Study : AGRL3_HUMAN (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C2_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 4 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C2_S1
Complex: RAM_A_5(2ZX2) / Model_31(2ZX2/A) = [3.5] Download278.6022.25MWPSQLLIFMMLLAPIIHAFSRAPIPMAVVRRELSCESYPIELRCPGTDVIMIESANYGRTDDKICDSDPAQMENIRCYLPDAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCPGLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPLQASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAGRPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSPYRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAFMICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDNLLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLGMGSTTTSTTLRTTTLSPGRSTTPSVSGRRNRSTSTPSPAVEVLDDMTTHLPSASSQIPALEESCEAVEAREIMWFKTRQGQIAKQPCPAGTIGVSTYLCLAPDGIWDPQGPDLSNCSSPWVNHITQKLKSGETAANIARELAEQTRNHLNAGDITYSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKAMVETVNNLLQPQALNAWRDLTTSDQLRAATMLLHTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIKLEVARLSTEGNLEDLKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLSTENASMKLGTEALSTNHSVIVNSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLTTNKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDVITWVGILLSLVCLLICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLEGVQLYIMLVEVFESEHSRRKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVIFLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNIKSWVIGAIALLCLLGLTWAFGLMYINESTVIMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRTHCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYSTGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNREGLLNNARDTSVMDTLPLNGNHGNSYSIASGEYLSNCVQIIDRGYNHNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSSEQNRNLMNKLVNNLGSGREDDAIVLDDATSFNHEESLGLELIHEESDAPLLPPRVYSTENHQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSLYTSMPTLAGVAATESVTTSTQTEPPPAKCGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHQLHTYYQLGRGSSDGFIVPPNKDGTPPEGSSKGPAHLVTSL
Complex: RAA_A_3(2JXA) / Model_8(2JXA/A) = [4.3] Download508.9434.31MWPSQLLIFMMLLAPIIHAFSRAPIPMAVVRRELSCESYPIELRCPGTDVIMIESANYGRTDDKICDSDPAQMENIRCYLPDAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCPGLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPLQASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAGRPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSPYRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAFMICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDNLLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLGMGSTTTSTTLRTTTLSPGRSTTPSVSGRRNRSTSTPSPAVEVLDDMTTHLPSASSQIPALEESCEAVEAREIMWFKTRQGQIAKQPCPAGTIGVSTYLCLAPDGIWDPQGPDLSNCSSPWVNHITQKLKSGETAANIARELAEQTRNHLNAGDITYSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKAMVETVNNLLQPQALNAWRDLTTSDQLRAATMLLHTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIKLEVARLSTEGNLEDLKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLSTENASMKLGTEALSTNHSVIVNSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLTTNKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDVITWVGILLSLVCLLICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLEGVQLYIMLVEVFESEHSRRKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVIFLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNIKSWVIGAIALLCLLGLTWAFGLMYINESTVIMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRTHCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYSTGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNREGLLNNARDTSVMDTLPLNGNHGNSYSIASGEYLSNCVQIIDRGYNHNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSSEQNRNLMNKLVNNLGSGREDDAIVLDDATSFNHEESLGLELIHEESDAPLLPPRVYSTENHQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSLYTSMPTLAGVAATESVTTSTQTEPPPAKCGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHQLHTYYQLGRGSSDGFIVPPNKDGTPPEGSSKGPAHLVTSL
Complex: RAA_A_3(2JXA) / Model_54(2JXA/A) = [4.3] Download619.1231.00MWPSQLLIFMMLLAPIIHAFSRAPIPMAVVRRELSCESYPIELRCPGTDVIMIESANYGRTDDKICDSDPAQMENIRCYLPDAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCPGLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPLQASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAGRPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSPYRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAFMICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDNLLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLGMGSTTTSTTLRTTTLSPGRSTTPSVSGRRNRSTSTPSPAVEVLDDMTTHLPSASSQIPALEESCEAVEAREIMWFKTRQGQIAKQPCPAGTIGVSTYLCLAPDGIWDPQGPDLSNCSSPWVNHITQKLKSGETAANIARELAEQTRNHLNAGDITYSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKAMVETVNNLLQPQALNAWRDLTTSDQLRAATMLLHTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIKLEVARLSTEGNLEDLKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLSTENASMKLGTEALSTNHSVIVNSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLTTNKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDVITWVGILLSLVCLLICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLEGVQLYIMLVEVFESEHSRRKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVIFLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNIKSWVIGAIALLCLLGLTWAFGLMYINESTVIMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRTHCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYSTGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNREGLLNNARDTSVMDTLPLNGNHGNSYSIASGEYLSNCVQIIDRGYNHNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSSEQNRNLMNKLVNNLGSGREDDAIVLDDATSFNHEESLGLELIHEESDAPLLPPRVYSTENHQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSLYTSMPTLAGVAATESVTTSTQTEPPPAKCGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHQLHTYYQLGRGSSDGFIVPPNKDGTPPEGSSKGPAHLVTSL
Complex: CHAIN_B_2(4DLQ) / Model_52(4DLQ/A) = [10.2] Download--MWPSQLLIFMMLLAPIIHAFSRAPIPMAVVRRELSCESYPIELRCPGTDVIMIESANYGRTDDKICDSDPAQMENIRCYLPDAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCPGLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPLQASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAGRPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSPYRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAFMICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDNLLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLGMGSTTTSTTLRTTTLSPGRSTTPSVSGRRNRSTSTPSPAVEVLDDMTTHLPSASSQIPALEESCEAVEAREIMWFKTRQGQIAKQPCPAGTIGVSTYLCLAPDGIWDPQGPDLSNCSSPWVNHITQKLKSGETAANIARELAEQTRNHLNAGDITYSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKAMVETVNNLLQPQALNAWRDLTTSDQLRAATMLLHTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIKLEVARLSTEGNLEDLKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLSTENASMKLGTEALSTNHSVIVNSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLTTNKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDVITWVGILLSLVCLLICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLEGVQLYIMLVEVFESEHSRRKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVIFLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNIKSWVIGAIALLCLLGLTWAFGLMYINESTVIMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRTHCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYSTGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNREGLLNNARDTSVMDTLPLNGNHGNSYSIASGEYLSNCVQIIDRGYNHNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSSEQNRNLMNKLVNNLGSGREDDAIVLDDATSFNHEESLGLELIHEESDAPLLPPRVYSTENHQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSLYTSMPTLAGVAATESVTTSTQTEPPPAKCGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHQLHTYYQLGRGSSDGFIVPPNKDGTPPEGSSKGPAHLVTSL
Consensus
[pKd Mean = 5.57]
-468
(s=141)
29
(s=5)
MWPSQLLIFMMLLAPIIHAFSRAPIPMAVVRRELSCESYPIELRCPGTDVIMIESANYGRTDDKICDSDPAQMENIRCYLPDAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCPGLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPLQASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAGRPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSPYRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAFMICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDNLLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDSRSGQAHHGQVSYISPPIHLDSELERPSVKDISTTGPLGMGSTTTSTTLRTTTLSPGRSTTPSVSGRRNRSTSTPSPAVEVLDDMTTHLPSASSQIPALEESCEAVEAREIMWFKTRQGQIAKQPCPAGTIGVSTYLCLAPDGIWDPQGPDLSNCSSPWVNHITQKLKSGETAANIARELAEQTRNHLNAGDITYSVRAMDQLVGLLDVQLRNLTPGGKDSAARSLNKAMVETVNNLLQPQALNAWRDLTTSDQLRAATMLLHTVEESAFVLADNLLKTDIVRENTDNIKLEVARLSTEGNLEDLKFPENMGHGSTIQLSANTLKQNGRNGEIRVAFVLYNNLGPYLSTENASMKLGTEALSTNHSVIVNSPVITAAINKEFSNKVYLADPVVFTVKHIKQSEENFNPNCSFWSYSKRTMTGYWSTQGCRLLTTNKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAVHDLLLDVITWVGILLSLVCLLICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFLAAFTWMFLEGVQLYIMLVEVFESEHSRRKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYGTDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVIFLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNIKSWVIGAIALLCLLGLTWAFGLMYINESTVIMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGKCLRTHCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYSTGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDINSSASLNREGLLNNARDTSVMDTLPLNGNHGNSYSIASGEYLSNCVQIIDRGYNHNETALEKKILKELTSNYIPSYLNNHERSSEQNRNLMNKLVNNLGSGREDDAIVLDDATSFNHEESLGLELIHEESDAPLLPPRVYSTENHQPHHYTRRRIPQDHSESFFPLLTNEHTEDLQSPHRDSLYTSMPTLAGVAATESVTTSTQTEPPPAKCGDAEDVYYKSMPNLGSRNHVHQLHTYYQLGRGSSDGFIVPPNKDGTPPEGSSKGPAHLVTSL