@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : Lmo1629: (2016-03-27 )
MIVKICGLKKAVDVAAAVENGADMIGFVFAKSKRQVTVDEAHELAKNIPAGVKKVGVFVNPTEEELTAAIKGVPLDIVQLHGQEPAEQANRTDAEVIKAFPVKDGKLPDNINDYPNAYILLDAPAEEYEGGSGKTFDWDKIDRDLLTKNKLIIAGGLNAQNVQEAIKRFEPYAVDISSGVETNGEKDPQKIKCFIKTAKGVE

Atome Classification :

(20 SA) .........10.------.......20........-30--.--.--.--.-.-....40.-----.......50........60........70........80-...------..-----.---.---.90---.---.---.------.--.----..--..100------.....-....110---.--.--.-....120....-...130.-..---.---.---..140-.....-.-----..-150.......160.......170.......180.-.-......190.......200
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) MIVKICGLKKAV------DVAAAVENGADMIGFVF-A---K--S--K--R-Q-VTVDEAH-----ELAKNIPAGVKKVGVFVNPTEEELTAAIKGVPLDIVQLH-GQE------PA-----E---Q---AN----R---T---D------A--E----VI--KAF--------PVKDG-KLPDNIN---D--Y--P-NAYILLDAPAE-EYEGGSG-KT---F---D---WDKI--DRDLL-T-----KN-KLIIAGGLNAQNVQEAIKRFEPYAVDISSGV-ET-N-GEKDPQKIKCFIKTAKGVE
2 PsiBlast_PDB 97.0544% -97 - C4 -1NSJ TRPF_THEMA A:[4-205] --VKICGITNLE------DALFSVESGADAVGFVFYP---K--S--K--R-Y-ISPEDAR-----RISVELPPFVFRVGVFVNEEPEKILDVASYVQLNAVQLH-GEE------PI-----E---L---CR----K---I---A------E--RIL--VI--KAV--------GVSNE-RDMERAL---N--Y--R-EFPILLDTKTP-EY-GGSG-KT---F---D---WSLILPYRDRF--------R-YLVLSGGLNPENVRSAIDVVRPFAVDVSSGV-EAFP-GKKDHDSIKMFIKNAKGL-
18 HHSearch 95.4544% -92 - C4 -1NSJ TRPF_THEMA A:[2-204] VRVKICGITNLE------DALFSVESGADAVGFVF-YP--K--S--K--R-Y-ISPEDAR-----RISVELPPFVFRVGVFVNEEPEKILDVASYVQLNAVQLH-GEE------PI-----E---L---CR----K---I---AER----I--L----VI--KAV--------GVSNE-RDMERAL---N--Y--R-EFPILLDTKT--PEYGGSG-KT---F---D---WSLI--LPYR--D-----RFRYLVLSGGLNPENVRSAIDVVRPFAVDVSSGV-EAFP-GKKDHDSIKMFIKNAKG--
1 PsiBlast_PDB 92.5244%-104 - C4 -1LBM TRPF_THEMA A:[4-205] --VKICGITNLE------DALFSVESGADAVGFVFYP---K--S--K--R-Y-ISPEDAR-----RISVELPPFVFRVGVFVNEEPEKILDVASYVQLNAVQLH-GEE------PI-----E---L---CR----K---I---A------E--RIL--VI--KAV--------GVSNE-RDMERAL---N--Y--R-EFPILLDT-----------------F---D---WSLILPYRDRF--------R-YLVLSGGLNPENVRSAIDVVRPFAVDVSSGV-EAFP-GKKDHDSIKMFIKNAKGL-
17 PsiBlast_CBE 89.1843%-102 - C4 -1DL3 TRPF_THEMA B:[4-203] --VKICGITNLE------DALFSVESGADYVGFVF-YP--K--S--K--R-Y-ISPEDAR-----RISVELP--VERVGVFVNEEPEKILDVASYVQLNAVQLH-GEE------PI-----E---L---CR----K---I---A------E--R----ILVWKAV--------GVSNE-RDMERAL---N--Y--R-EFPILLDTKT---------------F---D---WSLILPYRDRF--------R-YLVLSGGLNPENVRSAIDVVRPFAVDVSSGV-EAFP-GKKDHDSIKMFIKNAKGL-
3 PsiBlast_PDB 87.7843% -99 - C4 -1DL3 TRPF_THEMA A:[4-203] --VKICGITNLE------DALFSVESGADYVGFVF-YP--K--S--K--R-Y-ISPEDAR-----RISVELP--VERVGVFVNEEPEKILDVASYVQLNAVQLH-GEE------PI-----E---L---CR----K---I---A------E--R----ILVWKAV--------GVSNE-RDMERAL---N--Y--R-EFPILLDT---------------------D---WSLILPYRDRF--------R-YLVLSGGLNPENVRSAIDVVRPFAVDVSSGV-EAFP-GKKDHDSIKMFIKNAKGL-
19 HHSearch 84.8035% -79 - C4 -1V5X - ? A:[1-199] MRVKICGITRLE------DALLAEALGAFALGFVL-AP--G--S--R--R-R-IAPEAAR-----AIGEALGPFVVRVGVFRDQPPEEVLRLMEEARLQVAQLH-GEE------PP-----E---W---AE----A---V---GRF----Y--P----VI--KAF--------PLEGP-ARP-EWA---D--Y--P-AQALLLDGK-----RPGSG-EA---Y---P---RAWA--KPLL--A-----TGRRVILAGGIAPENLEEVLA-LRPYALDLASGV-EEAP-GVKSAEKLRALFARLASL-
6 PsiBlast_PDB 83.7531% -82 - C4 -4WUI ? A:[4-204] MYIKVCGLTDPH------AIDAAQAAHVDAIGFVH-AP--T--S--P--R-H-LTPPHIS-----TLTATVDCTIDTVLVVATTPIADALALAESTGVSVLQLH-GQY------SD-----D---D---VA----Y---A---A------A--R----FP--RVW--------RATSL-SASPNLTVG-A--Y--G-EELLLLDAP-----QAGSG-HT---W---D---FAAL--AHRRP-T------G-RWLLAGGLTPDNVADAITTTSPWGVDVSSGV-ES-APGVKDPAKIAAFVQAARGVS
4 PsiBlast_PDB 83.5334% -82 - C4 -1V5X - ? A:[1-193] MRVKICGITRLE------DALLAEALGAFALGFVL-A---PG-S--R--R-R-IAPEAAR-----AIGEALGPFVVRVGVFRDQPPEEVLRLMEEARLQVAQLH-GEE------PP-----E---W---AE----A---V---G------RFYP----VI--KAF--------PLEGP-ARPE-WA---D--Y--P-AQALLLDG-----KRPGSG-EA---Y---P---RAWA--KPLLA-T-----GR-RVILAGGIAPENLEEVLA-LRPYALDLASGVEEA-P-GVKSAEKLRALF-------
5 PsiBlast_PDB 80.8935% -89 - C4 -4AAJ TRPF_PYRFU A:[21-226] MFVKICGIK-SL------EELEIVEKHADATGVVVNS---N--S--K--R-R-IPLEKAR-----EIIENSAIPVFLVSTMVGFSEWAM--AIERTGAQYIQVH-SNA------LP-----Q---T---ID----T---L---K------K--EFGVFVM--KAFRVPTISKNPEEDANRLLSEIS---R--Y--N-ADMVLLDT-----------------H---D---L-RV--SSLVA-R-----KI-PVIVAGGLNAENVEEVIKVVKPYGVDVSSGV-EK-Y-GIKDPKLVEEFVRRAKNV-
20 HHSearch 80.5731% -84 - C4 -1PII TRPC_ECOLI A:[256-451] -ENKVCGLTRGQ------DAKAAYDAGAIYGGLIF-VA--T--S--P--R-C-VNVEQAQ-----EVMAAA--PLQYVGVFRNHDIADVVDKAKVLSLAAVQLH-GNE------EQ-----L---Y---ID----T---L---REALPAHV--A----IW--KAL--------SVGET-LP---AR---E--F--QHVDKYVLDNG-----QGGSG-QR---F---D---WSLL--NGQS--------LG-NVLLAGGLGADNCVEAAQ-TGCAGLDFNSAV-ESQP-GIKDARLLASVFQTLRA--
7 PsiBlast_PDB 79.6531% -75 - C4 -1PII TRPC_ECOLI A:[258-451] ---KVCGLTRGQ------DAKAAYDAGAIYGGLIFVA---T--S--P--R-C-VNVEQAQ-----EVMAAAP--LQYVGVFRNHDIADVVDKAKVLSLAAVQLH-GNEEQLYIDTL-----R---E---AL----P---A---H------V--A----IW--KAL--------SVGE--TLPAREF---Q--H--V-DKYVL-----D-NGQGGSG-QR---F---D---WSLL--NGQSL--------G-NVLLAGGLGADNCVEAAQT-GCAGLDFNSAV-ES-QPGIKDARLLASVFQTLRA--
8 PsiBlast_PDB 57.8939%-111 - C4 -2KZH - A:[5-84] ---KVCGLTRGQ------DAKAAYDAGAIYGGLIFVA---T--S--P--R-C-VNVEQAQ-----EVMAAAP--LQYVGVFRNHDIADVVDKAKVLSLAAVQLH-GNE-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
27 HHSearch 54.7217% -58 - C4 -1RPX RPE_SOLTU A:[26-228] ----------GE------QVKAIEQAGCDWIHVDV-MD--G--RFVPN-I-T-IGPLVVD-----SLRPITD-LPLDVHLMIVEP-DQRVPDFIKAGADIVSVHCEQS------STIHLH-R---T---IN----QIKSL---G------A--K----AG--VVL--------NPGTP-LT--AIE---YVLD--A-VDLVLIMSVN----PGFGG-QS---FIESQ---VKKI--SDLRK-ICAERGLNPWIEVDGGVGPKNAYKVIEA-GANALVAGSAV-FGAP-DY--AEAIKGIKTSKR---
24 HHSearch 53.4714% -39 - C4 -1TQX ? A:[22-222] -----------E------ETQRMESLGAEWIHLDV-MD--MHFV--PN-L-S-FGPPVIN-----NLKKYTKSIFFDVHLMVEYPEKYVPLL---KTSNQLTFH-FEA------LN-----E---DTERCIQLAKEIRDN---N------L--W----CG--ISI--------KPKTD---VQKLVPILD--TN-L-INTVLVMTVEP----GFGG-QS---F---MHDMMGKV--SFLRK-KY----KNLNIQVDGGLNIETTEISASH-GANIIVAGTSI-FNAE-DP--KYVIDTMRVSVQ---
21 HHSearch 53.0015% -64 - C4 -1XI3 THIE_PYRFU A:[15-212] --LKLYVITDRRLKPEVESVREALEGGATAIQMRI-KN--A--P--T--R-E-M-YEIGK-----TLRQLTR-E-YDALFFVDDRV----DVALAVDADGVQLG-PED------MPI----E---V---AK----E---I---APN----L--I----IG--ASV--------Y--SL-EEALEAE---K--K--G-ADYLGAGSVFP-T-----DARV---I---G---LEGL--RKIVE-S-----VKIPVVAIGGINKDNAREVLKT-GVDGIAVISAV-MGAE-DV--RKATEELRKIVEE--
15 PsiBlast_PDB 51.5232% -87 - C4 -4DI9 PDCH_SPHPI A:[111-198] ------------------ELAALHEGGMRGIRFNF-L---K--R----------LVDDAPKDKFLEVAGRLPAGWHVVIYFEADILEELRPFMDAIPVPIVIDH-MGR------PD-----V---R---QG--------P---D------G--A----DM--KAF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
29 HHSearch 51.2315% -60 - C4 -1TQJ - RPE_SYNY3 A:[21-222] -----------E------EIKAVDEAGADWIHVDV-MD--G--RFVP--NIT-IGPLIVD-----AIRPLT-KKTLDVHLMIVEP-EKYVEDFAKAGADIISVH-VEH------NASPHLHR---T---LC----Q---IRELG------K--K----AG--AVL--------NPST---PLDFLE---Y--VLPV-CDLILIMSVNP---------QSFIPE---V---LPKI--RALRQ-MCDERGLDPWIEVDGGLKPNNTWQVLEA-GANAIVAGSAV-FNAP-NY--AEAIAGVRNSKR---
14 PsiBlast_PDB 51.0232% -87 - C4 -4DI8 PDCH_SPHPI A:[111-198] ------------------ELAALHEGGMRGIRFNF-L---K--R----------LVDDAPKDKFLEVAGRLPAGWHVVIYFEADILEELRPFMDAIPVPIVIDH-MGR------PD-----V---R---QG--------P---D------G--A----DM--KAF----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
28 HHSearch 50.2913% -69 - C4 -2TPS THIE_BACSU A:[37-205] -------------------VQKALKGGATLYQFRE-KG--G--D--ALTG-E-ARIKFAE-----KAQAACR--EAGVPFIVNDDV----ELALNLKADGIHIG-QED------ANA----K---E---VR----A---AIG-D------M--I----LG--VSA--------H--TM-SEVKQAE---E--D--G-ADYVGLGPIYPTETKKDTR-AV---Q---G---VSLI--EAVRRQG-----ISIPIVGIGGITIDNAAPVIQA-GADGVSMISAI-SQ----------------------
30 HHSearch 49.9420% -49 - C4 -3INP ? A:[45-244] ------------------DVKAVLAAGADNIHFDV-MDNHY--V--P--N-LTFGPMVLK-----ALRDYGITAGMDVHLMVKPV-DALIESFAKAGATSIVFH-PEA------SE-----HIDRS---LQ----LIKSF---G------I--Q----AG--LAL--------NPATG---IDCLK---Y--VESN-IDRVLIMSVNP----GF---QK---F---IPAMLDKA--KEISK-WISSTDRDILLEIDGGVNPYNIAEIAVC-GVNAFVAGSAI-FNSD-SYK--QTIDKMRDELN---