N-----PNNAAA----L------PGKCGVSIP-----------------------------
18 HHSearch 63.0126% -91 - C3 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[3-78] ----------------------TC----GQVTSNLAPCLAYLR----N-----T----G---------------------------P----L-------GRCCGGVKA-L--------V------------NSARTTEDRQIA---CTC-------------------------LKSA-----------------A----G--------------A------ISG---------I--N-----LGKAAG----L------PSTCGVNIP-----------------------------
24 HHSearch 62.7729%-135 - C3 -3OB4 - ? A:[429-488] ---------------------------------------------------------------------------------------------------ERCCNELNE-FEN------N------------Q----------R---CMC---------------E---------ALQQI---------M------ENQSDR--------------L------Q-G---------R--QQEQQFKRELRN----L------PQQCGLRAP------QR---C-----------------
34 SP3 62.5923%-116 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] ----------------------MCYPGQAFQVPALPACRPLLRLQCNG-----S----Q---V--------PE---------A---V----L-------RDCCQQLAH-I--------S------------E----------W---CRC---------------GALYSMLDSMYKEHG---------A------F----P-----------------------R---------C--RREVV-KLTAAS----I------TAVCRLPIV------VD---ASGDGAYVCKDVAAYPDA
6 Fugue 60.4425% -80 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] PYGRGRTESGCYQQMEEAEMLNHC----GMYLMKNLGERSQVS----P-----R----M---R--------EE---------D---H----K-------QLCCMQLKN-L--------D------------E----------K---CMC---------------P---------AIMMM---------L------N----E--------------P------M-W---------I--RMRDQVMSMAHN----L------PIECNLMSQ-------P---CQM---------------
39 SP3 59.9325%-104 - C3 -1BEA - ? ?:[5-120] ----------------------SCVPGWAIPHNPLPSCRWYVTSRTCG-----I----G---P--------RL---------P---W----PELK----RRCCRELAD-I--------P------------A----------Y---CRCTALSILMDGAIPPGPD---------AQLEG---------R------L----E--------------D------LPG---------C--P-----REVQRG----FAATLVTEAECNLATI------SGVAECPWILG------------
26 HHSearch 58.2323% -80 * C3 *1HSS - IAA1_WHEAT A:[13-106] ------------------------------QVPALPACRPLLR----L-----Q----CNG-S--------QVPE-------A---V----L-------RDCCQQLAH-I--------S------------E----------W---CRC---------------G---------ALYSM---------LDSMYKEH-----------------------------GAFPRCRREV--V-----KLTAAS----I------TAVCRLPIV------VD---------------------
17 HHSearch 58.1727% -80 - C3 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[2-78] ----------------------TC----GQVQGNLAQCIGFLQ----K-----G----G-----------------------V---V----P-------PSCCTGVKN-ILNSSRTTAD------------R----------RAV-CSC---------------L----------KAA-----------------A----G--------------A------VRG---------I--N-----PNNAEA----L------PGKCGVNIP-----------------------------
36 SP3 57.2125% -88 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] PYGRGRTESGCYQQMEEAEMLNHC----GMYLMKNLGERSQVS----P-----R----M---R--------EE---------D---H----K-------QLCCMQLKN-L--------D------------E----------K---CMCP--------------A---------IMMML---------N------E----P--------------M------W-I---------R--M-----RDQVMSMAHNL------PIECNL-MS------QP---CQM---------------
12 HHSearch 53.6425% -88 - C3 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[4-67] -------------------------------ASQLAVCASAIL----S-----G----A-----------------------K---P----S-------GECCGNLRA-Q--------Q-----------------------G---CFC---------------Q---------YAKDP---------T------Y----G--------------Q--------Y---------I--R-----SPHARD----T------LTSCGLAVP-------H---C-----------------
37 SP3 52.8920%-153 - C3 -1HYP - ? ?:[6-80] ---------------------PSC----P----DLSICLNILG----G-----S----L---G-----------------------T----V-------DDCCALIGGLG--------D------------I----------EAIVCLC---------------I-----------------------Q------L----R--------------A------L-G---------IL-NL----NRNLQL----I------LNSCGRSYP------SNAT-CPRT--------------
21 HHSearch 52.7624% -87 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[19-101] --------------------------------EMLNHCGMYLM----K-----N----L---GERSQ----VSPRMREE---D---H----K-------QLCCMQLKN-L--------D------------E----------K---CMC---------------P---------AIMMM---------L------N----E--------------P------MWIRMRD-----Q--V-----MSMAHN----L------PIECNLM-S------QP---C-----------------
28 HHSearch 51.0820%-103 - C3 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[23-112] --------------------------------VNLKPCEQHIM----Q-----R----I---MGEQEQYDSYD---------I---R----STRSSDQQQRCCDELNE-MEN------T------------Q----------G---CMC---------------E---------ALQQIMENQCD---R------L----Q--------------D------R-Q---------MVQQF----KRELMS----L------PQQCNFR-------------------------------
25 HHSearch 51.0426% -95 - C3 -2LVF - ? A:[16-105] --------------------------------QMLSHCRMYMR----QQMEEST----Y---Q--------TMPRRGME---P---H----M-------SECCEQLEG-M--------D------------E----------S---CRC---------------E---------GLRMMMRMMQQKEMQ------P----R--------------GEQ----M-R---------R--M-----MRLAEN----I------PSRCNLS-P------MR---C-----------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(3 SA) .........10........20........30........40........50........60........70......
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) LTLCDMNDDGLLACKPSVTKPDPVEPPSPACCQALTGANLTCLCSYRNSLMLPSLGIDPDLALGLPSKCNLTPPADC
44 94.89100%-129 - C- -M044 - A:[1-136] LTLCDMNDDGLLACKPSVTKPDPVEPPSPACCQALTGANLTCLCSYRNSLMLPSLGIDPDLALGLPSKCNLTPPADC
42 94.50100%-136 - C- -M042 - A:[1-97] LTLCDMNDDGLLACKPSVTKPDPVEPPSPACCQALTGANLTCLCSYRNSLMLPSLGIDPDLALGLPSKCNLTPPADC
47 91.24100%-144 - C- -M047 - A:[1-119] LTLCDMNDDGLLACKPSVTKPDPVEPPSPACCQALTGANLTCLCSYRNSLMLPSLGIDPDLALGLPSKCNLTPPADC