@TOME V2.3
(Nov 2016)
Ref.
-
-
Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Atome Result
Tools Result
PDB occurence
Core Structure Cluster
Sequence Color type :
Secondary Structure
Hydrophobicity
Disulfide Bonds
TCoffee Identity Score
Uniprot annotation
Core Structure Cluster
Contacts with Ligands
Show alignment :
Atome selection
All alignments
Only Template with Ligand
Column output:
Score:
Atome Rank Value
Tools Score
Hide column
Alignment:
Sequence Identity (%)
Tcoffee Alignment Score
Hide column
3D Common Core:
Tito PKB Score
Verify3D Score
QMean Score
Hide column
Structural Clustering:
Cluster Num
3D-Jury Struct. Score
Hide column
Modeller Result :
Model Rank
QMean Score
Dfire Score
Dope Score
Errat Score
Verify3D Score
Modeller Score
Hide column
Complexes Modeling
Show Ligands of Templates
Complexes Affinity Score
Main Binding Site Identity
Hide column
Templates Information:
Uniprot entry
Cath class
Scop class
Smart class
Prosite class
Pfam class
EC Number
Taxonomy
Experiment Method
Hide column
Sequence & Result Tab:
PDB Template Sequence
Complexes Tab
Values color: [
Good
|
Correct
|
Middling
|
Bad
]
Sequence color :
Mutated
Helix
Strand
Conserved
Query sequence : Rv1511: (2016-05-02 )
MKRALITGITGQDGSYLAELLLAKGYEVHGLIRRASTFNTSRIDHLYVDPHQPGARLFLHYGDLIDGTRLVTLLSTIEPDEVYNLAAQSHVRVSFDEPVHTGDTTGMGSMRLLEAVRLSRVHCRFYQASSSEMFGASPPPQNELTPFYPRSPYGAAKVYSYWATRNYREAYGLFAVNGILFNHESPRRGETFVTRKITRAVARIKAGIQSEVYMGNLDAVRDWGYAPEYVEGMWRMLQTDEPDDFVLATGRGFTVREFARAAFEHAGLDWQQYVKFDQRYLRPTEVDSLIGDATKAAELLGWRASVHTDELARIMVDADMAALECEGKPWIDKPMIAGRT
Atome Classification :
(20 SA)
.........10........20........30........40........50.......-.60........70........80........90........100.......110.......-120--.--.----.......130...-..-..140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.....--..--270-------------..---------------..-.--------------------------....280.......290.......300.......310.......320.......330.......340
(Atome)
(Ident)
(Tito)
(Num)
(Ligand)
(Uniprot)
MK
R
A
L
I
TGITGQ
D
G
S
Y
L
A
E
L
L
L
AKG
Y
E
V
H
G
L
I
RRASTFNTSR
I
D
H
L
Y
VDPHQPG
A
R
L
F
-
L
H
YGDLIDG
T
R
L
V
T
L
L
STI
E
P
D
E
V
Y
N
L
A
AQ
S
H
V
R
V
SFDEPVHTGDTTG
M
G
S
M
R
L
L
E
A
V
R
L
S
-
R
----
V
--
H
----
C
R
F
Y
QASSSEMFG-AS-PPPQNELTPFYPRSPYGA
A
K
V
Y
S
Y
W
ATR
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
V
N
G
I
L
FNHESPRRG
E
T
F
V
T
R
K
I
T
R
A
V
A
R
I
K
A
GIQSE
V
Y
MG
N
L
D
A
V
R
DWGY
A
P
E
Y
V
E
G
M
W
R
M
LQTDEPD
D
F
V
L
ATGRGF
T
V
R
E
F
A
R
A
A
F
E
HAG--L
D
--
W
---------------
Q
Q
---------------
Y
V
-
K
--------------------------
F
D
Q
R
YL
R
P
T
E
V
D
S
L
IG
D
A
T
K
A
A
E
L
L
GWRASV
H
T
D
E
L
A
R
I
M
VDAD
M
A
A
L
ECEGKPWIDKPMIAGRT
25
PsiBlast_CBE
96.44
56%
-89
- C1 -
1T2A
3
GMDS_HUMAN
D:
[27-367]
---
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
--------
N
M
K
-
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
----
L
IN
S
----
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
V
Q
-
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
KT
I
V
--
W
---------------
E
G
KNENEVGRCKETGKV
H
V
-
T
--------------------------
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
-----------------
27
PsiBlast_CBE
96.05
56%
-88
- C1 -
1T2A
3
GMDS_HUMAN
B:
[27-367]
---
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
--------
N
M
K
-
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
----
L
IN
S
----
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
V
Q
-
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
KT
I
V
--
W
---------------
E
G
KNENEVGRCKETGKV
H
V
-
T
--------------------------
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
-----------------
26
PsiBlast_CBE
95.67
56%
-87
- C1 -
1T2A
3
GMDS_HUMAN
C:
[27-367]
---
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
--------
N
M
K
-
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
----
L
IN
S
----
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
V
Q
-
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
KT
I
V
--
W
---------------
E
G
KNENEVGRCKETGKV
H
V
-
T
--------------------------
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
-----------------
4
PsiBlast_PDB
95.60
56%
-88
- C1 -
1T2A
3
GMDS_HUMAN
A:
[27-367]
---
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
V
R
R
S
S
S
F
N
T
G
R
I
E
H
L
Y
--------
N
M
K
-
L
H
Y
G
D
L
T
D
S
T
C
L
V
K
I
I
N
E
V
K
P
T
E
I
Y
N
L
G
A
Q
S
H
V
K
I
S
F
D
L
A
E
Y
T
A
D
V
D
G
V
G
T
L
R
L
L
D
A
V
K
T
C
-
G
----
L
IN
S
----
V
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
K
V
Q
-
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
A
A
K
L
Y
A
Y
W
I
V
V
N
F
R
E
A
Y
N
L
F
A
V
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
A
N
F
V
T
R
K
I
S
R
S
V
A
K
I
Y
L
G
Q
L
E
C
F
S
L
G
N
L
D
A
K
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
N
D
E
P
E
D
F
V
I
A
T
G
E
V
H
S
V
R
E
F
V
E
K
S
F
L
H
I
G
K
T
I
V
--
W
---------------
E
G
KNEN
E
V
G
R
C
KETGKV
H
V
-
T
--------------------------
V
D
L
K
Y
Y
R
P
T
E
V
D
F
L
Q
G
D
C
T
K
A
K
Q
K
L
N
W
K
P
R
V
A
F
D
E
L
V
R
E
M
V
H
A
D
V
E
L
M
-----------------
103
HHSearch
95.51
61%
-81
- C1 -
1N7H
2
GMD2_ARATH
A:
[28-357]
R
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
-------
A
L
M
K
-
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
I
D
S
G
R
--
T
----
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
-
S
T
-
P
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
--
L
N
--
W
---------------
K
D
---------------
Y
V
-
E
--------------------------
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
E
L
A
K
R
---------------
1
PsiBlast_PDB
95.15
61%
-83
- C1 -
1N7G
3
GMD2_ARATH
A:
[29-352]
-
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
-------
K
A
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
----
I
--
D
S
G
R
T
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
-
S
T
-
P
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
--
L
N
--
W
---------------
K
D
---------------
Y
V
-
E
--------------------------
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
--------------------
2
PsiBlast_PDB
94.55
61%
-83
- C1 -
1N7H
2
GMD2_ARATH
A:
[29-352]
-
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
--------
A
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
----
I
--
D
S
G
R
T
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
-
S
T
-
P
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
--
L
N
--
W
---------------
K
D
---------------
Y
V
-
E
--------------------------
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
--------------------
21
PsiBlast_CBE
94.40
61%
-84
- C1 -
1N7H
2
GMD2_ARATH
B:
[29-352]
-
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
I
------
K
A
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
----
I
--
D
S
G
R
T
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
-
S
T
-
P
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
--
L
N
--
W
---------------
K
D
---------------
Y
V
-
E
--------------------------
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
--------------------
23
PsiBlast_CBE
94.05
61%
-84
- C1 -
1N7G
3
GMD2_ARATH
C:
[29-352]
-
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
I
------
K
A
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
----
I
--
D
S
G
R
T
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
-
S
T
-
P
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
--
L
N
--
W
---------------
K
D
---------------
Y
V
-
E
--------------------------
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
--------------------
24
PsiBlast_CBE
92.86
61%
-81
- C1 -
1N7G
3
GMD2_ARATH
B:
[29-352]
-
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
I
D
-----
K
A
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
----
I
--
D
S
G
R
T
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
-
S
T
-
P
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
L
G
N
L
Q
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
--
L
N
--
W
---------------
K
D
---------------
Y
V
-
E
--------------------------
I
D
Q
R
Y
F
R
P
A
E
V
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
--------------------
22
PsiBlast_CBE
90.44
61%
-82
- C1 -
1N7G
2
GMD2_ARATH
D:
[29-352]
-
K
I
A
L
I
T
G
I
T
G
Q
D
G
S
Y
L
T
E
F
L
L
G
K
G
Y
E
V
H
G
L
I
R
R
S
S
N
F
N
T
Q
R
I
N
H
I
Y
I
--------
L
M
K
L
H
Y
A
D
L
T
D
A
S
S
L
R
R
W
I
D
V
I
K
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
H
V
A
V
S
F
E
I
P
D
Y
T
A
D
V
V
A
T
G
A
L
R
L
L
E
A
V
R
S
H
-
T
----
I
--
D
SGRT
V
K
Y
Y
Q
A
G
S
S
E
M
F
G
-
S
T
-
P
P
P
Q
S
E
T
T
P
F
H
P
R
S
P
Y
A
A
S
K
C
A
A
H
W
Y
T
V
N
Y
R
E
A
Y
G
L
F
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
E
N
F
V
T
R
K
I
T
R
A
L
G
R
I
K
V
G
L
Q
T
K
L
F
-----
A
S
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
E
K
P
D
D
Y
V
V
A
T
E
E
G
H
T
V
E
E
F
L
D
V
S
F
G
Y
L
G
--
L
N
--
W
---------------
K
D
---------------
Y
V
-
E
--------------------------
I
D
---------
D
N
L
Q
G
D
A
S
K
A
K
E
V
L
G
W
K
P
Q
V
G
F
E
K
L
V
K
M
M
V
D
E
D
L
--------------------
6
PsiBlast_PDB
90.44
50%
-81
- C1 -
2Z95
1
?
A:
[4-335]
-
K
R
A
L
I
T
G
I
R
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
E
V
Y
G
A
D
R
-----
A
S
W
R
L
K
E
L
G
I
E
N
D
-----
V
K
-
I
I
H
M
D
L
L
E
F
S
N
I
I
R
T
I
E
K
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
V
S
F
E
Q
P
I
L
T
A
E
V
D
A
I
G
V
L
R
I
L
E
A
L
R
T
V
-
K
----
P
--
D
----
T
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
K
V
Q
-
E
I
P
Q
T
E
K
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
F
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
A
Y
N
M
F
A
C
S
G
I
L
F
N
H
E
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
I
T
Y
S
L
A
R
I
K
Y
G
L
Q
D
K
L
V
L
G
N
L
N
A
K
R
D
W
G
Y
A
P
E
Y
V
E
A
M
W
L
M
M
Q
Q
P
E
P
D
D
Y
V
I
A
T
G
E
T
H
T
V
R
E
F
V
E
K
A
A
K
I
A
G
--
F
D
I
E
W
V
G
EGIN
E
K
G
I
DRNTG
K
V
---------------
I
V
-
E
--------------------------
V
S
E
E
F
F
R
P
A
E
V
D
I
L
V
G
N
P
E
K
A
M
K
K
L
G
W
K
P
R
T
T
F
D
E
L
V
E
I
M
M
E
A
D
L
--------------------
29
PsiBlast_CBE
90.41
50%
-79
- C1 -
2Z1M
2
?
D:
[4-335]
-
K
R
A
L
I
T
G
I
R
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
E
V
Y
G
A
D
R
R
S
G
E
F
A
S
W
R
L
K
E
L
G
I
E
N
D
-----
V
K
-
I
I
H
M
D
L
L
E
F
S
N
I
I
R
T
I
E
K
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
V
S
F
E
Q
P
I
L
T
A
E
V
D
A
I
G
V
L
R
I
L
E
A
L
R
T
V
-
K
----
P
--
D
----
T
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
K
V
Q
-
E
I
P
Q
T
E
K
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
F
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
A
Y
N
M
F
A
C
S
G
I
L
F
N
H
E
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
I
T
Y
S
L
A
R
I
K
Y
G
L
Q
D
K
L
V
L
G
N
L
N
A
K
R
D
W
G
Y
A
P
E
Y
V
E
A
M
W
L
M
M
Q
Q
P
E
P
D
D
Y
V
I
A
T
G
E
T
H
T
V
R
E
F
V
E
K
A
A
K
I
A
G
--
F
D
IE
W
VGEGINEKGIDRNTG
K
V
---------------
I
V
-
E
--------------------------
V
S
E
E
F
F
R
P
A
E
V
D
I
L
V
G
N
P
E
K
A
M
K
K
L
G
W
K
P
R
T
T
F
D
E
L
V
E
I
M
M
E
A
D
L
--------------------
98
HHSearch
89.91
54%
-73
- C1 -
1RPN
3
GM4D_PSEAE
A:
[15-333]
-
R
S
A
L
V
T
G
I
T
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
R
V
H
G
L
V
A
R
R
S
S
D
T
R
W
R
L
R
E
L
G
-----
I
E
G
D
I
Q
-
Y
E
D
G
D
M
A
D
A
C
S
V
Q
R
A
V
I
K
A
Q
P
Q
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
A
S
W
N
Q
P
V
T
T
G
V
V
D
G
L
G
V
T
H
L
L
E
A
I
R
Q
F
S
P
-------
E
----
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
-
L
I
Q
A
E
R
Q
D
E
N
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
V
A
K
L
Y
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
F
G
L
H
A
S
S
G
I
L
F
N
H
E
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
V
T
D
A
V
A
R
I
K
L
G
K
Q
Q
E
L
R
L
G
N
V
D
A
K
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
D
K
A
D
D
Y
V
V
A
T
G
V
T
T
T
V
R
D
M
C
Q
I
A
F
E
H
V
G
--
L
D
--
Y
---------------
R
D
---------------
F
L
-
K
--------------------------
I
D
P
A
F
F
R
P
A
E
V
D
V
L
L
G
N
P
A
K
A
Q
R
V
L
G
W
K
P
R
T
S
L
D
E
L
I
R
M
M
V
E
A
D
L
R
R
V
S
----------------
5
PsiBlast_PDB
89.77
50%
-79
- C1 -
2Z1M
2
?
A:
[4-335]
-
K
R
A
L
I
T
G
I
R
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
E
V
Y
G
A
D
R
R
S
G
E
F
A
S
W
R
L
K
E
L
G
I
E
N
D
-----
V
K
-
I
I
H
M
D
L
L
E
F
S
N
I
I
R
T
I
E
K
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
V
S
F
E
Q
P
I
L
T
A
E
V
D
A
I
G
V
L
R
I
L
E
A
L
R
T
V
-
K
----
P
--
D
----
T
K
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
K
V
Q
-
E
I
P
Q
T
E
K
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
F
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
A
Y
N
M
F
A
C
S
G
I
L
F
N
H
E
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
I
T
Y
S
L
A
R
I
K
Y
G
L
Q
D
K
L
V
L
G
N
L
N
A
K
R
D
W
G
Y
A
P
E
Y
V
E
A
M
W
L
M
M
Q
Q
P
E
P
D
D
Y
V
I
A
T
G
E
T
H
T
V
R
E
F
V
E
K
A
A
K
I
A
G
--
F
D
I
E
W
V
G
EGIN
E
K
G
I
DRNTG
K
V
---------------
I
V
-
E
--------------------------
V
S
E
E
F
F
R
P
A
E
V
D
I
L
V
G
N
P
E
K
A
M
K
K
L
G
W
K
P
R
T
T
F
D
E
L
V
E
I
M
M
E
A
D
L
--------------------
32
PsiBlast_CBE
89.27
53%
-76
- C1 -
1RPN
3
GM4D_PSEAE
B:
[15-329]
-
R
S
A
L
V
T
G
I
T
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
R
V
H
G
L
V
A
R
R
S
S
D
T
R
W
R
L
R
E
L
G
I
E
-----
G
D
I
Q
-
Y
E
D
G
D
M
A
D
A
C
S
V
Q
R
A
V
I
K
A
Q
P
Q
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
A
S
W
N
Q
P
V
T
T
G
V
V
D
G
L
G
V
T
H
L
L
E
A
I
R
Q
F
-
S
----
P
--
E
----
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
L
I
Q
-
A
E
R
Q
D
E
N
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
V
A
K
L
Y
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
F
G
L
H
A
S
S
G
I
L
F
N
H
E
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
V
T
D
A
V
A
R
I
K
L
G
K
Q
Q
E
L
R
L
G
N
V
D
A
K
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
D
K
A
D
D
Y
V
V
A
T
G
V
T
T
T
V
R
D
M
C
Q
I
A
F
E
H
V
G
--
L
D
--
Y
---------------
R
D
---------------
F
L
-
K
--------------------------
I
D
P
A
F
F
R
P
A
E
V
D
V
L
L
G
N
P
A
K
A
Q
R
V
L
G
W
K
P
R
T
S
L
D
E
L
I
R
M
M
V
E
A
D
L
--------------------
104
HHSearch
88.90
56%
-76
- C1 -
1DB3
-
GM4D_ECOLI
A:
[1-357]
S
K
V
A
L
I
T
G
V
T
G
Q
D
G
S
Y
L
A
E
F
L
L
E
K
G
Y
E
V
H
G
I
K
R
---------------------
P
K
F
H
-
L
H
Y
G
D
L
S
D
T
S
N
L
T
R
I
L
R
E
V
Q
P
D
E
V
Y
N
L
G
A
M
S
H
V
A
V
S
F
E
S
P
E
Y
T
A
D
V
D
A
M
G
T
L
R
L
L
E
A
I
R
F
L
-
G
LE--
K
--
K
----
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
L
Y
G
-
L
V
Q
E
I
P
Q
K
E
T
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
A
V
A
K
L
Y
A
Y
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
Y
G
M
Y
A
C
N
G
I
L
F
N
H
E
S
P
R
R
G
E
T
F
V
T
R
K
I
T
R
A
I
A
N
I
A
Q
G
L
E
S
C
L
Y
L
G
N
M
D
S
L
R
D
W
G
H
A
K
D
Y
V
K
M
Q
W
M
M
L
Q
Q
E
Q
P
E
D
F
V
I
A
T
G
V
Q
Y
S
V
R
Q
F
V
E
M
A
A
A
Q
L
G
--
I
K
--
L
---------------
R
F
---------------
E
G
T
G
VE
E
K
G
I
V
VSVTGHDAPGVKPGDVI
I
A
V
D
P
R
Y
F
R
P
A
E
-
E
T
L
L
G
D
P
T
K
A
H
E
K
L
G
W
K
P
E
I
T
L
R
E
M
V
S
E
M
V
A
N
D
L
E
A
A
K
K
H
S
-------------
7
PsiBlast_PDB
88.88
53%
-77
- C1 -
1RPN
3
GM4D_PSEAE
A:
[15-329]
-
R
S
A
L
V
T
G
I
T
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
R
V
H
G
L
V
A
R
R
S
S
D
T
R
W
R
L
R
E
L
G
I
E
-----
G
D
I
Q
-
Y
E
D
G
D
M
A
D
A
C
S
V
Q
R
A
V
I
K
A
Q
P
Q
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
A
S
W
N
Q
P
V
T
T
G
V
V
D
G
L
G
V
T
H
L
L
E
A
I
R
Q
F
-
S
----
P
--
E
----
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
L
I
Q
-
A
E
R
Q
D
E
N
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
V
A
K
L
Y
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
F
G
L
H
A
S
S
G
I
L
F
N
H
E
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
V
T
D
A
V
A
R
I
K
L
G
K
Q
Q
E
L
R
L
G
N
V
D
A
K
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
D
K
A
D
D
Y
V
V
A
T
G
V
T
T
T
V
R
D
M
C
Q
I
A
F
E
H
V
G
--
L
D
--
Y
---------------
R
D
---------------
F
L
-
K
--------------------------
I
D
P
A
F
F
R
P
A
E
V
D
V
L
L
G
N
P
A
K
A
Q
R
V
L
G
W
K
P
R
T
S
L
D
E
L
I
R
M
M
V
E
A
D
L
--------------------
30
PsiBlast_CBE
88.61
53%
-77
- C1 -
1RPN
3
GM4D_PSEAE
D:
[15-329]
-
R
S
A
L
V
T
G
I
T
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
R
V
H
G
L
V
A
R
R
S
S
D
T
R
W
R
L
R
E
L
G
I
E
-----
G
D
I
Q
-
Y
E
D
G
D
M
A
D
A
C
S
V
Q
R
A
V
I
K
A
Q
P
Q
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
A
S
W
N
Q
P
V
T
T
G
V
V
D
G
L
G
V
T
H
L
L
E
A
I
R
Q
F
-
S
----
P
--
E
----
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
L
I
Q
-
A
E
R
Q
D
E
N
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
V
A
K
L
Y
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
F
G
L
H
A
S
S
G
I
L
F
N
H
E
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
V
T
D
A
V
A
R
I
K
L
G
K
Q
Q
E
L
R
L
G
N
V
D
A
K
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
D
K
A
D
D
Y
V
V
A
T
G
V
T
T
T
V
R
D
M
C
Q
I
A
F
E
H
V
G
--
L
D
--
Y
---------------
R
D
---------------
F
L
-
K
--------------------------
I
D
P
A
F
F
R
P
A
E
V
D
V
L
L
G
N
P
A
K
A
Q
R
V
L
G
W
K
P
R
T
S
L
D
E
L
I
R
M
M
V
E
A
D
L
--------------------
31
PsiBlast_CBE
88.38
53%
-75
- C1 -
1RPN
3
GM4D_PSEAE
C:
[15-329]
-
R
S
A
L
V
T
G
I
T
G
Q
D
G
A
Y
L
A
K
L
L
L
E
K
G
Y
R
V
H
G
L
V
A
R
R
S
S
D
T
R
W
R
L
R
E
L
G
I
E
-----
G
D
I
Q
-
Y
E
D
G
D
M
A
D
A
C
S
V
Q
R
A
V
I
K
A
Q
P
Q
E
V
Y
N
L
A
A
Q
S
F
V
G
A
S
W
N
Q
P
V
T
T
G
V
V
D
G
L
G
V
T
H
L
L
E
A
I
R
Q
F
-
S
----
P
--
E
----
T
R
F
Y
Q
A
S
T
S
E
M
F
G
L
I
Q
-
A
E
R
Q
D
E
N
T
P
F
Y
P
R
S
P
Y
G
V
A
K
L
Y
G
H
W
I
T
V
N
Y
R
E
S
F
G
L
H
A
S
S
G
I
L
F
N
H
E
S
P
L
R
G
I
E
F
V
T
R
K
V
T
D
A
V
A
R
I
K
L
G
K
Q
Q
E
L
R
L
G
N
V
D
A
K
R
D
W
G
F
A
G
D
Y
V
E
A
M
W
L
M
L
Q
Q
D
K
A
D
D
Y
V
V
A
T
G
V
T
T
T
V
R
D
M
C
Q
I
A
F
E
H
V
G
--
L
D
--
Y
---------------
R
D
---------------
F
L
-
K
--------------------------
I
D
P
A
F
F
R
P
A
E
V
D
V
L
L
G
N
P
A
K
A
Q
R
V
L
G
W
K
P
R
T
S
L
D
E
L
I
R
M
M
V
E
A
D
L
--------------------