@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Query sequence : Rv2400c: (2016-05-10 )
MLSLTLSEASCIASASRWRHIIPAGVVCALIAGIGVGCHGGPSDVVGRAGPDRAHTSITLVAYAVPEPGWSAVIPAFNASEQGRGVQVITSYGASADQSRGVADGKPADLVNFSVEPDIARLVKAGKVDKDWDADATKGIPFGSVVTFVVRAGNPKNIRDWDDLLRPGIEVITPSPLSSGSAKWNLLAPYAAKSDGGRNNQAGIDFVNTLVNEHVKLRPGSGREATDVFVQGSGDVLISYENEAIATERAGKPVQHVTPPQTFKIENPLAVVATSTHLGAATAFRNFQYTVQAQKLWAQAGFRPVDPAVAADFADLFPVPAKLWTIADLGGWGSVDPQLFDKATGSITKIYLRATG

Atome Classification :

(20 SA) .........10........20........30........40........50........60.-...---.----.-.--.70.......----.----80........90...---------....----.100.---.-.-....110.......120.......130.------.-------.----.----.-------------.-----------...140.--......150....--------...160......-.--170...----.--.-------..---.----.----180----.------.--.-.--.---....190-.-..----.--.-----------.---.---200-....-.....210-...-...--------.--.----220--........230........240..-..--...---------250-------.-.....-..260.------.----.--.---.....270--.---..---..--....280....-...290.......--------300.--.......310.......320......-.330.......340.......350....
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) MLSLTLSEASCIASASRWRHIIPAGVVCALIAGIGVGCHGGPSDVVGRAGPDRAHTSITLVA-YAV---P----E-P--GWSAVIPAFN----A----SEQGRGVQVITSYGA---------SADQ----SRGVA---D-G-KPADLVNFSVEPDIARLVKAGKVDK--D------W-------D----A----D-------------A-----------TKGIPFG--SVVTFVVRAGNPK--------NIRDWDDLLRPG-I--E--VIT----P--S-------PL---S----S----G------S------A--K-W--N---LLAPYAA-K-SD----G--G-----------R---N---N---QAGI-DFVNTLV--NEH-VKL--------R--P----G-S--GREATDVFVQ-GSGDVLISYENEA-IA--TER---------AG--------K-PVQHV-TPP--Q------T----F--K---IENPLA----V---VA---TS--THLGAATAFRN-FQYTVQAQKLWAQ--------A-GF--RPVDPAVAADFADLFPVPAKLWTIAD-LGGWGSVDPQLFDKATGSITKIYLRATG
1 PsiBlast_PDB 94.2335% -57 - C5 -1SBP SUBI_SALTY A:[8-298] ------------------------------------------------------------VS-YDP---T----R-E--LYEQYNKAFS----AHWK-QETGDNVVIDQSHGG---------SGKQ----ATSVI---N-G-IEADTVTLALAYDVNAIAERGRIDK--N------W-------I----K----R-------------LP----------DDSAPYT--STIVFLVRKGNPK--------QIHDWNDLIKPG-V--S--VIT----P--N-------PK---S----S----G------G------A--R-W--N---YLAAWGY-A-LH----H--N-----------N---N---D---QAKAEDFVKALF---KN-VEV--------L--D----S-G--ARGSTNTFVERGIGDVLIAWENEALLA--TNE---------LG--------KDKFEIV-TPS--E------S----I--L---AEPTVSVVDKV---VE---KK--DTKAVAEAYLK-YLYSPEGQEIAAK--------N-FY--RPRDADVAKKYDDAFP-KLKLFTIDEVFGGWAKAQKDHF----------------
26 HHSearch 92.6132% -51 - C5 -1SBP SUBI_SALTY A:[3-307] -------------------------------------------------------IQLLNVS-YDP---T----R-E--LYEQYNKAFSAHWKQ----E-TGDNVVIDQSHGG---------SGKQ----ATSVI---N-G-IEADTVTLALAYDVNAIAERGRIDK--N------W-------I----K----RL------------P-----------DDSAPYT--STIVFLVRKGNPK--------QIHDWNDLIKPG-V--S--VIT----P--N-------PK---S----S----G------G------A--R-W--N---YLAAWGY-A--L----H--HNN---------N---D---Q---AKAE-DFVKAL---FKN-VEV--------L--D----SGA--RGSTNTFVER-GIGDVLIAWENEA-LL--ATNE--------LGK-------D-KFEIV-TPS--ES-----I----L--A---EPTVSV----VDKVVE---KK--DTKAVAEAYLK-YLYSPEGQEIAAK--------N-FY--RPRDADVAKKYDDAFPK-LKLFTIDEVFGGWAKAQKDHFADG-GTFDQI------
40 HHSearch 67.4517% -50 - C5 -4R75 ? A:[3-278] ------------------------------------------------------KGRLVIYC-SAT--------N-V--MCENAAKTFE----Q----KY-DVKTSFIRN--G---------SGST----FAKIEAEKN-N-PQADVWYGGTLDPQSQAGELGLLEAY-RSPN---I-------D----Q----IM------------PKFQDPAKVKG-NLSSAVYI-GILGFAVNTERLKKLGIEK--IPQCWNDLTDPK-LKGE--IQI----A--D-------PQ---S----S----G------T------A--Y----T---AIATFAQ-L--W-------G-------------------E---DKAF-DYFKHL---HPN-ISQ--------Y--T----K-S--GITPARNAAR-GETTVGIGFLHDY-AL--EKE---------QG--------A-PLEMV-VPCE-G------T----G--Y---ELGGVS----I---LK---GA--RNLDNAKLFVD-FALSKEGQETAWK--------KGQALQTLTNTTA------------------------------------------------
30 HHSearch 67.4318% -53 - C5 -3PU5 ? A:[4-285] -----------------------------------------------------ADDHIYVTS-SGGSF-L----E-N--VRKHMAEPFE----K----QS-GVKVTLVPG--T---------NPAH----ALKILSSRG-T-PPYDVAAFGG-NDMYRLIRAKKLAQVDE------KSVPSL--A----D----VP------------EKFKADWE----GCGSLYDY-SSVGIAYRPDKIQG-------GVKSWKEFVERT-VAGE--FGKQVFFN--N-------LS---S----N----V------R------G----A--E---VLSMFGK-I--Y----G--SGY---------G---D---I---EASI-ATLERM---KPH-IFK--------F--F----T-A--FNDPVVLLTS-GEGAIGPGWDGRT-FI--AEDS--------TK--------G-MVKWV-DPTE-G------A----V--S---SGPVMA----V---VK---GG--K-EDLAKAFMN-YALGEEAQKAFCEA-------M-YY--GAVNRKVQ-----------------------------------------------
35 HHSearch 67.1818% -57 - C5 -2VOZ FUTA2_SYNY3 A:[34-309] -------------------------------------------------------RTINLYS-SRH---Y------N--TDDALYDAFG----E----------VNLIEA--S---------AEEL----IERIQSEGA-N-SPGDILFTVDAGMLWRAEQAGLFQPVRSGK----L-------N----E----RIP-----------ENLRHPDGL---WYGFT-Q--RARVLYYSRDRVNPA------DLSTYEALADPQ-W--RGKILV----R----------PS---S----N----V------Y------N--L----S---LTASRIA----I----H--G-------------------E---PETR-RWLQGL---VGN-FARQ-------P--E----G-N--DTAQIRAIAA-GIGDVAIANSYYY-IR--LQK---------STDPADQEVVE-KVSLF-FPN--TGSGERGT----H--V---NVSGAG----V---LK---NA--PNRDAAIAFLE-YLASDDAQRYFAEG-------N-NE--YPVIPGVPI----------------------------------------------
39 HHSearch 66.9719% -54 - C5 -1Y9U - ? A:[6-284] -------------------------------------------------------DEVSLYT-TRE--------P-K--LIQPLLDAFA----K----D-SGIKVNTVFV--K----------DGL----LERVRAEGD-K-SPADVLMTVDIGNLIDLVNGGVTQKIQS------QTL-----D----S----VVPANLRGAEG---S-----------WYALSL---RDRVLYVEKDLKL--------DSFRYGDLADPK-WKGK--VCI----R--S-------GQ--------H----P------Y------N--T----A---LVAAMIA----H----D--G-------------------A---EATE-KWLRGV---KAN-LARK-------A--A----G-G--DRDVARDILG-GICDIGLANAYYV-GH--MKNAEPGTDARKWG--------D-AIKVV-RPTFAGG-----T----H--V---NISGAA----V---AA---HA--PNKANAVKLLE-YLVSEPAQTLYAQA-------N-YE--YPVRAGVK-----------------------------------------------
22 HHSearch 66.1717% -62 - C5 -4EDP ? A:[36-308] --------------------------------------------------------KLVVST-WGL---NE---D-V--LKETVFEPFA----K----EH-GVEIVLDIG--N---------NSER----LTKMKNN-P-N-SQIDITYLAE-SFAEQGVEAGIFDKL-DYSK---I-------PNAS-E----MN------------EKAKSTVEA---GYGPAYTL-NSIGIVVDPSAGI--------EINSWEDLWKPE-LKNK--IAI----P--D-------IT---T----TN---G------P------A--M-V--EI--AAEKAGV-D-VK-------T-----------D---N---G---EAAF-KELEAL---KPN-VVK--------T--Y----S-K--SSDLANMFSN-GEIVAAVASDFAF-GT--ISK---------AK--------P-EVINV-IPES-G------T----Y--L---NFNTIN----I---NK---NS--KNKDLAYEFIN-YALSKEVQEKTAKA-------L-NE--SPVNKEV------------------------------------------------
28 HHSearch 64.8915% -54 - C5 -4EUO ? A:[2-269] --------------------------------------------------------DLVFSS-WGG---TTQ--D-A--QKAAWAEKFM----V----E-TGINVLQDGP-TD---------YGKL----KAMVE---ANG-VTWDVVDVEG-DYAAQAGPKGLLEKLDFSV----I-------D----KT---KLD-----------PRFVT-------DYSVGSFY-YSFVIGCNVDSVSA-------CPKSWADLFDTAKFPGK--RTF----Y--K-------WS---A----P----G------V------I----E--A---ALLADGV-T-AD----KLYP-----------L---D---L---DRAF-KKLDTI---KSD-I-I--------W--W----S-G--GAQSQQLIAS-AEAPFGSVWNGRM-TA--LEQ---------SG--------V-KVETS-WAQ---------N----I--T---AADSLV----V---PK---GT--KNKDAAMKFIA-LATSAQAQADMATA-------T-GY--APVNIES------------------------------------------------
38 HHSearch 64.8015% -61 - C5 -4GL0 ? A:[10-283] ------------------------------------------------------SNTLTIYN-WGD---Y---------IDPSLITKFE----K----E-TGIKVIYQTF-DS---------NEAM----MTKIEQ--G-G-TTFDIAVPSD-YAISKMKEENLLIPL-DHSK---L-------PNE--K----YLDPRFMDLSFDDDN-----------KYSMPYFW-GTLGIIYNKEMFPDK------NFDTWNALFDPE-LKNQ--ILL----I--D-------GA---R----E----V------M------G--L--------GLNSLGY-S-LN----DT-NK----------A---H---L---QAAR-DKLETM---TPN-VKA--------I---------V--GDEIKLLMAD-N-AGVAVTFSGEA-AE--MLS---------EN--------E-DLEYV-IPKD-G------S----N--L---WFDNMV----I---PK---TA--KNVDGAHKFIN-FMLKPENAAINAEY-------V-GY--ATPNAKA------------------------------------------------
36 HHSearch 63.7414% -68 - C5 -4EQB ? A:[8-284] ------------------------------------------------------SQKLVIYN-WGD----------Y--IDPELLTQFT----E----E-TGIQVQYETFD-S---------NEAM----YTKIKQ--G-G-TTYDIAIPSE-YMINKMKDEDLLVPLDY------SKIEGI--E----N----IGPEFLNQSFDPG-N-----------KFSIPYFW-GTLGIVYNETMVDE-------APEHWDDLWKLE-Y--KNSIML----F--D-------GA---R----E----V------L------G-------L---GLNSLGY-S-LN----S--KDP---------Q---Q---L---EETV-DKLYKL---TPN-IKA--------I---------V--ADEMKGYMIQ-NNVAIGVTFSGEA-SQ--MLE---------KN--------E-NLRYV-VPT--EA-----S----N--L---WFDNMV----I---PK---TV--KNQDSAYAFIN-FMLKPENALQNAEY-------V-GY--STPNLPAKELL--------------------------------------------
32 HHSearch 63.7314% -44 - C5 -3WOA MALE_ECOLI (first) A:[37-356] -----------------------------VADKMGMGQSGSG--------MKIEEGKLVIWI-NGDK--G----Y-N--GLAEVGKKFE----K----D-TGIKVTVEHPDKL---------EEKF----PQVAA---T-G-DGPDIIFWAH-DRFGGYAQSGLLAEITP------DKAF----Q----D----KLYPFTWDAVRYNGK-----------LIAYPIAV-EALSLIYNKDLLPN-------PPKTWEEIPALD-K--E--LKA----KGKS-------AL---MFNLQE----P------Y------F--T-W--P---LIAADGG-YAFKYE--N--GKYDIKDVGVDNA---G---A---KAGL-TFLVDL---IKN-KHM--------NA-D----T-D--YSIAEAAFNK-GETAMTINGPWAW-SN--IDT---------SK--------V-NYGVTVLPT--FKG----QPSKPF--V---GVLSAG----I---NA---AS--PNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKD-------K-PLG-AVALKS-------------------------------------------------
33 HHSearch 62.1516% -56 * C5 *4R6Y PHNS_SALTY A:[3-274] ------------------------------------------------------ESVVTVYS-IDG---LHDGDN-S--WYQVQFDAFT----K----A-TGITVRYVEG--G---------GGVV----VERLAKERT-N-PQADVLVTAP-PFIQRAAAEKLLANFNT------DT------A----S----AI------------PDANN-------LY-SPLVK-NYLSFIYNSKLLKT-------APASWQDLLDGK-FKNK--LQY----S--T-------PG---Q----A----A------D------G--T-A--V---MLQAFHS----F----G------------------S---K---DAGF-AYLGKL---QAN-NVG--------P--S----A-S--TGKLTALVNK-GEIYVANGDLQMN-LA--QME---------RN--------P-NVKIF-WPA--NDKGERSA----L--A---IPYVIG----L---VQ---GA--PQSENGKKLIN-FLLSKEAQTRVSEL-------S-WG--MPVRSDVT-----------------------------------------------
31 HHSearch 60.5617% -59 - C5 -3VXB ? A:[38-369] --------------------------------------------------------TITAMV-YGD---DA---V-K--VQDKAASRFN----ASAEAKKANAKVKMERIPASDY-------PAKL----RTAMG---S-P-NAPDIFFNWGGGSIKAYKEAGQLVDLTD------VIKSDEVLS----T----GFLPSVVAAGSLDGH-----------EYGIPMRGMQPVLLFYNKSVFAEHKLT---PPTTWDQLLDNV-A--K--LKK----A--GVT-----PF---A----L----GG-----VEIWPE-L--M-W--LEY-LVDRIGGPQ-VFDKIRN--GDASGWGD----P---A---V---LKAA-QTVKQL---VDE-GAF--------G--KGFSSV-SYNNGGAPALLAK-GKAGMHLMGSWEY-ST--QLGKFPDF----AK--------K-DLGWCAFPSFEG------GAGD-IRNVVGNPCNYWS----V---NA---RT--GNKDGAIAFLR-DCASEAYTKDLID--------N-GD--VPTTTIA------------------------------------------------
25 HHSearch 59.5314% -52 - C5 -4MFI - ? A:[31-354] -------------------------------------------------SVKSGSGPIDFWS-SHPGQ-S----S-A--AERELIGRFQ----D----RFPTLSVKLIDAGKD---------YDEVAQKFNAALI---G-T-DVPDVVLLDD-RWWFHFALSGVLTALDD------LFGQVGV-DTT--D----YVDSLLADYEFNG-R-----------HYAVPYAR-STPLFYYNKAAWQQAGLPDR-GPQSWSEFDEWG-P--E--LQR----V--VGAGRS--AH---G----WA---N------A------DLIS-W--TFQGPNWAFGG-A-YS----DK-WTLT--------L---TEPAT---IAAG-NFYRNS---IHG-KGY-----------A----A-V--ANDIANEFAT-GILASAVASTGSL-AG--ITAS--------AR--------F-DFGAAPLPT--GPDA---APAC-P--T---GGAGLA----I---PA---KLSEERKVNALKFIA-FVTNPTNTAYFSQQ-------T-GY--LPVRKSAVD----------------------------------------------
34 HHSearch 59.1818% -50 - C5 -2ZYO ? A:[13-326] -------------------------------------------------KSEGKPDKLVVWE-NAD---DGVQ-L-N--NTKKWAGEFT----K----K-TGIQVEVVPV--A---------LLKQQEKLTLDGP---A-G-KGADLVTWPH-DRLGEAVTKGLLQPIQVDNS---V-------K----N----QFDDVAMKALTYGGK-----------LYGLPKAI-ESVALIYNKKLMGQ-------VPATYDELFQYA-K--A--NNK----P--D-------EQ---K----Y----GVLFEANN------F--Y-YTYF---LFAAKGA-A-VFKEQ-D--GTLDPNEIG---L---NSPEA---VQGM-NEVQKW---FTE-ARL--------PQ-S----L-K--ADTVNGLFKS-GKVAAVINGPWAI-KD--YQA---------AG--------I-NVGVAPLPKIDG------KDAQTF--I---GVKGWY----L---SA---YS--KYPKYATELMQ-FLTSKEALASRFKE-------T-GE--IPPQKELL-----------------------------------------------
41 HHSearch 58.8418% -48 - C5 -2QRY THIB_ECOLI A:[22-291] ------------------------------------------------------KPVLTVYT-YDS---F----AADWGPGPVVKKAFE----A----D-CNCELKLVAL-ED---------GVSL----LNRLRMEGK-N-SKADVVLGLDNNLLDAASKTGLFAKSGV------A-------ADA--V----NVPGGWN-------N-----------DTFVPFDY-GYFAFVYDKNKLKN-------PPQSLKELVESD-QNWR--VIY----Q--D-------PR---T----S----T------P------G--L----G---LLLWMQK-V--Y-------G-----------------------DDAP-QAWQKL---AKK-TVT--------V--T----K-G--WSEAYGLFLK-GESDLVLSYTTSP-AYHILEE---------KK--------D-NYAAA-NFSE-G------H----Y--L---QVEVAA----R---TA---AS--KQPELAQKFLQ-FMVSPAFQNAIPTG-------N-WM--YPVA-NVT-----------------------------------------------
37 HHSearch 58.5917% -36 - C5 -4R9F ? A:[41-376] -----------------------------------------------------KQVVLTLWYPWAGP--D----G-D--AVVSLAKEYS----K----THPNVQIKAQMVSGAGIAATQGGGQGKF----LSAVA---A-G-NPPDLVLYWGQDALPGLADQGAIIPLDD------YLKDVDT-S----K----FFEAAYNAMKYKG-K-----------IYGLPEMV-NVRVLFWNKDLFKQAGLDPNTPPKTIAELDQMA-A--K--LTK----T--K-------NGTIEQ----M----G------FIPWIGQG--VPH--V---MAGVFGT-S-LVDS--N--GNPI--------LSPDK---N---PQLL-NLLKWEVSYSDKYGAMNINKFIAGM--S----Q-N--SSQANDPFVL-GKVAMMISGEWQI-NA--NKQYN-------PK--------L-NFGVGPIPQ--APGG---KPMPSL--M---DGNTWM----I---PK---GS--KHPQEAMDFIK-WTMDPQRIADTADK-------VYNI--APIVEA-------------------------------------------------
42 HHSearch 58.5712% -46 - C5 -1URS ? A:[30-333] -------------------------------------------------------QTITVWS-WQTGP-E----L-Q--DVKQIAAQWA----K----AH-GDKVIVVDQSSNPKG------FQFY----ATAAR---T-G-KGPDVVFGMPHDNNGVFAEEGLMAPVPS------GVLN----T----G----LYAPNTIDAIKVNGT-----------MYSVPVSV-QVAAIYYNKKLVPQ-------PPQTWAEFVKDA-N--A--HGF----M--Y-------DQ---A----N----L------Y------F--D-Y--A---IIGGYGG-Y-VFKDN-N--GTLDPNNIG---L---DTPGA---VQAY-TLMRDM---VSK-YHW--------MTPS----T-N--GSIAKAEFLA-GKIGMYVSGPWDT-AD--IEK---------AK--------I-DFGVTPWPT--LPNG---KHATPF--L---GVITAF----V---NK---ES--KTQAADWSLVQ-ALTSAQAQQMYFRD-------S-QQ--IPALLSVQR----------------------------------------------
27 HHSearch 57.4816% -44 - C5 -4KYS ? A:[62-381] -------------------------------------------------------QTLNVAL-YEYVPDP----I-R--FKKAVETEWN----K----KEPNIKLNFVD-------------WDCY----SED-----P-P-KDLDVFVFDA-VYLSHFVKEGYLSEIPE------K-------DIKNKE----DIL-----------PFAMEGCTIKGSAYAIPQII-STNLLFSRKGDYDIQ------KVNSVYDLYDKL-G--K--FTS----E--DIILPNNKGL---L----IDMSGG------TSK----AC-M-YL-D---SLIDTTQ-E-YT----KFCSLPN--------L---NEL-NKDAIESL-VLLQSM---AGK-SQANY------W--PEN--N-D--SYIRAKWFIN-GKGRAYIGYTEAM-SQ--MKEFA-------ND--------I-DFKTISLSK--NSNI---P----I--F---YGDVVG----I---NSSITNS--YKKEKAIELAN-IITDKNTMVKAVSPDENNKYPQ-YL--LPARRSVYHN---------------------------------------------
23 HHSearch 57.2911% -47 - C5 -3RPW ? A:[31-312] -----------------------------------------------------QSNVVIMQD-PGGG--YG---D-A--LRKVMYDPFE----K----ET-GIKVVTVQEARS---------GPRI----KAQAE---A-GKAQWDLTFIFD-QET-KLLGDCCLADI-DYSKLSES-------A----HKTLAAMPDNLK-------R-----------KKGVALQV-IGVGLVYNKDKFKGDK-----APQTWADFWDVKKFPGR--RCM----P--A-------WP---R----F------------------T--F-E--A---ALMADGV-T-KDKL--Y--P-----------I---D---M---DRAL-KKLKEI---KPH-VVK--------W--W----T-T--AAQPPQLILD-GEADMCLAYTGSM-SK--LAL---------EG--------A-PIDLT-FNQ--G-----------F--V---YYDFFS----I---PK---GA--PNYDNALKLLS-WRLDPKRAAQLTST-------F-PV--ALPSKVVFDA---------------------------------------------