@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 554_tIII_BRANA: (2014-05-10 )
QQCLDNLSNMQVCAPLVLPGAVNPAPNSNCCIALQATNKDCICNALRAATTFTTTCNLPSLDCGITI

Atome Classification :

(20 SA) --.......--..10.......------.---20----.----.----.-.-------..-----------.-------..30......--.--------.----------40....----------.-----.--------------------------------.-----------------------.----------------------50..--.------..-----....-60.-.-.....--------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --QQCLDNL--SNMQVCAPLVL------P---G-----A----V----N-P-------AP-----------N-------SNCCIALQAT--N--------K----------DCICNA----------L-----R--------------------------------A-----------------------A----------------------T-TF--T------TT-----CNLP-S-L-D-CGITI--------------
16 HHSearch 83.5131%-142 - C3 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[14-104] --------V--PALPACRPLLR------LQCNG-----S----Q----VPE-------AV-----------L-------RDCCQQLAHI--S--------E----------WCRCGA----------L-----YSMLDSMYKEHGAFPRCRREVVKL---------T-----------------------A----------------------A-SI--T------AV-----CRLP-I-V----------------------
11 HHSearch 77.3920%-165 - C3 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[14-119] --SSCERQVDRVNLKPCEQHIMQRIM--G---E-----QEQYDS----Y-D-------IR-----------STRSSDQQQRCCDELNEMENT--------Q----------GCMCEA----------L-----QQIMENQCDRLQDRQMVQQFKR-----------E-----------------------L----------------------M-SL--P------QQ-----CNFR-A-P-QRCDL----------------
15 HHSearch 76.7831%-173 - C3 -2DS2 - ? B:[8-70] -------------------------------------------------------------------------------RQCCNQLRQV--D--------R----------PCVCPV----------L-----R--------------------------------QAAQQVLQRQIIQGPQQLRRLFDAA----------------------R-NL--P------NI-----CNIP-NIG-A-CPFR---------------
5 HHSearch 75.8936%-134 - C3 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[4-67] --------A--SQLAVCASAIL------S---G-----A-------------------KP-----------S-------GECCGNLRAQ--Q-------------------GCFCQY----------A-----KDPTYGQYIRSP---------------------H-----------------------A----------------------R-DT--L------TS-----CGLA-V-P-H-C------------------
19 HHSearch 75.2730%-174 - C3 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[14-109] --------H--NPLPSCRWYVTSRTCG-I---G-----P-----------R-------LPWPEL-------K-------RRCCRELADI--P--------A----------YCRCTA----------L-----SILMDGAIPPGPDAQLEGRLEDLPGCPREVQRGF-----------------------A----------------------A-TLVTE------AE-----CNLA-T-I----------------------
31 SP3 73.0623%-105 * C3 *1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -AISCGQVA--SAIAPCISYAR----------------G----Q----G-S-------GP-----------S-------AGCCSGVRSL--NNAARTTADR----------RAACNC----------L-----K--------------------------------N-----------------------A----------------------AAGV--S------GLNAGNAASIP-S---K-CGVSIPYTISTSTDCSRVN
2 HHSearch 72.9726%-113 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[2-69] ---GCNAG----QLTVCTGAIA------G---G-----A-------------------RP-----------T-------AACCSSLRAQ-----------Q----------GCFCQF----------A-----KDPR-----------------------------YGRYVNSPN---------------A----------------------R-KA--V------SS-----CGIA-L-P-T-CH-----------------
1 HHSearch 70.3126%-114 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-72] --DLCGMSQ--DELNECKPAVS------K---E-----N----P------T-------SP-----------S-------QPCCTALQHA--D--------F----------ACLCGY----------KNSPWLGS-------------------------------FGVDPEL-----------------A----------------------S-AL--P------KQ-----CGLA--------------------------
18 HHSearch 69.2022%-164 - C3 -1SM7 - ? A:[13-106] -----------QHLRACQQWIRQQLAGSP---F-----S----E----N-QWGPQQGPSL-----------R-------EQCCNELYQE--D--------Q----------VCVCPT----------L-----K--------------------------------Q-----------------------AAKSVRVQGQHGPFQSTRIYQIAK-NL--P------NV-----CNMK-QIG-T-CPF----------------
23 Fugue 64.8725% -89 - C3 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] --AGC--NA--GQLTVCTGAIA------G---G-----------------A-------RP-----------T-------AACCSSLRA---Q--------Q----------GCFCQF----------A-----KDPRYGRYVNSP---------------------N-----------------------A----------------------R-KA--V------SS-----CGIA-L-P-T-CH-----------------
10 HHSearch 64.6026%-140 - C3 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[19-102] -----------EMLNHCGMYLM------K---NLGERSQ----V----S-PRMREE--DH-----------K-------QLCCMQLKNL--D--------E----------KCMCPA----------I-----MMMLNEPMWIRMRDQVMS---------------M-----------------------A----------------------H-NL--P------IE-----CNLM-S-Q-P-CQ-----------------
14 HHSearch 62.9224%-127 - C3 -2LVF - ? A:[16-108] -----------QMLSHCRMYMRQQME--E---S-----T----Y----Q-TMPRRGMEPH-----------M-------SECCEQLEGM--D--------E----------SCRCEG----------L-----R--------------------------------MMMRMMQQKEMQPRGEQMRRMMRLA----------------------E-NI--P------SR-----CNLS-P-M-R-CPMG---------------
12 HHSearch 61.1926%-134 - C3 -1PNB - ? B:[11-72] -----------------------------------------------------------------------R-------EQCCNELYQE--D--------Q----------VCVCPT----------L-----K--------------------------------QAAKSVRVQGQHGPFQSTRIYQI-A----------------------K-NL--P------NV-----CNMK-Q-IGT-CPF----------------
6 HHSearch 60.4724%-118 - C3 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[3-76] ---TCGQVT--SNLAPCLAYLR------N---T-----G--------------------P-----------L-------GRCCGGVKAL--V--------NSARTTEDRQIACTCLKSAAGA-----ISGINLG--------------------------------K-----------------------A----------------------A-GL--P------ST-----CGVN--------------------------
9 HHSearch 59.5525%-113 - C3 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[3-77] ---TCGQVS--SSLAPCIPYVR------G---G-----------------G-------AV-----------P-------PACCNGIRNV--N--------NLARTTPDRQAACNCLKQLSASVPGVNP-----N--------------------------------N-----------------------A----------------------A-AL--P------GK-----CGVS--------------------------
4 HHSearch 59.4524%-116 - C3 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[2-76] ---DCGHVD--SLVRPCLSYVQ------G---G-----------------P-------GP-----------S-------GQCCDGVKNL--H--------NQARSQSDRQSACNCLK----------G-----IARGIHNLNED----------------------N-----------------------A----------------------R-SI--P------PK-----CGVN--------------------------
22 Fugue 59.1224% -97 - C3 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] AIDLCGMSQ--DELNECKPAV-------S---K-----E----N----P-T-------SP-----------S-------QPCCTALQHA--D--------F----------ACLCGY----------K-----N--------------------------------S-----------------------P----------------------W-LG--SFGVDPELA-----SALP-K-Q---CGLANAPTC----------
17 HHSearch 57.7629%-133 - C3 -3OB4 - ? A:[429-490] -------------------------------------------------------------------------------ERCCNELNEFENN--------Q----------RCMCEA----------L-----Q--------------------------------QIMENQSDRLQGRQQEQQFKRE--L----------------------R-NL--P------QQ-----CGLRAP-Q-R-CDL----------------
8 HHSearch 57.5118%-102 - C3 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[2-76] ---TCGQVQ--GNLAQCIGFLQ------K---G-----------------G-------VV-----------P-------PSCCTGVKNI--L--------NSSRTTADRRAVCSCLKAAAGAVRGINP-----N--------------------------------N-----------------------A----------------------E-AL--P------GK-----CGVN--------------------------
13 HHSearch 56.0421%-103 - C3 -1PSY - 2SS_RICCO A:[16-120] --QQCRQEVQRKDLSSCERYLRQSSS--R---R-----S----TGEEVL-R-------MPGDENQQQESQQL-------QQCCNQVKQV--R--------D----------ECQCEA----------I-----K--------------------------------YIAEDQIQQGQLHGEESERVAQR-A----------------------G-EI--V------SS-----CGV------R-CMR----------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60......
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) QQCLDNLSNMQVCAPLVLPGAVNPAPNSNCCIALQATNKDCICNALRAATTFTTTCNLPSLDCGITI
40 98.21100%-163 - C- -M040 - A:[1-154] QQCLDNLSNMQVCAPLVLPGAVNPAPNSNCCIALQATNKDCICNALRAATTFTTTCNLPSLDCGITI
39 94.05100%-166 - C- -M039 - A:[1-154] QQCLDNLSNMQVCAPLVLPGAVNPAPNSNCCIALQATNKDCICNALRAATTFTTTCNLPSLDCGITI
42 93.77100%-159 - C- -M042 - A:[1-161] QQCLDNLSNMQVCAPLVLPGAVNPAPNSNCCIALQATNKDCICNALRAATTFTTTCNLPSLDCGITI
41 87.99100%-156 - C- -M041 - A:[1-154] QQCLDNLSNMQVCAPLVLPGAVNPAPNSNCCIALQATNKDCICNALRAATTFTTTCNLPSLDCGITI