Study : Lmo1755 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: TAR_B_4(4IST) / Model_48(4IST/B) = [3.3] Download313.7423.56LGLFDFSVKELHDKLVKKEISPFDLVSESFNRIESVEDKVGSFITLNKEAAFGVAEELGDAGIDPNNMLAGLPIGIKDNIVTKNLRTTAASKILENFDPIYDATVVSKLKNAQTINIGKLNMDEFAMGSSTETSYFHKTHNPWDLSRVPGGSSGGSASAVAAGEVLFSLGSDTGGSIRQPAAFCGVVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPITKNVEDNAYLLEAISGLDANDSTSINQPVERFSDSLTGDIKGLRIGVPKEYLAEGVDPGVKQAVLDALKTLEKLGATWDEVSLPHSEYGVASYYILASSEASSNLSRFDGVRYGYRSPNATTLEELYTKTRSEGFGDEVKRRIMLGTYALSSGYYDAYYKKAQQARTLIKQDFINVFENYDVIIGPSSPTTAFKIDGMINDPITMYSNDILTVPINLAGVPAISVPCGFSDGLPVGLQIIGNYFEESLLYKVAHAFEQETTFHKEKPNL
Complex: TAR_A_3(4IST) / Model_49(4IST/A) = [3.4] Download581.7710.30LGLFDFSVKELHDKLVKKEISPFDLVSESFNRIESVEDKVGSFITLNKEAAFGVAEELGDAGIDPNNMLAGLPIGIKDNIVTKNLRTTAASKILENFDPIYDATVVSKLKNAQTINIGKLNMDEFAMGSSTETSYFHKTHNPWDLSRVPGGSSGGSASAVAAGEVLFSLGSDTGGSIRQPAAFCGVVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPITKNVEDNAYLLEAISGLDANDSTSINQPVERFSDSLTGDIKGLRIGVPKEYLAEGVDPGVKQAVLDALKTLEKLGATWDEVSLPHSEYGVASYYILASSEASSNLSRFDGVRYGYRSPNATTLEELYTKTRSEGFGDEVKRRIMLGTYALSSGYYDAYYKKAQQARTLIKQDFINVFENYDVIIGPSSPTTAFKIDGMINDPITMYSNDILTVPINLAGVPAISVPCGFSDGLPVGLQIIGNYFEESLLYKVAHAFEQETTFHKEKPNL
Complex: GLN_A_4(4N0I) / Model_15(4N0I/A) = [3.4] Download4028.8819.47LGLFDFSVKELHDKLVKKEISPFDLVSESFNRIESVEDKVGSFITLNKEAAFGVAEELGDAGIDPNNMLAGLPIGIKDNIVTKNLRTTAASKILENFDPIYDATVVSKLKNAQTINIGKLNMDEFAMGSSTETSYFHKTHNPWDLSRVPGGSSGGSASAVAAGEVLFSLGSDTGGSIRQPAAFCGVVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPITKNVEDNAYLLEAISGLDANDSTSINQPVERFSDSLTGDIKGLRIGVPKEYLAEGVDPGVKQAVLDALKTLEKLGATWDEVSLPHSEYGVASYYILASSEASSNLSRFDGVRYGYRSPNATTLEELYTKTRSEGFGDEVKRRIMLGTYALSSGYYDAYYKKAQQARTLIKQDFINVFENYDVIIGPSSPTTAFKIDGMINDPITMYSNDILTVPINLAGVPAISVPCGFSDGLPVGLQIIGNYFEESLLYKVAHAFEQETTFHKEKPNL
Complex: ASN_A_5(2DQN) / Model_2(2DQN/A) = [3.7] Download8300.3624.37LGLFDFSVKELHDKLVKKEISPFDLVSESFNRIESVEDKVGSFITLNKEAAFGVAEELGDAGIDPNNMLAGLPIGIKDNIVTKNLRTTAASKILENFDPIYDATVVSKLKNAQTINIGKLNMDEFAMGSSTETSYFHKTHNPWDLSRVPGGSSGGSASAVAAGEVLFSLGSDTGGSIRQPAAFCGVVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPITKNVEDNAYLLEAISGLDANDSTSINQPVERFSDSLTGDIKGLRIGVPKEYLAEGVDPGVKQAVLDALKTLEKLGATWDEVSLPHSEYGVASYYILASSEASSNLSRFDGVRYGYRSPNATTLEELYTKTRSEGFGDEVKRRIMLGTYALSSGYYDAYYKKAQQARTLIKQDFINVFENYDVIIGPSSPTTAFKIDGMINDPITMYSNDILTVPINLAGVPAISVPCGFSDGLPVGLQIIGNYFEESLLYKVAHAFEQETTFHKEKPNL
Complex: GLN_A_5(2F2A) / Model_6(2F2A/A) = [4.3] Download4072.7320.12LGLFDFSVKELHDKLVKKEISPFDLVSESFNRIESVEDKVGSFITLNKEAAFGVAEELGDAGIDPNNMLAGLPIGIKDNIVTKNLRTTAASKILENFDPIYDATVVSKLKNAQTINIGKLNMDEFAMGSSTETSYFHKTHNPWDLSRVPGGSSGGSASAVAAGEVLFSLGSDTGGSIRQPAAFCGVVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPITKNVEDNAYLLEAISGLDANDSTSINQPVERFSDSLTGDIKGLRIGVPKEYLAEGVDPGVKQAVLDALKTLEKLGATWDEVSLPHSEYGVASYYILASSEASSNLSRFDGVRYGYRSPNATTLEELYTKTRSEGFGDEVKRRIMLGTYALSSGYYDAYYKKAQQARTLIKQDFINVFENYDVIIGPSSPTTAFKIDGMINDPITMYSNDILTVPINLAGVPAISVPCGFSDGLPVGLQIIGNYFEESLLYKVAHAFEQETTFHKEKPNL
Consensus
[pKd Mean = 3.62]
-3459
(s=2908)
19
(s=5)
LGLFDFSVKELHDKLVKKEISPFDLVSESFNRIESVEDKVGSFITLNKEAAFGVAEELGDAGIDPNNMLAGLPIGIKDNIVTKNLRTTAASKILENFDPIYDATVVSKLKNAQTINIGKLNMDEFAMGSSTETSYFHKTHNPWDLSRVPGGSSGGSASAVAAGEVLFSLGSDTGGSIRQPAAFCGVVGMKPTYGRVSRFGLIAFASSLDQIGPITKNVEDNAYLLEAISGLDANDSTSINQPVERFSDSLTGDIKGLRIGVPKEYLAEGVDPGVKQAVLDALKTLEKLGATWDEVSLPHSEYGVASYYILASSEASSNLSRFDGVRYGYRSPNATTLEELYTKTRSEGFGDEVKRRIMLGTYALSSGYYDAYYKKAQQARTLIKQDFINVFENYDVIIGPSSPTTAFKIDGMINDPITMYSNDILTVPINLAGVPAISVPCGFSDGLPVGLQIIGNYFEESLLYKVAHAFEQETTFHKEKPNL