@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : jhp_0375: (2015-12-14 )
MVVSVPATSANLGPGFDCLGLSLNLRNRFFIEPSNIHAVKLVGEGEGIPKFLTNNIFTKVFYEILKKHGNDGSFKFLLHNKVPITRGMGSSSAMIVGAVASAFAFLGFAFDRENILNTALIYENHPDNITPAVFGGYNAAFVEKKKVISLKTKIPSFLKAVMVIPNRVISTKQSRHLLPKRYSVQESVFNLSHASLMTMAIVQGKWDLLRCCSKDRMHQYKRMQTYPVLFAIQKLALENNALMSTLSGSGSSFFNMCYEEDAPKLKQVLSKKFPKFRVAVLDFDNDGVLIEKD

Atome Classification :

(20 SA) ----------.........10----.----.-----------.-----...---.-.20--....-.---------....30..-.-.--....40--....--.-------.----------.----.----.50....---.....----60.-----------...---....70-.........80........90........100......---------------.--------110.......120.--------.------.....130...---....140....----.--..150---.......--160......-.170.-....-----------..--180---------.-.-.-----.--------...190...-....-------.200.......-210.....-..220.--------.---....--------..230.......240.......250........-.260.----.......270.----.......280.......290.--------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ----------MVVSVPATSAN----L----G-----------P-----GFD---C-LG---LSLN-L---------RNRFFIEP-S-N--IHAVK---LVGE--G-------E----------G----I----PK-FLTN---NIFTK----VFY-----------EIL---KKHGN--DGSFKFLLHNKVPITRGMGSSSAMIVGAVASAFAFLGF---------------A--------FDRENILNTALIYE--------N------HPDNITPAVFG---GYNAAFVEKKK----V--ISLKT---KIPSFLK--AVMVIPNRV-ISTKQ-SRHL-----------LP--KRY---------S-V-Q-----E--------SVFNL-SHA-SLMT-------MAIVQGKWDLL-RCCSKDRM-HQYK-R--------M---QTYP--------VLFAIQKLALENNALMSTLSGSG--SSFFNMCY-EE-DA----PKLKQVLSK-K----FPKFRVAVLDFDNDGVLIEKD--------------
1 PsiBlast_PDB 94.1129% -98 - C3 -3HUL KHSE_LISMO A:[5-285] ------------IRVPATTAN----L----G-----------P-----GFD---S-CG---LALT-LYLTLDIGAEADSWYIE--H-N--I-------------G-------G----------G----I----PH-DETN---VIIET----A---------------L---NLAPN--LTPHHLVMTCDIPPARGLGSSSAAVVAGIELANTLAEL---------------N--------LSKEEKVRIAAEIE--------G------HPDNVAPAVLG---NWVVGAKLDGE----D--FYVRH---LFP--CA--LIAFIPKAE-LL--------------------P--DTL---------P-F-K-----E--------AVQAS-SIA-NVMI-------AAILRNDMTLAGEMMERDLW---------------S---QLVP--------HLAQIRDVAKNQGAYAACLSGAG--PTVLVFAP-RN-LA----NKLQTSLQT-L----EIDADVLLLDVEGSGAEVFRE--------------
17 HHSearch 92.8527% -96 - C3 -3HUL KHSE_LISMO A:[3-290] ----------LRIRVPATTAN----L----G-----------P-----GFD---S-CG---LALT-L---------YLTLDIGAEA-D--SWYIE---HNIG----------G----------G----I----PH-D-ET---NVIIE----TAL-----------NLA---PN-----LTPHHLVMTCDIPPARGLGSSSAAVVAGIELANTLAEL---------------N--------LSKEEKVRIAAEIE--------G------HPDNVAPAVLG---NWVVGAKLDGE-------DFYVR---HLFP-CA--LIAFIPKAE-LL--------------------P--DTL---------P-F-K-----E--------AVQAS-SIA-NVMI-------AAILRNDMTLA-GEMMERDLW--------------S---QLVP--------HLAQIRDVAKNQGAYAACLSGAG--PTVLVFAP-RN-LA----NKLQTSLQT-L----EIDADVLLLDVEGSGAEVFRE--------------
40 Fugue 91.7925% -87 - C3 -1H74 KHSE_METJA A:[1-296] --------MKVRVKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLKEP---------YDVIEVEA-I-D--DKEII---IEVD--D-------K----------N----I----PT-DPDK---NVAGI----VAK-----------KMI---DDFNI--GKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAYAINELFKL---------------N--------LDKLKLVDYASYGE--------LASSGAKHADNVAPAIFG---G-FTMVTNYEP----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---KLIP--------NYFKIKE-EVKDKVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YENTIRTE---VGKGVEVV----------------
41 Fugue 91.7025% -89 * C3 *1H72 KHSE_METJA C:[1-296] --------MKVRVKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLKEP---------YDVIEVEA-I-D--DKEII---IEVD--D-------K----------N----I----PT-DPDK---NVAGI----VAK-----------KMI---DDFNI--GKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAYAINELFKL---------------N--------LDKLKLVDYASYGE--------LASSGAKHADNVAPAIFG---G-FTMVTNYEP----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---KLIP--------NYFKIKE-EVKDKVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YENTIRTEV---GKGVEVV----------------
43 Fugue 90.9526% -94 - C3 -1H72 KHSE_METJA C:[1-296] --------MKVRVKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD----VFG---LCLKEP---------YDVIEVEA-I-D--DKEII---IEVD--D-------K----------N----I----PT-DPDK---NVAGI----VAK-----------KMI---DDFN-I-GKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAYAINELFKL---------------N--------LDKLKLVDYASYGE--------LASSGAKHADNVAPAIFG---GFTMVTNY---EPLEV--LHIPI-----DFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-------------LPKAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---K---LIPNYFKIKEEVKDK------VYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YE-------------------NTIRTEVGKGVEVV
42 Fugue 90.7425% -87 - C3 -1FWK KHSE_METJA A:[1-296] --------MKVRVKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLKEP---------YDVIEVEA-I-D--DKEII---IEVD--D-------K----------N----I----PT-DPDK---NVAGI----VAK-----------KMI---DDFNI--GKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAYAINELFKL---------------N--------LDKLKLVDYASYGE--------LASSGAKHADNVAPAIFG---G-FTMVTNYEP----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---KLIP--------NYFKIKEE-VKDKVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YENTIRTE---VGKGVEVV----------------
18 HHSearch 88.3025% -91 - C3 -1H72 KHSE_METJA C:[3-296] ----------VRVKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLKEP---------YDVIEVEAIDDK--EIIIE---VDDK---------------------N----I----PT-DPDK---NVAGI----VAK-----------KMI---DDFNI--GKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAYAINELFKL---------------N--------LDKLKLVDYASYGELASSGA--K------HADNVAPAIFG---GFTMVTNYEP-----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLF-GRYMMSDK-VIEP-V--------RG--KLIP--------NYFKIKEEVKD-KVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----Y--ENTIRTEVG-KGVEVV----------------
3 PsiBlast_PDB 81.2324% -78 - C3 -4RPF KHSE_YERPN A:[5-274] ------------IYAPASIGN----V----S-----------V-----GFD---V-LG---AAVSPI---------DGTLLGDC-V-S--VTAAERFSLHNE--G-------R----------F----V----SK-LPDDPKQNIVYQ----CWE-----------RFC---QEMGK--EIPVAMVLEKNMPIGSGLGSSACSVVAGLMAMNEFCGQ---------------P--------LDKVTLLGMMGELE--------GRVSGSIHFDNVAPCYLG---GMQ-LILEQEG----Y--IS--Q---DVPGFSDWLWVMAYPGIK-VSTAE-ARAI-----------LP--AQY---------R-R-Q-----D--------CITHG-RNL-AGFI-------HACHTQQPDLA-AKMMKDVI-AEPY-R--------T---QLLP--------GFAAARQAAQDIGALACGISGSG--PTLFAVCN-DQ-AT----AQRMAGWLQ-N----HYLQNDEGFVHICRLDTAGAR--------------
7 PsiBlast_PDB 80.7827% -86 - C3 -1H74 KHSE_METJA A:[5-277] ------------VKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLK-----------------EP-Y-D--VIEVE---AIDD--K-------E----------I----I----IE-VDDK---NIPTDPDKNVAG-----------IVA---KKMID--D----FNIGKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAY---------------AINELFKLNLDKLKLVDYASYGELASSGA--K------HADNVAPAIFG---GFTMV-TNYEP----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---KLIP--------NYFKIKE-EVKDKVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YENTIRTEVGKGVEVV-------------------
6 PsiBlast_PDB 80.0827% -83 - C3 -1H72 KHSE_METJA C:[5-277] ------------VKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLK-----------------EP-Y-D--VIEVE---AIDD--K-------E----------I----I----IE-VDDK---NIPTDPDKNVAG-----------IVA---KKMID--D----FNIGKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAY---------------AINELFKLNLDKLKLVDYASYGELASSGA--K------HADNVAPAIFG---GFTMV-TNYEP----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---KLIP--------NYFKIKE-EVKDKVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YENTIRTEVGKGVEVV-------------------
4 PsiBlast_PDB 79.7627% -86 - C3 -1FWK KHSE_METJA A:[5-277] ------------VKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLK-----------------EP-Y-D--VIEVE---AIDD--K-------E----------I----I----IE-VDDK---NIPTDPDKNVAG-----------IVA---KKMID--D----FNIGKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAY---------------AINELFKLNLDKLKLVDYASYGELASSGA--K------HADNVAPAIFG---GFTMV-TNYEP----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---KLIP--------NYFKIKE-EVKDKVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YENTIRTEVGKGVEVV-------------------
5 PsiBlast_PDB 79.6627% -83 - C3 -1FWL - KHSE_METJA A:[9-281] ------------VKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLK-----------------EP-Y-D--VIEVE---AIDD--K-------E----------I----I----IE-VDDK---NIPTDPDKNVAG-----------IVA---KKMID--D----FNIGKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAY---------------AINELFKLNLDKLKLVDYASYGELASSGA--K------HADNVAPAIFG---GFTMV-TNYEP----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---KLIP--------NYFKIKE-EVKDKVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YENTIRTEVGKGVEVV-------------------
8 PsiBlast_PDB 78.8827% -82 - C3 -1H73 KHSE_METJA A:[5-277] ------------VKAPCTSAN----L----G-----------V-----GFD---V-FG---LCLK-----------------EP-Y-D--VIEVE---AIDD--K-------E----------I----I----IE-VDDK---NIPTDPDKNVAG-----------IVA---KKMID--D----FNIGKGVKITIKKGVKAGSGLGSSAASSAGTAY---------------AINELFKLNLDKLKLVDYASYGELASSGA--K------HADNVAPAIFG---GFTMV-TNYEP----L--EVLHI---PIDFKLD--ILIAIPNIS-INTKE-AREI-----------LP--KAV---------G-L-K-----D--------LVNNV-GKA-CGMV-------YALYNKDKSLFGRYMMSDKV-IEPV-R--------G---KLIP--------NYFKIKE-EVKDKVYGITISGSG--PSIIAFPK-EE-FI----DEVENILRD-Y----YENTIRTEVGKGVEVV-------------------
22 HHSearch 76.2317% -85 - C3 -2CZ9 GAL1_PYRHO A:[2-350] ----------IKVKSPGRVNL----I----G-----------EHTDYTYGY---V-MP---MAIN-L---------YTKIEAEKHG----EVILY---SEHF--G-------EERKF------SLNDLR----KE-NSWI---DYVKG----IFW-----------VLK---ESDYE--VGGIKGRVSGNLPLGAGLSSSASFEVGILETLDKLYNL---------------K--------LDSLSKVLLAKKAENEFVGVPCG------ILDQFA-VVFGREGNVIFLDTHT------L--DYEYI---PFPKDVS--ILVFYTGVR-----SSEYAERKHIAEESLKILG--KGSSKEVREGELSKL-P-----PLHRKFFGYIVREN-ARV-LEVR-------DALKEGNVEEV-GKILTTAH-WDLA-KN-------YE--VSCK--------ELDFFVERALKLGAYGARLTGAGFGGSAIALVD-KE-DA----ETIGEEILREYLKRFPWKARHFIVEP-SDGVGI-----------------
19 HHSearch 73.8716% -72 - C3 -3PYF ISPE_MYCTU A:[6-300] ----------VTVRVPGKVNLYLAVG----D-----------RRED--GYH---E-LTTVFHAVS-L---------VDEVTVRNADVL--SLELV---GEGA----------D----------Q----L----PT-D-ER---NLAWQ----AAE-----------LMA---EHVGR--APDVSIMIDKSIPVAGGMAGGSADAAAVLVAMNSLWEL---------------N--------VPRRDLRMLAARLG--------S---------DVPFALHG---GTALGTGRGE--------ELATV---LSRNTFH--WVLAFADSG-LLTSA-VYNE-----------LD--RLR---------E-V-G-----D--------P-PRL-GEP-GPVL-------AALAAGDPDQL-APLLGNEM-Q-AA-A--------V---SLDP--------ALARALRAGVEAGALAGIVSGSG--PTCAFLCT-SASSA----IDVGAQLSG-A----GVCRTVRVATGPVPGARVV----------------
28 HHSearch 72.2117% -82 - C3 -1KKH MVK_METJA A:[6-315] ----------MIIETPSKVIL----F----G-----------EHAVVYGYR---A-IS---MAID-L---------TSTIEIKETQED--EIILN---LNDL--NKSLGLNLN----------E----IKNINPNNFGDF---KYCLC----AIK-----------NTL---DYLNIEPKTGFKINISSKIPISCGLGSSASITIGTIKAVSGFYNK---------------E--------LKDDEIAKLGYMVEKEIQGKA-S------ITDTST-ITYK---GILEIKNNKFRK---I--KGEFE---EFLKNCK--FLIVYAEKRKKKTAE-LVNE-----------VA--KIE---------N-K-D-----E--------IFKEI---D-KVID-------EALKIKNKEDF-GKLMTKNH-ELLK-K--------LN--ISTP--------KLDRIVDIGNRFG-FGAKLTGAGGGGCVIILVN-EE-KE----KELLKELNK-E----D--VRIFNCRMMN----------------------
32 HHSearch 71.7418% -90 - C3 -2V8P ISPE_AQUAE A:[5-269] ----------IKVLSPAKINL----GLWVLG-----------RLPS--GYHEILT-LY---QEIP-F---------YDEIYIREGV-----LRVE---T-NI---------------------G----I----P--Q-EE---NLVYK----GLR-----------EFE---RITGI--EINYSIFIQKNIPPGAGLGGGSSNLAVVLKKVNELLGS---------------P--------LSEEELRELVGSIS--------A---------DAPFFLLG---KSAIGRGKGE--------VLEPV---ETEISGK--ITLVIPQVS-SSTGR-VYSS-----------LR--EEH---------F-V-------------------TP-EYA-EEKI-------QRIISGEVEEI-ENVLGDIA-R-----------------ELYP--------EINEVYRFVEYLG-FKPFVSGSG--STVYFFGG-AS-EE------LKKAAKM-R----G--WKVVELEL------------------------
45 Fugue 70.5616% -86 - C3 -1UEK - ISPE_THET8 A:[1-268] MERLAPAKVNLGLSVRFRRED----G----Y-----------H-----ELH---T-LF---APFS-L---------ADRLVVEP-V-S---SGLH---FQGP--Y-------G-------------------------RE---NLAYR----AAS-----------LYL---EAAGQ--PGGVRILLEKRIPEGAGLGGGSSDAAQVLLALQALYPA---------------E--------VDLFALARTL---------------------GADVPFFLL---G-RGAEARGVG----E--RLKPL---ALPP-VP--AVVFFPGLR-VPTPL-VYRA-----------VR--PED---------F-G-P-----D--------LPVEA-ILE-ALAR-------GEEPPYWNSLE-GPAFRL-----------------------FP--------ELKEVRGRMRALGLRGVLMSGSG--SAFFGLAEGPD-HA----RRAAEALRA-W----GRAWAGTLGGG------------------------
30 HHSearch 68.1119% -66 - C3 -1KVK KIME_RAT A:[6-381] ----------LLVSAPGKVIL----H----G-----------EHAVVHGKV---A-LA---VALN-L---------RTFLVLRPQSNG--KVSLN---LPNVGIKQV-----WDVATLQLLDT------E---KL-KKVA---GLPRD----CVGNEGLSLLAFLYLYLAICRKQRT--LPSLDIMVWSELPPGAGLGSSAAYSVCVAAALLTACEEVTNPLKDRGSIGSWPE--------EDLKSINKWAYEGERVIHGN--P------SGVDNSVSTWG---GALRYQQGKM----------SSL---KRLPALQ--ILLTNTKVP-RSTKA-LVAG-----------VR--SRL---------I-K-FPEIMAP--------LLTSI-DAISLECERVLGEMAAAPVPEQYLVL-EELMDMNQ-HHLN-A--------LG--VGHA--------SLDQLCQVTAAHG-LHSKLTGAGGGGCGITLLK-PG-LERAKVEAAKQALTG-C----G--FDCWETSIGAPGVSMHSA--------------
36 HHSearch 67.3913% -81 - C3 -3QT5 - ? A:[5-326] ----------GKARAHTNIAL----I----KYWGKADETYIIP-----MNN---S-LS---VTLD-RF--------YTETKVTFDP-DFTEDCLI---LNGN---------------------E----V----NA--KEK---EKIQN----YMN-----------IVR---DLAGN--RLHARIESENYVPTAAGLASSASAYAALAAACNEALSL---------------N--------LSDTDLSRLARRGS--------G---------SASRSIFG---GFAEWEKGHDD----LTSYAHGINSNGWEKDLSMIFVVINNQSK-K-SRS-GMSL-----------TR--DTS---------R-FYQ-----Y--------WLDHVDEDL-NEAK-------EAVKNQDFQRL-GEVIEANG-LRMHATNLGAQPPFTYLVQESY--------DAMAIVEQCRKANLPCYFTMDAG--PNVKVLVE-KK-NK----QAVMEQFLK-V----FDESKIIASDIISSGVEIIK---------------