Atome 2 Filter

@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]

Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : Rv1411c: (2016-05-01 )
MRTPRRHCRRIAVLAAVSIAATVVAGCSSGSKPSGGPLPDAKPLVEEATAQTKALKSAHMVLTVNGKIPGLSLKTLSGDLTTNPTAATGNVKLTLGGSDIDADFVVFDGILYATLTPNQWSDFGPAADIYDPAQVLNPDTGLANVLANFADAKAEGRDTINGQNTIRISGKVSAQAVNQIAPPFNATQPVPATVWIQETGDHQLAQAQLDRGSGNSVQMTLSKWGEKVQVTKPPVS

Atome Classification :

	(20 SA)									.........--------10........20.....---...30........40........50.-.......60.......---.-70-.-.......80--.....---...--------90...-------...--.---.--100----.....-----..110....-------.-..120.......130.-.----------------------------.....140-.----.....---.150..---.....160------------........170..-----------......180..-.-..-----------..190.......-200-----.------.....--..-210-..-....-------.220---.......-..230-.....---------
		(Atome)	(Ident)	(Tito)	(Num)		(Ligand)	(Uniprot)		MRTPRRHCR--------RIAVLAAVSIAATVVAG---CSSGSKPSGGPLPDAKPLVEEATAQT-KALKSAHMVLTVNGKI---P-GL-S-LKTLSGDLT--TNPTA---ATG--------NVKLT-------LGG--S---D--IDA----DFVVF-----DGILYATLT-------P-NQWSDFGPAADIYDPA-Q----------------------------VLNPDTGL-A----NVLAN---FADAKA---EGRDTIN-------------GQNTIRISG-KVS-----------AQAVNQIAPPF-N-AT-----------QPVPATVWIQET-GD------H------QLAQA--QL-DRG-SG-NSVQ-------MT-----LSKWGEK-VQVT--KPPVS---------
73	Fugue	98.30	99%	-96	- C6 -	3MH9	-	LPRG_MYCTU	A:[35-239]	---------------------------------------------GGPLPDAKPLVEEATAQT-KALKSAHMVLTVNGKI---P-GL-S-LKTLSGDLT--TNPTA---ATG--------NWKLT-------LGG--S---D--IDA----DFVVF-----DGILYATLT-------P-NQWSDFGPAADIYDPA-Q----------------------------VLNPDTGL-A----NVLAN---FADAKA---EGRDTIN-------------GQNTIRISG-KVS-----------AQAVNQIAPPF-N-AT-----------QPVPATVWIQET-GD------H------QLAQA--QL-DRG-SG-NSVQ-------MT-----LSKWGEK-VQVT--KPPVSKLH------
1	PsiBlast_PDB	97.84	99%	-97	- C6 -	3MH9	-	LPRG_MYCTU	C:[34-236]	--------------------------------------------SGGPLPDAKPLVEEATAQT-KALKSAHMVLTVNGKI---P-GL-S-LKTLSGDLT--TNPTA---ATG--------NWKLT-------LGG--S---D--IDA----DFVVF-----DGILYATLT-------P-NQWSDFGPAADIYDPA-Q----------------------------VLNPDTGL-A----NVLAN---FADAKA---EGRDTIN-------------GQNTIRISG-KVS-----------AQAVNQIAPPF-N-AT-----------QPVPATVWIQET-GD------H------QLAQA--QL-DRG-SG-NSVQ-------MT-----LSKWGEK-VQVT--KPPVS---------
8	HHSearch	97.20	99%	-100	- C6 -	3MH9	-	LPRG_MYCTU	C:[36-236]	----------------------------------------------GPLPDAKPLVEEATAQT-KALKSAHMVLTVNGKI---P-GL-S-LKTLSGDLT--TNPTA---ATG--------NWKLT-------LGG--S---D--IDA----DFVVF-----DGILYATLT-------P-NQWSDFGPAADIYDPA-Q----------------------------VLNPDTGL-A----NVLAN---FADAKA---EGRDTIN-------------GQNTIRISG-KVS-----------AQAVNQIAPPF-N-AT-----------QPVPATVWIQETGD-------H------QLAQA--QL-DRG-SG-NSVQ-------MT-----LSKWGEK-VQVT--KPPVS---------
4	PsiBlast_PDB	95.87	100%	-102	- C6 -	4ZRA		?	A:[8-203]	----------------------------------------------GPLPDAKPLVEEATAQT-KALKSAHMVLTVNGKI---P-GL-S-LKTLSGDLT--TNPTA---ATG--------NVKLT-------LGG--S---D--IDA----DFVVF-----DGILYATLT-------P-NQWSDFGPAADIYDPA-Q----------------------------VLNPDTGL-A----NVLAN---FADAKA---EGRDTIN-------------GQNTIRISG-KVS-----------AQAVNQIAPPF-N-AT-----------QPVPATVWIQET-GD------H------QLAQA--QL-DRG-SG-NSVQ-------MT-----LSKWGEK-VQVT----------------
2	PsiBlast_PDB	95.71	100%	-103	- C6 -	3MH8	-	LPRG_MYCTU	A:[36-231]	----------------------------------------------GPLPDAKPLVEEATAQT-KALKSAHMVLTVNGKI---P-GL-S-LKTLSGDLT--TNPTA---ATG--------NVKLT-------LGG--S---D--IDA----DFVVF-----DGILYATLT-------P-NQWSDFGPAADIYDPA-Q----------------------------VLNPDTGL-A----NVLAN---FADAKA---EGRDTIN-------------GQNTIRISG-KVS-----------AQAVNQIAPPF-N-AT-----------QPVPATVWIQET-GD------H------QLAQA--QL-DRG-SG-NSVQ-------MT-----LSKWGEK-VQVT----------------
3	PsiBlast_PDB	95.54	100%	-102	- C6 -	3MHA		LPRG_MYCTU	A:[8-202]	----------------------------------------------GPLPDAKPLVEEATAQT-KALKSAHMVLTVNGKI---P-GL-S-LKTLSGDLT--TNPTA---ATG--------NVKLT-------LGG--S---D--IDA----DFVVF-----DGILYATLT-------P-NQWSDFGPAADIYDPA-Q----------------------------VLNPDTGL-A----NVLAN---FADAKA---EGRDTIN-------------GQNTIRISG-KVS-----------AQAVNQIAPPF-N-AT-----------QPVPATVWIQET-GD------H------QLAQA--QL-DRG-SG-NSVQ-------MT-----LSKWGEK-VQV-----------------
7	HHSearch	74.22	30%	-89	- C6 -	4QA8		LPRF_MYCBO	A:[20-229]	-------------------------------------------G--SPSPEAQQILQDSSKAT-KGLHSVHVVVTVNN-L---S-TL-P-FESVDADVT--NQPQGNGQAVG--------NAKVR-------MKPNTP---V--VAT----EFLVT-----NKTMYTKRG---------GDYVSVGPAEKIYDPG-I----------------------------ILDKDRGL-G----AVVGQ---VQNPTI---QGRDAID-------------GLATVKVSG-TID-----------AAVIDPIVPQL-GKGG-----------GRLPITLWIVDT-NASTPAPAA------NLVRM--VI-DKD--Q-GNVD-------IT-----LSNWGAP-VTIP--NPAG----------
5	PsiBlast_PDB	73.95	30%	-97	- C6 -	4QA8		LPRF_MYCBO	A:[25-227]	--------------------------------------------------EAQQILQDSSKAT-KGLHSVHVVVTVN-NL---S-TL-P-FESVDADVT--NQPQGNGQAVG--------NAKVR-------MKP--N---TPVVAT----EFLVT-----NKTMY-TKR-------G-GDYVSVGPAEKIYDPG-I----------------------------ILDKDRGL-G----AVVGQ---VQNPTI---QGRDAID-------------GLATVKVSG-TID-----------AAVIDPIVPQLGK-GG-----------GRLPITLWIVDT-NA------STPAPAANLVRM--VI-DKD-QG-N-VD-------IT-----LSNWGAP-VTIP--NP------------
9	HHSearch	65.16	31%	-64	- C6 -	2BYO		LPPX_MYCTU	A:[20-207]	-----------------------------------------------SDPALLAEIRQSLDAT-KGLTSVHVAVRTTGKV---D-SL-LGITSADVDVR--ANPLA---AKG--------VCTYN--------DE---------QGV----PFRVQ-----GDNISVKLF---------DDWSNLGSISE-LSTS-R----------------------------V-----GV-T----QLLSG---VTNLQA---QGTEVID-------------GISTTKITG-TIP-----------ASSVKMLDPG----AK-----------SARPATVWIAQDGS-------H------HLVRA--SI-DLG--S-GSIQ-------LT-----QSKWNEP-VNVD----------------
74	Fugue	65.09	30%	-57	- C6 -	2BYO		LPPX_MYCTU	A:[20-207]	-----------------------------------------------SDPALLAEIRQSLDAT-KGLTSVHVAVRTTGKV---D-SLLG-ITSADVDVR--ANPLA---AKG--------VCTYN-------DEQ----------GV----PFRVQ-----GDNISVKL--------F-DDWSNLGSISELSTS-----------------------------------RVGV-T----QLLSG---VTNLQA---QGTEVID-------------GISTTKITG-TIP-----------ASSVKMLDP---G-AK-----------SARPATVWIAQD-GS------H------HLVRA--SI-DLG-S--GSIQ-------LT-----QSKWNEP-VNVD----------------
6	PsiBlast_PDB	60.65	31%	-54	- C6 -	2BYO		LPPX_MYCTU	A:[28-206]	-------------------------------------------------------IRQSLDAT-KGLTSVHVAVRTTGKV---D-SLLG-ITSADVDVR--ANPLA---AKGVCTYNDEQGVPFR-------VQG--D---N--ISV----KL--F-----D------------------DWSNLGSISELS-TS-R----------------------------V-----GV-T----QLLSG---VTNLQA---QGTEVID-------------GISTTKITG-TIP-----------ASSVKMLDP---G-AK-----------SARPATVWIAQD-GS------H------HLVRA--SI-DLG-SG--SIQ-------LT-----QSKWNEP-VNV-----------------
11	HHSearch	54.15	14%	-42	- C6 -	4MXT		?	A:[3-168]	------------------------------------------------QPDAKNILERTAEAF-RKAGGVKLAFTVNEQ------Q-----GSYAGVLY--LEGE-----KF--------VVETE--------------------GM----KTWFD-----GHTQWSYVAS------A-DEVNVSEPTQEE-L---Q----------------------------TLNPYAWL-S----LYKQG----YRLKL---SSVGG---------------DKSVYYITM-TAA-------------DKR----------K-----------DPESVYLFVTKD-T-------Y------RLHQV--DL-APR-GSKYMTT-------IL-----IDSYQTG-QS------------------
14	HHSearch	48.54	11%	-26	- C6 -	3M4W		RSEB_ECOLI	A:[2-177]	-------------------------------------------------PASGALLQQMNLAS-QS-LNYELSFISINK------QG---VESLRYRHA--RLDNR---PLA--------QLLQM--------DG---------PRR----EVVQR-----GNEISYFEP-------GLEPFT-LNGDYI-VDSL-P----------------------------SLIY-TDF-K----RLSPY----YDFIS---VGRTRIA-------------DRLCEVIRV-VAR-----------DG-------------------------TRYSYIVWMDTE-S-------K------LPMRV--DL-LDRDGE-TLEQ-------FR-----VIAFNVN-QD------------------
12	HHSearch	46.96	11%	-35	- C6 -	2YZY		?	A:[6-183]	-------------------------------------------------QSAQEILDRVEKNL-S--TPWQATVQGRI----------E--EELLARVY--ALPQA---RLF--------RVEFL-------KPG--S---L--EGN----FTVIT-----EKEVWNYLY-------LTNQLVISP---------------------------------------------------------Q----VDLRL---EGEVRLP-------------EGMAWKLVG-RS---------------------------Q-----------GFAAMELYILKA-D-------P------RPLRF--VF-LDEKGK-VLAD-------LK-----VVEFK-R-TNL-----------------
80	Fugue	46.26	24%	-36	- C7 -	3P4G		?	A:[23-323]	-HSFDHYIGSAFDASNNNVAVTGNVSATLNVLAGDDKVSIDGNVEDVLVAANVAVLDMGTGND-----QLYVAGDVLGKIDAGT-GN-D-EIYIKGDVS--AAVDA---GTG--------NDEVY-------IGG--NLSGD--LDAGTDNDNIQI-----GGDVNAALN-------A-GTGNDNLIIGH--DVS-G----------------------------IVNMGTDN-D----TVEVGRTINASGKVLLDTGDDSLLVSGDLFGEVDGGTGNDTIIIAG-KVSGNIQGGTGNDIVRVQSQVWAEA-N-ISLGTGDDVLIVEHELHGTVAGNEG-DD------S------IYLKFYTKE-QYN-NN-SDLR-------NR-----VANF-EH-IRVS--DGVVKGSPADFADY
16	HHSearch	44.39	11%	-41	- C6 -	2W7Q		LOLA_PSEAE	A:[17-183]	-------------------------------------------------IDDSAAVQRLTGLL-NKAQTLTARFSQLTLD---GSGT-R-LQETAGQLS--LKRPG----LF--------RWHTD-------AP----------NEQ----LLISN-----GEKVWLYDPD------L-EQVTIQKLDQRLT----------------------------------QTPALLL-SGDISKISES----FAITY---KE------------------GGNVVDFVL-KPK-----------TK--D----------T-----------LFDTLRLSFRS--G--------------KVNDM--QM-IDG-VG-QRTN-------IL-----FFDVKMN---------------------
78	Fugue	44.31	15%	-22	* C7 *	4KFU		?	A:[2-206]	------NPD--------DIVVLV-----------------GRKKSG----KSYLIKHYFIPVL-KAHKISYIIDDHNLLR---S-GS-E-YSKFGYNAT--SLSDI---VSK--------QYVVV-------YDR--A---K--NDD----FFEKL-----WQASKLHSK-------K-Y-----GTTVLIIDEA-Y----------------------------YHFKYKQ-------KVTPA---IDEALH---ANRHA--------------------GLGL-ILS-----------TQRVYDLMPIV-Y-KQ-----------ADLIIMFYTREP-NE------L------RWISK--YI-SAE-AA-EKVKTLKQYHFLI-----YDVNSQT-IKIH--KPILE---------
17	HHSearch	43.68	14%	-36	- C6 -	1IWL		LOLA_ECOLI	A:[2-158]	------------------------------------------------------AASDLKSRL-DKVSSFHASFTQKVTD----------VQEGQGDLW--VKRPN----LF--------NWHMT-------QP----------DES----ILVSD-----GKTLWFYNP-------FVEQATATWLKDATG----------------------------------NTPFMLIAR----NQSSD---WQQYNI---K----QN--------------GDDFVLTP-K-------------AS--N----------G-----------NLKQFTINVGRD---------G------TIHQF--SA-VEQ-DD-QRSS-------YQ-----LKSQQ-----------------------
13	HHSearch	43.50	8%	-19	- C6 -	3BK5		?	A:[3-198]	------------------------------------------------AEKGLEIAQERKARD-EGWGDSIATMEMILKN---AQ-E-SSTRLMRLKSLEVEGDGD----KG--------LTIFD-------QPR--D---V--TGT----AFLNHSHTIGADDQWLYLPA------L-KRVKRISSRNKSGPFMGS----------------------------EFAYEDLS-S----FEI-E---KYRFNH---LKDEKFN-------------GQDVFVLEQ-IPT-----------DK------------NS-----------GYTKQVVWLDKA-H-------Y------RPLKV--EF-YDRKGA-LLKT-------LT-----FANYKQYLDKYW--RA------------
77	Fugue	43.19	13%	-14	- C8 -	3HL1		?	A:[3-317]	PPVWTLPRL--------YQHFQGAIDLELWTIPY---YLTVLYSIKDPTTVPYRLIQAAVYQEMLHAQLVSNIANAYGYS---P-TL-S-APEYVGTAV--PHIDF---DLD--------TPNPTSIFTPYSAEL--G---P--LDL----TRVNTM----CLIEYPEWRTQREPDLA-DDVTDYGSIGEFYDAL-RVGMEQLRGHVRGNQKQMDENSPPLTVTESGDAGFLQ-A----LTLVD---IIVDQG---EGQAWPH-------------FQRFDFIRRMPNW-----------PGVYTGVTDPP-A-GS-----------PGAEAQARLIAD-FA------G------FLDIL--NGMFSG-GG-APPA-------FGVQMAKLGGDILS-CWKLGAVPRYS---------