Study : Wbm0061 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 4 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: G4P_B_9(4ZCM) / Model_21(4ZCM/B) = [4.6] Download1550.8710.47MNEFKSIRNIAIIAHVDHGKTTLLDNMLKQSGTFRENQEVQERVMDSGNQERERGITILAKCTSIMWGDEKINIIDTPGHADFGGEVERVLCMVDGVLLLVDAAEGPMPQTKFVLSKALKADLKSIVIINKVDRPDSRIDEVLNEIYELFFNLDATNEQLDFPVLYASGRNGWCIKELSDKRKDLSPLFSTVIDYIKPANYDRNAPFAMLVTLLESDKFLGRILTGKIYQGIAKVNSDLKVLDLDGKVIKRGRLTKLLSFSGLKRIPVEQAVAGDIIAIAGLEKASVSATIVAPEVTTAISSTPVDPPTMAITLSVNDSPFAGQEGTKLTSAIIKDRLYAEAEINVAITVTPTPNDEAFEVGGRGELQLGVLIENMRREGFELSVSRPRVLFKEEGGKKLEPIEEVVIDVDDEYSGIIMKKLSFRKGEVTDMRPSGSGRTRLIFLVPSRGLIGYQGEFLTDSRGTGIINRLFHSYAPYKGPISRRRNGVLISTDKGEAVAYAIFNLQDRGIMFIKPQDRVYCGMVVGQHSRDNDLEINVLKGKQLTNVRAAGSDEAIKLTPPKTMTLEDMIAYIDDDELVEVTPKSIRLRKKFLDPNERRRAEKAKNKE
Complex: GDP_B_9(4ZCL) / Model_22(4ZCL/B) = [5.0] Download1132.455.88MNEFKSIRNIAIIAHVDHGKTTLLDNMLKQSGTFRENQEVQERVMDSGNQERERGITILAKCTSIMWGDEKINIIDTPGHADFGGEVERVLCMVDGVLLLVDAAEGPMPQTKFVLSKALKADLKSIVIINKVDRPDSRIDEVLNEIYELFFNLDATNEQLDFPVLYASGRNGWCIKELSDKRKDLSPLFSTVIDYIKPANYDRNAPFAMLVTLLESDKFLGRILTGKIYQGIAKVNSDLKVLDLDGKVIKRGRLTKLLSFSGLKRIPVEQAVAGDIIAIAGLEKASVSATIVAPEVTTAISSTPVDPPTMAITLSVNDSPFAGQEGTKLTSAIIKDRLYAEAEINVAITVTPTPNDEAFEVGGRGELQLGVLIENMRREGFELSVSRPRVLFKEEGGKKLEPIEEVVIDVDDEYSGIIMKKLSFRKGEVTDMRPSGSGRTRLIFLVPSRGLIGYQGEFLTDSRGTGIINRLFHSYAPYKGPISRRRNGVLISTDKGEAVAYAIFNLQDRGIMFIKPQDRVYCGMVVGQHSRDNDLEINVLKGKQLTNVRAAGSDEAIKLTPPKTMTLEDMIAYIDDDELVEVTPKSIRLRKKFLDPNERRRAEKAKNKE
Complex: G4P_A_5(4ZCM) / Model_1(4ZCM/A) = [5.4] Download1042.715.00MNEFKSIRNIAIIAHVDHGKTTLLDNMLKQSGTFRENQEVQERVMDSGNQERERGITILAKCTSIMWGDEKINIIDTPGHADFGGEVERVLCMVDGVLLLVDAAEGPMPQTKFVLSKALKADLKSIVIINKVDRPDSRIDEVLNEIYELFFNLDATNEQLDFPVLYASGRNGWCIKELSDKRKDLSPLFSTVIDYIKPANYDRNAPFAMLVTLLESDKFLGRILTGKIYQGIAKVNSDLKVLDLDGKVIKRGRLTKLLSFSGLKRIPVEQAVAGDIIAIAGLEKASVSATIVAPEVTTAISSTPVDPPTMAITLSVNDSPFAGQEGTKLTSAIIKDRLYAEAEINVAITVTPTPNDEAFEVGGRGELQLGVLIENMRREGFELSVSRPRVLFKEEGGKKLEPIEEVVIDVDDEYSGIIMKKLSFRKGEVTDMRPSGSGRTRLIFLVPSRGLIGYQGEFLTDSRGTGIINRLFHSYAPYKGPISRRRNGVLISTDKGEAVAYAIFNLQDRGIMFIKPQDRVYCGMVVGQHSRDNDLEINVLKGKQLTNVRAAGSDEAIKLTPPKTMTLEDMIAYIDDDELVEVTPKSIRLRKKFLDPNERRRAEKAKNKE
Complex: GDP_A_5(4ZCL) / Model_5(4ZCL/A) = [5.5] Download1032.885.00MNEFKSIRNIAIIAHVDHGKTTLLDNMLKQSGTFRENQEVQERVMDSGNQERERGITILAKCTSIMWGDEKINIIDTPGHADFGGEVERVLCMVDGVLLLVDAAEGPMPQTKFVLSKALKADLKSIVIINKVDRPDSRIDEVLNEIYELFFNLDATNEQLDFPVLYASGRNGWCIKELSDKRKDLSPLFSTVIDYIKPANYDRNAPFAMLVTLLESDKFLGRILTGKIYQGIAKVNSDLKVLDLDGKVIKRGRLTKLLSFSGLKRIPVEQAVAGDIIAIAGLEKASVSATIVAPEVTTAISSTPVDPPTMAITLSVNDSPFAGQEGTKLTSAIIKDRLYAEAEINVAITVTPTPNDEAFEVGGRGELQLGVLIENMRREGFELSVSRPRVLFKEEGGKKLEPIEEVVIDVDDEYSGIIMKKLSFRKGEVTDMRPSGSGRTRLIFLVPSRGLIGYQGEFLTDSRGTGIINRLFHSYAPYKGPISRRRNGVLISTDKGEAVAYAIFNLQDRGIMFIKPQDRVYCGMVVGQHSRDNDLEINVLKGKQLTNVRAAGSDEAIKLTPPKTMTLEDMIAYIDDDELVEVTPKSIRLRKKFLDPNERRRAEKAKNKE
Consensus
[pKd Mean = 5.12]
-1189
(s=212)
6
(s=2)
MNEFKSIRNIAIIAHVDHGKTTLLDNMLKQSGTFRENQEVQERVMDSGNQERERGITILAKCTSIMWGDEKINIIDTPGHADFGGEVERVLCMVDGVLLLVDAAEGPMPQTKFVLSKALKADLKSIVIINKVDRPDSRIDEVLNEIYELFFNLDATNEQLDFPVLYASGRNGWCIKELSDKRKDLSPLFSTVIDYIKPANYDRNAPFAMLVTLLESDKFLGRILTGKIYQGIAKVNSDLKVLDLDGKVIKRGRLTKLLSFSGLKRIPVEQAVAGDIIAIAGLEKASVSATIVAPEVTTAISSTPVDPPTMAITLSVNDSPFAGQEGTKLTSAIIKDRLYAEAEINVAITVTPTPNDEAFEVGGRGELQLGVLIENMRREGFELSVSRPRVLFKEEGGKKLEPIEEVVIDVDDEYSGIIMKKLSFRKGEVTDMRPSGSGRTRLIFLVPSRGLIGYQGEFLTDSRGTGIINRLFHSYAPYKGPISRRRNGVLISTDKGEAVAYAIFNLQDRGIMFIKPQDRVYCGMVVGQHSRDNDLEINVLKGKQLTNVRAAGSDEAIKLTPPKTMTLEDMIAYIDDDELVEVTPKSIRLRKKFLDPNERRRAEKAKNKE