@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : Lmo0135: (2016-03-12 )
MKKFLLVAVISVFALVLTACGGSGASSDKANGSGKAKDGGSLIIGVTGDPEVINPNYASDRVTLTIQQAVYAPLFWEVDGKPALAKSLDISDDNLTYTVKLKDGLTWHDGKPLTADDVVFTVNSILDTKQNSPNRGNFVFDDKPVKVEAVDDTTVKFTLPTVAPAFENTIKTFFPIPKHIFEGVENIEKSDKNKNPIGSGPYKFVEYKTGEYVSLERFNDYFDGKPKLDKVTFRITKDQNAANLALQNGEINLKSIQPSDRNKVEKASAVNIITYPENRLSYATFNENQPALKSKELRQALSYALDREEIIDAAYGSDEYAKPASSFLTENTKYFTDKVETYDQDIAKAKKLVKESGFDTSQKLTVYYLNNSKSQESIALYLQQQYKEIGVTLDLKPTDPNALSNITLDRKNADYSIALNGYIMGNDPDAYKSLYLSDAPYNYSNYHNKDLDALWEKGAVTADDKERQEIYEKIQNTIADDAVIYPISYDNAVLALDSRYGGQKAATPQPVTMFRDLSKLYLTE

Atome Classification :

(20 SA) .........10........20........30........40......--..50---......--.---.--60...-.-.--...70.--...---.---.-----------.--------.------80--.....---.-..90...-------------.....100.......110----.------.------.......120....----...130.-----------.--------------..---.--.---------------.-------140--------....-----....150----..---.......160-....-.--------..170--.-.-.---.------.-...180..--..----------.-----------..190------.-.-.-..--....200.......210.......220.-----.-.-----....230.......240.......250-..-.--.-..-.--260-...-...-.-..270..-------.....---280...-------------..-------------.-------.290.......300.......310...-....320....-...330....----..---------.-----.-340--..-..-.....350.......360----------.----------.------------.......----370--...----......380.-....-..390....----...400-...--.-----..------..---410...-....420--..--.-.-...430---.-..--.-..-----------.---------.440---.........450.....--..460-........470.......480.......490.......500.......-.510........520..-
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) MKKFLLVAVISVFALVLTACGGSGASSDKANGSGKAKDGGSLIIGVT--GDPE---VINPNY--A---S--DRVTL-T-I--QQAVYA--PLF---W---E-----------V--------D------GK--PALAK---S-LDISDDN-------------LTYTVKLKDGLTWHDG------K------P------LTADDVVFTVNSIL----DTKQNSP-----------N--------------RG---N--F---------------V-------FD---------DKPV-----KVEAV------DD---TTVKFTLPTV-APAF-E--------NTIK---T-F-F---P------I-PKHIFEGV--EN----------I-----------EKS--------D-K-N-KN--PIGSGPYKFVEYKTGEYVSLERFNDYFD-----G-K-----PKLDKVTFRITKDQNAANLALQNGEIN-LK-S--I-QP-S--D---RNK-VEK-A-SAVNIIT-------YPENR---LSYATF-------------NE-------------N-------QPALKSKELRQALSYALDREEIIDAAY-GSDEYAKPASS-FLTEN-TKYF----TD---------K-----V-E----TY-DQ-DIAKAKKLVKESGFDT------------S----------Q------------KLTVYYL----N----NSK----SQESIALYLQ-QQYK-EIGVTLDLK----PTDPN--ALS--N-----IT------LD---RKNADY-SIALNGY--IM--G-N-DPDAY----K-SL--Y-LS-----------D---------AP-----YNYSNYHNKDLDALWEK--GAVT--ADDKERQEIYEKIQNTIADDAVIYPISYDNAVLALDSRYG-GQKAATP-QP-VTMFRDLSKLYLTE-
1 PsiBlast_PDB 94.5532% -41 - C2 -1XOC APPA_BACSU A:[17-503] ----------------------------------KPQQGGDLVVGSI--GEPT---LFNSLY--S---T--DDAST-D-I--ENMLYS--FLTKTDE---K-----------L--------N------VK--LSLAE---S-IKELDGG-------------LAYDVKIKKGVKFHDG------K------E------LTADDVVFTYSVPL-----SKDYKG-----------E--------------RG---S--T---------------Y------------------EMLK-----SVEKK------GD---YEVLFKLKYK-DGNFYN--------NALD---S-T-A---I------L-PKHILGNVPIAD----------L-----------EEN--------E-F-NRKK--PIGSGPFKFKEWKQGQYIKLEANDDYFE-----G-R-----PYLDTVTYKVIPDANAAEAQLQAGDIN-FF-N--V-PA-T--D---YKT-AEK-F-NNLKIVT-------DLALS---YVYIGW-------------NE-------------K-------NELFKDKKVRQALTTALDRESIVSQVLDGDGEVAYIPES-PLSWN-YPKD----ID---------------V-P----KF-EY-NEKKAKQMLAEAGWKD------------T----------NGDGILDKDGKKFSFTLKTN----Q----GNK----VREDIAVVVQ-EQLK-KIGIEVKTQ----IVEWS--ALV--E------Q------MN---PPNWDF-DAMVMGW--SL--S-T-FPDQY----D-IF--H-SS-----------Q---------IKKG---LNYVWYKNAEADKLMKD--AKSI--SDRKQYSKEYEQIYQKIAEDQPYTFLYYPNNHMAMPENLE-GYK-----------------------
22 HHSearch 93.6231% -42 - C2 -1XOC APPA_BACSU A:[17-519] ----------------------------------KPQQGGDLVVGSI--GEPT---LFNSLY--S---T--DDAST-D-I--ENMLYS--FLT---K---T-----------D--------EK-----LNVKLSLAE---S-IKELDGG-------------LAYDVKIKKGVKFHDG------K------E------LTADDVVFTYSVPL----SKDYKGE-----------R--------------GS---T--Y---------------E-------ML---------K--------SVEKK------GD---YEVLFKLKYK-DGNF-Y--------NNALD--S-T-A---I------L-PKHILGNV--PIADLE------E-----------NEF--------N-R---KK--PIGSGPFKFKEWKQGQYIKLEANDDYFE-----G-R-----PYLDTVTYKVIPDANAAEAQLQAGDIN-FF-N--V-PA-T--D---YKT-AEK-F-NNLKIVT-------DLALS---YVYIGW-------------NE-------------K-------NELFKDKKVRQALTTALDRESIVSQVL-DGD--GEVAYI-PESPL-SWNY----PKDI-------D-----V-P----KF-EY-NEKKAKQMLAEAGWKDTNGDGILDKDGKK----------F------------SFTLKTN----Q----GNK----VREDIAVVVQ-EQLK-KIGIEVKTQ----IVEWS--ALV--E-----QM-------NP--PN-WDF-DAMVMGW--SL--S-T-FPDQ-----Y-DI--F-HSSQI--------K---------KG-----LNYVWYKNAEADKLMKD--AKSI--SDRKQYSKEYEQIYQKIAEDQPYTFLYYPNNHMAMPENLE-GYK---Y-HP-KRDLYNIEKWWLA--
21 HHSearch 88.5625% -49 - C2 -1UQW GSIB_ECOLI A:[23-508] -------------------------------------AAKDVVVAVG--SNFT---TLDPYD--A---N--DTLSQ-A-V--AKSFYQ--GLF---G---L-----------D--------KE-----MKLKNVLAE---S-YTVSDDG-------------ITYTVKLREGIKFQDG------T------D------FNAAAVKANLDRAS----DPANHLK-----------R--------------HN---L--Y---------------K-------NI---------A--------KTEAI------DP---TTVKITLKQP-FSAF-I--------NILAHP-A-T-A---M------I-SPAALEKY--G-----------------------KEI--------G-----FY--PVGTGPYELDTWNQTDFVKVKKFAGYWQ-----PGL-----PKLDSITWRPVADNNTRAAMLQTGEAQ-FA-FP-I-PY-E--Q---ATL-LEK-N-KNIELMA-------SPSIM---QRYISM-------------NV-------------T-------QKPFDNPKVREALNYAINRPALVKVAF-AGY--ATPATG-VVPPS-IAYA-----Q---------S-----Y-K----PW-PY-DPVKARELLKEAGYPN------------G----------F------------STTLWSS----H----NHS----TAQKVLQFTQ-QQLA-QVGIKAQVT----AMDAG--QRA--A-----EV------EGKGQKE-SGV-RMFYTGW--SA--STG-EADWA----LSPL--F-AS-----------QNWPP-----TL-----FNTAFYSNKQVDDFLAQ--ALKT--NDPAEKTRLYKAAQDIIWQESPWIPLVVEKLVSAHSKNLT-GFW---I-MP-DTGF-SFEDADL---
27 HHSearch 86.3823% -39 - C2 -1JET OPPA_SALTY A:[9-516] -----------------------------------LADKQTLVRNNG--SEVQ---SLDPHK--I---E--GVPES-N-V--SRDLFE--GLL---I---S-----------D--------VE-----GHPSPGVAE---K-WEN-KDF-------------KVWTFHLRENAKWSDG------T------P------VTAHDFVYSWQRLA----DPNTASP-----------Y--------------AS---YLQYGHIANIDDIIAGKKPA-------TD---------L--------GVKAL------DD---HTFEVTLSEP-VPYF-Y--------KLLVHP-S-V-S---P------V-PKSAVEKF--GD-----------------------KW--------T-Q-P-AN--IVTNGAYKLKNWVVNERIVLERNPQYWD-----NAK-----TVINQVTYLPISSEVTDVNRYRSGEID-MT-YNNM-PI-E--L---FQK-LKK-E-IPNEVRV-------DPYLC---TYYYEI-------------NN-------------Q-------KAPFNDVRVRTALKLALDRDIIVNKVK-NQG--DLPAYS-YTPPY-TDGA----KL---------V-----EPEWFKWSQ-QK-RNEEAKKLLAEAGFTA------------DKP--------L------------TFDLLYN----T----S-D----LHKKLAIAVA-SIWKKNLGVNVNLE----NQEWK--TFL--D-----TR-------H----Q-GTF-DVARAGW--CA--DYN-EPTSF----L-NT--M-LS-----------D---------SS-----NNTAHYKSPAFDKLIAD--TLKV--ADDTQRSELYAKAEQQLDKDSAIVPVYYYVNARLVKPWVG-GYT---GKDP-LDNI-YVKNLYIIK-
2 PsiBlast_PDB 85.7926% -45 - C2 -1UQW GSIB_ECOLI A:[23-485] ----------------------------------AAKD---VVVAVG--SNFT---TLDPYD--A---N--DTLSQ-A-V--AKSFYQ--GLF---GLDKE-----------M--------K------LK--NVLAE---S-YTVSDDG-------------ITYTVKLREGIKFQDG------T------D------FNAAAVKANLDRAS----DPA-NHL-----------K--------------RH---N--L---------------Y------------------KNIA-----KTEAI------DP---TTVKITLKQP-FSAF-I--------NILA---H----------------PATAMISP--AA----------L-----------EKY--------G-K-E-IGFYPVGTGPYELDTWNQTDFVKVKKFAGYWQP----G-L-----PKLDSITWRPVADNNTRAAMLQTGEAQ-FA-F--P-IP-Y--E---QATLLEK-N-KNIELMA-------SPSIM---QRYISM-------------NV-------------T-------QKPFDNPKVREALNYAINRPALVKVAF-AG--YATPATG-VVPPS-IAY-----AQ---------S-----Y-K----PW-PY-DPVKARELLKEAGYPN------------G----------F------------STTLWSS----H----NHS----TAQKVLQFTQ-QQLA-QVGIKAQVT----AMDAGQRAAE--V-----EG------KG---QKESGV-RMFYTGWSAST--G-E-ADWAL----S-PL--F-ASQ----------N---------WPPTL--FNTAFYSNKQVDDFLAQ--ALKT--NDPAEKTRLYKAAQDIIWQESPWIPLVVEKLVSA---------------------------------
23 HHSearch 85.7524% -45 - C2 -3TPA - ? A:[8-513] ---------------------------------------NTLVNCIA--TAPM---KLSPAI--T---N--DANDF-NAS--SQQVYN--RLV---E---F-----------K--------AGK----IEVEPGLAE---R-WEISEDG-------------LVYTFYLRQNVKFHSNKTFSPTR------P------LNADDVVFSFQRQA----DKNHPYHNVSAGTYFYFNW--------------MN---L--P---------------S-------IL---------K--------SVEKV------DD---YTVKITLNKP-NTPF-I--------TTVAMD-F-L-S---I------Y-SKEYADQL--LA----------Q-----------GKP--------E-T-LDQQ--PIGTGPFIFQTNQTDHAVRYTANVDYWK-----G-K-----ADIERLIFSITPDAGTRYAKLKAGECD-VI-DF-P-NI-S--D---IAQ-MKK-D-PQINLLE-------REGLN---LAYIGL-------------NT-------------T-------KPELNNVKVRQALHHATDKKAIVDAVY-QGG--GTVATN-PFPDA-VLGY----NP---------H-----L-P----QY-EF-NLEKAKALLAEAGYPN------------G----------F------------ETEIWVQPVVRP----SNP----NPRRTAEIIQ-ADWA-KIGVKAKLV----THEWA--DFN--K-----RT-------R----E-GEF-AAGTYGW--TS--RNG-DPDNF----LFPL--F-SQ-----------ANI-------PG-----TNYSRWTDEKFEALLAS--AAQI--QDTQTRAKLYQQAVEIFQQNSPIIPFAHSINYVPLNKRVQ-GFV---Q-NP-FGYT-AFYGVSLK--
25 HHSearch 85.6725% -45 * C2 *1DPE DPPA_ECOLI A:[1-507] ---------------------------------------KTLVYCSE--GSPE---GFNPQL--F---I--SGTTYDA-S--SVPLYN--RLV---E---F-----------K--------IGT----TEVIPGLAE---K-WEVSEDG-------------KTYTFHLRKGVKWHDN------KEFKPTRE------LNADDVVFSFDRQK----NAQNPYHKVSGGSYEY--FEG------------MG---L--P---------------E-------LI---------S--------EVKKV------DD---NTVQFVLTRP-EAPF-L--------ADLAMD-F-A-S---I------L-SKEYADAM--MK----------AGTP--------EKL--------D-----LN--PIGTGPFQLQQYQKDSRIRYKAFDGYWG-----T-K-----PQIDTLVFSITPDASVRYAKLQKNECQ-VM-PY-P-NP-A--D---IAR-MKQ-D-KSINLME-------MPGLN---VGYLSY-------------NV-------------Q-------KKPLDDVKVRQALTYAVNKDAIIKAVY-QGA--GVSAKN-LIPPT-MWGY----ND---------D-----V-Q----DY-TY-DPEKAKALLKEAGLEK------------G----------F------------SIDLWAM----PVQRPYNP----NARRMAEMIQ-ADWA-KVGVQAKIV----TYEWG--EYL--K-----RA-------K----D-GEH-QTVMMGW--TG--DNG-DPDNF----FATE--F-SCAAS--------E---------QG-----SNYSKWCYKPFEDLIQP--ARAT--DDHNKRVELYKQAQVVMHDQAPALIIAHSTVFEPVRKEVK-GYV---V-DP-LGKH-HFENVSIE--
6 PsiBlast_PDB 82.4427% -36 - C2 -4ZE8 ? A:[6-456] ----------------------------------------ALRLGVN--GLPN---SLEPVN--A---I--SNVGP-R-I--VNQIFD--TLI---A---RDFFAKGAPGNAI--------D------LV--PALAE---S-WERIDEK--------------SVRFKLRQKVMFHDG------V------E------LTADDVAYTFSSERLWGPEAIKKIP-----------L--------------GK---S--Y---------------S-------LDF--------DEPV------VE--------DK---YTV--TLRTK-TPSY-----------LIE---T-F-V---ASWMSRIV-PKEYYKKL--GA----------V-----------DFG--------N-K-------PVGTGPYKFVEFVAGDRVVLEANDAYWG-----P-K-----PTASKITYQIVAEPATRVAGLISGEYDIIT-T--L-TP-D--D---IQL-INS-Y-PDLETRG-------TLIEN---FHMFTF-------------NM-------------N-------QEVFKDKKLRRALALAVNRPIMVEALW--KKQASIPAGF-NFPNY-GETF----DP---------K-----R-K----AM-EY-NVEEAKRLVKESGYDG------------T-----------------------PITYHTM----G----NYY----ANAMPALMMMIEMWK-QIGVNVVMK----TYAPG--SFPPDN-----QT------WM---RNWS-------NGQ--WM--T-----DAY----A-TI--V-PE-----------F---------GPNGQVQKRWGWKAPAEFNELCQK--VTVL--PNGKERFDAYNRMRDIFEEEA----------------------------------------------