@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 505_tIV_MAIZE: (2014-05-09 )
AVCDMSNEQFMSCQPAAAKTTDPPAAPSQACCDALAGADLKCLCGYKNSPWMGVYNIDPKRAMELPAKCGLATPPDC

Atome Classification :

(20 SA) --------..-.----......---10........20---.--..-------..----.----.---------.30......-.--------.----------40---------.---....---------....-----50------.----..--------------.-.----..---------.60....--....70...------.--..-----------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --------AV-C----DMSNEQ---FMSCQPAAAKTT---D--PP-------AA----P----S---------QACCDALAG-A--------D----------L----------K---CLCG---------YKNS-----PW------M----GV--------------Y-N----ID---------PKRAMEL--PAKCGLATP------P--DC-----------------
11 HHSearch 94.9351%-101 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-77] --------DL-C----GMSQDE---LNECKPAVSKEN---P-----------TS----P----S---------QPCCTALQH-A--------D----------F----------A---CLCG---------YKNS-----PW------L----GS--------------F-G----VD---------PELASAL--PKQCGLANA------P--TC-----------------
1 Fugue 91.8550% -99 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] ------AIDL-C----GMSQDE---LNECKPAVSKEN---P--TS-------------P----S---------QPCCTALQH-A--------D----------F----------A---CLCG---------YKNS-----PW------L----GS--------------F-G----VD---------PELASAL--PKQCGLANA------P--TC-----------------
35 SP3 71.0023%-103 - C2 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] ---------M-CYPGQAFQVPA---LPACRPLLRLQC---N--GS-------QV----P----EAVL------RDCCQQLAH-I--------S----------E----------W---CRCGALYSMLDSMYKEH-----GA------F----P-----------------R----CRREVV-----KLTAASI--TAVCRLPIV------V--DASGDGAYVCKDVAAYPDA
28 HHSearch 69.4828% -68 - C2 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[13-109] ------------------PHNP---LPSCRWYVTSRTCG-I--GP-------RL----PWPELK---------RRCCRELAD-I--------P----------A----------Y---CRCT---------ALSI-----LMDGAIPPG----PDA-------------Q-LEGRLEDLPGCPREVQRGFAATLVTEAECNLATI----------------------------
13 HHSearch 65.9431%-100 - C2 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[2-68] ---------G-C----NAG--Q---LTVCTGAIAGG----------------AR----P----T---------AACCSSLRA-Q-------------------Q----------G---CFCQ---------FAKD-----PR------Y----GR----------------Y----VN---------SPNARKA--VSSCGIALP---------TC-----------------
12 HHSearch 64.5535% -83 - C2 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[5-67] --------------------SQ---LAVCASAILSG----------------AK----P----S---------GECCGNLRA-Q--------Q---------------------G---CFCQ---------YAKD-----PT------Y----GQ----------------Y----IR---------SPHARDT--LTSCGLAVP---------HC-----------------
5 Fugue 63.8526% -80 - C2 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] PYGRGRTESG-C----YQQMEEAEMLNHCGMYLMKNL---G--ER-------SQ----V----SPRMREEDHKQLCCMQLKN-L--------D----------E----------K---CMCP---------AIMMMLNEPMW------I----RM--------------R-D----QV---------MSMAHNL--PIECNL-MS------Q--PCQM---------------
26 HHSearch 62.6826% -66 - C2 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[14-106] -------------------VPA---LPACRPLLRLQCNGSQ--VP-------EA----V----L---------RDCCQQLAH-I--------S----------E----------W---CRCG---------ALYS-----MLDSMYKEH---------------------------GAFPRCRREVVKLTAASI--TAVCRLPIV------V--D------------------
32 SP3 62.2825% -74 * C2 *1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] --------AISC----GQVASA---IAPCISYARGQG---------------SG----P----S---------AGCCSGVRS-LNNAARTTAD----------R----------R---AACN---------CLKN-----AA------A----GV--------------S-G----LN---------AGNAASI--PSKCGVSIPYTISTST--DCSRVN-------------
19 HHSearch 60.8927% -80 - C2 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[3-80] ---------T-C----GQVSSS---LAPCIPYVRGG----------------GA----V----P---------PACCNGIRN-V--------NNLARTTPDRQA----------A---CNC----------LKQL-------------S----AS--------------VPG----VN---------PNNAAAL--PGKCGVSIP------Y---------------------
33 SP3 60.8027% -85 - C2 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] --------AG-C----NAGQ-----LTVCTGAIAGGA----------------R----P----T---------AACCSSLRA-Q--------Q---------------------G---CFCQ---------FAKD-----PR------Y----GR--------------Y------VN---------SPNARKA--VSSCGIAL-------P--TCH----------------
18 HHSearch 60.3026% -67 - C2 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[3-79] ---------T-C----GQVTSN---LAPCLAYLRNTG---------------------P----L---------GRCCGGVKA-L--------V----------NSARTTEDRQIA---CTC----------LKSA-------------A----GA--------------ISG----IN---------LGKAAGL--PSTCGVNIP------Y---------------------
17 HHSearch 60.2828% -67 - C2 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[2-79] ---------T-C----GQVQGN---LAQCIGFLQKG----------------GV----V----P---------PSCCTGVKN-ILNSSRTTAD----------R----------RAV-CSCL----------KAA-------------A----GA--------------VRG----IN---------PNNAEAL--PGKCGVNIP------Y---------------------
2 Fugue 60.2831% -90 - C2 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] --------AG-C----N--AGQ---LTVCTGAI-------A--GG-------AR----P----T---------AACCSSLR--A--------Q----------Q----------G---CFCQ---------FAKD-----PR------Y----GR--------------Y------VN---------SPNARKA--VSSCGIALP------T--CH-----------------
29 HHSearch 59.9421% -54 - C2 -1B1U - IAAT_ELECO A:[13-109] ------------------PHNP---LDSCRWYVSTRTCG-V--GP-------RLATQEM----K---------ARCCRQLEA-I--------P----------A----------Y---CRCE---------AVRI-----LM------D----GVVTPSGQHEGRLLQDLPGCP--RQVQRA-----FAPKLVT--EVECNLATI------H---------------------
14 HHSearch 58.1525% -59 - C2 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[3-81] ---------S-C----GQVASA---IAPCISYARGQG---S------------G----P----S---------AGCCSGVRS-L--------N----------NAARTTADRRAA---CNC----------LKNA-------------A----AG--------------VSG----LN---------AGNAASI--PSKCGVSIP------Y---------------------
23 HHSearch 56.5024% -94 - C2 -3OB4 - ? A:[429-488] -------------------------------------------------------------------------ERCCNELNE-FEN------N----------Q----------R---CMCE---------ALQQ-----IM------ENQSDRL--------------Q-G----RQQEQQF----KRELRNL--PQQCGLRAP------Q--RC-----------------
34 SP3 55.7916%-108 - C2 -1HYP - ? ?:[6-80] --------PS-C----P----D---LSICLNILGGS----------------LG----T----V---------DDCCALIGGLG--------D----------I----------EAIVCLCIQ--------LRAL-----GI------L----NL--------------------------------NRNLQLI--LNSCGRSYP------SNATCPRT--------------
22 HHSearch 54.6024% -82 - C2 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[20-101] ---------------------M---LNHCGMYLMKNL---GERSQVSPRMREED----H----K---------QLCCMQLKN-L--------D----------E----------K---CMCP---------AIMM-----ML------N----EP--------------MWIRMRDQV---------MSMAHNL--PIECNLMS-------Q--PC-----------------
16 HHSearch 53.2324% -58 - C2 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[2-79] ---------D-C----GHVDSL---VRPCLSYVQGG----------------PG----P----S---------GQCCDGVKN-L--------H----------NQARSQSDRQSA---CNCL---------KGIA-----RG------I--------------------H-N----LN---------EDNARSI--PPKCGVNLP------Y---------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(3 SA) .........10........20........30........40........50........60........70......
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) AVCDMSNEQFMSCQPAAAKTTDPPAAPSQACCDALAGADLKCLCGYKNSPWMGVYNIDPKRAMELPAKCGLATPPDC
49 99.03100%-118 - C- -M049 - A:[1-139] AVCDMSNEQFMSCQPAAAKTTDPPAAPSQACCDALAGADLKCLCGYKNSPWMGVYNIDPKRAMELPAKCGLATPPDC
42 94.78100%-104 - C- -M042 - A:[1-123] AVCDMSNEQFMSCQPAAAKTTDPPAAPSQACCDALAGADLKCLCGYKNSPWMGVYNIDPKRAMELPAKCGLATPPDC
48 92.54100%-109 - C- -M048 - A:[1-139] AVCDMSNEQFMSCQPAAAKTTDPPAAPSQACCDALAGADLKCLCGYKNSPWMGVYNIDPKRAMELPAKCGLATPPDC