@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : 685_tV_BRADI: (2014-05-13 )
AGECGATPADRMALKLAPCASAGQDPASAPSSGCCTAVHTIGKQSPKCLCAVMLSNTARSAGIKPEAAITIPKRCNLVDRPVGYKCGAYTLP

Atome Classification :

(20 SA) --------------.........10-------...--.--.----....20.-.....----.---------------------.-----------------30..---------------------......40..-------.-------.-------.-------...50....-----...-------------.------60--.--------.-----.---..----------....70--......--------..80.....------....90.---------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) --------------AGECGATPAD--------RMA--L--K----LAPCASA-GQDPA----S---------------------A-----------------PSSG---------------------CCTAVHTIGK-------Q-------S-------P-------KCLCAVMLS-----NTA-------------R------S---A--------G-----I---KP----------EAAITI--PKRCNL--------VDR-PVGYK------CGAYTLP---------
30 SP3 80.1523% -99 * C4 *1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] -------------------AISCG--------QVA--S--A----IAPCISY-ARGQG----S---------------------G-----------------PSAG---------------------CCSGVRSLNN-------A-------A-------RTTADR--RAACNCLKN-----AAA-------------G------V---S--------G-----L---NA----------GNAASI--PSKCGV--------S----IPYTISTSTDCSRVN-----------
4 Fugue 74.1830% -89 - C4 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] ----------------MCYPGQAFQVPALPACRPL--L--R----LQCNGS---QVP-----E---------------------A-----------------VLRD---------------------CCQQLAHI-----------------S-------E-------WCRCGALYS-----MLDSMYKEHGAFPRCRR------E---V--------V-----K---LT----------AASITA----VCRLPIVVDASGDGA-YVCKD------VAAYPDA---------
13 HHSearch 70.7921% -87 - C4 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[2-82] ---------------------DCG--------HVD--S--L----VRPCLSY-VQGG-----P---------------------G-----------------PSGQ---------------------CCDGVKNLHNQAR----SQSDR---Q-------S-------ACNCLKGIA-----R----------------------G---IH-------N-----L---NE----------DNARSI--PPKCGV--------NLPYTIS------------------------
1 Fugue 70.7434% -79 - C4 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -------------AIDLCGMS-------------Q--D--E----LNECKPAVSKENP----T---------------------S-----------------PSQP---------------------CCTALQHA-----------------D-------F-------ACLCGYKNS-----PWL-------------G------S---F--------G-----V---DP----------ELASAL--PKQCGL--------ANA-P---T------C---------------
12 HHSearch 67.8429% -73 - C4 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[3-80] ---------------------SCG--------QVA--S--A----IAPCISY-ARGQG----S---------------------G-----------------PSAG---------------------CCSGVRSLNN-------A-------ARTTADRRA-------ACNC--LKN-----A-A-------------A------G---VS-------G-----L---NA----------GNAASI--PSKCGV--------SIP----------------------------
15 HHSearch 64.7925% -89 - C4 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[2-82] ---------------------TCG--------QVQ--G--N----LAQCIGF-LQKG-----G---------------------V-----------------VPPS---------------------CCTGVKNILN-------SSRTTADRR-------A-------VCSC--LKA------AA-------------G------A---VR-------G-----I---NP----------NNAEAL--PGKCGV--------NIPYKIS------------------------
28 HHSearch 64.4519% -91 - C4 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[16-109] ----------------------------------------P----LPSCRWY-VTSRTCGIGPR--------------------LPWPE-------------LKRR---------------------CCRELADI-----------------P-------A-------YCRCTALSI-----LMDGAI----------PPGPDAQLEGRLEDLPGCPRE-----V---QR----------GFAATLVTEAECNL--------ATI----------------------------
16 HHSearch 63.8421% -79 - C4 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-79] --------------------ITCG--------QVS--S--S----LAPCIPY-VRGG-----G---------------------A-----------------VPPA---------------------CCNGIRNVNNLARTTPDR-------Q-------A-------ACNC--LKQ-----L-S-------------A------S---VP-------G-----V---NP----------NNAAAL--PGKCGV--------SIP----------------------------
17 HHSearch 63.2625% -87 - C4 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-78] --------------------ITCG--------QVT--S--N----LAPCLAY-LRNTG--------------------------------------------PLGR---------------------CCGGVKALVN-------S-------A-------RTTEDRQIACTC--LKS-----A-A-------------G------A---IS-------G-----I---NL----------GKAAGL--PSTCGV--------NIP----------------------------
6 Fugue 61.1719%-103 - C4 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] -------------PYGRGRTESGC--------YQQ--M--EEAEMLNHCGMY-LMKNL----G---------------------E-----------------RSQVSPRMREEDHKQL---------CCMQLKNL-----------------D-------E-------KCMCPAIMMMLNEPMWI-------------R------M---R--------D-----Q---VM----------SMAHNL--PIECNL--------MSQ-----P------CQM-------------
11 HHSearch 57.1232% -68 - C4 -2RKN DIRL1_ARATH A:[2-75] -------------------IDLCG--------MSQ--D--E----LNECKPA-VSKENP---T---------------------S-----------------PSQP---------------------CCTALQHA-----------------D-------F-------ACLCGYKNS-----PWL-------------G------S---F--------G-----V---DP----------ELASAL--PKQCGL--------ANA-P--------------------------
8 Fugue 55.1117% -58 - C4 -1PSY - 2SS_RICCO A:[1-125] AEFMESKGEREGSSSQQCRQEVQR--------K-------D----LSSCERY-LRQSS----S---------------------R-----------------RSTGEEVLRMPGDENQQQESQQLQQCCNQVKQV-----------------R-------D-------ECQCEAIKY-----IAE-------------D------Q---I--------Q-----Q---GQLHGEESERVAQRAGEI--VSSCGV--------RCM-RQTRT------N---------------
25 HHSearch 54.4616% -92 - C4 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[15-112] ---------------------SCE--------RQVDRV--N----LKPCEQH-IMQRI----M---------------------GEQEQYDSYDIRSTRSSDQQQR---------------------CCDELNEME--------N-------T-------Q-------GCMCEALQQ-----IME-------------NQCD---R---LQ-------DRQ---MVQQFK----------RELMSL--PQQCNF--------R------------------------------
27 HHSearch 54.2922%-132 - C4 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[37-105] ------------------------------------------------------------------------------------------------------VLRD---------------------CCQQLAHI-----------------S-------E-------WCRCGALYS-----MLD-------------SMYK---EH---GAFPRCRRE-----V---VK----------LTAASI--TAVCRL--------PIV-V--------------------------
19 HHSearch 52.0428% -84 - C4 -1N89 NLT2G_WHEAT A:[5-65] -------------------------------------S--Q----LAVCASA-ILSG-----A---------------------K-----------------PSGE---------------------CCGNLRAQ-----------------Q---------------GCFCQYAKD-----PTY-------------G------Q------------Y-----I---RS----------PHARDT--LTSCGL--------AVP----------------------------
23 HHSearch 51.9624%-149 - C4 -2DS2 - ? B:[7-63] -------------------------------------------------------------------------------------------------------LRQ---------------------CCNQLRQV-----------------D-------R-------PCVCPVLRQ-----AAQ-------------QVLQRQII---Q--------GPQQLRR---LF----------DAARNL--PNICNI--------PN-----------------------------
21 HHSearch 51.4816%-109 - C4 -1HYP - HPSE_SOYBN A:[10-79] ----------------------------------------D----LSICLNI-LGG-S----L---------------------G-----------------TVDD---------------------CCALIGGLGD-------IE------A-------I-------VCLCIQLRA---------------------L------G---I--------------L---NL----------NRNLQLI-LNSCGR---------SY-PSNAT------CPR-------------
26 HHSearch 51.3216% -72 - C4 -1PSY - 2SS_RICCO A:[16-116] --------------------QQCR--------QEV--QRKD----LSSCERY-LRQSS----SRRSTGEEVLRMPGDENQQQESQ-----------------QLQQ---------------------CCNQVKQV-----------------R-------D-------ECQCEAIKY-----IAEDQIQQGQLHG---E------E---S--------E-----R---VA----------QRAGEI--VSSCGV---------------------------------------
10 Fugue 50.6615% -55 - C3 -1MOL - MONB_DIOCU A:[1-94] ---------------GEWEIIDIG--------PFT--Q--N----LGKFAVD-EENKI----G---------------------Q-----------------YGRL---------------------------TFNK-------V-------I-------R-------PCMKKTIYE-----NER-------------E------I---K--------G-----Y---EY----------QLYVYA--SDKLFR--------ADI-SEDYK------TRGRKLLRFNGPVPPP
24 HHSearch 50.1819%-128 - C4 -3OB4 - ? A:[428-483] -------------------------------------------------------------------------------------------------------QER---------------------CCNELNEFE--------N-------N-------Q-------RCMCEALQQ-----IMENQSD---------R------L---Q--------GRQQEQQ---FK----------RELRNL--PQQCGL--------R------------------------------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(3 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90.
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) AGECGATPADRMALKLAPCASAGQDPASAPSSGCCTAVHTIGKQSPKCLCAVMLSNTARSAGIKPEAAITIPKRCNLVDRPVGYKCGAYTLP
43 91.16100% -96 - C- -M043 - A:[1-138] AGECGATPADRMALKLAPCASAGQDPASAPSSGCCTAVHTIGKQSPKCLCAVMLSNTARSAGIKPEAAITIPKRCNLVDRPVGYKCGAYTLP
40 41.49100% -9 - C- -M040 - A:[3-148] AGECGATPADRMALKLAPCASAGQDPASAPSSGCCTAVHTIGKQSPKCLCAVMLSNTARSAGIKPEAAITIPKRCNLVDRPVGYKCGAYTLP
39 37.72100% -5 - C- -M039 - A:[3-148] AGECGATPADRMALKLAPCASAGQDPASAPSSGCCTAVHTIGKQSPKCLCAVMLSNTARSAGIKPEAAITIPKRCNLVDRPVGYKCGAYTLP