@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : jhp_0895: (2015-12-19 )
MEIAVFGGGAWGRALAFAFGEKNEVKIISRRDLNEPLKKLNDALISKGSAPIEQVDLERGLKAALYVIAISVQHLREWFQNASLPKNAKVLIASKGIEVLNKAFVSEIAKDFIDPNALCFLAGPSFAAEIIQGLPCALVIHSNNQALALEFANKTPSFIRAYAQQDIIGGEIAGAYKNVIAIAGGVCDGLKLGNSAKASLLSRGLVEMQRFGAFFGGKTETFLGLSGAGDLFLTANSILSRNYRVGLGLAQNKPLEVVLEELGEVAEGVKTTNAIVEIARKYGIYTPIASELALLLKGKSVLESMNDLIRRA

Atome Classification :

(20 SA) -------.........10........20------..-.-------.-...--..-30.--..-----...---------..--40------.------.---.-....---.-50----....--------....-60...-.-----....70........80-.-------.-------.----.---------------------.-....90..------......--100.--...--.....110..--------.--....120----------........130.......140.......150---..--.---.-.--.-..160.......170.......180.......------190.-----......200.......210.....---.---.220.......230.......240.......250.---.......260---.--..----.....270.......280.--.--.....290-....-...300........310-----------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -------MEIAVFGGGAWGRALAFAFG-------EK-N-------E-VKI--IS-RRD--LN-----EPL---------KK--LN------D------A---L-ISKG---S-AP----IEQV--------DLER-GLKAA-L-----YVIAISVQHLREWFQ--N-------A-------S----L---------------------P-KNAKVLIA------SKGIEV--L--N--KAF--VSEIAKDFID--------P--NALCFL-----------AGPSFAAEIIQGLPCALVIHSNNQALALEF----AN--K---T-P--S-FIRAYAQQDIIGGEIAGAYKNVIAIAGGVCDG------LKLG-----NSAKASLLSRGLVEMQRFGAFFGG---K---TETFLGLSGAGDLFLTANSILSRNYRVGLGLAQ-N---KPLEVVLEE----L--GE----VAEGVKTTNAIVEIARKYG--I--YTPIASEL-ALLL-KGKSV-LESMNDLIRRA-----------
1 PsiBlast_PDB 95.1839% -91 - C1 -1Z82 ? A:[19-325] -----------VLGAGSWGTVFAQMLH-------ENGE-------E-VIL--WA-RR----------------------KE--IV------D------L---INVSHT---S-PY----VEESKITVRATNDLEE-IKKED-I-----LVIAIPVQYIREHL-----------L-------R----L---------------------PVKPSMVLNL------SKGIEI--K--T--GKR--VSEIVEEILGC-------P--YAV--L-----------SGPSHAEEVAKKLPTAVTLAGENSK---EL----QK--RI--S-T--E-YFRVYTCEDVVGVEIAGALKNVIAIAAGILDG------FGGW-----DNAKAALETRGIYEIARFGMFFGA---D---QKTFMGLAGIGDLMVTCNSRYSRNRRFGELIAR-GF--NPLK-LLES----S--NQ----VVEGAFTVKAVMKIAKENK--I--DMPISEEVYRVVY-EGKPP-LQSMRDLMR-------------
21 PsiBlast_CBE 91.0032%-101 - C1 -1N1E GPDA_LEIME B:[20-343] -----------VFGSGAFGTALAMVLS-------KKCR-------E-VCVWHMN-EEE--VR-----LVN---------EK--RE------N------V---L-FLKG---V-QL----ASNITFTS----DVEK-AYNGAEI-----ILFVIPTQFLRGFFE--K-------SGGNLIAYA----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRLQRIMST--G---D-R--S-FV-CWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQRT----S--KA----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQIYEIVY-KKKNP-RDALADLLSCG-----------
5 PsiBlast_PDB 90.7132%-105 - C1 -1M66 GPDA_LEIME A:[20-343] -----------VFGSGAFGTALAMVLS-------KKCR-------E-VCVWHMN-EEE--VR-----LVN---------EK--RE------N------V---L-FLKG---V-QL----ASNITFTS----DVEK-AYNGAEI-----ILFVIPTQFLRGFFE--K-------SGGNLIAYA----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRLQRIMST--G---D-R--S-FV-CWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQR---------A----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQIYEIVY-KKKNP-RDALADLLSCG-----------
2 PsiBlast_PDB 90.6532%-109 - C1 -1EVY GPDA_LEIME A:[20-343] -----------VFGSGAFGTALAMVLS-------KKCR-------E-VCVWHMN-EEE--VR-----LVN---------EK--RE------N------V---L-FLKG---V-QL----ASNITFTS----DVEK-AYNGAEI-----ILFVIPTQFLRGFFE--K-------SGGNLIAYA----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRLQRIMST--G---D-R--S-FV-CWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQR---------A----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQIYEIVY-KKKNP-RDALADLLSCG-----------
8 PsiBlast_PDB 90.5932%-104 - C1 -1N1G GPDA_LEIME A:[20-343] -----------VFGSGAFGTALAMVLS-------KKCR-------E-VCVWHMN-EEE--VR-----LVN---------EK--RE------N------V---L-FLKG---V-QL----ASNITFTS----DVEK-AYNGAEI-----ILFVIPTQFLRGFFE--K-------SGGNLIAYA----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRLQRIMST--G---D-R--S-FV-CWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQR---------A----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQIYEIVY-KKKNP-RDALADLLSCG-----------
3 PsiBlast_PDB 90.4532%-108 - C1 -1EVZ GPDA_LEIME A:[20-343] -----------VFGSGAFGTALAMVLS-------KKCR-------E-VCVWHMN-EEE--VR-----LVN---------EK--RE------N------V---L-FLKG---V-QL----ASNITFTS----DVEK-AYNGAEI-----ILFVIPTQFLRGFFE--K-------SGGNLIAYA----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRLQRIMST--G---D-R--S-FV-CWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQR---------A----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQIYEIVY-KKKNP-RDALADLLSCG-----------
4 PsiBlast_PDB 89.9232%-105 - C1 -1JDJ GPDA_LEIME A:[20-343] -----------VFGSGAFGTALAMVLS-------KKCR-------E-VCVWHMN-EEE--VR-----LVN---------EK--RE------N------V---L-FLKG---V-QL----ASNITFTS----DVEK-AYNGAEI-----ILFVIPTQFLRGFFE--K-------SGGNLIAYA----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRLQRIMST--G---D-R--S-FV-CWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQR---------A----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQIYEIVY-KKKNP-RDALADLLSCG-----------
6 PsiBlast_PDB 89.9132%-105 - C1 -1M67 GPDA_LEIME A:[20-343] -----------VFGSGAFGTALAMVLS-------KKCR-------E-VCVWHMN-EEE--VR-----LVN---------EK--RE------N------V---L-FLKG---V-QL----ASNITFTS----DVEK-AYNGAEI-----ILFVIPTQFLRGFFE--K-------SGGNLIAYA----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRLQRIMST--G---D-R--S-FV-CWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQR---------A----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQIYEIVY-KKKNP-RDALADLLSCG-----------
7 PsiBlast_PDB 89.8332%-101 - C1 -1N1E GPDA_LEIME A:[20-343] -----------VFGSGAFGTALAMVLS-------KKCR-------E-VCVWHMN-EEE--VR-----LVN---------EK--RE------N------V---L-FLKG---V-QL----ASNITFTS----DVEK-AYNGAEI-----ILFVIPTQFLRGFFE--K-------SGGNLIAYA----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRLQRIMST--G---D-R--S-FV-CWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQRT----S--KA----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQIYEIVY-KKKNP-RDALADLLSCG-----------
28 HHSearch 89.7638% -78 - C1 -1Z82 ? A:[15-324] -------MRFFVLGAGSWGTVFAQMLH-------EN-G-------EEVIL--WA-RRK--EI-----VDL---------IN--VS------H------T---S-PYVEESKI-TV----RATN--------DLEE-IKKED-I-----LVIAIPVQYIREHLLR-L-------P----------------------------------V-KPSMVLNL------SKGIEI--K--T--GKR--VSEIVEEILG-----------CPYAVL-----------SGPSHAEEVAKKLPTAVTLAGENS---KEL----QK--R---IST--E-YFRVYTCEDVVGVEIAGALKNVIAIAAGILDG------FGGW-----DNAKAALETRGIYEIARFGMFFGA---D---QKTFMGLAGIGDLMVTCNSRYSRNRRFGELIAR-G---FNPLKLLES----S--NQ----VVEGAFTVKAVMKIAKENK--I--DMPISEEV-YRVV-YEGKPPLQSMRDLMR-------------
9 PsiBlast_PDB 89.3231% -98 - C1 -3K96 GPDA_COXBU A:[32-336] ---------IAILGAGSWGTALALVLA-------RK-G-------QKVRL--WSYESD--HV-----DEM---------QAEGVN------N------R---Y-LPNY---P-FP-----ETL--------KAYC-DLKAS-LEGVTDILIVVPSFAFHEVIT--R-------M-------K----P---------------------L-IDAKTRIAWGTKGLAKGSRL--L--H--EVV--ATELGQ---------------VPMAVI-----------SGPSLATEVAANLPTAVSLASNNSQFSKDL----IE--R---L-HG-Q-RFRVYKNDDMIGVELCGSVKNILAIATGISDG------LKLG-----SNARAALITRGLTEMGRLVSVFGG---K---QETLTGLAGLGDLVLTCTDNQSRNRRFGLALGE-G---VDKKEAQQA----I--GQ----AIEGLYNTDQVHALAQKHA--I--EMPLTFQV-HRIL-HEDLD-PQQAVQELLER-----------
22 PsiBlast_CBE 87.5431% -95 - C1 -3K96 GPDA_COXBU B:[32-336] ---------IAILGAGSWGTALALVLA-------RK-G-------QKVRL--WSYESD--HV-----DEM---------QAEGVN------N------R---Y-LPNY---P-FP-----ETL--------KAYC-DLKAS-LEGVTDILIVVPSFAFHEVIT--R-------M-------K----P---------------------L-IDAKTRIAWGTKGLAKGSRL--L--H--EVV--ATELGQ---------------VPMAVI-----------SGPSLATEVAANLPTAVSLASNNSQFSKDL----IE--R---L-HG-Q-RFRVYKNDDMIGVELCGSVKNILAIATGISDG------LKLG-----SNARAALITRGLTEMGRLVSVFGG---K---QETLTGLAGLGDLVLTCTDNQSRNRRFGLALGE-G---VDKKEAQQA----I--GQ----AIEGLYNTDQVHALAQKHA--I--EMPLTFQV-HRIL-HEDLD-PQQAVQELLER-----------
44 Fugue 87.2531%-101 - C1 -1EVY GPDA_LEIME A:[9-357] KDELLYLNKAVVFGSGAFGTALAMVLS-------KK-C-------R-EVC--VW-HMN---E-----EEV---------RL--VN------E------K---R-ENVL---F-LKGVQLASNI--------TFTS-DVEKA-YNGAEIILFVIPTQFLRGFFE--KSGGNLIAY-------A----K---------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRL----QR--IMSTG-D--R-SFVCWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQ---------RA----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQI-YEIVYKKKNP-RDALADLLSCGLQDEGLPPLFK
24 HHSearch 85.4132% -96 - C1 -1EVY GPDA_LEIME A:[16-343] -------NKAVVFGSGAFGTALAMVLS-------KK-C-------REVCV--WH-MNE--EE-----VRL---------VN--EK------RENVLFLK---G-VQLA---S-NI----TFTS--------DVEKAYNGAE-I-----ILFVIPTQFLRGFFEKSG-------G-------NLIAYAK--------------------E-KQVPVLVC------TKGIER--S--T--LKF--PAEIIGEFLP--------S--PLLSVL-----------AGPSFAIEVATGVFTCVSIASADINVARRL----QR--I---MSTGDR-SFVCWATTDTVGCEVASAVKNVLAIGSGVANG------LGMG-----LNARAALIMRGLLEIRDLTAALGG---D---GSAVFGLAGLGDLQLTCSSELSRNFTVGKKLGK-G---LPIEEIQR---------A----VAEGVATADPLMRLAKQLK--V--KMPLCHQI-YEIV-YKKKNPRDALADLLSCG-----------
26 HHSearch 83.8429% -87 - C1 -3K96 GPDA_COXBU A:[30-350] -------HPIAILGAGSWGTALALVLA-------RK-G-------QKVRL--WS-YES--DH-----VDE---------MQ--AEG-----VNNRYL-P---N-YPFP---E-TL----KAYC--------DLKASLEGVT-D-----ILIVVPSFAFHEVITRMK-------P-------L----I---------------------D-AKTRIAWG------TKGLAK--G--S--R-L--LHEVVATELG--------Q--VPMAVI-----------SGPSLATEVAANLPTAVSLASNNSQFSKDL----IE--R---LHG--Q-RFRVYKNDDMIGVELCGSVKNILAIATGISDG------LKLG-----SNARAALITRGLTEMGRLVSVFGG---K---QETLTGLAGLGDLVLTCTDNQSRNRRFGLALGE-G---VDKKEAQQA----I--GQ----AIEGLYNTDQVHALAQKHA--I--EMPLTFQV-HRIL-HEDLDPQQAVQELLERS-----------
10 PsiBlast_PDB 79.2227% -78 - C1 -2PLA GPD1L_HUMAN A:[6-317] -------LKVCIVGSGNWGSAVAKIIG----------N-------N-VKK--LQ-KFA--ST-----VKMWVFEETVNGRK--LT------D------I---I-NNDH------------ENV--------KYLP-GHKLP-E-----NVVAMS--NLSEAVQ--D-------A-------D----LLVFVIPHQFIHRICDEITGRVP-KKALGITL------IKGIDE--G--P--EGLKLISDIIREKMG--------I--D-ISVL-----------MGANIANEVAAEKFCETTIGSKVMENGLLF----KELLQ---T-P--N-F-RITVVDDADTVELCGALKNIVAVGAGFCDG------LRCG-----DNTKAAVIRLGLMEMIAFARIFCKGQVS---TATFLESCGVADLITTCYG--GRNRRVAEAFAR-TG--KTIEELEKE----MLNGQ----KLQGPQTSAEVYRILKQKG--L--LDKFPLFT-AVYQ-ICYES-RPVQEMLSCLQ-----------
27 HHSearch 78.3924% -92 - C1 -1TXG GPDA_ARCFU A:[1-333] -------MIVSILGAGAMGSALSVPLV-------DN-G-------NEVRI--WG-TEFDTEI-----LKS---------IS--AG------RE-----HPRLG-VKLN---GVEI----FWPE--------QLEKCLENAE-V-----VLLGVSTDGVLPVMSRIL-------P-------Y----L---------------------K--DQYIVLI------SKGLID--F--DNSVLT--VPEAVWRLKH--------DLRERTVAI-----------TGPAIAREVAKRMPTTVVFSSPSESSANKM----KE--I---FET--E-YFGVEVTTDIIGTEITSALKNVYSIAIAWIRG------YESRKNVEMSNAKGVIATRAINEMAELIEILGG---D---RETAFGLSGFGDLIATFRG--GRNGMLGELLGK-G---LSIDEAMEELERRG--VG----VVEGYKTAEKAYRLSSKIN--A--DTKLLDSI-YRVL-YEGLKVEEVLFELATFK-----------
25 HHSearch 77.1423% -85 * C1 *1X0V GPDA_HUMAN A:[9-349] -------KKVCIVGSGNWGSAIAKIVGGNAAQLAQF-D-------PRVTM--WV-FEE--DIGGKKLTEI---------IN--TQHENVKYL------P---G-HKLP---P-NV----VAVP--------DVVQAAEDAD-I-----LIFVVPHQFIGKICDQLK-------G-------H----L---------------------K-ANATGISL------IKGVDE--GPNG--LKL--ISEVIGERLG-----------IPMSVL-----------MGANIASEVADEKFCETTIGCKDPAQGQLL----KE--L---MQT--P-NFRITVVQEVDTVEICGALKNVVAVGAGFCDG------LGFG-----DNTKAAVIRLGLMEMIAFAKLFCS---GPVSSATFLESCGVADLITTCYG--GRNRKVAEAFARTG---KSIEQLEKELL--N--GQ----KLQGPETARELYSILQHKG--LVDKFPLFMAV-YKVC-YEGQPVGEFIHCLQNHP-----------
29 HHSearch 72.0921% -87 - C1 -1YJ8 - ? A:[22-366] -------LKISILGSGNWASAISKVVG-------TN-AKNNYLFENEVRM--WI-RDE--F-ERM--VDI---------IN--NKHENTKYL------K---G-VPLP---H-NI----VAHS--------DLASVINDAD-L-----LIFIVPCQYLESVLASIK-------E-------------IKI------------------A-SHAKAISL------TKGFIVKKN--Q--MKL--CSNYISDFLN-----------IPCSAL-----------SGANIAMDVAMENFSEATIGGNDKDSLVIW----QR--V---FDL--P-YFKINCVNETIEVEICGALKNIITLACGFCDG------LNLP-----TNSKSAIIRNGINEMILFGKVFFQKF-N---ENILLESCGFADIITSFLA--GRNAKCSAEFIK-STPKKTWEELENEIL--K--GQ----KLQGTVTLKYVYHMIKEKNMTN--EFPLFTVL-HKIS-FENEDPSSLLKTFMNNK-----------
14 PsiBlast_PDB 69.8526% -70 - C1 -1TXG GPDA_ARCFU A:[1-303] -------MIVSILGAGAMGSALSVPLV-------DNGN-------E-VRI--WG-TEF--DT-----EIL---------KS--I---------------------------S-AG----REHP--------RLGV-KLNG---------VEIFWPEQLEKCLE--N-------A-------E----VVLLGV----------------S-TDGVLPVM------SRILPY--L--K--DQY--IVLISKGLIDFDNSVLTVP--EAVWRLKHDLRERTVAITGPAIAREVAKRMPTTVVFSSPSESSANKM----KE--I---F-E--TEYFGVEVTTDIIGTEITSALKNVYSIAIAWIRGYESRKNVEMS-----N-AKGVIATRAINEMAELIEILGG---D---RETAFGLSGFGDLIATFRG--GRNGMLGELLGK-G---LSIDEAMEE----L--ERRGVGVVEGYKTAEKAYRLSSKIN--A--DTKLLDSI-YRVL-YEGLK-VEEVLFELATF-----------