@TOME V2.3
(Nov 2016)

Ref. - - Doc.
Global output mode :
Sort entries by :
Sequence Color type :

Show alignment :
Column output:
Score:

Alignment:

3D Common Core:

Structural Clustering:

Modeller Result :

Complexes Modeling
Templates Information:
Sequence & Result Tab:

Values color: [ Good | Correct | Middling | Bad ]Sequence color : MutatedHelixStrandConserved

Query sequence : PA2856: (2016-02-11 )
MRALLLSGCLALVLLTQQAAAQTLLVVGDSISAALGLDTSQGWVALLQKRLADEGYDYRVVNASISGDTSAGGLARLPALLAEEKPALVVIELGGNDGLRGMAPAQLQQNLASMAQKARAEGAKVLLLGIQLPPNYGPRYIEAFSRVYGAVAAQEKTALVPFFLEGVGGVQGMMQADGIHPALAAQPRLLENVWPTLKPLL

Atome Classification :

(20 SA) .........10........20....-....30...-...---------.----------.--------------40---------.........50....--..-.-.60-------------.........70---------.---------.----------..--...---------.---------80--.--....-...--90.-.......--100.--.--------------------------------------------..-----...-..110.......120--------.-----.......130..--.-.----------------.---------------------------..------140.......150----..--..-.-...-.160.--....--.----.---------170..---------------..---....180.......190.......200----
(Atome) (Ident) (Tito) (Num) (Ligand) (Uniprot) MRALLLSGCLALVLLTQQAAAQTLL-VVGDSISAA-LGL---------D----------T--------------S----------QGWVALLQKRLADEG--YD-Y-RV--------------VNASISGDTSA---------G---------G----------LA--RLP---------A---------LL--A--EEKP-ALV--VIE-LGGNDGL--R--G--M--------------------------------------------AP-----AQL-QQNLASMAQKARAE---------G-----AKVLLLGIQLPP--N-Y----------------G---------------------------PR------YIEAFSRVYGA------VA--AQ-E-KTA-LVPFF--LEGV--G----G---------V-QGM---------------MQ---ADGIHPALAAQPRLLENVWPTLKPLL-----
1 PsiBlast_PDB 99.54100%-117 - C2 -4JGG - EST_PSEAE A:[22-201] ---------------------QTLL-VVGDSISAA-LGL---------D----------T--------------S----------QGWVALLQKRLADEG--YD-Y-RV--------------VNASISGDTSA---------G---------G----------LA--RLP---------A---------LL--A--EEKP-ALV--VIE-LGGNDGL--R--G--M--------------------------------------------AP-----AQL-QQNLASMAQKARAE---------G-----AKVLLLGIQLPP--N-Y----------------G---------------------------PR------YIEAFSRVYGA------VA--AQ-E-KTA-LVPFF--LEGV--G----G---------V-QGM---------------MQ---ADGIHPALAAQPRLLENVWPTLKPLL-----
3 PsiBlast_PDB 79.0741%-110 - C2 -3HP4 - ? A:[3-182] ---------------------NTIL-ILGD-LSAA-YGL---------Q----------Q--------------E----------EGWVKLLQDKYDAEQ--SD-I-VL--------------INASISGETSG---------G---------A----------LR--RLD---------A---------LL--E--QYEP-THV--LIE-LGANDGL--R--G--F--------------------------------------------PV-----KKM-QTNLTALVKKSQAA---------N-----AMTALMEIYIPP--N-Y----------------G---------------------------PR------YSKMFTSSFTQ------IS--ED-T-NAH-LMNFF--MLDI--A----G---------K-SDL---------------MQ---NDSLHPNKKAQPLIRDEMYDSIKKWL-----
65 Fugue 78.2449%-110 - C2 -1IVN TESA_ECOLI A:[1-179] --------------------ADTLL-ILGDSLSAG-YRM---------S----------A--------------S----------AAWPALLNDKWSK-------T-SV--------------VNASISGDTSQ---------Q---------G----------LA--RLP---------A---------LL--K--QHQP-RWV--LVE-LGGNDGL--R--G--F--------------------------------------------QP-----QQT-EQTLRQILQDVKAA---------N-----AEPLLMQIRLPA--N-Y----------------G---------------------------RR------YNEAFSAIYPK------LA--KE-F-DVP-LLPFF--MEEV--Y----L---------K-PQW---------------MQ---DDGIHPNRDAQPFIADWMAKQLQPLVN----
42 HHSearch 77.9641%-108 - C2 -3HP4 - ? A:[2-181] --------------------DNTIL-ILGD-LSAA-YGL---------Q----------Q--------------E----------EGWVKLLQDKYDAEQ--SD-I-VL--------------INASISGETSG---------G---------A----------LR--RLD---------A---------LL--E--QYEP-THV--LIE-LGANDGL--R--G--F--------------------------------------------PV-----KKM-QTNLTALVKKSQAA---------N-----AMTALMEIYIPP--N-Y----------------G---------------------------PR------YSKMFTSSFTQ------IS--ED-T-NAH-LMNFF--MLDI--A----G---------K-SDL---------------MQ---NDSLHPNKKAQPLIRDEMYDSIKKW------
2 PsiBlast_PDB 77.6748%-108 - C2 -1U8U TESA_ECOLI A:[1-179] --------------------ADTLL-ILGDSLSAG-YRM---------S----------A--------------S----------AAWPALLNDKWQSKT-------SV--------------VNASISGDTSQ---------Q---------G----------LA--RLP---------A---------LL--K--QHQP-RWV--LVE-LGGNDGL--R--G--F--------------------------------------------QP-----QQT-EQTLRQILQDVKAA---------N-----AEPLLMQIRLPA--N-Y----------------G---------------------------RR------YNEAFSAIYPK------LA--KE-F-DVP-LLPFF--MEEV--Y----L---------K-PQW---------------MQ---DDGIHPNRDAQPFIADWMAKQLQPLV-----
44 HHSearch 66.7122% -85 * C2 *3RJT ? A:[6-215] ------------------EPGSKLV-MVGDSITDC-GRAHPVGEAPRGG----------L--------------G----------NGYVALVDAHLQVLHPDWR-I-RV--------------VNVGTSGNTVA---------D---------V----------AR--RWE---------D---------DV--M--ALQP-DYV--SLM-IGVNDVW--R--Q--FDMPLVVERHV----------------------------------GI-----DEY-RDTLRHLVATTKPR---------V-----REMFLLSPFYLE--P-NRSDP------------M---------------------------RK------TVDAYIEAMRD------VA--AS-E-HVP-FVDVQ--AEFD--RLLAHL---------N-TWV---------------LA---PDRVHPYLNGHLVIARAFLTAVGV-------
52 HHSearch 64.4024%-108 - C2 -2Q0Q ? A:[2-216] --------------------AKRIL-CFGDSLTWG-WVP---------VEDGAPTERFAP--------------D----------VRWTGVLAQQLG-----AD-F-EV--------------IEEGLSARTTN---------I---------DDPTDPRLNG-AS--YLP---------S---------CL--AT-HLPL-DLV--IIM-LGTNDTK--AYFR--R--------------------------------------------TP-----LDI-ALGMSVLVTQVLTSAGGVGTTYPA-----PKVLVVSPPPLA--P-M----------------PHPWFQLIFEGG----------------EQ------KTTELARVYSA------LA--SF-M-KVP-FFDAG--SVIS---------------------T---------------DG---VDGIHFTEANNRDLGVALAEQVRSLL-----
45 HHSearch 63.9428%-101 - C2 -1YZF - ? A:[2-190] ---------------------RKIV-LFGDSITAG-YLD---------EA---------V--------------S----------PVLVDLVKRDIAAMGL-EE-V-AV--------------INAGMPGDTTE---------D---------G----------LK--RLN---------K---------EV--L--IEKP-DEV--VIF-FGANDAS--LDRN--I--------------------------------------------TV-----ATF-RENLETMIHEIGS----------------EKVILITPPYAD--S-GRRPER-----------P---------------------------QT------RIKELVKVAQE------VG--AA-H-NLP-VIDLY--KAMTVYP----G---------T-DEF---------------LQ---ADGLHFSQVGYELLGALIVREIKGRL-----
48 HHSearch 58.0522% -95 - C2 -3P94 ? A:[20-203] ------------------KVPSNVV-FMGNSITDG-WWP---------A----------D-------------------------------ST-FF------IR-N-NF--------------VDRGISGQTTS---------E---------M----------LV--RFR---------Q---------DV--I--NLKP-KAV--VIL-AGINDIA--H--N--NGVI-----------------------------------------AL-----ENV-FGNLVSMAELAKAN---------H-----IKVIFCSVLPAY--D-FPWRPGMQ---------P---------------------------AD------KVIQLNKWIKE------YA--DK-N-GLT-YVDYH--SAMK--DERN-G---------L-PAN---------------LS---KDGVHPTLEGYKIMEKIVLEAIHKTV-----
66 Fugue 57.4717% -88 - C2 -2VPT GUNX_CLOTM A:[4-204] --------------------KTIKIMPVGDSCTEGMGGG-----------------------------------EM---------GSYRTELYRLLTQAG--LS-I-DFVGSQRSGPSSLPDKDHEGHSGWTIP---------Q---------I----------AS--NIN---------N---------WL--N--THNP-DVV--FLW-IGGNDLL--L--N--G--------------------------------------------NL-----N---ATGLSNLIDQIFTV---------K-----PNVTLFVADYYP--W-P---------------------------------------------E------AIKQYNAVIPG------IV--QQ-K-ANA-GKKVY--FVKL--SEIQFD---------R-NTD---------------IS---WDGLHLSEIGYKKIANIWYKYTIDILRALAG
54 HHSearch 57.4224% -82 - C2 -2O14 - YXIM_BACSU A:[159-362] -----------------PVTNRTIY-VGGDSTVCN-YYPLNS------S----------K--------------Q----------AGWGQMLPHYIDKH----T-F-QV--------------RNMASGGQIAR---------G---------F----------RNDGQLE---------A---------IL--K--YIKPGDYF--MLQ-LGINDTN--P--KHKE--------------------------------------------SE-----AEF-KEVMRDMIRQVKAK---------G-----ADVILSTPQGRA--TDF----------------TSEGIH----------------------SS------VNRWYRASILA------LA--EE-E-KTY-LIDLN--VLSS--A----YFTSIGPERTL-GLY---------------MD---GDTLHPNRAGADALARLAVQELKRQ------
56 HHSearch 55.2915% -89 - C2 -3BZW ? A:[22-262] ----------------HPWQGKKVG-YIGDSITDP-NCYG--------D----------N--------------I----------KKYWDFLKEWLG--------I-TP--------------FVYGISGRQWD---------D---------V----------PR--QAE---------K---------LK--KEHGGEV-DAI--LVF-MGTNDYN--S--S--VPIGEWFTEQEEQVLSAHGEMKKMVTRKKRTPVM-----------TQ-----DTY-RGRINIGITQLKKLFP-------D-----KQIVLLTPLHRS--L-ANFGDKNVQPDESYQNGC---------------------------GE------YIDAYVQAIKE------AG--NI-W-GIP-VIDFN--AVTG--M----NPMVEE----Q-LIY---------------FYDAGYDRLHPDTKGQERMARTLMYQLLAL------
53 HHSearch 55.0520% -80 - C2 -2HSJ ? A:[28-214] --------------NHISVVEPNIL-FIGDSIVEY-YP-------------------------------------------------L----QELFG-----TS-K-TI--------------VNRGIRGYQTG---------L---------L----------LE--NLD---------A---------HL--Y--GGAV-DKI--FLL-IGTNDIG--K--D--V--------------------------------------------PV-----NEA-LNNLEAIIQSVARDYP-------L-----TEIKLLSILPVN--E-REEYQQAVYIR------S---------------------------NE------KIQNWNQAYQE------LA--SA-YMQVE-FVPVF--DCLT--DQAG-Q---------L-KKE---------------YT---TDGLHLSIAGYQALSKSLKDYLY--------
4 PsiBlast_PDB 54.5630% -92 - C2 -1YZF - ? A:[2-169] ---------------------RKIV-LFGDSITAGYLDE---------A----------V--------------S----------PVLVDLVKRDIAAMG--LEEV-AV--------------INAGMPGDTTE---------D---------G----------LK--RLN---------K---------EV--L--IEKP-DEV--VIF-FGANDASLDR--N--I--------------------------------------------TV-----ATF-RENLETMIHEIGSE----------------KVILI---TPPYAD-S----------------G---------------------------RRPERPQTRIKELVKVAQE------VG--AA-H-NLP-VIDLYKAMTVY--P----G---------T-DEF---------------LQ---ADGLH--------------------------
55 HHSearch 54.4521%-102 - C2 -3DCI ? A:[23-230] --------------------MKTVL-AFGDSLTWG-ADP---------ATGLRHP----V--------------E----------HRWPDVLEAELAG-----K-A-KV--------------HPEGLGGRTTC---------Y---------DDHAGPACRNGAR--ALE---------V---------AL--SC-HMPL-DLV--IIM-LGTNDIK--P--V--HGGRAEAAVS-----------------------------------GM-----RRL-AQIVETFIYKPREA---------V-----PKLLIVAPPPCV--A-GPGGEPAGGR-------D---------------------------IE------QSMRLAPLYRK------LA--AE-L-GHH-FFDAG--SVA---------------------SA---------------SP---VDGVHLDASATAAIGRALAAPVRDIL-----
49 HHSearch 54.1816% -84 - C2 -2VPT GUNX_CLOTM A:[4-198] -------------------KTIKIM-PVGDSCTEG-MGG---------G----------E--------------M----------GSYRTELYRLLTQAG--LS-I-DFVGSQRSGPSSLPDKDHEGHSGWTIP---------Q---------I----------AS--NIN---------N---------WL--N--THNP-DVV--FLW-IGGNDLL--L--N--G---------------------------------------------------NLN-ATGLSNLIDQIFTVKP-------N-----VTLFVADYYPWP--E-A----------------I---------------------------KQ------YNAVIPGIVQQ------KA--NAGK-KVY-FVKLS--EIQF-------D---------R-NTD---------------IS---WDGLHLSEIGYKKIANIWYKYTIDI------
51 HHSearch 52.9118% -87 - C2 -3MIL IAH1_YEAST A:[2-210] -------------------DYEKFL-LFGDSITEF-AFN---------TRPIEDGK---D--------------Q----------YALGAALVNEYT-----RK-M-DI--------------LQRGFKGYTSR---------W---------A----------LK--ILP---------E---------IL--K---HES-NIVMATIF-LGANDAC--S--A--GPQSV----------------------------------------PL-----PEF-IDNIRQMVSLMKSY---------H-----IRPIIIGPGLVD--R-EKWEKEKSEEIALGYFRT---------------------------NE------NFAIYSDALAK------LA--NE-E-KVP-FVALN--KAFQ--QEGG-D---------A-WQQ---------------LL---TDGLHFSGKGYKIFHDELLKVIETF------
67 Fugue 52.2126% -90 - C2 -2Q0Q ? A:[2-216] --------------------AKRIL-CFGDSLTWG-WVP---------V----------E--------------DGAPTERFAPDVRWTGVLAQQL---G--AD-F-EV--------------IEEGLSARTTNIDDPTDPRLN---------G----------AS--YLP---------S---------CL--A--THLP-LDL--VIIMLGTNDTK--A--Y--F--------------------------------------------RRTPLDIALGMSVLVTQVLTSAGGV---------GTTYPAPKVLVVSPPPLA--PMP----------------H---------------------------PW------FQLIFEGGEQKTTELARVY--SA-L-ASFMKVPFF--DAGS--V----I------------ST---------------DG---VDGIHFTEANNRDLGVALAEQVRSLL-----
62 HHSearch 51.5618% -86 - C2 -2WAO A:[116-330] --------------AAPKPLERKIE-FIGDSITCA-YGN---------E----------GTSKEQSFTPKNENSY----------MSYAAITARNLNA---------SA--------------NMIAWSGIGLT---------MNYGGAPGPLI----------MD--RYP---------YTLPYSGVRWDF--S--KYVP-QVV--VIN-LGTNDFS--T--SF-A--------------------------------------------DK-----TKF-VTAYKNLISEVRRNYP-------D-----AHIFCCVGPMLW--G-TG---------------L---------------------------DL------CRSYVTEVVND------CNRSGD-L-KVY-FVEFP--QQ-------------------D-GST---------------GY---GEDWHPSIATHQLMAERLTAEIKNK------
59 HHSearch 51.4517% -90 - C2 -1ESC - ESTA_STRSC A:[4-304] -------------------DPVPTV-FFGDSYTAN-FGI---------A----------PVTNQDSERGWCFQAK----------ENYPAVATRSLADKG--IT-LDVQ--------------ADVSCGGALIH---------H---------F----------WE--KQELPFGAGELPP---------QQDAL--KQDT-QLT--VGS-LGGNTLG--F--N--RILKQCSDELRKPSLLPGDPVDGDEPAAKCGEFFGTGDGKQWLDDQF-----ERV-GAELEELLDRIGYFAP-------D-----AKRVLVGYPRLV--P-E----------------DTTKCLTAAPGQTQLPFADIPQDALPVLDQ------IQKRLNDAMKK------AA--AD-G-GAD-FVDLY--AGTG--A----NTACD-----GADRGIGGLLEDSQLELLGTKI---PWYAHPNDKGRDIQAKQVADKIEEIL-----