@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : new_query: (2014-05-15 )
ATCGQLIDSLIPCITYLQGGPGPSAACCGGVKKLNAAANTGPARKAACNCLKSAAGTIARLNNNQAAALPGKCGVKIPYKFSTSTNCNSIRF

Atome Classification :

(20 SA) ---------------.....----....---10......----------------------.------------------.--------20----.------------.-------------------.----------......30........40........50...---.-----...------------.-------60--------.----------.----------.-------......--70.........80--..--.......90.----
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ---------------ATCGQ----LIDS---LIPCITYL----------------------Q------------------G--------G-----P------------G-------------------P----------SAACCGGVKKLNAAANTGPARKAACNCLKSA---A-----GTI------------A-------R---------L----------N----------N-------NQAAAL--P-GKCGVKIPYK---FS--TSTNCNSIRF----
13 HHSearch 94.1251%-119 - C2 -1T12 - NLTP1_TOBAC A:[2-91] ---------------ITCGQ----VTSN---LAPCLAYL----------------------R------------------N--------T-----G--------------------------------P----------LGRCCGGVKALVNSARTTEDRQIACTCLKSA---A-----GAI------------S-------G---------I----------N----------L-------GKAAGL--P-STCGVNIPYK---IS--PSTDCSKVQ-----
12 HHSearch 91.9154%-112 - C2 -2ALG NLTP1_PRUPE A:[2-92] ---------------ITCGQ----VSSS---LAPCIPYV----------------------R------------------G--------G-----G------------A-------------------V----------PPACCNGIRNVNNLARTTPDRQAACNCLKQL---S-----ASV------------P-------G---------V----------N----------P-------NNAAAL--P-GKCGVSIPYK---IS--ASTNCATVK-----
32 SP3 89.5951%-112 - C2 -1FK5 NLTP_MAIZE A:[1-93] --------------AISCGQ----VASA---IAPCISYA----------------------R------------------G--------Q-----G------------SG------------------P----------SAGCCSGVRSLNNAARTTADRRAACNCLKNA---A-----AGV------------S-------G---------L----------N----------A-------GNAASI--P-SKCGVSIPYT---IS--TSTDCSRVN-----
16 HHSearch 88.4144%-113 - C2 -1BWO NLTP1_WHEAT A:[1-90] ---------------IDCGH----VDSL---VRPCLSYV----------------------Q------------------G--------G-----P------------G-------------------P----------SGQCCDGVKNLHNQARSQSDRQSACNCLKGI---A-----RGI------------H-------N---------L----------N----------E-------DNARSI--P-PKCGVNLPYT---IS--LNIDCSRV------
14 HHSearch 86.3054%-111 - C2 -1SIY - NLTP1_VIGRR A:[1-91] ---------------MTCGQ----VQGN---LAQCIGFL----------------------Q------------------K--------G-----G------------V-------------------V----------PPSCCTGVKNILNSSRTTADRRAVCSCLKAA---A-----GAV------------R-------G---------I----------N----------P-------NNAEAL--P-GKCGVNIPYK---IS--TSTNCNSIN-----
15 HHSearch 85.4052%-103 - C2 -1AFH - NLTP_MAIZE A:[2-93] ---------------ISCGQ----VASA---IAPCISYA----------------------R------------------G--------Q-----G------------SG------------------P----------SAGCCSGVRSLNNAARTTADRRAACNCLKNA---A-----AGV------------S-------G---------L----------N----------A-------GNAASI--P-SKCGVSIPYT---IS--TSTDCSRVN-----
6 Fugue 62.6222%-108 - C2 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[1-103] -------PYGRGRTESGCYQ----QMEEAEMLNHCGMYL----------------------MKNLGERSQVSPRM-----R--------E-----E------------D-------------------H----------KQLCCMQLKNLDEKCM--------CPAIMMM---LNEPMWIRM------------R-------D---------Q----------V----------M-------SMAHNL--P-IECNL------------MSQPCQM-------
27 HHSearch 62.3425%-121 - C2 -1SM7 - ? A:[13-101] --------------------------QH---LRACQQWI----------------------R------------------QQLA-----GS----PFSENQWGPQQGPS-------------------L----------REQCCNELYQE--------DQVCVCPTLKQA---A-----KSV------------RVQ-----GQ--------H----------G----------PFQSTRIYQIAKNL--P-NVCNMKQI-----------------------
29 HHSearch 60.9820%-142 - C2 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[15-106] --------------------------PA---LPACRPLL----------------------R------------------LQCN-----G-----SQ-----------VPEA----------------V----------LRDCCQQLAHI--------SEWCRCGALYSM---L-----DSM------------YKEH---------------GAFPRCRREVV----------K-------LTAASI--T-AVCRLPIVVD---------------------
30 HHSearch 59.1918%-109 - C2 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[22-114] -------------------------RVN---LKPCEQHI----------------------M------------------QRIM-----G-----EQEQ---------YDSYDIRSTRSSD-------Q----------QQRCCDELNEME-----N-TQGCMCEALQQI---M-----ENQ------------C-------DRLQD-----R----------QMVQQF-----K-------RELMSL--P-QQCNFRAP-----------------------
24 HHSearch 58.1321%-135 - C2 -1BEA - ITRF_MAIZE A:[15-109] --------------------------NP---LPSCRWYV----------------------TSRTC--------------G--------I-----G------------PRLPWPE-------------L----------KRRCCRELADI--------PAYCRCTALSIL---M-----DGA------------IPPGPDAQLEGR------L----------EDLPGCPREVQR-------GFAATLVTE-AECNLATI-----------------------
9 Fugue 55.6618%-108 - C2 -1HSS - IAA1_WHEAT A:[5-124] ----------------MCYPGQAFQVPA---LPACRPLL----------------------R------------------LQCNGSQVP------E------------A-------------------V----------LRDCCQQLAHIS--------EWCRCGALYSM---L-----DS-MYKEHGAFPRCRR-------E---------V----------V----------K-------LTAASI--TA-VCRLPIVVD---ASGDGAYVCKDVAAYPDA
25 HHSearch 53.0026% -90 - C2 -1PSY - 2SS_RICCO A:[25-122] --------------------------KD---LSSCERYL----------------------R------------------Q--------SSSR--R------------STGEEVLRMPGDENQQQESQQ----------LQQCCNQVKQV--------RDECQCEAIKYI---A-----EDQ------------IQQG----Q---------LHGEESER---V----------A-------QRAGEI--V-SSCGV--RCM---RQ--T-------------
31 HHSearch 50.8416%-117 - C2 -2LVF - ? A:[16-101] --------------------------QM---LSHCRMYM----------------------R------------------QQMEE----S-----T------------Y-------------------QTMPRRGMEPHMSECCEQLEGM--------DESCRCEGLRMM---M-----RMM------------QQKEM---Q---------PRGEQMRR---M----------M-------RLAENI--P-SRCNLS-------------------------
4 Fugue 49.1722% -64 - C2 -1PSY - 2SS_RICCO A:[1-125] AEFMESKGEREGSSSQQCRQ----EVQRKD-LSSCERYLRQSSSRRSTGEEVLRMPGDENQQ------------------Q--------E-----S------------Q-------------------Q----------LQQCCNQVKQVRDECQCEAIKYIAEDQIQQGQL-H-----GEE------------S-------E---------R----------V----------A-------QRAGEI--V-SSCG--VRCM---RQ--TRTN----------
2 Fugue 47.8324% -70 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[1-77] -------------AIDLCGM----SQDE---LNECKPAV----------------------S------------------K--------ENP---T------------S-------------------P----------SQPCCTALQHAD--------FACLCGYKNSP---W-----LGS------------F-------G---------V----------D----------P-------ELASAL--P-KQCGLANA-----------PTC---------
23 HHSearch 47.2523% -83 - C2 -1S6D - 2SS8_HELAN A:[19-97] --------------------------EM---LNHCGMYL----------------------M------------------K--------NLGERSQVSPRMREE----D-------------------H----------KQLCCMQLKNLD--------EKCMCPAIMMM---L-----NEP------------M-------WI--------RMRDQ------V----------M-------SMAHNL--P-IECNLM-------------------------
17 HHSearch 46.3524% -84 - C2 -2RKN DIRL1_ARATH A:[3-75] ---------------DLCGM----SQDE---LNECKPAV----------------------S------------------K--------E-----NPT----------S-------------------P----------SQPCCTALQHA--------DFACLCGYKNSP---W-----LGS------------F-------G---------V----------D----------P-------ELASAL--P-KQCGLANAP----------------------
22 HHSearch 45.8714%-119 * C2 *1B1U - IAAT_ELECO A:[15-109] --------------------------NP---LDSCRWYV----------------------S------------------TRTCG----V-----G------------PRLATQE-------------M----------KARCCRQLEAI--------PAYCRCEAVRIL---M-----DGV------------VTPS----GQHEGRLLQDL----------PGCPRQVQRA-F-------APKLVT--E-VECNLATIH----------------------
7 Fugue 45.7313% -65 - C2 -1W2Q - CONG_ARAHY A:[1-127] --GPMRRERGRQGDSSSCER----QVDRVN-LKPCEQHI----------------------MQRIMGEQEQYDSYDIRSTR--------S-----S------------D-------------------Q----------QQRCCDELNEMENTQGCMCEALQQIMENQCDRLQD-----RQM------------V-------Q---------Q----------F----------K-------RELMSL--P-QQCNFRAPQRCDLDV--SGGRCS--------


User Run . : Multi Template Modeling Result:

(4 SA) .........10........20........30........40........50........60........70........80........90.
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ATCGQLIDSLIPCITYLQGGPGPSAACCGGVKKLNAAANTGPARKAACNCLKSAAGTIARLNNNQAAALPGKCGVKIPYKFSTSTNCNSIRF
41 96.34100%-123 - C- -M041 - A:[1-94] ATCGQLIDSLIPCITYLQGGPGPSAACCGGVKKLNAAANTGPARKAACNCLKSAAGTIARLNNNQAAALPGKCGVKIPYKFSTSTNCNSIRF
42 96.25100%-130 - C- -M042 - A:[1-157] ATCGQLIDSLIPCITYLQGGPGPSAACCGGVKKLNAAANTGPARKAACNCLKSAAGTIARLNNNQAAALPGKCGVKIPYKFSTSTNCNSIRF
40 93.73100%-124 - C- -M040 - A:[1-94] ATCGQLIDSLIPCITYLQGGPGPSAACCGGVKKLNAAANTGPARKAACNCLKSAAGTIARLNNNQAAALPGKCGVKIPYKFSTSTNCNSIRF
45 93.15100%-124 - C- -M045 - A:[1-94] ATCGQLIDSLIPCITYLQGGPGPSAACCGGVKKLNAAANTGPARKAACNCLKSAAGTIARLNNNQAAALPGKCGVKIPYKFSTSTNCNSIRF