Study : PA3814 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: PLP_B_6(4LW2) / Model_35(4LW2/B) = [3.1] Download474.8112.33MKLPIYLDYSATTPVDPRVAQKMSECLLMDGNFGNPASRSHVFGWKAEEAVENARRQVAELVNADPREIVWTSGATESDNLAIKGVAHFYSGKGKHIITSKIEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLEPGEDGLITPALVEAALRDDTILVSVMHVNNEIGTVNDIAAIGELTRSRGVLFHVDAAQSTGKVEIDLDKLKVDLMSFSAHKTYGPKGIGALYVRRKPRVRIEGQMHGGGHERGMRSGTLATHQIVGMGEAFRIAKEEMAQENARVLALRDRFFAQIDGLEELYINGSMTSRVPHNLNVSFNYVEGESLIMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGRNDELAHSSIRFTFGRFTTEEEIDYAAKKVVEAVSKLRELSPLWDMYKEGVDLSQVEWQAH
Complex: PLP_B_8(4EB7) / Model_22(4EB7/B) = [3.1] Download953.801.04MKLPIYLDYSATTPVDPRVAQKMSECLLMDGNFGNPASRSHVFGWKAEEAVENARRQVAELVNADPREIVWTSGATESDNLAIKGVAHFYSGKGKHIITSKIEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLEPGEDGLITPALVEAALRDDTILVSVMHVNNEIGTVNDIAAIGELTRSRGVLFHVDAAQSTGKVEIDLDKLKVDLMSFSAHKTYGPKGIGALYVRRKPRVRIEGQMHGGGHERGMRSGTLATHQIVGMGEAFRIAKEEMAQENARVLALRDRFFAQIDGLEELYINGSMTSRVPHNLNVSFNYVEGESLIMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGRNDELAHSSIRFTFGRFTTEEEIDYAAKKVVEAVSKLRELSPLWDMYKEGVDLSQVEWQAH
Complex: PMP_A_5(4HVK) / Model_5(4HVK/A) = [3.1] Download881.974.09MKLPIYLDYSATTPVDPRVAQKMSECLLMDGNFGNPASRSHVFGWKAEEAVENARRQVAELVNADPREIVWTSGATESDNLAIKGVAHFYSGKGKHIITSKIEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLEPGEDGLITPALVEAALRDDTILVSVMHVNNEIGTVNDIAAIGELTRSRGVLFHVDAAQSTGKVEIDLDKLKVDLMSFSAHKTYGPKGIGALYVRRKPRVRIEGQMHGGGHERGMRSGTLATHQIVGMGEAFRIAKEEMAQENARVLALRDRFFAQIDGLEELYINGSMTSRVPHNLNVSFNYVEGESLIMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGRNDELAHSSIRFTFGRFTTEEEIDYAAKKVVEAVSKLRELSPLWDMYKEGVDLSQVEWQAH
Complex: LPG_C_3(1I29) / Model_19(1I29/A) = [3.2] Download511.511.91MKLPIYLDYSATTPVDPRVAQKMSECLLMDGNFGNPASRSHVFGWKAEEAVENARRQVAELVNADPREIVWTSGATESDNLAIKGVAHFYSGKGKHIITSKIEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLEPGEDGLITPALVEAALRDDTILVSVMHVNNEIGTVNDIAAIGELTRSRGVLFHVDAAQSTGKVEIDLDKLKVDLMSFSAHKTYGPKGIGALYVRRKPRVRIEGQMHGGGHERGMRSGTLATHQIVGMGEAFRIAKEEMAQENARVLALRDRFFAQIDGLEELYINGSMTSRVPHNLNVSFNYVEGESLIMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGRNDELAHSSIRFTFGRFTTEEEIDYAAKKVVEAVSKLRELSPLWDMYKEGVDLSQVEWQAH
Complex: ACY_E_5(1C0N) / Model_16(1C0N/A) = [3.3] Download528.05-2.67MKLPIYLDYSATTPVDPRVAQKMSECLLMDGNFGNPASRSHVFGWKAEEAVENARRQVAELVNADPREIVWTSGATESDNLAIKGVAHFYSGKGKHIITSKIEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLEPGEDGLITPALVEAALRDDTILVSVMHVNNEIGTVNDIAAIGELTRSRGVLFHVDAAQSTGKVEIDLDKLKVDLMSFSAHKTYGPKGIGALYVRRKPRVRIEGQMHGGGHERGMRSGTLATHQIVGMGEAFRIAKEEMAQENARVLALRDRFFAQIDGLEELYINGSMTSRVPHNLNVSFNYVEGESLIMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGRNDELAHSSIRFTFGRFTTEEEIDYAAKKVVEAVSKLRELSPLWDMYKEGVDLSQVEWQAH
Consensus
[pKd Mean = 3.16]
-670
(s=204)
3
(s=5)
MKLPIYLDYSATTPVDPRVAQKMSECLLMDGNFGNPASRSHVFGWKAEEAVENARRQVAELVNADPREIVWTSGATESDNLAIKGVAHFYSGKGKHIITSKIEHKAVLDTCRQLEREGFEVTYLEPGEDGLITPALVEAALRDDTILVSVMHVNNEIGTVNDIAAIGELTRSRGVLFHVDAAQSTGKVEIDLDKLKVDLMSFSAHKTYGPKGIGALYVRRKPRVRIEGQMHGGGHERGMRSGTLATHQIVGMGEAFRIAKEEMAQENARVLALRDRFFAQIDGLEELYINGSMTSRVPHNLNVSFNYVEGESLIMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGRNDELAHSSIRFTFGRFTTEEEIDYAAKKVVEAVSKLRELSPLWDMYKEGVDLSQVEWQAH