@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 676_tV_BRADI: (2014-05-13 )
AGECGRVPVDRTALKLAPCAAATQNPRAAVPPSCCAQVRGIGRNPKCLCAVMLSNTARQAGVKPAVAMTIPKRCAIANRPIGYKCGPYTLP

Atome Classification :

(20 SA) ---------------------------------------------------------------.....---....10----....--.....20-----.....------.-----------------.---------------------.---30-........40.---.--------.--------.---....50...---..---.------------.--.---------60-----------.--------.-.-..-----....70-......--------...-80--.--.......----90--------------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ---------------------------------------------------------------AGECG---RVPVD-----RTAL--KLAPCAA-----ATQNP------R-----------------A---------------------A---VP-PSCCAQVRGIG---R--------N--------P---KCLCAVMLS---NT---A------------R--Q---------A------------G--------V-K-PA-----VAMTI--PKRCAI--------ANR-PI--G--YKCGPYT----LP--------------------------
31 SP3 82.6720%-116 * C5 *1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -----------------------------------------------------------------------AISCG-----QVAS--AIAPCIS-----YARGQ------G-----------------S---------------------G---PS-AGCCSGVRSLNNAAR--------T--------TADRRAACNCLKN---AA---A------------G--V---------S------------G--------L-N-AG-----NAASI--PSKCGV--------S----I--P--YTISTSTDCSRVN--------------------------
13 HHSearch 78.8129% -99 - C5 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[2-88] -------------------------------------------------------------------------TCG-----QVQG--NLAQCIG-----FLQKG------------------------G---------------------V---VP-PSCCTGVKNIL---NSSRTTADRR--------A---VCSC--LK----AA---A------------G--A---------VR-----------G--------I-N-PN-----NAEAL--PGKCGV--------NIPYKISTS--TNCN-----------------------------------
16 HHSearch 77.6025%-102 - C5 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[3-89] -------------------------------------------------------------------------TCG-----QVTS--NLAPCLA-----YLRNT------G-------------------------------------------PL-GRCCGGVKALV---N--------SARTTEDRQI---ACTC--LKS----A---A------------G--A---------IS-----------G--------I-N-LG-----KAAGL--PSTCGV--------NIPYKISPS--TDCSK----------------------------------
1 Fugue 74.3130% -68 - C5 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] --------------------------------------------------------------AIDLCG---M----------SQD--ELNECKP-----AVSKE------N-----------------P---------------------T---SPSQPCCTALQHA-------------D--------F---ACLCGYKNS---PW---L------------G--S---------F------------G--------V-D-PE-----LASAL--PKQCGL--------ANA-P-------TC------------------------------------
3 Fugue 73.9322%-106 - C5 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] -----------------------------------------------------------------MCYPGQAFQVPALPACRPLL--RLQCNGS-------QVP------------------------E---------------------A---VL-RDCCQQLAHIS---E--------W--------C---RCGALYSML---DS----MYKEHGAFPRCRR--E---------V------------V--------K-L-TA-----ASITA----VCRLPIVVDASGDGA-YV--C--KDVAAYP----DA--------------------------
26 HHSearch 73.3923%-121 - C5 -1B1U - IAAT_ELECO A:[16-114] ---------------------------------------------------------------------------------------PLDSCRW-----YVSTRTCGVGPR-----------------LATQ------------------E---MK-ARCCRQLEAI-------------P--------A---YCRCEAVRILMDGV---V------------T--P---------SGQHEGRLLQDLPGCPRQ----VQRAFA-----PKLVT--EVECNL--------ATI-HG--G--PFC------------------------------------
10 HHSearch 67.5326% -75 - C5 -2RKN DIRL1_ARATH A:[2-75] -----------------------------------------------------------------------IDLCG-----MSQD--ELNECKP-----AVSKE------NP----------------T---------------------S---PS-QPCCTALQHA-------------D--------F---ACLCGYKNS---PW---L------------G--S---------F------------G--------V-D-PE-----LASAL--PKQCGL--------ANA-P---------------------------------------------
33 SP3 66.0919% -69 - C2 -1G8L MOEA_ECOLI A:[7-177] LMSLDTALNEMLSRVTPLTAQETLPLVQCFGRILASDVVSPLDVPGFDNSAMDGYAVRLADIASGQ-----------------PL--PVAGKSF-----AGQPY------H-----------------G---------------------E---WP-AGTCIRIMTGA---P--------V--------P---EGCEAVVMQ---EQ---T------------E--Q---------M------------D------------NG-----VRFTA--EVRSGQ--------NIR-RR--GEDISAGAVV----FPAGTRLTTAELPVIASLGIAEVPVIRK
22 HHSearch 64.2530%-148 - C5 -2DS2 - ? B:[7-63] -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------L-RQCCNQLRQV-------------D--------R---PCVCPVLRQ---AA---QQVLQ--------RQII---------Q------------GPQQLR---R-L-FD-----AARNL--PNICNI--------PN------------------------------------------------
11 HHSearch 63.9723% -78 - C5 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[3-80] -------------------------------------------------------------------------SCG-----QVAS--AIAPCIS-----YARGQ------G-----------------S---------------------G---PS-AGCCSGVRSLN---NA-------ARTTADRR-A---ACNC--LKN----A---A------------A--G---------VS-----------G--------L-N-AG-----NAASI--PSKCGV--------SIP-----------------------------------------------
15 HHSearch 63.7228% -88 - C5 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[3-79] -------------------------------------------------------------------------TCG-----QVSS--SLAPCIP-----YVRGG------------------------G---------------------A---VP-PACCNGIRNVN---NLARTTPDRQ--------A---ACNC--LKQ----L---S------------A--S---------VP-----------G--------V-N-PN-----NAAAL--PGKCGV--------SIP-----------------------------------------------
28 HHSearch 62.1719%-102 - C5 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[16-109] ---------------------------------------------------------------------------------------PLPSCRW-----YVTSR------TCGIGPR-----------L---------------------PWPELK-RRCCRELADI-------------P--------A---YCRCTALSILMDGA---I------------P--PGPDAQLEGRL------------EDLPGCPREV-Q-RG-----FAATLVTEAECNL--------ATI-----------------------------------------------
27 HHSearch 60.2818%-142 - C5 -1SM7 - ? A:[14-100] ---------------------------------------------------------------------------------------HLRACQQ-----WIRQQ------L-----------------AGSPFSENQWGPQQGP------S---LR-EQCCNELYQE-------------D--------Q---VCVCPTLKQ---AA---KSVRV--------Q--GQ--------H------------GPFQST---R-I-YQ-----IAKNL--PNVCNM--------KQ------------------------------------------------
19 HHSearch 59.4819%-111 - C5 -1HYP - HPSE_SOYBN A:[10-79] ---------------------------------------------------------------------------------------DLSICLN-----ILGGS------L-----------------G---------------------T----V-DDCCALIGGLG---DIE------A--------I---VCLCIQLRA---------------------L--G---------I---------------------L-N-LN-----RNLQLI-LNSCGR---------SY-PS--N--ATCPR----------------------------------
8 Fugue 58.4317% -62 - C5 -1PSY - 2SS_RICCO A:[1-125] -------------------------------------------------AEFMESKGEREGSSSQQCR---QEVQR-----K-----DLSSCER-----YLRQS------S-----------------SRRSTGEEVLRMPGDENQQQESQ---QL-QQCCNQVKQV-------------R--------D---ECQCE-AIK---YI---A------------E--D---------Q------------I--------Q-Q-GQ-----LHGEE--SERVAQ--------RAG-EI--V--SSCGVRC----MRQTRTN---------------------
29 HHSearch 55.7916% -84 - C5 -1PSY - 2SS_RICCO A:[17-116] -------------------------------------------------------------------------QCR-----QEVQRKDLSSCER-----YLRQS------S-----------------SRRSTGEEVLRMPGDENQQQESQ---QL-QQCCNQVKQV-------------R--------D---ECQCEAIKY---IAEDQIQQGQLHG-----E--E---------S------------E--------R-V-AQ-----RAGEI--VSSCGV----------------------------------------------------------
6 Fugue 55.7013% -64 - C5 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[1-127] ------------------------------------------------------GPMRRERGRQGDSS---SCERQ-----VDRV--NLKPCEQ-----HIMQR------IMGEQEQYDSYDIRSTRSS---------------------D---QQ-QRCCDELNEME---N--------T--------Q---GCMCEALQQ---IM---ENQCDRLQDR---Q--M---------V------------Q--------Q-F-KR-----ELMSL--PQQCNF--------RAP-Q-------RCDLDV----SGGRCS----------------------
34 SP3 55.6316% -99 - C6 -1ML8 - YHFA_ECOLI A:[1-134] -----------------------------------MQARVKWVEGLTFLGESASGHQILMDGNSGDKA---PSPME-----MVLM--AAGGCSAIDVVSILQKG------R-----------------Q---------------------D---VV-D--CEVKLTSE---R--------R--------E---RLFTHINLH---FI---V------------T--G---------R------------D--------L-K-DAAVARAVDLSA--EKYC--------------SV--A--LMLEK-A----VNITHSYEVVAA----------------
18 HHSearch 53.3427% -97 - C5 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[5-64] ------------------------------------------------------------------------------------S--QLAVCAS-----AILSG------------------------A---------------------K---PS-GECCGNLRAQ-------------Q------------GCFCQYAKD---PT---Y------------G--Q----------------------Y--------I-R-SP-----HARDT--LTSCGL--------AV------------------------------------------------
14 HHSearch 53.1419% -93 - C5 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[2-78] -------------------------------------------------------------------------DCG-----HVDS--LVRPCLS-----YVQGG------------------------P---------------------G---PS-GQCCDGVKNLH---NQARSQSDRQ--------S---ACNCLKGIA---------------------R--G---------IH-----------N--------L-N-ED-----NARSI--PPKCGV--------NLP-----------------------------------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) AGECGRVPVDRTALKLAPCAAATQNPRAAVPPSCCAQVRGIGRNPKCLCAVMLSNTARQAGVKPAVAMTIPKRCAIANRPIGYKCGPYTLP
45 95.14100%-125 - C- -M045 - A:[1-156] AGECGRVPVDRTALKLAPCAAATQNPRAAVPPSCCAQVRGIGRNPKCLCAVMLSNTARQAGVKPAVAMTIPKRCAIANRPIGYKCGPYTLP
41 93.87100%-118 - C- -M041 - A:[1-123] AGECGRVPVDRTALKLAPCAAATQNPRAAVPPSCCAQVRGIGRNPKCLCAVMLSNTARQAGVKPAVAMTIPKRCAIANRPIGYKCGPYTLP
40 92.84100% -98 - C- -M040 - A:[1-123] AGECGRVPVDRTALKLAPCAAATQNPRAAVPPSCCAQVRGIGRNPKCLCAVMLSNTARQAGVKPAVAMTIPKRCAIANRPIGYKCGPYTLP
42 32.32100% 24 - C- -M042 - A:[6-151] AGECGRVPVDRTALKLAPCAAATQNPRAAVPPSCCAQVRGIGRNPKCLCAVMLSNTARQAGVKPAVAMTIPKRCAIANRPIGYKCGPYTLP