@TOME V2.3
(Nov 2016)

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Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : PA0009: (2015-12-18 )
MSQTTPAVRTFQDLILALQNYWAEQGCVVLQPYDMEVGAGTFHTATFLRAIGPETWNAAYVQPSRRPTDGRYGENPNRLQHYYQFQVVLKPNPENFQELYLGSLKAIGIDPLVHDIRFVEDNWESPTLGAWGLGWEIWLNGMEVTQFTYFQQVGGIECYPVTGEITYGLERLAMYLQGVDSVYDLVWTDGPFGKVTYGDVFHQNEVEQSTFNFEHANVPKLFELFDFYESEANRLIALELPLPTYEMVLKASHTFNLLDARRAISVTERQRYILRVRTLARAVAQSYLQARARLGFPMATPELRDEVLAKLKEAE

Atome Classification :

(20 SA) -.........10........20........30.....---------.-----------------------.---.-----40..-----..---.---------------------------...---------.---------------50-.----.--.--...-...60.-.....----..----70..-..---....80.......--.-----90.-.---.---------.----------.....----100....---.-..110.------------------------....---------------------.----------.120.----.-......-----.130--.---.......-------------------140--------.----...----...------..---150-.-----.--.-------.-...----.--160-...-.-----------.....170----.......180...-....190.........200---...------------......210.......220...---------------....230.......240---.......250.......260.---......270----.......---------.280-------........290.----------------.----------------.....300------.....-----------...310...-------------------------------
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) -MSQTTPAVRTFQDLILALQNYWAEQGCVVLQPYDME---------V-----------------------G---A-----G-TF-----HT---A---------------------------TFL---------R---------------A--I----G--P--ETW-NAAYVQ-PSRRP----TD----GRYG-EN---PNRLQHYYQFQVV--L-----K-P-N---P---------E----------NFQEL----YLGSLKA---I-GIDPLV------------------------HDIR---------------------F----------VE--D----N-WESPTL-----GAW---G---LGWEIWL-------------------N----------G----MEV----TQF------TY---FQ--Q-----V--G-------G-IEC----Y--P---VTG-E-----------ITYGLERL----AMYLQGVDSVYDL-VWTDG--PFGKVTYGDV-----FHQ------------NEVEQSTFNFEHANVPKLFELF---------------DFYESEANRLIALELPL---PTYEMVLKASHTFNLLDARRA---ISVTERQR-----YILRVRT---------LAR--------AVAQSYLQARAR----------------L----------------GFPMATP-------ELRDE-----------VLAKLKEAE-------------------------------
7 HHSearch 97.3460% -98 - C6 -3RF1 SYGA_CAMJJ A:[21-308] -----QSNAMTFSQMILNLQNYWQEQGCAIMQPYDMP---------A-----------------------G---A-----G-TF-----HP---A---------------------------TFL---------R---------------S--L----G--K--KPW-AAAYVA-PSRRP----TD----GRYG-EN---PNRLGAYYQFQVL--I-----K-P-S---P---------D----------NIQEL----YLKSLEN---L-GFDLKS------------------------HDIR---------------------F----------VE--D----N-WESPSL-----GAW---G---LGWEVWL-------------------D----------G----MEV----TQF------TY---FQ--Q-----V--G-------G-IAV----D--L---VSA-E-----------ITYGLERI----AMYLQNVDNVYDI-VWSEF--NGEKIKYADV-----HKQ------------SEYEFSKYNFEVSDVKILNEQF---------------ENSYKECKNILEQGLAL---PAYDYCMLAAHTFNLLDARGA---ISVAQRQD-----YMLKIRE---------LSK--------NCAEIYKKNLN--------------------------------------------------------------------------------------------------------
2 PsiBlast_PDB 95.9161%-102 - C6 -3RGL SYGA_CAMJE A:[26-303] ----------TFSQMILNLQNYWQEQGCAIMQPYDMP---------A-----------------------G---A-----G-TF-----HP---A---------------------------TFL---------R---------------S--L----G--K--KPW-AAAYVA-PSRRP----TD----GRYG-EN---PNRLGAYYQFQVL--I-----K-P-S---P---------D----------NIQEL----YLKSLEN---L-GFDLKS------------------------HDIR---------------------F----------VE--D----N-WESPSL-----GAW---G---LGWEVWL-------------------D----------G----MEV----TQF------TY---FQ--Q-----V--G-------G-IAV----D--L---VSA-E-----------ITYGLERI----AMYLQNVDNVYDI-VWSEF--NGEKIKYADV-----HKQ------------SEYEFSKYNFEVSDVKILNEQF---------------ENSYKECKNILEQGLAL---PAYDYCMLAAHTFNLLDARGA---ISVAQRQD-----YMLKIRE---------LSK--------NCAEIYKKNLN--------------------------------------------------------------------------------------------------------
1 PsiBlast_PDB 95.7761%-100 - C6 -3RF1 SYGA_CAMJJ A:[26-303] ----------TFSQMILNLQNYWQEQGCAIMQPYDMP---------A-----------------------G---A-----G-TF-----HP---A---------------------------TFL---------R---------------S--L----G--K--KPW-AAAYVA-PSRRP----TD----GRYG-EN---PNRLGAYYQFQVL--I-----K-P-S---P---------D----------NIQEL----YLKSLEN---L-GFDLKS------------------------HDIR---------------------F----------VE--D----N-WESPSL-----GAW---G---LGWEVWL-------------------D----------G----MEV----TQF------TY---FQ--Q-----V--G-------G-IAV----D--L---VSA-E-----------ITYGLERI----AMYLQNVDNVYDI-VWSEF--NGEKIKYADV-----HKQ------------SEYEFSKYNFEVSDVKILNEQF---------------ENSYKECKNILEQGLAL---PAYDYCMLAAHTFNLLDARGA---ISVAQRQD-----YMLKIRE---------LSK--------NCAEIYKKNLN--------------------------------------------------------------------------------------------------------
3 PsiBlast_PDB 95.5461%-100 - C6 -3UFG SYGA_CAMJE A:[26-303] ----------TFSQMILNLQNYWQEQGCAIMQPYDMP---------A-----------------------G---A-----G-TF-----HP---A---------------------------TFL---------R---------------S--L----G--K--KPW-AAAYVA-PSRRP----TD----GRYG-EN---PNRLGAYYQFQVL--I-----K-P-S---P---------D----------NIQEL----YLKSLEN---L-GFDLKS------------------------HDIR---------------------F----------VE--D----N-WESPSL-----GAW---G---LGWEVWL-------------------D----------G----MEV----TQF------TY---FQ--Q-----V--G-------G-IAV----D--L---VSA-E-----------ITYGLERI----AMYLQNVDNVYDI-VWSEF--NGEKIKYADV-----HKQ------------SEYEFSKYNFEVSDVKILNEQF---------------ENSYKECKNILEQGLAL---PAYDYCMLAAHTFNLLDARGA---ISVAQRQD-----YMLKIRE---------LSK--------NCAEIYKKNLN--------------------------------------------------------------------------------------------------------
10 HHSearch 56.4421% -91 - C6 -2ZTG SYA_ARCFU A:[57-270] ------KKPFELDEMREYYLNFFERRGHGRIERYPVVARWRTDIYLT-----------------------I---A-----S-IA-----DF---Q---------------------------PFV---------T---------------SG-V----A--P--PPANPLTISQ-PCIRL----DDLDSVGRTG----------RHLTLFEMM--A-----H-H-A---F---------NYPGKEIYWKNETVAY----CTELLNE---L-GVKK--------------------------EDIV---------------------Y----------KE--E----P-WAG--G-----GNA---G---PCLEAIV-------------------G----------G----LEV----ATL------VF---MNLEEHP---E--GDIEIKGARYRKM----D--N---YIV-D-----------TGYGLERF----VWASKGTPTVYDA-IFPEV--VDTIIDNSNV-----SFN------------REDERVRRIVAESSKLAGIMGE---------------LRGERLNQLRKSVADTV---GVSVEELEGIVVPLEKVYSLA---DHTRCILF-----MLGDGLV---------PSN--------AGAGYLARLMIR----------------R----------------SLRLAEE-------LELGL-----------DLYDLVEMH-------------------------------
15 HHSearch 55.0418%-110 - C6 -3DSQ ? A:[71-273] ---------PALLELEEKLAKALHQQGFVQVVTPTII---------TKSALAKM----------------TIG-E------PLFSQV--FWLDGK---------------------------KCL---------RPMLAPNLYTLWRELER--L----W--D--KPI-RIFEIG-TCYRK----ES----QG--------AQHLNEFTMLNLTELG-----T-P-LEERH---------Q----------RLEDM----ARWVLEA---A-GIRE----------------------------FE---------------------L----------VT--E----S-SVVY-------------G---DTVDVMK-------------------G----------D----LEL----AS------------GA--M-----G--PHFLDE--K-WEIF---D--P---WVG-------------LGFGLERL----LMIREGTQHVQSM-ARSLS--YLDGVRLNI-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
9 HHSearch 53.9621% -87 - C6 -3WQY SYA_ARCFU A:[57-270] ------KKPFELDEMREYYLNFFERRGHGRIERYPVVARWRTDIYLT-----------------------I---A-----S-IA-----DF---Q---------------------------PFV---------T---------------SG-V----A--P--PPANPLTISQ-PCIRL----DDLDSVGRTG----------RHLTLFEMM--A-----H-H-A---F---------NYPGKEIYWKNETVAY----CTELLNE---L-GVKK--------------------------EDIV---------------------Y----------KE--E----P-WAG--G-----GNA---G---PCLEAIV-------------------G----------G----LEV----ATL------VF---MNLEEHP---E--GDIEIKGARYRKM----D--N---YIV-D-----------TGYGLERF----VWASKGTPTVYDA-IFPEV--VDTIIDNSNV-----SFN------------REDERVRRIVAESSKLAGIMGE---------------LRGERLNQLRKSVADTV---GVSVEELEGIVVPLEKVYSLA---DHTRCILF-----MLGDGLV---------PSN--------AGAGYLARLMIR----------------R----------------SLRLAEE-------LELGL-----------DLYDLVEMH-------------------------------
12 HHSearch 52.8917% -93 - C6 -1YFS SYA_AQUAE A:[2-247] --------SLSAHEIRELFLSFFEKKGHTRVKSAPLVPENDPTLLFV-----------------------N---A-----G-MV-----PF---K---------------------------NVF---------L---------------G--L----E--K--RPYKRATSCQ-KCLRVSGKHNDLEQVGYTS----------RHHTFFEML--G-----N-F-S---F---------GDYFKK-----EAIEY----AWEFVTEV--L-KLPKEKLYVSVYKDDEEAYRIWNEHIGIPSERIW---------------------RLGE-------ED--N----F-WQMGDV-----GPC---G---PSSEIYVDRGEEYEGDE---------R----------Y----LEI----WNL------VF---MQYNR-----DENG-------VLTPL----P--H---PNI-D-----------TGMGLERI----ASVLQGKNSNFEIDIIFPL--IQFGEEVSGK-----KYG------------EKFETDVALRVIADHLRAITFA---------------ISDGVIPSNEGRGYVIR---RILRRAMRFGYKLGIENPFLY---KGVDLVVD-----IMKEPYP---------ELE--------LSREFVKGIVKG----------------E----------------EKRFIKT-------LKAGM-----------EYIQEVIQK-------------------------------
13 HHSearch 51.9718% -88 - C6 -3HY0 SYA_ECOLI A:[1-264] --------SKSTAEIRQAFLDFFHSKGHQVVASSSLVPHNDPTLLFT-----------------------N---A-----G-MN-----QF---K---------------------------DVF---------L---------------G--L----D--K--RNYSRATTSQ-RCVRAGGKHNDLENVGYTA----------RHHTFFEML--G-----N-F-S---F---------GDYFKL-----DAILF----AWLLLTSEKWF-ALPKERLWVTVYESDDEAYEIWEKEVGIPRERII---------------------RIGDNKGAPYASD--N----F-WQMGDT-----GPC---G---PCTEIFYDHGDHIWGGPPGSPEEDGDR----------Y----IEI----WNI------VF---MQFNRQA---D--G-------TMEPL----P--K---PSV-D-----------TAMGLERI----AAVLQHVNSNYDIDLFRTL--IQAVAKVTGA-----TDL------------SNKSLRVIADHIRSCAFLIADG---------------VMPSNENRGYVLRRIIR---RAVRHGNMLGAKETFFYKLVG---PLIDVMGS-----AGEDLKR---------QQA--------QVEQVLKTEEEQ----------------F----------------ARTLERG-------LALLD-----------EELAKLSGD-------------------------------
22 HHSearch 50.6817% -98 - C6 -3PCO ? A:[109-315] -----------VTRTIDRIESFFGELGFTVATGPEIE---------DDYH--------------------N---F-----D-ALNIPGHHP---ARADHDTFWFDTT---------------RLLRTQTSGVQIR---------------T--M----KAQQ--PPI-RIIAPG-RVYRN----DY----DQ---------THTPMFHQMEGLIVD-----T-NIS---F---------T----------NLKGT----LHDFLRN---F-FEED--------------------------LQIR---------------------F----------RP--SYF--P-FTEP-------------S---AEVDVMG-------------------K----------NGKW-LEV----LGC------GM---VHP-N-----V--LR------N-VGI----D--PEVYSGF-A-----------FGMGMERL----TMLRYGVTDLRSF-FENDL--RFLKQFK-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
21 HHSearch 46.6715% -90 - C6 -1B7Y SYFA_THETH A:[103-338] -----------ITLMERELVEIFRALGYQAVEGPEVE---------S-----------------------EFFNFDALNIP-EH-----HP---ARDMWDTFWLTGEGFRLEGPLGEEVEGRLLLRTHTSPMQVR---------------Y--M----V--AHTPPF-RIVVPG-RVFRF----EQ----TD--------ATHEAVFHQLEGL--VVGE--G-I-A---M---------A----------HLKGA----IYELAQA---LFGPDS---------------------------KVR---------------------F----------QPVYF----P-FVEPG----------------AQFAVWW-------------------PEGGK------W----LEL----GGAGMVHPKVF---QA--VDAYRER--L-------G-LPPAYR-G--V---TGF-A-----------FGLGVERL----AMLRYGIPDIRY--FFGGR--LKFLEQFKGV-----L----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
19 HHSearch 44.7719% -98 - C6 -2DU3 SEPS_ARCFU A:[203-341] -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------P--LPI-KLFSID-RCFRR----EQ----GEDA----------TRLYTYFSA--SCVLVDE-ELS---V---------D----------DGKAV----AEALLRQ---F-GFE----------------------------NFR---------------------F----------RK--DEKRSK-YYIP-------------D---TQTEVFAFHPKLVGSSTKYSD-----G----------W----IEI----ATF------GI---YSP-T-----A--LA------E-YDI----P--Y---PVM-N-----------LGLGVERL----AMILYGYDDVRKM-VYPQI--HGEIKLSDLD-----IAR------------EIKVKEVPQTAVGLKIAQSIVE---------------TAEKHASEPSPCSFLAF---EGEMMGRNVRVYVVEEEENTK---LCGPAYAN-----EVVVYKG---------DIY--------GIPKTKKWRSFF----------------E----------------EGVPTGI-------RYIDG-----------FAYYAARKV-------------------------------
24 HHSearch 42.0716% -77 * C6 *3L4G SYFA_HUMAN A:[344-481] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------P--F--TPV-KYFSID-RVFRN----ET----LD--------ATHLAEFHQIEGV--VADH--G-L-T---L---------G----------HLMGV----LREFFTK---L-GIT----------------------------QLR---------------------F----------KP--AYN--P-YTEP-------------S---MEVFSYH-------------------Q----------GLKKWVEV----GNS------GV---FRP-E-----M--LL------P-MGL----PENV---SVI-A-----------WGLSLERP----TMIKYGINNIREL-VGHK-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
17 HHSearch 41.2616% -65 - C6 -2DQ0 SYS_PYRHO A:[199-338] --------------LIRFALDRLIEKGFTPVIPPYMVRRFVE----EGSTSFEDFEDVIYKVEDEDLYLIP---T-----A-EH-----PL---A---------------------------GMH---------A---------------N--EILDGK--D--LPL-LYVGVS-PCFRK----EA----GTAGKDTKG-IFRVHQFHKVEQF--V-----Y-S-R---P---------EESWEWHE---KIIRN----AEELFQE---L-EIPYRV------------------------VNIC---------------------T----------GD--L----G-YVAAKK-----YDI---E---AWMPGQG-------------------K----------F----REV----VSA------SN---CT--D-----W--Q-------A-RRL----N--I---RFR-D-----------RTDEKPRY----VHTLNSTAIATSR-AIVAI--LENHQEEDGT-----VRI------------PKVLWKYTGFKEIVPVE---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
26 HHSearch 39.2216% -75 - C6 -3W3S SYS2_METKA A:[315-491] ----------------------------------------------A-----------------------P---A-----Q-CE-----PF---Y---------------------------ELL---------R---------------DEVV----DPER--LPI-KLYDCSGWTYRW----EG----GAA--KG---LERVNEFQRIEHV--W-----I-A-E---P---------EEAYRIRR---ELLEA----TKRVAEE---L-ELEWKVVVS---------------------DDPF---------------------Y----------LE--G----RLLEDRDI-----ELPDVPS---YEFEVYL-------------------PFKGERSSEEAW----ISV----GSF------NV---HGE-H-----F--VDGF----N-VKEKSGRT--L---FTG-C-----------AGLGVTRW----VVGLLAQHGFYPY-EWPEP--ILERIDEKFG-----GLP------------EVPKTLTWPE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
14 HHSearch 36.7716% -72 - C6 -1SES SYS_THET2 A:[243-391] -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A--LPL-RYAGYA-PAFRS----EA----GSFG-KDVRGLMRVHQFHKVEQY--V-----L-T-E---ASLEASDRAFQ----------ELLEN----AEEILRL---L-ELPY---------------------------RLV---------------------E----------VA-----------TGDM-----GPG---KWRQVDIEVYL-------------------PSEGR------Y----RET----HSC------SALLDWQARR-----A--NLRYRDPEG-RVR----Y--A---YTL-NN----------TALATPRI----LAMLLENHQLQDG-RVRVP--QALIPYMGKE-----VLE------------PCG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
16 HHSearch 34.8516% -66 - C6 -3ERR DYHC1_MOUSE (first) A:[352-501] -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A--LPL-RYAGYA-PAFRS----EA----GSFG-KDVRGLMRVHQFHKVEQY--V-----L-T-E---ASLEASDRAFQ----------ELLEN----AEEILRL---L-ELPY---------------------------RLV---------------------E----------VA--T---------GDM-----GPG---KWRQVDIEVYL-------------------PSEGR------Y----RET----HSC------SALLDWQARR-----A--NLRYRDPEG-RVR----Y--A---YTLNN-----------TALATPRI----LAMLLENHQLQDG-RVRVP--QALIPYMGKE-----VLE------------PG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
30 Fugue 33.9815% -40 - C4 -4CR2 - PSA5_YEAST (first) S:[126-478] KTIEVTAEINCFMHLLVQLFL-WDSKELEQLVEFNRK---------VVIP--------------------N---L-----L-CY-----YN---L---------------------------RSL---------N---------------L--I----N--A--KLW-FYIYLS-HETLAR---SS----EEIN-SD---NQNIILRSTMMKF--L-----KIA-S---L---------K----------HDNET----KAMLINL---I-LRDFLN------------------------NG-----------------------------------E--V----D-SASDFI-----SKL---E---YPHTDVS-------------------S----------S----LEA----RYF------FY---LS--K-----I--N-------A-IQLD---Y--S---TAN-E-----------YIIAAIRK----APHNSKSLGFLQQ-SNKLH--CCIQLLMGDIPELSFFHQ------------SNMQKSLLPYYHLTKAVKLGDL---------------KKFTSTITKYKQLLLKD---DTYQLCVRLRSNVIKTGIRIISLTYKKISLRD-----ICLKLNLDSEQTVEYMVSR--------AIRDGVIEAKIN----------------HEDGFIETTELLNIYDSEDPQQVF-------DERIK-----------FANQLHDEYLVS----------------------------
33 Fugue 31.0923% -42 - C2 -4P42 ESYT2_HUMAN A:[3-470] -------DTERAEWLNKTVKHMWPFICQFIEKLFRET---------I-----------------------E---P-----A-VR-----GA---N---------------------------THL---------S---------------T--F----S--F--TKV-DVG-QQ-PLRIN----GV----KVYT-EN---VDKRQIILDLQIS--F-----V-G-N---C---------E----------IDLEIKRYFCRAGVKS---I-QIHGTM------------------------RVILEPLIGDMPLVGALSIFFLRKPL----------LE--I----N-WTGLTNLLDVPGLN---G---LSDTIIL-------------------D----------I----ISNYLVLPNR------IT---VP--L-----V--S-------E-VQI----A--Q---LRF-P-----------VPKGVLRIHFIEAQDLQGKDTYLKG-LVKGKSDPYGIIRVGNQ-----IFQSRVIKENLSPKWNEVYEALV-YEHPGQELEIELFDEDPDKDDFLGSLMIDLIEVEKERLLDEWFTLDEVPKGKLHLRLEWLTLMPNASNL---DKVLTDIGLSSALLILYLDS---------ARNLPSSSNPNPVVQMSVGHKAQESKIRYKTNEPVWEENF----------------TFFIHNPKRQDLEVEVRDEQHQCSLGNLKVPLSQLLTSEDMTVSQRFQLSNSGPNSTIKMKIALRVLHLE
4 PsiBlast_PDB 29.8430% -86 - C6 -2ZZF - SYA_PYRHO A:[184-270] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DIT---------------------F----------KE--N----P-WAGG-------GNA---G---PAFEVLY-------------------R----------G----LEV----ATL------VF---MQ--Y-----K--K----------------------------KYIPMETKVVDTGYGLERL----VWMSQGTPTAYDA-VLGYV--VEPLKKMAGI-----EKI------------DEKILMENSRLAGMFDIEDLGD---------------LRYLREQVAKRVGITVE---ELEKAIRPYELIYAIADHTKA---LTFMLADG-----VVPSNVK---------AGY--------LARLLIRKSIRH----------------L----------------RELGLEV-------PLSEI-----------VALHIKELH-------------------------------