@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : jhp_0447: (2015-12-15 )
MPSDLEKPTIIYPCVWDYRVIMTTNDTSVLKELLETYQRPFKLELKNTSKNAKFYSFNVSMEVSNEAERNEIFQKISQLEVVAHAL

Atome Classification :

(20 SA) ---.........10...--.....------------20--.....--...30........---40...--....--.50-.--.---.......60..--.----...-..70........80.....-------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) ---MPSDLEKPTIIYPC--VWDYR------------VI--MTTND--TSVLKELLETYQR---PFKLE--LKNT--SK--N--A---KFYSFNVSMEV--S----NEA-ERNEIFQKISQLEVVAHAL-------------------
1 PsiBlast_PDB 95.9086%-168 - C3 -2JOQ - Y495_HELPY A:[4-89] ---MPSDSKKPTIIYPC--LWDYR------------VI--MTTKD--TSTLKELLETYQR---PFKLE--FKNT--SK--N--A---KFYSFNVSMEV--S----NES-ERNEIFQKISQLDKVVQTL-------------------
35 Fugue 95.7286%-166 - C3 -2JOQ - Y495_HELPY A:[1-91] QGHMPSDSKKPTIIYPC--LWDYR------------VI--MTTKD--TSTLKELLETYQR---PFKLE--FKNT--SK--N--A---KFYSFNVSMEV--S----NES-ERNEIFQKISQLDKVVQTLGS-----------------
2 PsiBlast_PDB 89.7686%-138 - C3 -2H9Z - Y495_HELPY A:[1-86] ---MPSDSKKPTIIYPC--LWDYR------------VI--MTTKD--TSTLKELLETYQR---PFKLE--FKNT--SK--N--A---KFYSFNVSMEV--S----NES-ERNEIFQKISQLDKVVQTL-------------------
13 HHSearch 79.3676%-104 - C3 -2H9Z - Y495_HELPY A:[1-86] ---MPSDSKKPTIIYPC--LWDYR------------VI--MTTKD--T--STLKELL-ETYQRPFKLE--FKNT--SK--N--A---KFYSFNVSMEV--S----NES-ERNEIFQKISQLDKVVQTL-------------------
14 HHSearch 51.289% -58 - C3 -2KO1 - ? A:[6-74] --------------------AGIR------------IV--GEDKN--GMTNQITGVISKF---DTNIR--TIVL--NA--K--D---GIFTCNLMIFV--K----NTD-KLTTLMDKLRKVQGVFTVE-------------------
16 HHSearch 49.8612% -54 - C3 -2F1F ILVH_ECOLI A:[3-72] -------------------RRILS------------VL--LENES--GALSRVIGLFSQR---GYNIE--SLTV--AP--T--DDP-TLSRMTIQTVG-------DEK-VLEQIEKQLHKLVDVLRVS-------------------
10 PsiBlast_PDB 49.6327% -20 - C3 -2XCO - GYRB_STAAN A:[629-693] ------------------------------------II--STIRE--SDTDKVAMESLQQ---RFKLS--EKQA--QAILD--M---RLRRLTGLERD--K----IEA-EYNELLNYISELETILADE-------------------
17 HHSearch 48.419% -47 - C3 -2PC6 ? A:[4-74] -------------------RHIIS------------LL--MENEA--GALSRVAGLFSAR---GYNIE--SLSV--AP--TEDP---TLSRMTLVTNG--P----D-E-IVEQITKQLNKLIEVVKLI-------------------
11 PsiBlast_PDB 48.0027% -13 - C3 -2XCQ - A:[1394-1458] ------------------------------------II--STIRE--SDTDKVAMESLQQ---RFKLS--EKQA--QAILD--M---RLRRLTGLERD--K----IEA-EYNELLNYISELETI-----------------------
5 PsiBlast_PDB 47.4227% -15 - C3 -2XCS - GYRA_STAAN (first) B:[595-659] ------------------------------------II--STIRE--SDTDKVAMESLQQ---RFKLS--EKQA--QAILD--M---RLRRLTGLERD--K----IEA-EYNELLNYISELETILADE-------------------
7 PsiBlast_PDB 46.8427% -17 - C3 -4BUL - GYRA_STAAN (first) A:[595-659] ------------------------------------II--STIRE--SDTDKVAMESLQQ---RFKLS--EKQA--QAILD--M---RLRRLTGLERD--K----IEA-EYNELLNYISELETILADE-------------------
8 PsiBlast_PDB 46.5427% -17 - C3 -4PLB GYRA_STAAU (first) B:[595-659] ------------------------------------II--STIRE--SDTDKVAMESLQQ---RFKLS--EKQA--QAILD--M---RLRRLTGLERD--K----IEA-EYNELLNYISELETILADE-------------------
21 HHSearch 45.649% -65 - C3 -1Y7P - Y1403_ARCFU A:[5-76] --------------------RGLR------------II--AENKI--GVLRDLTTIIA-------NIT--FAQTFLIK--H--GEHEGKALIYF--EI--E----G-G-DFEKILERVKTFDYIIEIE-------------------
6 PsiBlast_PDB 45.2227% -18 - C3 -2XCT - GYRA_STAAN (first) B:[595-659] ------------------------------------II--STIRE--SDTDKVAMESLQQ---RFKLS--EKQA--QAILD--M---RLRRLTGLERD--K----IEA-EYNELLNYISELETILADE-------------------
36 Fugue 44.629% -53 - C3 -1RWU - YBED_ECOLI A:[1-87] ----MKTKLNELLEFPT--PFTYK------------VMGQALPEL--VDQVVEVVQRHAP---GDYTP--TVKP--SS--K--G---NYHSVSITINA--T----HIE-QVETLYEELGKIDIVRMVL-------------------
37 Fugue 44.5215%-108 - C3 -1KVV - SRP19_ARCFU A:[1-104] --------MKESVVWTV--NLDSKKSRAEGRRIPRRFA--VPNVK--LHELVEASKELGL---KFRAE-----E--KK--Y--P---KSWW-EEGGRV--VVEKR---------GTKTKLMIELARKIAEIREQKREQKKDKKKKKK
15 HHSearch 43.978% -56 - C3 -2FGC ? A:[27-99] ---------------IR--EHLVS------------ML--VHNKP--GVMRKVANLFARR---GFNIS--SITV--GE--S--ETP-GLSRLVIMVKG-------DDK-TIEQIEKQAYKLVEVVKVT-------------------
20 HHSearch 43.9611% -61 - C3 -2LQJ - ? A:[147-222] ----------------Q--PYQVR------------VI--CRPKAETYVRAHIVQRTSSN---DITLRGIRTGP--A---G--D---DNITLTAHLLMVGH----TPA-KLERLVAELSLQPGVYA---------------------
9 PsiBlast_PDB 43.7927% -23 - C3 -5BS3 GYRA_STAAU (first) B:[595-659] ------------------------------------II--STIRE--SDTDKVAMESLQQ---RFKLS--EKQA--QAILD--M---RLRRLTGLERD--K----IEA-EYNELLNYISELETILADE-------------------
26 HHSearch 41.689% -48 - C3 -1SC6 - SERA_ECOLI A:[322-400] ----------PEVSLPLHGGRRLM------------HI--HENRP--GVLTALNKIFAEQ---GVNIA--AQYL--QT--S--A---QMGY--VVIDI--E----ADEDVAEKALQAMKAIPGTIRAR-------------------