@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Complexes Modeling
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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 681_tIV_BRADI: (2014-05-13 )
VCDMDNDDFMACQPAAAATTSPTPPDPSAACCATLGKADLKCLCSYKKSPWLSLYNIDPKRAMELPAKCGLSPPADC

Atome Classification :

(20 SA) --------------------------------........---.10.-.......20...--------.....30.......--------.----------40---------.--........-----50------..------.-----.----.-------.----.---------.-----------60....--....70...------...----------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --------------------------------VCDMDNDD---FMAC-QPAAAATTSPTP--------PDPSAACCATLGKA--------D----------L----------K--CLCSYKKS-----PW------LS------L-----Y----N-------I----D---------P-----------KRAMEL--PAKCGLSPP------ADC----------
1 Fugue 95.8943%-110 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -----------------------------AIDLCGMSQDE---LNEC-KPAV---SKENP--------TSPSQPCCTALQHA--------D----------F----------A--CLCGYKNS-----PW------LG------S-----F----G-------V----D---------P-----------ELASAL--PKQCGLANA------PTC----------
11 HHSearch 93.0244%-108 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[5-77] ---------------------------------CGMSQDE---LNEC-KPAVS---KENP--------TSPSQPCCTALQHA--------D----------F----------A--CLCGYKNS-----PW------LG------S-----F----G-------V----D---------P-----------ELASAL--PKQCGLANA------PTC----------
19 HHSearch 67.5227% -73 - C2 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[4-80] ---------------------------------CGQVSSS---LAPC-IPYVR---GG----------GAVPPACCNGIRNV--------NNLARTTPDRQA----------A--CNC-LKQL-------------SA------S-----VP---G-------V----N---------P-----------NNAAAL--PGKCGVSIP------Y------------
32 SP3 64.4923% -73 - C2 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] ----------------------------------AISCGQ---VASAIAPCISYARGQGS--------G-PSAGCCSGVRSLNNAARTTAD----------R----------R--AACNCLKN-----AA------AG------V-----S----G-------L----N---------A-----------GNAASI--PSKCGVSIPYTISTSTDCSRVN------
18 HHSearch 63.6523% -75 - C2 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[4-79] ---------------------------------CGQVTSN---LAPC-LAYLR---NTG-----------PLGRCCGGVKAL--------V----------NSARTTEDRQIA--CTC-LKSA-------------AG------A-----IS---G-------I----N---------L-----------GKAAGL--PSTCGVNIP------Y------------
12 HHSearch 63.6532% -82 - C2 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[5-67] --------------------------------------SQ---LAVC-ASAIL---SG----------AKPSGECCGNLRAQ--------Q---------------------G--CFCQYAKD-----PT------YG------Q----------Y-------I----R---------S-----------PHARDT--LTSCGLAVP-------HC----------
14 HHSearch 62.4227% -66 - C2 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[4-81] ---------------------------------CGQVASA---IAPC-ISYAR---GQGS---------GPSAGCCSGVRSL--------N----------NAARTTADRRAA--CNC-LKNA-------------AA------G-----VS---G-------L----N---------A-----------GNAASI--PSKCGVSIP------Y------------
23 HHSearch 61.8826% -77 - C2 -3OB4 - ? A:[428-488] -----------------------------------------------------------------------QERCCNELNEFEN------N----------Q----------R--CMCEALQQ-----IMENQS--DR------L-----Q----G-------R----QQEQQF----K-----------RELRNL--PQQCGLRAP------QRC----------
2 Fugue 61.1927% -76 - C2 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] -------------------------------AGCN--AGQ---LTVC-TGAI-----AGG--------ARPTAACCSSL-RA--------Q----------Q----------G--CFCQFAKD-----PR------YG------R-----Y------------V----N---------S-----------PNARKA--VSSCGIALP------TCH----------
33 SP3 60.5724% -87 - C2 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[1-69] -------------------------------AGCNAGQ-----LTVC-TGAIAGGA-------------RPTAACCSSLRAQ--------Q---------------------G--CFCQFAKD-----PR------YG------R-----Y------------V----N---------S-----------PNARKA--VSSCGIAL-------PTCH---------
22 HHSearch 60.3325% -95 - C2 -1SM7 - ? A:[44-104] ----------------------------------------------------------------------LREQCCNELYQE--------D----------Q----------V--CVCPTLKQ-----AA------KS------VRVQGQH----GP------FQSTRI---------Y-----------QIAKNL--PNVCNMKQI------GTC----------
16 HHSearch 59.3924% -45 - C2 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[3-79] ---------------------------------CGHVDSL---VRPC-LSYV---QGG----------PGPSGQCCDGVKNL--------H----------NQARSQSDRQSA--CNCLKGIA-----RG------I-------------H----N-------L----N---------E-----------DNARSI--PPKCGVNLP------Y------------
26 HHSearch 59.3726% -81 - C2 -2LVF - ? A:[45-105] ----------------------------------------------------------------------HMSECCEQLEGM--------D----------E----------S--CRCEGLRM-----MM------RM------M-----QQKEMQPRGEQMRR----M---------M-----------RLAENI--PSRCNLS-P------MRC----------
5 Fugue 58.1822% -60 - C2 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] -----------------------PYGRGRTESGCYQQMEEAEMLNHC-GMYLMKNLGERSQVSPRMREEDHKQLCCMQLKNL--------D----------E----------K--CMCPAIMMMLNEPMW------IR------M-----R----D-------Q----V---------M-----------SMAHNL--PIECNLMSQ-------PCQM--------
27 HHSearch 57.7120% -86 - C2 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[36-105] ---------------------------------------------------------------------AVLRDCCQQLAHI--------S----------E----------W--CRCGALYS-----MLDSMYKEH--------------------------G----AFPRCRREVVK-----------LTAASI--TAVCRLPIV------V------------
13 HHSearch 57.5629% -76 - C2 -1L6H - NLTPX_ORYSJ A:[3-68] ---------------------------------CNAG--Q---LTVC-TGAIA---GG----------ARPTAACCSSLRAQ-------------------Q----------G--CFCQFAKD-----PR------YG------R----------Y-------V----N---------S-----------PNARKA--VSSCGIALP-------TC----------
20 HHSearch 55.9322% -66 * C2 *2DS2 - ? B:[6-67] ----------------------------------------------------------------------ALRQCCNQLRQV--------D----------R----------P--CVCPVLRQ-----AA------QQVLQRQII-----Q----GPQQLR--R----L---------F-----------DAARNL--PNICNIPNI------GAC----------
15 HHSearch 55.8224% -67 - C2 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[3-79] ---------------------------------CGQVQGN---LAQC-IGFLQ---KG----------GVVPPSCCTGVKNILNSSRTTAD----------R----------RAVCSCLKAA--------------AG------A-----VR---G-------I----N---------P-----------NNAEAL--PGKCGVNIP------Y------------
8 Fugue 54.7318% -46 - C2 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[1-127] GPMRRERGRQGDSSSCERQVDRVNLKPCEQHIMQRIMGEQ---E----QYDSYDIRSTRS--------SDQQQRCCDELNEM--------E----------N----------T--QGCMCEAL-----QQ------IM------E-----N----Q-------C----D---------RLQDRQMVQQFKRELMSL--PQQCNFRAP------QRCDLDVSGGRCS
28 HHSearch 51.7223% -75 - C2 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[41-110] -----------------------------------------------------------------------KRRCCRELADI--------P----------A----------Y--CRCTALSI-----LMDGAIPPGP------DA----Q----LEGRL---E----DLPGCPREVQR-----------GFAATLVTEAECNLATI------S------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(3 SA) .........10........20........30........40........50........60........70......
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) VCDMDNDDFMACQPAAAATTSPTPPDPSAACCATLGKADLKCLCSYKKSPWLSLYNIDPKRAMELPAKCGLSPPADC
35 99.93100%-123 - C- -M035 - A:[1-106] VCDMDNDDFMACQPAAAATTSPTPPDPSAACCATLGKADLKCLCSYKKSPWLSLYNIDPKRAMELPAKCGLSPPADC
39 92.70100%-112 - C- -M039 - A:[1-95] VCDMDNDDFMACQPAAAATTSPTPPDPSAACCATLGKADLKCLCSYKKSPWLSLYNIDPKRAMELPAKCGLSPPADC
40 39.84100% -10 - C- -M040 - A:[3-105] VCDMDNDDFMACQPAAAATTSPTPPDPSAACCATLGKADLKCLCSYKKSPWLSLYNIDPKRAMELPAKCGLSPPADC