Study : SA0508 (atomeDB@cbs.cnrs.fr)


Main Binding Site Prediction:


Binding Site Prediction

Download fasta file
Download text file


Binding Site Number :C1_S1
Best Complexes choosen after comparative docking [pKd > 3] : 5 (5 maxi)

Complexes [Theoretical pKd]FileVolume (A3)
(FPocket)
Hydrophobicity
Score(FPocket)
Contacts Ligand/Receptor [<4A] in Site C1_S1
Complex: MYB_A_4(4BMK) / Model_12(4BMK/A) = [3.2] Download803.5712.85MVQSLHEFLEENINYLKENGLYNEIDTIEGANGPEIKINGKSYINLSSNNYLGLATNEDLKSAAKAAIDTHGVGAGAVRTINGTLDLHDELEETLAKFKGTEAAIAYQSGFNCNMAAISAVMNKNDAILSDELNHASIIDGCRLSKAKIIRVNHSDMDDLRAKAKEAVESGQYNKVMYITDGVFSMDGDVAKLPEIVEIAEEFGLLTYVDDAHGSGVMGKGAGTVKHFGLQDKIDFQIGTLSKAIGVVGGYVAGTKELIDWLKAQSRPFLFSTSLAPGDTKAITEAVKKLMDSTELHDKLWDNAQYLKNGLSKLGYDTGESETPITPVIIGDEKTTQEFSKRLKDEGVYVKSIVFPTVPRGTGRVRNMPTAAHTKDMLDEAIAAYEKVGKEMKLI
Complex: PLP_A_3(3A2B) / Model_41(3A2B/A) = [3.4] Download664.524.52MVQSLHEFLEENINYLKENGLYNEIDTIEGANGPEIKINGKSYINLSSNNYLGLATNEDLKSAAKAAIDTHGVGAGAVRTINGTLDLHDELEETLAKFKGTEAAIAYQSGFNCNMAAISAVMNKNDAILSDELNHASIIDGCRLSKAKIIRVNHSDMDDLRAKAKEAVESGQYNKVMYITDGVFSMDGDVAKLPEIVEIAEEFGLLTYVDDAHGSGVMGKGAGTVKHFGLQDKIDFQIGTLSKAIGVVGGYVAGTKELIDWLKAQSRPFLFSTSLAPGDTKAITEAVKKLMDSTELHDKLWDNAQYLKNGLSKLGYDTGESETPITPVIIGDEKTTQEFSKRLKDEGVYVKSIVFPTVPRGTGRVRNMPTAAHTKDMLDEAIAAYEKVGKEMKLI
Complex: PLP_A_3(3A2B) / Model_1(3A2B/A) = [3.4] Download635.234.52MVQSLHEFLEENINYLKENGLYNEIDTIEGANGPEIKINGKSYINLSSNNYLGLATNEDLKSAAKAAIDTHGVGAGAVRTINGTLDLHDELEETLAKFKGTEAAIAYQSGFNCNMAAISAVMNKNDAILSDELNHASIIDGCRLSKAKIIRVNHSDMDDLRAKAKEAVESGQYNKVMYITDGVFSMDGDVAKLPEIVEIAEEFGLLTYVDDAHGSGVMGKGAGTVKHFGLQDKIDFQIGTLSKAIGVVGGYVAGTKELIDWLKAQSRPFLFSTSLAPGDTKAITEAVKKLMDSTELHDKLWDNAQYLKNGLSKLGYDTGESETPITPVIIGDEKTTQEFSKRLKDEGVYVKSIVFPTVPRGTGRVRNMPTAAHTKDMLDEAIAAYEKVGKEMKLI
Complex: LLF_A_3(2G6W) / Model_18(2G6W/A) = [3.8] Download546.792.89MVQSLHEFLEENINYLKENGLYNEIDTIEGANGPEIKINGKSYINLSSNNYLGLATNEDLKSAAKAAIDTHGVGAGAVRTINGTLDLHDELEETLAKFKGTEAAIAYQSGFNCNMAAISAVMNKNDAILSDELNHASIIDGCRLSKAKIIRVNHSDMDDLRAKAKEAVESGQYNKVMYITDGVFSMDGDVAKLPEIVEIAEEFGLLTYVDDAHGSGVMGKGAGTVKHFGLQDKIDFQIGTLSKAIGVVGGYVAGTKELIDWLKAQSRPFLFSTSLAPGDTKAITEAVKKLMDSTELHDKLWDNAQYLKNGLSKLGYDTGESETPITPVIIGDEKTTQEFSKRLKDEGVYVKSIVFPTVPRGTGRVRNMPTAAHTKDMLDEAIAAYEKVGKEMKLI
Complex: PLP_A_3(3TQX) / Model_40(3TQX/A) = [3.9] Download666.816.59MVQSLHEFLEENINYLKENGLYNEIDTIEGANGPEIKINGKSYINLSSNNYLGLATNEDLKSAAKAAIDTHGVGAGAVRTINGTLDLHDELEETLAKFKGTEAAIAYQSGFNCNMAAISAVMNKNDAILSDELNHASIIDGCRLSKAKIIRVNHSDMDDLRAKAKEAVESGQYNKVMYITDGVFSMDGDVAKLPEIVEIAEEFGLLTYVDDAHGSGVMGKGAGTVKHFGLQDKIDFQIGTLSKAIGVVGGYVAGTKELIDWLKAQSRPFLFSTSLAPGDTKAITEAVKKLMDSTELHDKLWDNAQYLKNGLSKLGYDTGESETPITPVIIGDEKTTQEFSKRLKDEGVYVKSIVFPTVPRGTGRVRNMPTAAHTKDMLDEAIAAYEKVGKEMKLI
Consensus
[pKd Mean = 3.54]
-663
(s=82)
6
(s=3)
MVQSLHEFLEENINYLKENGLYNEIDTIEGANGPEIKINGKSYINLSSNNYLGLATNEDLKSAAKAAIDTHGVGAGAVRTINGTLDLHDELEETLAKFKGTEAAIAYQSGFNCNMAAISAVMNKNDAILSDELNHASIIDGCRLSKAKIIRVNHSDMDDLRAKAKEAVESGQYNKVMYITDGVFSMDGDVAKLPEIVEIAEEFGLLTYVDDAHGSGVMGKGAGTVKHFGLQDKIDFQIGTLSKAIGVVGGYVAGTKELIDWLKAQSRPFLFSTSLAPGDTKAITEAVKKLMDSTELHDKLWDNAQYLKNGLSKLGYDTGESETPITPVIIGDEKTTQEFSKRLKDEGVYVKSIVFPTVPRGTGRVRNMPTAAHTKDMLDEAIAAYEKVGKEMKLI